Protein–RNA interactions for Protein: Q96SW2

CRBN, Protein cereblon, humanhuman

Predictions only

Length 442 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CRBNQ96SW2 ZNF688-205ENST00000563707 244 ntTSL 3 BASIC24.67■■□□□ 1.54
CRBNQ96SW2 OGFR-204ENST00000621591 1194 ntTSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
CRBNQ96SW2 CHPF-201ENST00000243776 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
CRBNQ96SW2 RCAN3-205ENST00000436717 2574 ntTSL 3 BASIC24.67■■□□□ 1.54
CRBNQ96SW2 PODXL2-201ENST00000342480 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
CRBNQ96SW2 HOXD10-201ENST00000249501 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
CRBNQ96SW2 RFC2-202ENST00000352131 1576 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
CRBNQ96SW2 YAP1-202ENST00000345877 5284 ntTSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
CRBNQ96SW2 GTF3C5-201ENST00000342018 1905 ntTSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
CRBNQ96SW2 USP49-202ENST00000373010 2446 ntTSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
CRBNQ96SW2 NTMT1-210ENST00000613644 1501 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.66■■□□□ 1.54
CRBNQ96SW2 RPL7-202ENST00000396465 1308 ntTSL 3 BASIC24.66■■□□□ 1.54
CRBNQ96SW2 SLC12A4-202ENST00000422611 4670 ntTSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
CRBNQ96SW2 DBNL-219ENST00000490734 2004 ntTSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
CRBNQ96SW2 LONP1-201ENST00000360614 3236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
CRBNQ96SW2 GDPD1-201ENST00000284116 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
CRBNQ96SW2 ILKAP-201ENST00000254654 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
CRBNQ96SW2 HCN1-202ENST00000634658 4738 ntTSL 3 BASIC24.66■■□□□ 1.54
CRBNQ96SW2 ZNF768-202ENST00000562803 1999 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.66■■□□□ 1.54
CRBNQ96SW2 COPS9-201ENST00000307266 759 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
CRBNQ96SW2 NENF-201ENST00000366988 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
CRBNQ96SW2 AC114730.2-201ENST00000417267 668 ntTSL 3 BASIC24.66■■□□□ 1.54
CRBNQ96SW2 NCF1B-203ENST00000435988 1254 ntBASIC24.66■■□□□ 1.54
CRBNQ96SW2 FAM219B-212ENST00000565772 1249 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
CRBNQ96SW2 WNK1-203ENST00000447667 1902 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
CRBNQ96SW2 ARNTL-203ENST00000403290 2746 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
CRBNQ96SW2 ESPN-205ENST00000461727 1869 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
CRBNQ96SW2 GORASP1-206ENST00000422110 2523 ntTSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
CRBNQ96SW2 PHF12-201ENST00000268756 2957 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
CRBNQ96SW2 HSPB2-C11orf52-202ENST00000534100 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
CRBNQ96SW2 AP006587.1-201ENST00000534129 1502 ntBASIC24.66■■□□□ 1.54
CRBNQ96SW2 AUP1-201ENST00000377526 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
CRBNQ96SW2 EGLN2-201ENST00000303961 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
CRBNQ96SW2 SNAP47-201ENST00000315781 2367 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
CRBNQ96SW2 ZNF302-206ENST00000505242 2849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
CRBNQ96SW2 REXO2-201ENST00000265881 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
CRBNQ96SW2 FAM57A-201ENST00000301324 2013 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
CRBNQ96SW2 CAV3-201ENST00000343849 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
CRBNQ96SW2 HCFC1R1-202ENST00000354679 765 ntTSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
CRBNQ96SW2 POLR1D-203ENST00000399697 2036 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
CRBNQ96SW2 ZPBP-203ENST00000419417 1095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
CRBNQ96SW2 KRT8P8-201ENST00000434750 1448 ntBASIC24.65■■□□□ 1.54
CRBNQ96SW2 AL807752.2-201ENST00000435463 301 ntTSL 3 BASIC24.65■■□□□ 1.54
CRBNQ96SW2 ATPAF2-206ENST00000474627 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
CRBNQ96SW2 AC092849.2-201ENST00000492523 333 ntTSL 3 BASIC24.65■■□□□ 1.54
CRBNQ96SW2 REXO2-208ENST00000539754 791 ntTSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
CRBNQ96SW2 PNN-205ENST00000556530 601 ntTSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
CRBNQ96SW2 SEC23A-AS1-201ENST00000557350 500 ntTSL 3 BASIC24.65■■□□□ 1.54
CRBNQ96SW2 TRAPPC3-208ENST00000616074 1114 ntTSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
CRBNQ96SW2 SH3BP1-201ENST00000357436 2852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
CRBNQ96SW2 MEPCE-202ENST00000414441 2261 ntTSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
CRBNQ96SW2 AC073107.1-201ENST00000633579 1962 ntTSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
CRBNQ96SW2 TSG101-201ENST00000251968 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
CRBNQ96SW2 MRGPRG-AS1-201ENST00000420873 1818 ntTSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
CRBNQ96SW2 GCOM1-201ENST00000380568 1516 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
CRBNQ96SW2 FAM213B-201ENST00000378424 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
CRBNQ96SW2 SIX5-201ENST00000317578 3318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
CRBNQ96SW2 CAMKMT-201ENST00000378494 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
CRBNQ96SW2 ANKS3-202ENST00000446014 2265 ntTSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.54
CRBNQ96SW2 TCTN1-223ENST00000550703 2149 ntTSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.54
CRBNQ96SW2 TIMM13-201ENST00000215570 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
CRBNQ96SW2 PPP1R14A-202ENST00000347262 637 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
CRBNQ96SW2 PIGP-203ENST00000399098 972 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
CRBNQ96SW2 AL138781.1-201ENST00000566567 1274 ntBASIC24.64■■□□□ 1.54
CRBNQ96SW2 AC006435.1-201ENST00000571775 1065 ntTSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.54
CRBNQ96SW2 KLF2-202ENST00000592003 564 ntTSL 3 BASIC24.64■■□□□ 1.54
CRBNQ96SW2 AC083880.1-201ENST00000608266 535 ntBASIC24.64■■□□□ 1.54
CRBNQ96SW2 GAMT-205ENST00000640762 751 ntTSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.54
CRBNQ96SW2 USP39-202ENST00000409025 1946 ntTSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.53
CRBNQ96SW2 ART5-203ENST00000397068 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
CRBNQ96SW2 CNOT11-201ENST00000289382 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
CRBNQ96SW2 PLPPR2-208ENST00000591608 2552 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.53
CRBNQ96SW2 AC009113.1-201ENST00000570267 2443 ntBASIC24.64■■□□□ 1.53
CRBNQ96SW2 COPS7A-204ENST00000534947 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
CRBNQ96SW2 AL445433.2-201ENST00000425113 2544 ntTSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.53
CRBNQ96SW2 MAP2K2-202ENST00000394867 1471 ntTSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.53
CRBNQ96SW2 C19orf25-206ENST00000588849 1472 ntTSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.53
CRBNQ96SW2 CASC2-205ENST00000454781 2216 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
CRBNQ96SW2 SLC38A10-201ENST00000288439 2708 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
CRBNQ96SW2 AC087457.1-201ENST00000503496 2727 ntTSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
CRBNQ96SW2 RBM42-204ENST00000589559 1328 ntTSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
CRBNQ96SW2 NDUFV3-202ENST00000354250 1575 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
CRBNQ96SW2 IRX1P1-201ENST00000438849 1838 ntBASIC24.63■■□□□ 1.53
CRBNQ96SW2 FAM90A1-201ENST00000307435 2342 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
CRBNQ96SW2 MSLN-207ENST00000566549 2418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
CRBNQ96SW2 CCDC27-201ENST00000294600 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
CRBNQ96SW2 EPHX1-201ENST00000272167 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
CRBNQ96SW2 AC026362.1-201ENST00000540866 5618 ntTSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
CRBNQ96SW2 SLC29A2-201ENST00000311161 2262 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
CRBNQ96SW2 TTLL10-203ENST00000379290 2283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
CRBNQ96SW2 SMURF1-202ENST00000361368 5581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
CRBNQ96SW2 SLC31A2-201ENST00000259392 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
CRBNQ96SW2 XBP1-202ENST00000344347 1131 ntTSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
CRBNQ96SW2 GLI4-202ENST00000344692 1012 ntTSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
CRBNQ96SW2 SLC29A4P1-201ENST00000398760 971 ntBASIC24.63■■□□□ 1.53
CRBNQ96SW2 HAGLROS-201ENST00000426615 1121 ntTSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
CRBNQ96SW2 YBX1P10-201ENST00000444752 975 ntBASIC24.63■■□□□ 1.53
CRBNQ96SW2 HAGLR-207ENST00000452365 661 ntTSL 4 BASIC24.63■■□□□ 1.53
CRBNQ96SW2 TMEM218-207ENST00000528724 1117 ntTSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
CRBNQ96SW2 TMEM218-214ENST00000532156 954 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.4 ms