Protein–RNA interactions for Protein: Q6TFL3

CCDC171, Coiled-coil domain-containing protein 171, humanhuman

Predictions only

Length 1,326 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC171Q6TFL3 PDCD2-202ENST00000392090 936 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
CCDC171Q6TFL3 CCT7-202ENST00000398422 1234 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
CCDC171Q6TFL3 CCDC74B-203ENST00000409128 789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
CCDC171Q6TFL3 ANKRD54-204ENST00000411961 946 ntTSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
CCDC171Q6TFL3 DMRT2-206ENST00000412350 1244 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
CCDC171Q6TFL3 NIFKP9-201ENST00000419265 221 ntBASIC23.26■■□□□ 1.31
CCDC171Q6TFL3 AC020922.2-201ENST00000596786 359 ntTSL 4 BASIC23.26■■□□□ 1.31
CCDC171Q6TFL3 AL158152.2-201ENST00000602703 235 ntTSL 3 BASIC23.26■■□□□ 1.31
CCDC171Q6TFL3 AL353708.3-201ENST00000610272 989 ntBASIC23.26■■□□□ 1.31
CCDC171Q6TFL3 BCAP29-202ENST00000379117 1946 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
CCDC171Q6TFL3 LINC01465-201ENST00000408887 1940 ntBASIC23.26■■□□□ 1.31
CCDC171Q6TFL3 MON1A-202ENST00000417270 2527 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
CCDC171Q6TFL3 BRAF-201ENST00000288602 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
CCDC171Q6TFL3 C21orf91-203ENST00000400559 1593 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
CCDC171Q6TFL3 UBE2Q2-204ENST00000561851 1582 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
CCDC171Q6TFL3 PTGES2-AS1-201ENST00000443493 2100 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
CCDC171Q6TFL3 ZNF346-201ENST00000358149 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
CCDC171Q6TFL3 DLGAP4-204ENST00000373913 5056 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
CCDC171Q6TFL3 PCID2-202ENST00000337344 1898 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
CCDC171Q6TFL3 CMTM8-201ENST00000307526 1174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
CCDC171Q6TFL3 S100A14-203ENST00000368701 1080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
CCDC171Q6TFL3 GPR35-203ENST00000407714 1258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
CCDC171Q6TFL3 SNX5-213ENST00000486039 602 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
CCDC171Q6TFL3 FDX2-207ENST00000494368 584 ntTSL 4 BASIC23.25■■□□□ 1.31
CCDC171Q6TFL3 AC005786.3-201ENST00000589360 565 ntTSL 3 BASIC23.25■■□□□ 1.31
CCDC171Q6TFL3 SDHAP1-207ENST00000440850 2000 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
CCDC171Q6TFL3 NKX1-2-201ENST00000451024 3364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
CCDC171Q6TFL3 ARMC6-220ENST00000546344 1814 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
CCDC171Q6TFL3 KRT16-201ENST00000301653 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
CCDC171Q6TFL3 GTF3C5-201ENST00000342018 1905 ntTSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
CCDC171Q6TFL3 LGALS9C-209ENST00000581545 1378 ntTSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
CCDC171Q6TFL3 DLG3-201ENST00000194900 6112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
CCDC171Q6TFL3 HOXC13-201ENST00000243056 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
CCDC171Q6TFL3 P2RX3-204ENST00000616487 1346 ntTSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
CCDC171Q6TFL3 CHMP6-201ENST00000325167 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
CCDC171Q6TFL3 AC126773.2-201ENST00000562172 1682 ntTSL 3 BASIC23.24■■□□□ 1.31
CCDC171Q6TFL3 HMCES-201ENST00000383463 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
CCDC171Q6TFL3 GPR146-201ENST00000397095 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
CCDC171Q6TFL3 LGALS7-201ENST00000378626 466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
CCDC171Q6TFL3 AC108693.2-201ENST00000492981 303 ntTSL 3 BASIC23.24■■□□□ 1.31
CCDC171Q6TFL3 AC090877.2-202ENST00000560363 574 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
CCDC171Q6TFL3 MRPL4-204ENST00000588502 827 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
CCDC171Q6TFL3 TPGS2-221ENST00000614939 1268 ntTSL 4 BASIC23.24■■□□□ 1.31
CCDC171Q6TFL3 VAV1-210ENST00000602142 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
CCDC171Q6TFL3 TRIP6-201ENST00000200457 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
CCDC171Q6TFL3 CYP2E1-205ENST00000463117 1912 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
CCDC171Q6TFL3 AC008691.1-203ENST00000515337 1580 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
CCDC171Q6TFL3 LDHAL6A-202ENST00000396213 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
CCDC171Q6TFL3 SOX12-201ENST00000342665 4630 ntAPPRIS P1 BASIC23.24■■□□□ 1.31
CCDC171Q6TFL3 LAG3-201ENST00000203629 1974 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
CCDC171Q6TFL3 STXBP6-203ENST00000419632 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
CCDC171Q6TFL3 ITGB7-209ENST00000550743 2138 ntTSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
CCDC171Q6TFL3 BAZ1B-202ENST00000404251 5428 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
CCDC171Q6TFL3 FBXO24-201ENST00000241071 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
CCDC171Q6TFL3 CFAP77-203ENST00000393216 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
CCDC171Q6TFL3 AC007040.1-201ENST00000416229 477 ntTSL 3 BASIC23.23■■□□□ 1.31
CCDC171Q6TFL3 AL353807.1-201ENST00000427475 662 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
CCDC171Q6TFL3 MOK-228ENST00000523231 1114 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
CCDC171Q6TFL3 AF186192.3-201ENST00000583427 947 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
CCDC171Q6TFL3 USP36-216ENST00000589424 970 ntTSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
CCDC171Q6TFL3 CROCCP4-202ENST00000633627 573 ntTSL 3 BASIC23.23■■□□□ 1.31
CCDC171Q6TFL3 KLHDC2-201ENST00000298307 5514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
CCDC171Q6TFL3 PON1-201ENST00000222381 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
CCDC171Q6TFL3 MARC2-202ENST00000366913 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
CCDC171Q6TFL3 MLF2-201ENST00000203630 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
CCDC171Q6TFL3 P4HB-203ENST00000439918 1502 ntTSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
CCDC171Q6TFL3 CSF1-203ENST00000369801 1364 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
CCDC171Q6TFL3 UBTF-203ENST00000393606 2683 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
CCDC171Q6TFL3 TMEM8A-204ENST00000431232 3691 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
CCDC171Q6TFL3 SLC25A3-201ENST00000188376 1909 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
CCDC171Q6TFL3 GFI1-201ENST00000294702 2784 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
CCDC171Q6TFL3 AC009041.2-204ENST00000568394 3343 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
CCDC171Q6TFL3 PIANP-201ENST00000320591 2323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
CCDC171Q6TFL3 ILKAP-201ENST00000254654 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
CCDC171Q6TFL3 REEP2-202ENST00000378339 2170 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
CCDC171Q6TFL3 ASMTL-202ENST00000381333 2035 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
CCDC171Q6TFL3 C20orf27-201ENST00000217195 1302 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
CCDC171Q6TFL3 B3GALNT2-201ENST00000313984 1874 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
CCDC171Q6TFL3 SPRYD7-204ENST00000613924 2285 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
CCDC171Q6TFL3 TMEM259-209ENST00000592590 2509 ntTSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
CCDC171Q6TFL3 MEN1-209ENST00000394376 3034 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
CCDC171Q6TFL3 CTAG2-201ENST00000247306 993 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
CCDC171Q6TFL3 C16orf90-202ENST00000437192 907 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
CCDC171Q6TFL3 AL590666.2-201ENST00000448869 758 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
CCDC171Q6TFL3 LRRC75A-AS1-205ENST00000475953 1201 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
CCDC171Q6TFL3 AP002982.1-201ENST00000492365 877 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
CCDC171Q6TFL3 AL445675.2-201ENST00000620291 557 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
CCDC171Q6TFL3 HNRNPLL-206ENST00000410076 1687 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
CCDC171Q6TFL3 TEX21P-204ENST00000641479 1693 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
CCDC171Q6TFL3 FAM217A-208ENST00000639338 1929 ntTSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
CCDC171Q6TFL3 GRK2-201ENST00000308595 3466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
CCDC171Q6TFL3 EARS2-210ENST00000564501 2027 ntTSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
CCDC171Q6TFL3 FOXN3-214ENST00000557258 2692 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
CCDC171Q6TFL3 LAPTM4B-204ENST00000619747 2758 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
CCDC171Q6TFL3 FAM58A-204ENST00000576892 1306 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
CCDC171Q6TFL3 MME-217ENST00000616757 1315 ntTSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
CCDC171Q6TFL3 NDUFA10-203ENST00000404554 1557 ntTSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
CCDC171Q6TFL3 RNF212-202ENST00000382968 2335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
CCDC171Q6TFL3 CXXC5-201ENST00000302517 2658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
CCDC171Q6TFL3 MXD3-202ENST00000427908 2269 ntTSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.6 ms