Protein–RNA interactions for Protein: Q8NFY4

SEMA6D, Semaphorin-6D, humanhuman

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Length 1,073 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SEMA6DQ8NFY4 PPFIA1-202ENST00000389547 4133 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
SEMA6DQ8NFY4 SHANK1-202ENST00000359082 6459 ntTSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
SEMA6DQ8NFY4 VSTM2B-201ENST00000335523 1488 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
SEMA6DQ8NFY4 FAM206A-201ENST00000322940 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
SEMA6DQ8NFY4 NPY-202ENST00000405982 565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
SEMA6DQ8NFY4 AC114730.2-201ENST00000417267 668 ntTSL 3 BASIC16.89■□□□□ 0.29
SEMA6DQ8NFY4 SGO1-AS1-202ENST00000448208 819 ntTSL 3 BASIC16.89■□□□□ 0.29
SEMA6DQ8NFY4 GATS-209ENST00000454084 1030 ntTSL 3 BASIC16.89■□□□□ 0.29
SEMA6DQ8NFY4 AC007161.3-201ENST00000469183 637 ntTSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
SEMA6DQ8NFY4 TMEM191C-212ENST00000536718 480 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
SEMA6DQ8NFY4 AC089999.2-201ENST00000552525 248 ntTSL 3 BASIC16.89■□□□□ 0.29
SEMA6DQ8NFY4 ANP32AP1-202ENST00000560832 1074 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
SEMA6DQ8NFY4 LINC00304-202ENST00000562248 1095 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
SEMA6DQ8NFY4 GOSR2-208ENST00000573224 1115 ntTSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
SEMA6DQ8NFY4 USP36-216ENST00000589424 970 ntTSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
SEMA6DQ8NFY4 AC073648.6-201ENST00000641589 218 ntBASIC16.89■□□□□ 0.29
SEMA6DQ8NFY4 PCMT1-203ENST00000367384 1938 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
SEMA6DQ8NFY4 MICU2-201ENST00000382374 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
SEMA6DQ8NFY4 FAM239A-202ENST00000438107 2155 ntTSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
SEMA6DQ8NFY4 ANXA8L1-201ENST00000584982 2174 ntTSL 2 BASIC16.89■□□□□ 0.29
SEMA6DQ8NFY4 AL032819.2-201ENST00000624543 2162 ntBASIC16.89■□□□□ 0.29
SEMA6DQ8NFY4 ZNF582-207ENST00000619584 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
SEMA6DQ8NFY4 BABAM1-213ENST00000601043 1366 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.89■□□□□ 0.29
SEMA6DQ8NFY4 PAIP1-201ENST00000306846 2782 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
SEMA6DQ8NFY4 MTX1-202ENST00000368376 1632 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
SEMA6DQ8NFY4 FGFR2-208ENST00000360144 3001 ntTSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
SEMA6DQ8NFY4 RND1-201ENST00000309739 1681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
SEMA6DQ8NFY4 BIRC2-206ENST00000530675 1927 ntTSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
SEMA6DQ8NFY4 UBTF-203ENST00000393606 2683 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
SEMA6DQ8NFY4 MORF4L1-215ENST00000559345 1468 ntTSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
SEMA6DQ8NFY4 CHAC1-205ENST00000617961 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
SEMA6DQ8NFY4 FOXD4-201ENST00000382500 1974 ntAPPRIS P1 BASIC16.88■□□□□ 0.29
SEMA6DQ8NFY4 LARGE2-202ENST00000401752 2516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
SEMA6DQ8NFY4 KRT78-201ENST00000304620 1778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
SEMA6DQ8NFY4 SYNGR1-201ENST00000216155 497 ntTSL 3 BASIC16.88■□□□□ 0.29
SEMA6DQ8NFY4 ARL2-201ENST00000246747 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
SEMA6DQ8NFY4 CDC42EP5-201ENST00000301200 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
SEMA6DQ8NFY4 RPS14-201ENST00000312037 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
SEMA6DQ8NFY4 SYNE2-201ENST00000341472 1132 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
SEMA6DQ8NFY4 PPP1R14A-202ENST00000347262 637 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
SEMA6DQ8NFY4 PYCR3-202ENST00000377579 985 ntTSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
SEMA6DQ8NFY4 HOXD12-201ENST00000404162 841 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
SEMA6DQ8NFY4 FAM131A-208ENST00000453072 1038 ntTSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
SEMA6DQ8NFY4 GNB5-211ENST00000560116 918 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
SEMA6DQ8NFY4 MAGIX-206ENST00000615626 1057 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
SEMA6DQ8NFY4 HLA-B-256ENST00000639848 1089 ntBASIC16.88■□□□□ 0.29
SEMA6DQ8NFY4 HCG11-201ENST00000411553 5696 ntBASIC16.88■□□□□ 0.29
SEMA6DQ8NFY4 FBLN7-202ENST00000331203 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
SEMA6DQ8NFY4 CAPZB-202ENST00000264203 2068 ntTSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
SEMA6DQ8NFY4 MEN1-206ENST00000377321 2614 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
SEMA6DQ8NFY4 AP000974.1-201ENST00000623909 2387 ntBASIC16.88■□□□□ 0.29
SEMA6DQ8NFY4 CADPS2-201ENST00000313070 6065 ntTSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
SEMA6DQ8NFY4 MEN1-208ENST00000394374 3155 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
SEMA6DQ8NFY4 CREG2-201ENST00000324768 6383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
SEMA6DQ8NFY4 IKBKG-207ENST00000611071 2103 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
SEMA6DQ8NFY4 SLC29A4-202ENST00000396872 5685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
SEMA6DQ8NFY4 SNN-201ENST00000329565 3312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
SEMA6DQ8NFY4 CHMP6-201ENST00000325167 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
SEMA6DQ8NFY4 TMEM230-207ENST00000379286 1735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
SEMA6DQ8NFY4 CERS5-203ENST00000422340 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
SEMA6DQ8NFY4 CDHR5-201ENST00000349570 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
SEMA6DQ8NFY4 ECE1-205ENST00000436918 2328 ntTSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
SEMA6DQ8NFY4 CELF6-205ENST00000567083 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
SEMA6DQ8NFY4 FAR2P2-204ENST00000424873 2070 ntTSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
SEMA6DQ8NFY4 PRSS12-201ENST00000296498 4809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
SEMA6DQ8NFY4 TMEM235-201ENST00000374946 2409 ntTSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
SEMA6DQ8NFY4 PTPN12-201ENST00000248594 3406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
SEMA6DQ8NFY4 ACTL6A-201ENST00000392662 1899 ntTSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
SEMA6DQ8NFY4 SKP2-208ENST00000546211 1589 ntTSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
SEMA6DQ8NFY4 SNTB2-201ENST00000336278 9789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
SEMA6DQ8NFY4 HMCES-201ENST00000383463 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
SEMA6DQ8NFY4 MVB12A-201ENST00000317040 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
SEMA6DQ8NFY4 REXO2-201ENST00000265881 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
SEMA6DQ8NFY4 C10orf91-201ENST00000321248 1257 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
SEMA6DQ8NFY4 HCFC1R1-202ENST00000354679 765 ntTSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
SEMA6DQ8NFY4 CD99-203ENST00000381184 918 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
SEMA6DQ8NFY4 ANKRD39-201ENST00000393537 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
SEMA6DQ8NFY4 VKORC1-204ENST00000394971 664 ntTSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
SEMA6DQ8NFY4 LTB-210ENST00000429299 897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
SEMA6DQ8NFY4 AC008667.2-201ENST00000504413 469 ntTSL 3 BASIC16.87■□□□□ 0.29
SEMA6DQ8NFY4 REXO2-208ENST00000539754 791 ntTSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
SEMA6DQ8NFY4 MAX-217ENST00000557277 728 ntTSL 3 BASIC16.87■□□□□ 0.29
SEMA6DQ8NFY4 AC105020.4-201ENST00000569467 563 ntTSL 4 BASIC16.87■□□□□ 0.29
SEMA6DQ8NFY4 PIGQ-204ENST00000409527 1915 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
SEMA6DQ8NFY4 DNLZ-202ENST00000371739 2934 ntTSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
SEMA6DQ8NFY4 FPGS-203ENST00000373247 2279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
SEMA6DQ8NFY4 ZNF385B-204ENST00000410066 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
SEMA6DQ8NFY4 ISLR2-202ENST00000419208 2306 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
SEMA6DQ8NFY4 MAF1-201ENST00000322428 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
SEMA6DQ8NFY4 TRMU-202ENST00000381019 1381 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
SEMA6DQ8NFY4 TIGD6-202ENST00000515406 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
SEMA6DQ8NFY4 CACNA2D1-203ENST00000423588 1429 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
SEMA6DQ8NFY4 CYGB-201ENST00000293230 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
SEMA6DQ8NFY4 IP6K1-204ENST00000468463 1815 ntTSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
SEMA6DQ8NFY4 PPM1B-201ENST00000282412 2606 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
SEMA6DQ8NFY4 RELB-207ENST00000625761 2279 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
SEMA6DQ8NFY4 PRR14-203ENST00000542965 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
SEMA6DQ8NFY4 NFATC1-217ENST00000591814 4819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
SEMA6DQ8NFY4 SLC38A11-203ENST00000409149 1621 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
SEMA6DQ8NFY4 MARK2-201ENST00000350490 2903 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
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