Protein–RNA interactions for Protein: Q96FJ0

STAMBPL1, AMSH-like protease, humanhuman

Predictions only

Length 436 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
STAMBPL1Q96FJ0 FAM83E-201ENST00000263266 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
STAMBPL1Q96FJ0 HERPUD2-202ENST00000396081 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
STAMBPL1Q96FJ0 FOXN3-214ENST00000557258 2692 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
STAMBPL1Q96FJ0 RELB-207ENST00000625761 2279 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.86■□□□□ 0.77
STAMBPL1Q96FJ0 MEN1-209ENST00000394376 3034 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.86■□□□□ 0.77
STAMBPL1Q96FJ0 PRDM11-201ENST00000424263 1858 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.86■□□□□ 0.77
STAMBPL1Q96FJ0 GLS-202ENST00000338435 4475 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
STAMBPL1Q96FJ0 LRRC20-205ENST00000395010 2959 ntTSL 3 BASIC19.86■□□□□ 0.77
STAMBPL1Q96FJ0 MUTYH-203ENST00000372098 1839 ntTSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
STAMBPL1Q96FJ0 MUTYH-204ENST00000372104 1823 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
STAMBPL1Q96FJ0 MUTYH-205ENST00000372110 1809 ntTSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
STAMBPL1Q96FJ0 ZNF821-221ENST00000611294 1833 ntTSL 3 BASIC19.86■□□□□ 0.77
STAMBPL1Q96FJ0 RNF114-201ENST00000244061 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
STAMBPL1Q96FJ0 TM9SF1-206ENST00000528669 2425 ntTSL 5 BASIC19.85■□□□□ 0.77
STAMBPL1Q96FJ0 AC013269.1-201ENST00000409259 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
STAMBPL1Q96FJ0 TISP43-206ENST00000623376 1653 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
STAMBPL1Q96FJ0 FAM222A-202ENST00000538780 3294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
STAMBPL1Q96FJ0 GOLGA3-203ENST00000456883 5496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
STAMBPL1Q96FJ0 ZNF302-214ENST00000613363 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC19.85■□□□□ 0.77
STAMBPL1Q96FJ0 NAA20-202ENST00000334982 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
STAMBPL1Q96FJ0 SDHC-201ENST00000342751 1127 ntTSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
STAMBPL1Q96FJ0 SMNDC1-201ENST00000369592 1110 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.85■□□□□ 0.77
STAMBPL1Q96FJ0 SPATA25-201ENST00000372519 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
STAMBPL1Q96FJ0 RNF5-203ENST00000375094 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
STAMBPL1Q96FJ0 LINC02531-201ENST00000404689 593 ntTSL 5 BASIC19.85■□□□□ 0.77
STAMBPL1Q96FJ0 DNAJA4-210ENST00000489435 947 ntTSL 3 BASIC19.85■□□□□ 0.77
STAMBPL1Q96FJ0 CDH18-AS1-201ENST00000513573 424 ntTSL 2 BASIC19.85■□□□□ 0.77
STAMBPL1Q96FJ0 RPH3AL-203ENST00000536489 1235 ntTSL 2 BASIC19.85■□□□□ 0.77
STAMBPL1Q96FJ0 AC138028.5-201ENST00000566114 558 ntTSL 5 BASIC19.85■□□□□ 0.77
STAMBPL1Q96FJ0 PSME3-210ENST00000590720 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
STAMBPL1Q96FJ0 CCDC17-202ENST00000421127 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.85■□□□□ 0.77
STAMBPL1Q96FJ0 PTGES2-AS1-201ENST00000443493 2100 ntBASIC19.85■□□□□ 0.77
STAMBPL1Q96FJ0 BZW1-209ENST00000452790 1473 ntTSL 2 BASIC19.85■□□□□ 0.77
STAMBPL1Q96FJ0 IRF3-221ENST00000598808 1468 ntTSL 5 BASIC19.85■□□□□ 0.77
STAMBPL1Q96FJ0 TBC1D4-201ENST00000377625 6182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
STAMBPL1Q96FJ0 MORC4-201ENST00000255495 2940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
STAMBPL1Q96FJ0 SLC37A2-203ENST00000403796 2910 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.85■□□□□ 0.77
STAMBPL1Q96FJ0 TAL1-202ENST00000371884 4642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
STAMBPL1Q96FJ0 FAM66E-201ENST00000529252 1433 ntTSL 2 BASIC19.85■□□□□ 0.77
STAMBPL1Q96FJ0 FAM66B-201ENST00000529456 1432 ntTSL 2 BASIC19.85■□□□□ 0.77
STAMBPL1Q96FJ0 USP21-201ENST00000289865 2195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
STAMBPL1Q96FJ0 MAPK8IP3-216ENST00000610761 5626 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
STAMBPL1Q96FJ0 CRMP1-202ENST00000397890 2911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
STAMBPL1Q96FJ0 POLD3-203ENST00000527458 2122 ntTSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
STAMBPL1Q96FJ0 SEPT7-206ENST00000435235 1584 ntTSL 2 BASIC19.84■□□□□ 0.77
STAMBPL1Q96FJ0 ATRN-201ENST00000262919 8633 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC19.84■□□□□ 0.77
STAMBPL1Q96FJ0 TMEM218-213ENST00000531909 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
STAMBPL1Q96FJ0 IPO13-201ENST00000372339 1201 ntTSL 2 BASIC19.84■□□□□ 0.77
STAMBPL1Q96FJ0 JADE2-211ENST00000612830 1251 ntTSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
STAMBPL1Q96FJ0 AL160396.2-202ENST00000636692 566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.84■□□□□ 0.77
STAMBPL1Q96FJ0 C17orf58-201ENST00000334461 1535 ntTSL 2 BASIC19.84■□□□□ 0.77
STAMBPL1Q96FJ0 ZNF274-212ENST00000617501 2538 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
STAMBPL1Q96FJ0 AC069544.2-201ENST00000640019 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
STAMBPL1Q96FJ0 SMTN-204ENST00000404574 1735 ntTSL 2 BASIC19.84■□□□□ 0.77
STAMBPL1Q96FJ0 CNNM3-201ENST00000305510 3447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
STAMBPL1Q96FJ0 TBC1D2B-202ENST00000409931 6086 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
STAMBPL1Q96FJ0 PGAP1-204ENST00000409475 2443 ntTSL 2 BASIC19.84■□□□□ 0.77
STAMBPL1Q96FJ0 FAM131C-201ENST00000375662 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
STAMBPL1Q96FJ0 IKBKG-207ENST00000611071 2103 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
STAMBPL1Q96FJ0 NAGPA-AS1-202ENST00000632058 2265 ntTSL 2 BASIC19.83■□□□□ 0.77
STAMBPL1Q96FJ0 SLMAP-201ENST00000295951 5433 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.83■□□□□ 0.77
STAMBPL1Q96FJ0 MSANTD1-201ENST00000438480 2922 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.83■□□□□ 0.77
STAMBPL1Q96FJ0 KRT78-201ENST00000304620 1778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
STAMBPL1Q96FJ0 RAPGEF5-203ENST00000405243 2800 ntTSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
STAMBPL1Q96FJ0 GTF2IP4-202ENST00000544802 3609 ntTSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
STAMBPL1Q96FJ0 C11orf86-201ENST00000308963 1187 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.83■□□□□ 0.77
STAMBPL1Q96FJ0 LINC00471-201ENST00000313064 1282 ntTSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
STAMBPL1Q96FJ0 WIPF1-207ENST00000410117 777 ntTSL 3 BASIC19.83■□□□□ 0.77
STAMBPL1Q96FJ0 SERPINH1P1-201ENST00000419794 1249 ntBASIC19.83■□□□□ 0.77
STAMBPL1Q96FJ0 AL391244.2-201ENST00000428932 543 ntTSL 2 BASIC19.83■□□□□ 0.77
STAMBPL1Q96FJ0 CTBP1-AS2-203ENST00000507044 739 ntTSL 3 BASIC19.83■□□□□ 0.77
STAMBPL1Q96FJ0 CAMKK1-202ENST00000348335 3563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
STAMBPL1Q96FJ0 FLYWCH1-201ENST00000253928 5037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
STAMBPL1Q96FJ0 BRAF-201ENST00000288602 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
STAMBPL1Q96FJ0 BACE1-204ENST00000445823 1408 ntTSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
STAMBPL1Q96FJ0 LDLRAD4-211ENST00000587757 2171 ntTSL 2 BASIC19.83■□□□□ 0.76
STAMBPL1Q96FJ0 PVRIG-201ENST00000317271 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
STAMBPL1Q96FJ0 MRPL2-202ENST00000388752 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
STAMBPL1Q96FJ0 SLC9A6-202ENST00000370698 4631 ntTSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
STAMBPL1Q96FJ0 ISOC1-201ENST00000173527 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
STAMBPL1Q96FJ0 FAM187A-202ENST00000412523 1748 ntTSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
STAMBPL1Q96FJ0 SLC25A41-201ENST00000321510 1532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.82■□□□□ 0.76
STAMBPL1Q96FJ0 BSCL2-207ENST00000407022 1516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
STAMBPL1Q96FJ0 KCNK17-201ENST00000373231 1658 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
STAMBPL1Q96FJ0 BAG3-201ENST00000369085 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
STAMBPL1Q96FJ0 C16orf74-201ENST00000284245 906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
STAMBPL1Q96FJ0 MAL-201ENST00000309988 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
STAMBPL1Q96FJ0 NUDT8-202ENST00000376693 728 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.82■□□□□ 0.76
STAMBPL1Q96FJ0 CALM3-202ENST00000391918 702 ntTSL 2 BASIC19.82■□□□□ 0.76
STAMBPL1Q96FJ0 LINC01191-201ENST00000412690 844 ntTSL 2 BASIC19.82■□□□□ 0.76
STAMBPL1Q96FJ0 NAA60-204ENST00000421765 1045 ntTSL 2 BASIC19.82■□□□□ 0.76
STAMBPL1Q96FJ0 FAM219B-212ENST00000565772 1249 ntTSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
STAMBPL1Q96FJ0 SKOR1-203ENST00000554054 3620 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.82■□□□□ 0.76
STAMBPL1Q96FJ0 MARK1-202ENST00000366918 5169 ntTSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
STAMBPL1Q96FJ0 THAP12-201ENST00000260045 3300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
STAMBPL1Q96FJ0 SEPT6-202ENST00000354228 1576 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
STAMBPL1Q96FJ0 CHPF-203ENST00000535926 2634 ntTSL 2 BASIC19.82■□□□□ 0.76
STAMBPL1Q96FJ0 DBN1-210ENST00000512501 1878 ntTSL 3 BASIC19.82■□□□□ 0.76
STAMBPL1Q96FJ0 RALGPS1-208ENST00000424082 2362 ntTSL 2 BASIC19.81■□□□□ 0.76
STAMBPL1Q96FJ0 CHMP6-201ENST00000325167 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.1 ms