Protein–RNA interactions for Protein: Q92542

NCSTN, Nicastrin, humanhuman

Predictions only

Length 709 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NCSTNQ92542 CTAG2-201ENST00000247306 993 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
NCSTNQ92542 PFN3-201ENST00000358571 530 ntAPPRIS P1 BASIC19.2■□□□□ 0.66
NCSTNQ92542 TREX2-204ENST00000370212 861 ntTSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
NCSTNQ92542 TREX2-205ENST00000370231 1255 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
NCSTNQ92542 USF2-203ENST00000379134 648 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
NCSTNQ92542 POMC-202ENST00000380794 1295 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.2■□□□□ 0.66
NCSTNQ92542 TREX2-207ENST00000393862 907 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.2■□□□□ 0.66
NCSTNQ92542 GXYLT1P3-201ENST00000453058 1193 ntBASIC19.2■□□□□ 0.66
NCSTNQ92542 CXCL2-202ENST00000508487 1218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
NCSTNQ92542 MOK-228ENST00000523231 1114 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
NCSTNQ92542 CAPN5-206ENST00000531028 534 ntTSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
NCSTNQ92542 LINC02167-201ENST00000562769 594 ntTSL 3 BASIC19.2■□□□□ 0.66
NCSTNQ92542 AC009093.4-201ENST00000567984 561 ntTSL 4 BASIC19.2■□□□□ 0.66
NCSTNQ92542 AC113410.3-201ENST00000623366 203 ntBASIC19.2■□□□□ 0.66
NCSTNQ92542 REST-211ENST00000640168 1268 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
NCSTNQ92542 CDK11B-207ENST00000626918 2457 ntTSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
NCSTNQ92542 BABAM1-208ENST00000598188 1470 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
NCSTNQ92542 TMEM218-213ENST00000531909 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
NCSTNQ92542 CIRBP-225ENST00000589710 1835 ntTSL 2 BASIC19.2■□□□□ 0.66
NCSTNQ92542 LTB4R2-202ENST00000528054 3092 ntBASIC19.2■□□□□ 0.66
NCSTNQ92542 AC005332.8-201ENST00000622750 2735 ntBASIC19.2■□□□□ 0.66
NCSTNQ92542 COLEC12-201ENST00000400256 5742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
NCSTNQ92542 RALGPS1-204ENST00000373436 1667 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
NCSTNQ92542 HTR7P1-201ENST00000538670 1336 ntBASIC19.2■□□□□ 0.66
NCSTNQ92542 STRN3-202ENST00000357479 2799 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
NCSTNQ92542 KCNN2-207ENST00000610748 2091 ntTSL 3 BASIC19.2■□□□□ 0.66
NCSTNQ92542 KRT1-201ENST00000252244 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
NCSTNQ92542 CTU2-210ENST00000567949 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
NCSTNQ92542 ZNF561-AS1-201ENST00000585797 1593 ntTSL 2 BASIC19.19■□□□□ 0.66
NCSTNQ92542 CYTH1-209ENST00000589296 2159 ntTSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
NCSTNQ92542 FAM83A-205ENST00000522648 1604 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
NCSTNQ92542 TMEM250-201ENST00000418388 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
NCSTNQ92542 C1QBP-201ENST00000225698 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
NCSTNQ92542 AKR1A1-201ENST00000351829 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
NCSTNQ92542 SNX5-213ENST00000486039 602 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
NCSTNQ92542 FOXN3-AS1-201ENST00000555562 1077 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
NCSTNQ92542 C17orf62-238ENST00000585064 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.19■□□□□ 0.66
NCSTNQ92542 AC004264.1-201ENST00000608354 794 ntBASIC19.19■□□□□ 0.66
NCSTNQ92542 CDH5-202ENST00000539168 1672 ntTSL 2 BASIC19.19■□□□□ 0.66
NCSTNQ92542 CSPG5-201ENST00000264723 4080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
NCSTNQ92542 PPM1G-201ENST00000344034 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
NCSTNQ92542 MCEMP1-201ENST00000333598 1730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
NCSTNQ92542 DDRGK1-201ENST00000354488 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
NCSTNQ92542 C19orf84-202ENST00000574814 1318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
NCSTNQ92542 CPNE9-202ENST00000383831 1751 ntTSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
NCSTNQ92542 TP53RK-201ENST00000372102 2012 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
NCSTNQ92542 RHOA-202ENST00000418115 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
NCSTNQ92542 ST3GAL4-204ENST00000444328 1812 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
NCSTNQ92542 DOK4-218ENST00000569548 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
NCSTNQ92542 CWH43-201ENST00000226432 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
NCSTNQ92542 KRT18-202ENST00000388837 1420 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
NCSTNQ92542 NHLH2-201ENST00000320238 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
NCSTNQ92542 UTP4-201ENST00000314423 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
NCSTNQ92542 FLCN-203ENST00000389169 1692 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
NCSTNQ92542 ADORA2A-201ENST00000337539 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
NCSTNQ92542 DIAPH1-203ENST00000389057 5762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
NCSTNQ92542 ILKAP-201ENST00000254654 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
NCSTNQ92542 CBX1-202ENST00000393408 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
NCSTNQ92542 CMTM8-201ENST00000307526 1174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
NCSTNQ92542 TSTD1-202ENST00000368023 574 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.18■□□□□ 0.66
NCSTNQ92542 TSPAN14-205ENST00000372158 1095 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
NCSTNQ92542 TMSB4X-201ENST00000380633 495 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.18■□□□□ 0.66
NCSTNQ92542 CALM3-202ENST00000391918 702 ntTSL 2 BASIC19.18■□□□□ 0.66
NCSTNQ92542 GPSM1-203ENST00000392944 1111 ntTSL 3 BASIC19.18■□□□□ 0.66
NCSTNQ92542 HDAC11-205ENST00000404548 577 ntTSL 4 BASIC19.18■□□□□ 0.66
NCSTNQ92542 LIME1-205ENST00000480139 819 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.18■□□□□ 0.66
NCSTNQ92542 IAH1-215ENST00000497473 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
NCSTNQ92542 ASPHD2-201ENST00000215906 3357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
NCSTNQ92542 C2orf54-201ENST00000307486 2017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
NCSTNQ92542 RAB34-201ENST00000301043 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
NCSTNQ92542 RBM26-207ENST00000622611 5230 ntTSL 2 BASIC19.18■□□□□ 0.66
NCSTNQ92542 IGFALS-201ENST00000215539 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
NCSTNQ92542 SAMD3-202ENST00000368134 2377 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.18■□□□□ 0.66
NCSTNQ92542 NOS1AP-206ENST00000530878 2894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
NCSTNQ92542 BANP-223ENST00000538234 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
NCSTNQ92542 CPNE7-201ENST00000268720 2657 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
NCSTNQ92542 PLBD1-201ENST00000240617 2426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
NCSTNQ92542 KSR1-205ENST00000509603 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
NCSTNQ92542 OGG1-203ENST00000302036 2220 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
NCSTNQ92542 CEP78-201ENST00000277082 2542 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.17■□□□□ 0.66
NCSTNQ92542 TBX2-201ENST00000240328 3339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
NCSTNQ92542 KCNQ5-207ENST00000403813 6539 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
NCSTNQ92542 VMAC-201ENST00000339485 2254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
NCSTNQ92542 BST1-201ENST00000265016 1480 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
NCSTNQ92542 SNX32-201ENST00000308342 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
NCSTNQ92542 EFS-201ENST00000216733 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
NCSTNQ92542 NES-201ENST00000368223 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
NCSTNQ92542 MAP2K5-203ENST00000354498 1783 ntTSL 2 BASIC19.17■□□□□ 0.66
NCSTNQ92542 SAAL1-204ENST00000529318 1503 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
NCSTNQ92542 SNAP47-202ENST00000366759 2362 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
NCSTNQ92542 AC093503.3-201ENST00000624917 2352 ntBASIC19.17■□□□□ 0.66
NCSTNQ92542 CLN8-208ENST00000635751 1807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
NCSTNQ92542 ATP5D-201ENST00000215375 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
NCSTNQ92542 TCTEX1D2-201ENST00000325318 673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
NCSTNQ92542 VMO1-201ENST00000328739 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
NCSTNQ92542 MRGPRG-201ENST00000332314 870 ntAPPRIS P1 BASIC19.17■□□□□ 0.66
NCSTNQ92542 BCL7B-206ENST00000455335 985 ntTSL 3 BASIC19.17■□□□□ 0.66
NCSTNQ92542 AC004080.6-201ENST00000467897 919 ntTSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
NCSTNQ92542 GCFC2-207ENST00000470503 1066 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
NCSTNQ92542 SBF2-AS1-202ENST00000499953 854 ntTSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.1 ms