Protein–RNA interactions for Protein: Q96CN9

GCC1, GRIP and coiled-coil domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 775 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GCC1Q96CN9 EXOSC4-202ENST00000525936 606 ntTSL 3 BASIC24.12■■□□□ 1.45
GCC1Q96CN9 SMAGP-206ENST00000604188 433 ntTSL 3 BASIC24.12■■□□□ 1.45
GCC1Q96CN9 TRAPPC6A-201ENST00000006275 805 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
GCC1Q96CN9 IFNAR2-204ENST00000382264 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
GCC1Q96CN9 GFER-201ENST00000248114 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
GCC1Q96CN9 KLHDC4-203ENST00000347925 1821 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
GCC1Q96CN9 DMRT2-204ENST00000382251 2292 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
GCC1Q96CN9 TNXA-203ENST00000507684 2038 ntBASIC24.11■■□□□ 1.45
GCC1Q96CN9 MARK2-208ENST00000508192 2924 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
GCC1Q96CN9 ADORA2A-201ENST00000337539 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
GCC1Q96CN9 MAST2-201ENST00000361297 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
GCC1Q96CN9 GCOM1-201ENST00000380568 1516 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
GCC1Q96CN9 SLC5A10-205ENST00000417251 1984 ntTSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
GCC1Q96CN9 CORO1A-216ENST00000570045 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
GCC1Q96CN9 PIK3R1-201ENST00000320694 2625 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
GCC1Q96CN9 THAP7-AS1-203ENST00000452284 2298 ntTSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
GCC1Q96CN9 IFI6-203ENST00000362020 828 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
GCC1Q96CN9 HES2-203ENST00000377837 1222 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
GCC1Q96CN9 ZFYVE1-202ENST00000394207 1183 ntTSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
GCC1Q96CN9 RHOG-202ENST00000396978 1066 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.11■■□□□ 1.45
GCC1Q96CN9 AC008105.2-201ENST00000420431 579 ntTSL 4 BASIC24.11■■□□□ 1.45
GCC1Q96CN9 MAGI2-AS3-202ENST00000422093 762 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
GCC1Q96CN9 MAGIX-206ENST00000615626 1057 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
GCC1Q96CN9 TRMT2A-203ENST00000404751 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
GCC1Q96CN9 ITPKB-202ENST00000366784 3146 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
GCC1Q96CN9 DMWD-201ENST00000270223 3305 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
GCC1Q96CN9 REPS1-203ENST00000409812 2511 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
GCC1Q96CN9 NAGPA-AS1-202ENST00000632058 2265 ntTSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
GCC1Q96CN9 SAAL1-204ENST00000529318 1503 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
GCC1Q96CN9 FAM83A-205ENST00000522648 1604 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
GCC1Q96CN9 AC138696.1-201ENST00000522452 2897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
GCC1Q96CN9 GCOM1-202ENST00000380569 1846 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
GCC1Q96CN9 EGFL7-203ENST00000371699 2125 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
GCC1Q96CN9 C10orf91-201ENST00000321248 1257 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
GCC1Q96CN9 AC035140.1-201ENST00000507957 493 ntTSL 3 BASIC24.1■■□□□ 1.45
GCC1Q96CN9 AP003097.1-201ENST00000530657 1135 ntBASIC24.1■■□□□ 1.45
GCC1Q96CN9 NDUFS3-212ENST00000534208 583 ntTSL 4 BASIC24.1■■□□□ 1.45
GCC1Q96CN9 GOLGA2P7-203ENST00000557881 896 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
GCC1Q96CN9 AC007493.2-201ENST00000568427 478 ntTSL 3 BASIC24.1■■□□□ 1.45
GCC1Q96CN9 ZNF264-205ENST00000599653 705 ntTSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
GCC1Q96CN9 GOLGA2P10-205ENST00000618267 983 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
GCC1Q96CN9 MEF2B-201ENST00000409224 1683 ntTSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
GCC1Q96CN9 SLC39A4-201ENST00000276833 2297 ntTSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
GCC1Q96CN9 TRPV3-209ENST00000576742 2766 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
GCC1Q96CN9 FGFR2-204ENST00000356226 3547 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
GCC1Q96CN9 SDHAP1-207ENST00000440850 2000 ntBASIC24.1■■□□□ 1.45
GCC1Q96CN9 MRM3-201ENST00000304478 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
GCC1Q96CN9 YPEL5-205ENST00000402708 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
GCC1Q96CN9 HCK-206ENST00000518730 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
GCC1Q96CN9 HOXD11-201ENST00000249504 1533 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.1■■□□□ 1.45
GCC1Q96CN9 MAEA-208ENST00000505839 1444 ntTSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
GCC1Q96CN9 PDCD10-201ENST00000392750 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
GCC1Q96CN9 P3H4-202ENST00000393928 2601 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
GCC1Q96CN9 TBL1Y-203ENST00000383032 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
GCC1Q96CN9 OLFM1-202ENST00000277415 1014 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
GCC1Q96CN9 CXCL3-201ENST00000296026 1075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
GCC1Q96CN9 PARL-201ENST00000311101 1240 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
GCC1Q96CN9 AC068831.2-201ENST00000448987 367 ntTSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
GCC1Q96CN9 ZNF529-AS1-202ENST00000475219 1033 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
GCC1Q96CN9 WDR86-AS1-203ENST00000480632 704 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
GCC1Q96CN9 AC122129.2-201ENST00000583598 466 ntTSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
GCC1Q96CN9 LINC00654-202ENST00000589201 579 ntTSL 3 BASIC24.09■■□□□ 1.45
GCC1Q96CN9 SYNGR4-202ENST00000595322 533 ntTSL 3 BASIC24.09■■□□□ 1.45
GCC1Q96CN9 Six3os1_6.1-201ENST00000620790 196 ntBASIC24.09■■□□□ 1.45
GCC1Q96CN9 CD24-208ENST00000622315 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
GCC1Q96CN9 AC073648.6-201ENST00000641589 218 ntBASIC24.09■■□□□ 1.45
GCC1Q96CN9 TRIM58-201ENST00000366481 3225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
GCC1Q96CN9 FBXL16-203ENST00000562563 2257 ntTSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
GCC1Q96CN9 AC012414.5-201ENST00000564214 1602 ntTSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
GCC1Q96CN9 TRIM7-205ENST00000422067 1954 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
GCC1Q96CN9 ANGPTL4-201ENST00000301455 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
GCC1Q96CN9 RPL7-202ENST00000396465 1308 ntTSL 3 BASIC24.09■■□□□ 1.45
GCC1Q96CN9 WDR37-206ENST00000620998 1303 ntTSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
GCC1Q96CN9 PITX2-203ENST00000355080 2100 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
GCC1Q96CN9 GAS6-201ENST00000327773 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
GCC1Q96CN9 NOL3-204ENST00000564053 1592 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
GCC1Q96CN9 ACBD4-207ENST00000586346 1579 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
GCC1Q96CN9 FGFR3-210ENST00000613647 4438 ntTSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
GCC1Q96CN9 ADORA2A-215ENST00000618076 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
GCC1Q96CN9 IL15-208ENST00000529613 1355 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
GCC1Q96CN9 NHLH2-201ENST00000320238 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
GCC1Q96CN9 ZNF398-202ENST00000475153 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
GCC1Q96CN9 POMC-201ENST00000264708 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
GCC1Q96CN9 ARMC10P1-201ENST00000313754 855 ntBASIC24.08■■□□□ 1.45
GCC1Q96CN9 AL109797.1-201ENST00000452501 835 ntTSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
GCC1Q96CN9 LINC01881-205ENST00000456398 1235 ntTSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
GCC1Q96CN9 AC226101.2-201ENST00000458252 747 ntTSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
GCC1Q96CN9 CA3-AS1-201ENST00000517697 559 ntTSL 4 BASIC24.08■■□□□ 1.45
GCC1Q96CN9 CERNA3-201ENST00000521403 557 ntTSL 3 BASIC24.08■■□□□ 1.45
GCC1Q96CN9 PRKY-204ENST00000533551 1019 ntBASIC24.08■■□□□ 1.45
GCC1Q96CN9 SPI1-204ENST00000533968 1290 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
GCC1Q96CN9 CDKN2A-213ENST00000579122 666 ntTSL 3 BASIC24.08■■□□□ 1.45
GCC1Q96CN9 C17orf50-201ENST00000603305 569 ntTSL 3 BASIC24.08■■□□□ 1.45
GCC1Q96CN9 C17orf50-203ENST00000605587 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
GCC1Q96CN9 CEP55-201ENST00000371485 2638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
GCC1Q96CN9 UPP1-201ENST00000331803 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
GCC1Q96CN9 SLC6A7-203ENST00000524041 2431 ntTSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.44
GCC1Q96CN9 SAMD11-211ENST00000616125 2230 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
GCC1Q96CN9 GGPS1-206ENST00000488594 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
GCC1Q96CN9 FXYD6-211ENST00000539526 2132 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.1 ms