Protein–RNA interactions for Protein: Q8WWF3

SSMEM1, Serine-rich single-pass membrane protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 244 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SSMEM1Q8WWF3 DRD5-201ENST00000304374 2330 ntAPPRIS P1 BASIC16.02■□□□□ 0.15
SSMEM1Q8WWF3 PRSS33-204ENST00000576886 1755 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
SSMEM1Q8WWF3 ILKAP-201ENST00000254654 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
SSMEM1Q8WWF3 GNAI1-201ENST00000351004 3347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
SSMEM1Q8WWF3 C5orf47-201ENST00000340147 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
SSMEM1Q8WWF3 RTN1-202ENST00000342503 1703 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
SSMEM1Q8WWF3 ZNF821-211ENST00000564134 1748 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
SSMEM1Q8WWF3 SPNS1-201ENST00000311008 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
SSMEM1Q8WWF3 TEX45-201ENST00000361664 1679 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
SSMEM1Q8WWF3 PPP5C-202ENST00000391919 1929 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
SSMEM1Q8WWF3 TLE3-214ENST00000558939 6004 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
SSMEM1Q8WWF3 ZNF12-204ENST00000405858 5051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
SSMEM1Q8WWF3 KCNMA1-278ENST00000640141 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
SSMEM1Q8WWF3 INTS11-202ENST00000411962 1832 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
SSMEM1Q8WWF3 AC124283.5-201ENST00000624661 1809 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
SSMEM1Q8WWF3 PHF2-202ENST00000375376 3045 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
SSMEM1Q8WWF3 COMMD7-202ENST00000446419 1343 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
SSMEM1Q8WWF3 C19orf84-202ENST00000574814 1318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
SSMEM1Q8WWF3 PFN3-201ENST00000358571 530 ntAPPRIS P1 BASIC16.01■□□□□ 0.15
SSMEM1Q8WWF3 DNTTIP1-201ENST00000372622 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
SSMEM1Q8WWF3 ZFYVE1-202ENST00000394207 1183 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
SSMEM1Q8WWF3 YBEY-205ENST00000397694 534 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
SSMEM1Q8WWF3 ELAVL3-202ENST00000438662 1223 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
SSMEM1Q8WWF3 RNF135-204ENST00000443677 1261 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
SSMEM1Q8WWF3 NELFE-206ENST00000444811 1202 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
SSMEM1Q8WWF3 AC004080.6-201ENST00000467897 919 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
SSMEM1Q8WWF3 AC019257.1-201ENST00000517676 557 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
SSMEM1Q8WWF3 CBLN3-202ENST00000555436 718 ntTSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
SSMEM1Q8WWF3 PNN-205ENST00000556530 601 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
SSMEM1Q8WWF3 UBL5-202ENST00000586895 432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
SSMEM1Q8WWF3 REXO1L12P-201ENST00000622156 912 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
SSMEM1Q8WWF3 AC113410.3-201ENST00000623366 203 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
SSMEM1Q8WWF3 IL11RA-201ENST00000318041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
SSMEM1Q8WWF3 SPATA22-210ENST00000573128 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
SSMEM1Q8WWF3 NSDHL-201ENST00000370274 1929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
SSMEM1Q8WWF3 RBM15B-201ENST00000563281 6641 ntAPPRIS P1 BASIC16.01■□□□□ 0.15
SSMEM1Q8WWF3 ACTR5-201ENST00000243903 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
SSMEM1Q8WWF3 EIF4E3-201ENST00000295612 2764 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
SSMEM1Q8WWF3 MPV17L2-204ENST00000599612 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
SSMEM1Q8WWF3 UBTF-203ENST00000393606 2683 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
SSMEM1Q8WWF3 NOP56-201ENST00000329276 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SSMEM1Q8WWF3 MFSD1-219ENST00000622669 2361 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SSMEM1Q8WWF3 LRCH4-201ENST00000310300 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SSMEM1Q8WWF3 SENP6-202ENST00000370010 4644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SSMEM1Q8WWF3 BACE1-203ENST00000428381 1333 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SSMEM1Q8WWF3 SPHK2-211ENST00000600537 2136 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
SSMEM1Q8WWF3 GAS2L1-208ENST00000616432 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SSMEM1Q8WWF3 DDX59-201ENST00000331314 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SSMEM1Q8WWF3 HTRA4-201ENST00000302495 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SSMEM1Q8WWF3 C17orf58-204ENST00000580729 2065 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
SSMEM1Q8WWF3 PRDM11-201ENST00000424263 1858 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
SSMEM1Q8WWF3 MSGN1-201ENST00000281047 606 ntAPPRIS P1 BASIC16■□□□□ 0.15
SSMEM1Q8WWF3 CMTM8-201ENST00000307526 1174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SSMEM1Q8WWF3 FAM26F-202ENST00000368605 1117 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
SSMEM1Q8WWF3 TSPAN14-205ENST00000372158 1095 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
SSMEM1Q8WWF3 SMIM1-201ENST00000444870 546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SSMEM1Q8WWF3 STXBP1-203ENST00000476182 566 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
SSMEM1Q8WWF3 LIME1-205ENST00000480139 819 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
SSMEM1Q8WWF3 BX088651.1-201ENST00000540551 451 ntBASIC16■□□□□ 0.15
SSMEM1Q8WWF3 AC007786.1-201ENST00000587859 709 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
SSMEM1Q8WWF3 Six3os1_6.1-201ENST00000620790 196 ntBASIC16■□□□□ 0.15
SSMEM1Q8WWF3 RTKN-201ENST00000233330 2220 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SSMEM1Q8WWF3 KCNC3-203ENST00000477616 3176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SSMEM1Q8WWF3 MFSD10-206ENST00000508221 1639 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
SSMEM1Q8WWF3 AC125437.2-201ENST00000625180 2167 ntBASIC16■□□□□ 0.15
SSMEM1Q8WWF3 TMEM255B-202ENST00000375353 6100 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SSMEM1Q8WWF3 LPAR2-202ENST00000542587 2546 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
SSMEM1Q8WWF3 S1PR5-201ENST00000333430 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SSMEM1Q8WWF3 WIPI2-203ENST00000401525 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SSMEM1Q8WWF3 AC018445.3-201ENST00000624177 1945 ntBASIC16■□□□□ 0.15
SSMEM1Q8WWF3 IKZF1-209ENST00000438033 1748 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
SSMEM1Q8WWF3 LBX2-AS1-202ENST00000603175 2083 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
SSMEM1Q8WWF3 PLEKHG5-212ENST00000537245 4794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
SSMEM1Q8WWF3 FA2H-201ENST00000219368 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
SSMEM1Q8WWF3 THOP1-202ENST00000395212 1877 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
SSMEM1Q8WWF3 FAM129C-201ENST00000332386 2222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
SSMEM1Q8WWF3 SEPT11-201ENST00000264893 5593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
SSMEM1Q8WWF3 DDRGK1-201ENST00000354488 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
SSMEM1Q8WWF3 HTR7P1-201ENST00000538670 1336 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
SSMEM1Q8WWF3 TXNL1-211ENST00000590954 1339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
SSMEM1Q8WWF3 ATP6V0B-213ENST00000532642 1685 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
SSMEM1Q8WWF3 IL17RC-202ENST00000383812 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
SSMEM1Q8WWF3 IL17RC-203ENST00000403601 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
SSMEM1Q8WWF3 CDC42EP1-201ENST00000249014 2181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
SSMEM1Q8WWF3 GNS-208ENST00000543646 2164 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
SSMEM1Q8WWF3 BACE1-209ENST00000513780 1465 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
SSMEM1Q8WWF3 FGFR2-208ENST00000360144 3001 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
SSMEM1Q8WWF3 CLINT1-207ENST00000523908 2346 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
SSMEM1Q8WWF3 SLC35A3-222ENST00000640715 1989 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
SSMEM1Q8WWF3 PTBP1P-201ENST00000554374 1601 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
SSMEM1Q8WWF3 WDR25-201ENST00000335290 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
SSMEM1Q8WWF3 TSTD1-202ENST00000368023 574 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
SSMEM1Q8WWF3 POMC-202ENST00000380794 1295 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
SSMEM1Q8WWF3 GPSM1-203ENST00000392944 1111 ntTSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
SSMEM1Q8WWF3 ARF3-208ENST00000541959 807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
SSMEM1Q8WWF3 SUMO2-203ENST00000578238 490 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
SSMEM1Q8WWF3 AC005943.1-201ENST00000585937 1002 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
SSMEM1Q8WWF3 PRKACA-209ENST00000590853 1101 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
SSMEM1Q8WWF3 CEP55-201ENST00000371485 2638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
SSMEM1Q8WWF3 IMPDH1-214ENST00000496200 2283 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.7 ms