Protein–RNA interactions for Protein: Q96F86

EDC3, Enhancer of mRNA-decapping protein 3, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 508 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EDC3Q96F86 PHOSPHO2-206ENST00000616481 1252 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.47■■□□□ 1.35
EDC3Q96F86 PHOSPHO2-208ENST00000617738 1053 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
EDC3Q96F86 NAT6-201ENST00000354862 1330 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
EDC3Q96F86 P4HB-203ENST00000439918 1502 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
EDC3Q96F86 PEX16-210ENST00000532681 1639 ntTSL 3 BASIC23.47■■□□□ 1.35
EDC3Q96F86 AC126773.2-201ENST00000562172 1682 ntTSL 3 BASIC23.47■■□□□ 1.35
EDC3Q96F86 HOMER1-202ENST00000334082 5881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
EDC3Q96F86 STIM2-211ENST00000639195 2265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
EDC3Q96F86 SOX2-201ENST00000325404 2513 ntAPPRIS P1 BASIC23.47■■□□□ 1.35
EDC3Q96F86 ACD-201ENST00000219251 2052 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
EDC3Q96F86 ACVR1C-203ENST00000348328 1270 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
EDC3Q96F86 ZNF346-201ENST00000358149 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
EDC3Q96F86 FUOM-203ENST00000368552 762 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
EDC3Q96F86 DAB1-202ENST00000371230 1150 ntTSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
EDC3Q96F86 C6orf89-203ENST00000373685 1400 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
EDC3Q96F86 HPF1-201ENST00000393381 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
EDC3Q96F86 MEN1-209ENST00000394376 3034 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
EDC3Q96F86 C21orf91-203ENST00000400559 1593 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
EDC3Q96F86 HOXD12-202ENST00000406506 1318 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.46■■□□□ 1.35
EDC3Q96F86 SPON2-203ENST00000431380 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
EDC3Q96F86 AC137630.1-201ENST00000452042 782 ntTSL 4 BASIC23.46■■□□□ 1.35
EDC3Q96F86 DHDH-203ENST00000522614 776 ntTSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
EDC3Q96F86 PLD4-204ENST00000540372 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
EDC3Q96F86 KRT18-207ENST00000550600 1696 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
EDC3Q96F86 TMEM263-208ENST00000551489 621 ntTSL 4 BASIC23.46■■□□□ 1.35
EDC3Q96F86 CDH5-204ENST00000563425 1932 ntTSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
EDC3Q96F86 AL160286.2-201ENST00000567150 934 ntBASIC23.46■■□□□ 1.35
EDC3Q96F86 SMAD7-207ENST00000589634 1278 ntAPPRIS ALT1 TSL 4 BASIC23.46■■□□□ 1.35
EDC3Q96F86 RELB-207ENST00000625761 2279 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
EDC3Q96F86 FGFR2-204ENST00000356226 3547 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
EDC3Q96F86 CNEP1R1-203ENST00000458059 2965 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
EDC3Q96F86 FOXK2-201ENST00000335255 5265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
EDC3Q96F86 NTNG2-202ENST00000393229 4792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
EDC3Q96F86 SYTL1-201ENST00000318074 1900 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.35
EDC3Q96F86 ISM2-207ENST00000493585 1739 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
EDC3Q96F86 GABRD-205ENST00000638771 1707 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.45■■□□□ 1.34
EDC3Q96F86 SMARCB1-204ENST00000407422 1643 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
EDC3Q96F86 DPF1-209ENST00000456296 1562 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
EDC3Q96F86 FBXO27-207ENST00000600828 1557 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
EDC3Q96F86 COL13A1-205ENST00000398978 3093 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
EDC3Q96F86 KRT8P41-201ENST00000533985 1514 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
EDC3Q96F86 ZFYVE1-202ENST00000394207 1183 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
EDC3Q96F86 HDAC11-203ENST00000402271 1018 ntTSL 3 BASIC23.45■■□□□ 1.34
EDC3Q96F86 MIR1224-201ENST00000408193 85 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
EDC3Q96F86 AL355355.2-201ENST00000442321 338 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
EDC3Q96F86 BX322234.1-201ENST00000444188 980 ntTSL 3 BASIC23.45■■□□□ 1.34
EDC3Q96F86 MRPL36-202ENST00000505059 610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
EDC3Q96F86 AC093752.1-201ENST00000511950 605 ntTSL 4 BASIC23.45■■□□□ 1.34
EDC3Q96F86 RPS20-210ENST00000523936 899 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
EDC3Q96F86 AC117500.4-201ENST00000542797 617 ntTSL 3 BASIC23.45■■□□□ 1.34
EDC3Q96F86 C12orf76-208ENST00000551185 496 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
EDC3Q96F86 GCHFR-205ENST00000559932 695 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
EDC3Q96F86 LINC02256-201ENST00000561999 366 ntTSL 3 BASIC23.45■■□□□ 1.34
EDC3Q96F86 ZNF561-AS1-202ENST00000586614 568 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
EDC3Q96F86 LINC01023-201ENST00000606054 436 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
EDC3Q96F86 AL031985.4-201ENST00000642138 673 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
EDC3Q96F86 AC087482.1-204ENST00000636067 2431 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
EDC3Q96F86 AC116562.4-201ENST00000641316 2276 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
EDC3Q96F86 FBXL18-203ENST00000453700 1932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
EDC3Q96F86 METRNL-203ENST00000571814 1900 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
EDC3Q96F86 TMEM235-203ENST00000550981 1786 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
EDC3Q96F86 RCC2P6-201ENST00000526625 1557 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
EDC3Q96F86 PTGER3-209ENST00000460330 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
EDC3Q96F86 TREX2-203ENST00000338525 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
EDC3Q96F86 DUSP1-201ENST00000239223 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
EDC3Q96F86 NKX6-1-201ENST00000295886 2628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
EDC3Q96F86 CCSAP-201ENST00000284617 5121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
EDC3Q96F86 BIK-201ENST00000216115 953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
EDC3Q96F86 IZUMO2-201ENST00000293405 728 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
EDC3Q96F86 TCTEX1D2-201ENST00000325318 673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
EDC3Q96F86 IGHV3-73-201ENST00000390636 437 ntAPPRIS P1 BASIC23.44■■□□□ 1.34
EDC3Q96F86 LINC01122-201ENST00000422723 675 ntTSL 3 BASIC23.44■■□□□ 1.34
EDC3Q96F86 B3GAT3P1-201ENST00000471720 806 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
EDC3Q96F86 WDR86-AS1-203ENST00000480632 704 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
EDC3Q96F86 KCNMA1-220ENST00000481070 896 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
EDC3Q96F86 ANK1-211ENST00000522231 1060 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
EDC3Q96F86 ANK1-212ENST00000522543 1160 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
EDC3Q96F86 C17orf62-230ENST00000583617 866 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
EDC3Q96F86 MIR4785-201ENST00000585005 73 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
EDC3Q96F86 ZNF667-AS1-206ENST00000591797 535 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
EDC3Q96F86 CROCCP2-205ENST00000639481 1296 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
EDC3Q96F86 KIF22-203ENST00000561482 2505 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
EDC3Q96F86 CACNA1H-210ENST00000638323 8048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
EDC3Q96F86 NYX-202ENST00000378220 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
EDC3Q96F86 PCGF3-208ENST00000470161 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
EDC3Q96F86 TM7SF3-201ENST00000343028 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
EDC3Q96F86 ITGB7-209ENST00000550743 2138 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
EDC3Q96F86 PVRIG-201ENST00000317271 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
EDC3Q96F86 AL390860.1-201ENST00000449298 1541 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
EDC3Q96F86 WIPF1-202ENST00000359761 2003 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
EDC3Q96F86 EIF2B1-201ENST00000424014 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
EDC3Q96F86 PTGER2-201ENST00000245457 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
EDC3Q96F86 SDHA-201ENST00000264932 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
EDC3Q96F86 SPHK1-207ENST00000590959 1851 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
EDC3Q96F86 CSPG5-201ENST00000264723 4080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
EDC3Q96F86 FAM228A-201ENST00000295150 1774 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
EDC3Q96F86 KRT17P2-201ENST00000300992 1314 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
EDC3Q96F86 KRTCAP3-201ENST00000288873 872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
EDC3Q96F86 AC116562.2-201ENST00000507042 360 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
EDC3Q96F86 AC134349.1-201ENST00000543969 385 ntTSL 3 BASIC23.43■■□□□ 1.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.9 ms