Protein–RNA interactions for Protein: Q8N4S0

CCDC82, Coiled-coil domain-containing protein 82, humanhuman

Predictions only

Length 544 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC82Q8N4S0 RARRES2P10-201ENST00000564312 460 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
CCDC82Q8N4S0 AF186192.3-201ENST00000583427 947 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
CCDC82Q8N4S0 MRPL4-204ENST00000588502 827 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
CCDC82Q8N4S0 AC091551.1-201ENST00000590722 1228 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
CCDC82Q8N4S0 AL158152.2-201ENST00000602703 235 ntTSL 3 BASIC22.56■■□□□ 1.2
CCDC82Q8N4S0 TMEM70-201ENST00000312184 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
CCDC82Q8N4S0 GTF3C5-201ENST00000342018 1905 ntTSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
CCDC82Q8N4S0 TSPAN17-202ENST00000310032 2550 ntTSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
CCDC82Q8N4S0 MTX1-202ENST00000368376 1632 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
CCDC82Q8N4S0 GPR139-202ENST00000570682 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
CCDC82Q8N4S0 MEN1-206ENST00000377321 2614 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
CCDC82Q8N4S0 PAOX-201ENST00000278060 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
CCDC82Q8N4S0 Z82202.1-201ENST00000623446 1880 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
CCDC82Q8N4S0 LAPTM4B-204ENST00000619747 2758 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
CCDC82Q8N4S0 KRT18-207ENST00000550600 1696 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
CCDC82Q8N4S0 AKT1-211ENST00000554848 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
CCDC82Q8N4S0 FAM83E-201ENST00000263266 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
CCDC82Q8N4S0 CEP78-202ENST00000376597 2618 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
CCDC82Q8N4S0 ARFRP1-208ENST00000612256 2974 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
CCDC82Q8N4S0 SH3GLB2-202ENST00000372559 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
CCDC82Q8N4S0 C1QBP-201ENST00000225698 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
CCDC82Q8N4S0 CTAG2-201ENST00000247306 993 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
CCDC82Q8N4S0 CXCL3-201ENST00000296026 1075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
CCDC82Q8N4S0 PMF1-BGLAP-202ENST00000368276 852 ntTSL 3 BASIC22.55■■□□□ 1.2
CCDC82Q8N4S0 DUSP15-205ENST00000398084 1256 ntTSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
CCDC82Q8N4S0 DMRT2-206ENST00000412350 1244 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
CCDC82Q8N4S0 AP002982.1-201ENST00000492365 877 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
CCDC82Q8N4S0 AC027682.2-201ENST00000563083 336 ntTSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
CCDC82Q8N4S0 AC004706.3-201ENST00000634558 1009 ntTSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
CCDC82Q8N4S0 HLA-A-209ENST00000638375 975 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
CCDC82Q8N4S0 FOXN3-214ENST00000557258 2692 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
CCDC82Q8N4S0 CDH5-204ENST00000563425 1932 ntTSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
CCDC82Q8N4S0 P2RX3-204ENST00000616487 1346 ntTSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
CCDC82Q8N4S0 MARK2-202ENST00000361128 3004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
CCDC82Q8N4S0 AC004982.2-201ENST00000609497 1578 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
CCDC82Q8N4S0 UBTF-203ENST00000393606 2683 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
CCDC82Q8N4S0 FARSA-207ENST00000588025 2057 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
CCDC82Q8N4S0 SOCS2-201ENST00000340600 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
CCDC82Q8N4S0 HOXD11-201ENST00000249504 1533 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.54■■□□□ 1.2
CCDC82Q8N4S0 WDR74-201ENST00000278856 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
CCDC82Q8N4S0 LINC01743-201ENST00000366308 964 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
CCDC82Q8N4S0 RPS2P55-201ENST00000397318 883 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
CCDC82Q8N4S0 C1orf52-203ENST00000471115 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
CCDC82Q8N4S0 AC107956.1-201ENST00000494359 873 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
CCDC82Q8N4S0 ISG20-210ENST00000560741 800 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
CCDC82Q8N4S0 AP006294.2-201ENST00000641667 209 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
CCDC82Q8N4S0 INSM1-201ENST00000310227 2829 ntAPPRIS P1 BASIC22.54■■□□□ 1.2
CCDC82Q8N4S0 ZNF598-204ENST00000563630 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
CCDC82Q8N4S0 ITPKB-202ENST00000366784 3146 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
CCDC82Q8N4S0 CRTC1-204ENST00000601916 1834 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
CCDC82Q8N4S0 NAA60-235ENST00000576916 1567 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
CCDC82Q8N4S0 MARK1-203ENST00000402574 5273 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
CCDC82Q8N4S0 LRRC1-202ENST00000370888 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
CCDC82Q8N4S0 RAB11FIP4-211ENST00000621161 8628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
CCDC82Q8N4S0 ZNF331-214ENST00000511154 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
CCDC82Q8N4S0 RELB-207ENST00000625761 2279 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
CCDC82Q8N4S0 HSDL1-202ENST00000434463 1493 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
CCDC82Q8N4S0 HMBS-214ENST00000542729 1469 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
CCDC82Q8N4S0 BACE2-201ENST00000328735 2824 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
CCDC82Q8N4S0 C2CD2-202ENST00000380486 6345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
CCDC82Q8N4S0 NSMF-201ENST00000265663 2981 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
CCDC82Q8N4S0 TUBA4A-202ENST00000392088 2499 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
CCDC82Q8N4S0 BEST2-201ENST00000042931 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
CCDC82Q8N4S0 EPN3-216ENST00000537145 2223 ntTSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
CCDC82Q8N4S0 ZNF324B-202ENST00000545523 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
CCDC82Q8N4S0 STARD10-201ENST00000334805 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
CCDC82Q8N4S0 KCNS2-201ENST00000287042 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
CCDC82Q8N4S0 SPDYE2-201ENST00000341656 1219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
CCDC82Q8N4S0 C1orf50-201ENST00000372525 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
CCDC82Q8N4S0 RALGPS1-206ENST00000394011 819 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
CCDC82Q8N4S0 SAPCD2P4-201ENST00000424595 1171 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
CCDC82Q8N4S0 ABCC5-211ENST00000446941 883 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
CCDC82Q8N4S0 SPDYE2B-202ENST00000455020 1219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
CCDC82Q8N4S0 RBCK1-213ENST00000475269 1200 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
CCDC82Q8N4S0 NME1-207ENST00000480143 964 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
CCDC82Q8N4S0 ATP6V0E1-204ENST00000519911 718 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
CCDC82Q8N4S0 MOK-228ENST00000523231 1114 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
CCDC82Q8N4S0 TMEM9B-203ENST00000528117 949 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
CCDC82Q8N4S0 HLX-AS1-201ENST00000552026 563 ntTSL 4 BASIC22.53■■□□□ 1.2
CCDC82Q8N4S0 AL049780.2-201ENST00000556236 367 ntTSL 3 BASIC22.53■■□□□ 1.2
CCDC82Q8N4S0 AC044860.1-201ENST00000560756 1160 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
CCDC82Q8N4S0 AC020922.2-201ENST00000596786 359 ntTSL 4 BASIC22.53■■□□□ 1.2
CCDC82Q8N4S0 RARA-201ENST00000254066 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
CCDC82Q8N4S0 SMAD7-201ENST00000262158 3087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
CCDC82Q8N4S0 ILKAP-201ENST00000254654 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
CCDC82Q8N4S0 CSF1-203ENST00000369801 1364 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
CCDC82Q8N4S0 IL15-208ENST00000529613 1355 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
CCDC82Q8N4S0 TMSB4X-203ENST00000380636 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
CCDC82Q8N4S0 ISLR2-204ENST00000453268 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
CCDC82Q8N4S0 RIMBP3B-201ENST00000620804 6105 ntAPPRIS P1 BASIC22.52■■□□□ 1.2
CCDC82Q8N4S0 GLI4-202ENST00000344692 1012 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
CCDC82Q8N4S0 NKAIN4-201ENST00000370307 793 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
CCDC82Q8N4S0 HES2-203ENST00000377837 1222 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
CCDC82Q8N4S0 AP000697.1-201ENST00000430607 339 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
CCDC82Q8N4S0 MRPL2-207ENST00000487429 905 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
CCDC82Q8N4S0 AC022509.3-202ENST00000545819 566 ntTSL 3 BASIC22.52■■□□□ 1.2
CCDC82Q8N4S0 AC015712.2-203ENST00000560461 688 ntTSL 3 BASIC22.52■■□□□ 1.2
CCDC82Q8N4S0 RPS15-203ENST00000586096 570 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
CCDC82Q8N4S0 TPGS2-221ENST00000614939 1268 ntTSL 4 BASIC22.52■■□□□ 1.2
CCDC82Q8N4S0 CR392000.1-201ENST00000624770 1228 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.8 ms