Protein–RNA interactions for Protein: Q92576

PHF3, PHD finger protein 3, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 2,039 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PHF3Q92576 PDLIM3-212ENST00000620787 2352 ntTSL 4 BASIC17.46■□□□□ 0.39
PHF3Q92576 PRMT2-206ENST00000397638 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
PHF3Q92576 KCTD1-202ENST00000408011 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
PHF3Q92576 AC007952.6-201ENST00000573168 2673 ntBASIC17.46■□□□□ 0.39
PHF3Q92576 AC003957.1-201ENST00000625108 2673 ntBASIC17.46■□□□□ 0.39
PHF3Q92576 ST3GAL5-222ENST00000638572 4431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.38
PHF3Q92576 SNAPC2-201ENST00000221573 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.38
PHF3Q92576 CRTC1-203ENST00000594658 2384 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
PHF3Q92576 AC044802.1-201ENST00000501143 2894 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
PHF3Q92576 ESX1-201ENST00000372588 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
PHF3Q92576 NUDT8-201ENST00000301490 809 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
PHF3Q92576 TERF1P1-201ENST00000311003 1181 ntBASIC17.45■□□□□ 0.38
PHF3Q92576 LY6E-214ENST00000522971 857 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
PHF3Q92576 CIRBP-217ENST00000588230 1013 ntTSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
PHF3Q92576 SMIM8-209ENST00000608868 815 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
PHF3Q92576 ANKRD54-211ENST00000609454 825 ntTSL 3 BASIC17.45■□□□□ 0.38
PHF3Q92576 EZH2-201ENST00000320356 2639 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
PHF3Q92576 PNMA2-204ENST00000522362 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
PHF3Q92576 PAQR4-203ENST00000572687 2251 ntTSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
PHF3Q92576 RAVER2-201ENST00000294428 4398 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
PHF3Q92576 SLC11A2-208ENST00000546743 1740 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
PHF3Q92576 SLC25A3-211ENST00000548847 1369 ntTSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
PHF3Q92576 DOCK9-206ENST00000427887 4176 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
PHF3Q92576 CLIP3-206ENST00000593074 2080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
PHF3Q92576 GIPR-202ENST00000304207 1432 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
PHF3Q92576 SYNE4-202ENST00000340477 1004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
PHF3Q92576 PRICKLE4-202ENST00000394260 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
PHF3Q92576 PRICKLE4-203ENST00000394263 1155 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
PHF3Q92576 UBB-203ENST00000395839 1012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
PHF3Q92576 POLI-202ENST00000406285 2030 ntTSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
PHF3Q92576 TUBB8P6-201ENST00000436895 1288 ntBASIC17.45■□□□□ 0.38
PHF3Q92576 AC097488.1-201ENST00000507834 756 ntBASIC17.45■□□□□ 0.38
PHF3Q92576 IKBKB-210ENST00000518983 447 ntTSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
PHF3Q92576 AC073508.3-201ENST00000619697 1419 ntBASIC17.45■□□□□ 0.38
PHF3Q92576 RPS27A-211ENST00000639844 606 ntTSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
PHF3Q92576 RDH13-203ENST00000415061 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
PHF3Q92576 TMEM223-201ENST00000307366 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
PHF3Q92576 AL035541.1-201ENST00000424850 823 ntTSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
PHF3Q92576 FAM86C1-203ENST00000426628 952 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
PHF3Q92576 DNAJC27-AS1-204ENST00000428614 780 ntTSL 3 BASIC17.44■□□□□ 0.38
PHF3Q92576 CCDC124-201ENST00000445755 938 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
PHF3Q92576 B3GAT3P1-201ENST00000471720 806 ntBASIC17.44■□□□□ 0.38
PHF3Q92576 AC103855.2-201ENST00000533315 573 ntTSL 4 BASIC17.44■□□□□ 0.38
PHF3Q92576 AC015712.4-203ENST00000559673 630 ntTSL 3 BASIC17.44■□□□□ 0.38
PHF3Q92576 CCDC124-203ENST00000597436 1055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
PHF3Q92576 CD37-204ENST00000535669 1674 ntTSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
PHF3Q92576 SAXO1-202ENST00000380534 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
PHF3Q92576 FOXC2-201ENST00000320354 2478 ntAPPRIS P1 BASIC17.44■□□□□ 0.38
PHF3Q92576 LRP8-204ENST00000371454 3322 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
PHF3Q92576 HDAC1-201ENST00000373548 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
PHF3Q92576 SPOCK3-215ENST00000510741 1963 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
PHF3Q92576 KRT16P6-202ENST00000425692 1426 ntBASIC17.44■□□□□ 0.38
PHF3Q92576 SAE1-201ENST00000270225 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
PHF3Q92576 MFSD1-219ENST00000622669 2361 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
PHF3Q92576 LRRC23-202ENST00000323702 1208 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
PHF3Q92576 DUSP23-203ENST00000368109 729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
PHF3Q92576 DHRS4L2-202ENST00000397071 1117 ntTSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
PHF3Q92576 ZNF337-AS1-204ENST00000428254 817 ntTSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
PHF3Q92576 NCF1B-202ENST00000432102 930 ntTSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
PHF3Q92576 AC126696.3-202ENST00000570159 553 ntTSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
PHF3Q92576 BRSK1-201ENST00000309383 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
PHF3Q92576 FAM129C-201ENST00000332386 2222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
PHF3Q92576 EOMES-202ENST00000449599 2829 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
PHF3Q92576 LEFTY2-202ENST00000420304 2085 ntTSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
PHF3Q92576 SOCS2-207ENST00000549206 2072 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.43■□□□□ 0.38
PHF3Q92576 RTN4-207ENST00000402434 1456 ntTSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
PHF3Q92576 PSMD8-201ENST00000215071 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
PHF3Q92576 SLC25A15-201ENST00000338625 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
PHF3Q92576 WWOX-202ENST00000402655 1594 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
PHF3Q92576 CYP2A7-201ENST00000291764 2128 ntTSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
PHF3Q92576 SLC52A2-209ENST00000530047 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
PHF3Q92576 FXR2-201ENST00000250113 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
PHF3Q92576 FAM76B-204ENST00000536839 2546 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
PHF3Q92576 STMN3-201ENST00000370053 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
PHF3Q92576 POMZP3-201ENST00000275569 1259 ntTSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
PHF3Q92576 NDUFA13-201ENST00000428459 576 ntTSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
PHF3Q92576 KRT18P16-201ENST00000510337 1294 ntBASIC17.43■□□□□ 0.38
PHF3Q92576 CFL2-205ENST00000555765 632 ntTSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
PHF3Q92576 NAPSB-206ENST00000562112 1266 ntBASIC17.43■□□□□ 0.38
PHF3Q92576 MZF1-203ENST00000594234 2385 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
PHF3Q92576 CYP21A2-222ENST00000435122 1914 ntTSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
PHF3Q92576 AC107959.1-202ENST00000502083 1945 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
PHF3Q92576 MED25-201ENST00000312865 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
PHF3Q92576 RAC1-201ENST00000348035 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
PHF3Q92576 Z82202.1-201ENST00000623446 1880 ntBASIC17.43■□□□□ 0.38
PHF3Q92576 CNNM4-201ENST00000377075 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
PHF3Q92576 SYT15-205ENST00000503753 1331 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
PHF3Q92576 C14orf79-202ENST00000547315 2370 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
PHF3Q92576 RAD23A-203ENST00000586534 1746 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
PHF3Q92576 TRMU-201ENST00000290846 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
PHF3Q92576 RAB5C-202ENST00000393860 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
PHF3Q92576 AC087482.1-204ENST00000636067 2431 ntTSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
PHF3Q92576 TM7SF3-201ENST00000343028 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
PHF3Q92576 NT5C1A-201ENST00000235628 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
PHF3Q92576 C1orf50-201ENST00000372525 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
PHF3Q92576 MESTP1-201ENST00000404287 994 ntBASIC17.42■□□□□ 0.38
PHF3Q92576 AC103564.1-201ENST00000437330 562 ntTSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
PHF3Q92576 ATP6V0E1-204ENST00000519911 718 ntTSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
PHF3Q92576 PNKP-207ENST00000596014 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
PHF3Q92576 DOK1-201ENST00000233668 2555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.1 ms