Protein–RNA interactions for Protein: Q969F1

GTF3C6, General transcription factor 3C polypeptide 6, humanhuman

Predictions only

Length 213 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GTF3C6Q969F1 LINC00969-218ENST00000452844 583 ntTSL 3 BASIC22.61■■□□□ 1.21
GTF3C6Q969F1 LINC00969-221ENST00000457233 1279 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
GTF3C6Q969F1 PRELID2-204ENST00000505416 738 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC22.61■■□□□ 1.21
GTF3C6Q969F1 MAEA-208ENST00000505839 1444 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
GTF3C6Q969F1 AC035140.1-201ENST00000507957 493 ntTSL 3 BASIC22.61■■□□□ 1.21
GTF3C6Q969F1 KRT18P6-201ENST00000555540 1265 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
GTF3C6Q969F1 MTDHP1-201ENST00000605323 784 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
GTF3C6Q969F1 SCARF2-203ENST00000623402 3248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
GTF3C6Q969F1 ANKDD1B-204ENST00000601380 2569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
GTF3C6Q969F1 CDK18-217ENST00000506784 2143 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
GTF3C6Q969F1 ATP6V0B-213ENST00000532642 1685 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
GTF3C6Q969F1 STARD3-209ENST00000544210 1666 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
GTF3C6Q969F1 AL390860.1-201ENST00000449298 1541 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
GTF3C6Q969F1 SYTL1-201ENST00000318074 1900 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
GTF3C6Q969F1 MBD3-207ENST00000590550 2782 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
GTF3C6Q969F1 ORAI2-204ENST00000473939 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
GTF3C6Q969F1 KLHL2-201ENST00000226725 3134 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
GTF3C6Q969F1 ABCC6-209ENST00000640696 1893 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
GTF3C6Q969F1 CPZ-202ENST00000360986 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
GTF3C6Q969F1 AKT1-211ENST00000554848 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
GTF3C6Q969F1 TUBA3FP-202ENST00000422086 1974 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
GTF3C6Q969F1 CCT5-214ENST00000515676 1997 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
GTF3C6Q969F1 LAD1-202ENST00000391967 2906 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
GTF3C6Q969F1 CD8B-203ENST00000390655 1417 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
GTF3C6Q969F1 CACNA2D1-203ENST00000423588 1429 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
GTF3C6Q969F1 AC093503.3-201ENST00000624917 2352 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
GTF3C6Q969F1 PDLIM2-204ENST00000397760 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
GTF3C6Q969F1 RNF135-204ENST00000443677 1261 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
GTF3C6Q969F1 LINC00894-209ENST00000458274 547 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
GTF3C6Q969F1 PRKY-204ENST00000533551 1019 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
GTF3C6Q969F1 TRAPPC5-203ENST00000595985 411 ntTSL 3 BASIC22.6■■□□□ 1.21
GTF3C6Q969F1 FP475955.1-201ENST00000624937 553 ntTSL 4 BASIC22.6■■□□□ 1.21
GTF3C6Q969F1 VWA8-AS1-201ENST00000611103 2079 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
GTF3C6Q969F1 RTN4-201ENST00000317610 2333 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
GTF3C6Q969F1 SNAPC2-201ENST00000221573 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
GTF3C6Q969F1 NOP56-201ENST00000329276 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
GTF3C6Q969F1 CIDEB-202ENST00000336557 2409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
GTF3C6Q969F1 SLC16A3-221ENST00000617373 2048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
GTF3C6Q969F1 SLC16A3-222ENST00000619321 2015 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
GTF3C6Q969F1 BCR-202ENST00000359540 4708 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
GTF3C6Q969F1 SLC25A20-201ENST00000319017 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
GTF3C6Q969F1 MLST8-232ENST00000569417 1870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
GTF3C6Q969F1 DIO3-201ENST00000510508 2102 ntAPPRIS P1 BASIC22.6■■□□□ 1.21
GTF3C6Q969F1 CYHR1-202ENST00000403000 1477 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
GTF3C6Q969F1 NBPF21P-201ENST00000425093 1451 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
GTF3C6Q969F1 NAT6-204ENST00000443094 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
GTF3C6Q969F1 AC010173.1-201ENST00000549023 1453 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
GTF3C6Q969F1 ACD-202ENST00000393919 1974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
GTF3C6Q969F1 DDAH2-211ENST00000375787 1330 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
GTF3C6Q969F1 DDX31-206ENST00000480876 1333 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
GTF3C6Q969F1 TSG101-201ENST00000251968 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
GTF3C6Q969F1 GMPPA-203ENST00000358215 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
GTF3C6Q969F1 HMGA1-205ENST00000447654 2159 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
GTF3C6Q969F1 CMTM7-201ENST00000334983 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
GTF3C6Q969F1 MGAT5B-201ENST00000301618 4486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
GTF3C6Q969F1 SYNDIG1L-201ENST00000331628 2607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
GTF3C6Q969F1 FGF2-201ENST00000264498 6775 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
GTF3C6Q969F1 B4GALT1-202ENST00000535206 1535 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
GTF3C6Q969F1 PFN3-201ENST00000358571 530 ntAPPRIS P1 BASIC22.59■■□□□ 1.21
GTF3C6Q969F1 SDCBP-204ENST00000447182 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
GTF3C6Q969F1 MCRIP1-201ENST00000455127 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
GTF3C6Q969F1 TMEM9-209ENST00000485839 938 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
GTF3C6Q969F1 JOSD2-202ENST00000595669 733 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
GTF3C6Q969F1 SLC6A6-208ENST00000621751 1252 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
GTF3C6Q969F1 PGAP3-206ENST00000579146 2220 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
GTF3C6Q969F1 USP25-202ENST00000285681 5216 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
GTF3C6Q969F1 SLC47A1-202ENST00000395585 1998 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
GTF3C6Q969F1 ABI3-202ENST00000419580 1718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
GTF3C6Q969F1 LINC01586-201ENST00000506090 1840 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
GTF3C6Q969F1 KIF1BP-201ENST00000361983 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
GTF3C6Q969F1 MAPKAPK2-202ENST00000367103 2961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
GTF3C6Q969F1 UBL4A-202ENST00000369660 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
GTF3C6Q969F1 ZNF394-203ENST00000426306 2017 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
GTF3C6Q969F1 AATK-AS1-203ENST00000637878 1306 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
GTF3C6Q969F1 PTH2R-204ENST00000617735 2472 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
GTF3C6Q969F1 TEPSIN-213ENST00000637944 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
GTF3C6Q969F1 NDOR1-203ENST00000427047 2315 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
GTF3C6Q969F1 SLC22A18-202ENST00000347936 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
GTF3C6Q969F1 MAPK9-208ENST00000455781 4336 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
GTF3C6Q969F1 PEX16-210ENST00000532681 1639 ntTSL 3 BASIC22.58■■□□□ 1.21
GTF3C6Q969F1 FNIP1-204ENST00000511848 1720 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
GTF3C6Q969F1 MMAB-206ENST00000540016 945 ntTSL 3 BASIC22.58■■□□□ 1.21
GTF3C6Q969F1 CMTM3-207ENST00000564060 824 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
GTF3C6Q969F1 CMTM3-211ENST00000565922 615 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
GTF3C6Q969F1 NOXO1-205ENST00000566005 1144 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
GTF3C6Q969F1 IL15RA-222ENST00000622442 1160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
GTF3C6Q969F1 C20orf204-205ENST00000636176 961 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
GTF3C6Q969F1 SPON2-203ENST00000431380 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
GTF3C6Q969F1 TRAPPC5-204ENST00000596148 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
GTF3C6Q969F1 MPZL1-201ENST00000359523 5010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
GTF3C6Q969F1 SNX18-203ENST00000381410 5218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
GTF3C6Q969F1 KMT5B-203ENST00000401547 2666 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
GTF3C6Q969F1 FOXP4-205ENST00000409208 3341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.2
GTF3C6Q969F1 SIX5-203ENST00000560168 1975 ntTSL 4 BASIC22.58■■□□□ 1.2
GTF3C6Q969F1 NOTCH2NL-204ENST00000579793 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.2
GTF3C6Q969F1 DACT2-204ENST00000610183 2088 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
GTF3C6Q969F1 IDUA-201ENST00000247933 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
GTF3C6Q969F1 CEACAM3-202ENST00000357396 1316 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
GTF3C6Q969F1 MGARP-201ENST00000398955 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
GTF3C6Q969F1 COMMD7-202ENST00000446419 1343 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.3 ms