Protein–RNA interactions for Protein: Q6TDU7

CASC1, Protein CASC1, humanhuman

Predictions only

Length 716 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CASC1Q6TDU7 FXYD6-211ENST00000539526 2132 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
CASC1Q6TDU7 KMT5C-201ENST00000255613 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
CASC1Q6TDU7 ZNF346-201ENST00000358149 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
CASC1Q6TDU7 MMD2-201ENST00000401401 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
CASC1Q6TDU7 RAB11FIP2-201ENST00000355624 6061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
CASC1Q6TDU7 SLC25A3-201ENST00000188376 1909 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
CASC1Q6TDU7 NECAB3-202ENST00000375238 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
CASC1Q6TDU7 GFI1-201ENST00000294702 2784 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
CASC1Q6TDU7 ZNF843-203ENST00000618063 1765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
CASC1Q6TDU7 TJP1-208ENST00000495972 2890 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
CASC1Q6TDU7 PIK3R1-201ENST00000320694 2625 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
CASC1Q6TDU7 NDUFB1-201ENST00000329559 528 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
CASC1Q6TDU7 PITX2-203ENST00000355080 2100 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
CASC1Q6TDU7 GDAP1L1-202ENST00000372952 722 ntTSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
CASC1Q6TDU7 APTR-205ENST00000447009 902 ntTSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
CASC1Q6TDU7 IDH1-AS1-202ENST00000448588 489 ntTSL 3 BASIC23.61■■□□□ 1.37
CASC1Q6TDU7 CIRBP-213ENST00000587323 1092 ntTSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
CASC1Q6TDU7 AL160396.2-202ENST00000636692 566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
CASC1Q6TDU7 TRMT2A-203ENST00000404751 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
CASC1Q6TDU7 EPB41L4B-201ENST00000374557 4006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
CASC1Q6TDU7 PITX3-201ENST00000370002 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
CASC1Q6TDU7 CDHR5-201ENST00000349570 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
CASC1Q6TDU7 LIPG-203ENST00000577628 2323 ntTSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
CASC1Q6TDU7 DMKN-207ENST00000419602 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
CASC1Q6TDU7 RSAD1-201ENST00000258955 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
CASC1Q6TDU7 LMNB1-202ENST00000395354 1572 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
CASC1Q6TDU7 NFIB-208ENST00000397581 3318 ntTSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
CASC1Q6TDU7 AC008060.1-201ENST00000401499 1551 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
CASC1Q6TDU7 ISOC2-203ENST00000438389 1566 ntTSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
CASC1Q6TDU7 SNX19-209ENST00000530356 1562 ntTSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
CASC1Q6TDU7 TSHZ3-201ENST00000240587 5176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
CASC1Q6TDU7 RNF144A-201ENST00000320892 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
CASC1Q6TDU7 PLEKHG5-212ENST00000537245 4794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
CASC1Q6TDU7 GCOM1-201ENST00000380568 1516 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
CASC1Q6TDU7 DACH1-202ENST00000613252 5233 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
CASC1Q6TDU7 MCEMP1-201ENST00000333598 1730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
CASC1Q6TDU7 ANKRD39-201ENST00000393537 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
CASC1Q6TDU7 NME1-207ENST00000480143 964 ntTSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
CASC1Q6TDU7 GCOM1-202ENST00000380569 1846 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
CASC1Q6TDU7 UBE2K-203ENST00000445950 2175 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
CASC1Q6TDU7 SNCA-203ENST00000394986 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
CASC1Q6TDU7 KRT8P8-201ENST00000434750 1448 ntBASIC23.59■■□□□ 1.37
CASC1Q6TDU7 ART5-203ENST00000397068 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
CASC1Q6TDU7 AC141586.3-201ENST00000562166 1838 ntBASIC23.59■■□□□ 1.37
CASC1Q6TDU7 FAM217A-208ENST00000639338 1929 ntTSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
CASC1Q6TDU7 C2orf82-203ENST00000409533 561 ntAPPRIS P2 TSL 4 BASIC23.59■■□□□ 1.37
CASC1Q6TDU7 AC011611.3-201ENST00000552367 569 ntTSL 4 BASIC23.59■■□□□ 1.37
CASC1Q6TDU7 PNN-205ENST00000556530 601 ntTSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
CASC1Q6TDU7 SEC23A-AS1-201ENST00000557350 500 ntTSL 3 BASIC23.59■■□□□ 1.37
CASC1Q6TDU7 AC003102.1-201ENST00000588279 569 ntTSL 4 BASIC23.59■■□□□ 1.37
CASC1Q6TDU7 HOXB2-201ENST00000330070 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
CASC1Q6TDU7 ACBD4-207ENST00000586346 1579 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
CASC1Q6TDU7 CEP85L-205ENST00000419517 2079 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
CASC1Q6TDU7 P3H4-201ENST00000355468 2791 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
CASC1Q6TDU7 AC004408.2-201ENST00000623613 2777 ntBASIC23.59■■□□□ 1.37
CASC1Q6TDU7 KLHL2-201ENST00000226725 3134 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
CASC1Q6TDU7 ITGB7-209ENST00000550743 2138 ntTSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
CASC1Q6TDU7 SLC23A3-201ENST00000295738 2037 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
CASC1Q6TDU7 USP32-201ENST00000300896 5171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
CASC1Q6TDU7 OSR2-202ENST00000435298 1736 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
CASC1Q6TDU7 PSKH2-201ENST00000276616 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
CASC1Q6TDU7 PAIP1-201ENST00000306846 2782 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
CASC1Q6TDU7 UBN1-201ENST00000262376 6252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
CASC1Q6TDU7 SLC27A1-204ENST00000598424 2681 ntTSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
CASC1Q6TDU7 CHST11-201ENST00000303694 5709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
CASC1Q6TDU7 RFC2-202ENST00000352131 1576 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
CASC1Q6TDU7 FDFT1-209ENST00000525900 1596 ntTSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
CASC1Q6TDU7 ZNF12-204ENST00000405858 5051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
CASC1Q6TDU7 UBP1-202ENST00000283629 4148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
CASC1Q6TDU7 VEGFB-201ENST00000309422 1380 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
CASC1Q6TDU7 SLC29A4P2-201ENST00000504749 1089 ntBASIC23.58■■□□□ 1.37
CASC1Q6TDU7 CXXC5-AS1-201ENST00000514287 577 ntTSL 4 BASIC23.58■■□□□ 1.37
CASC1Q6TDU7 AC016065.1-203ENST00000523225 1017 ntTSL 3 BASIC23.58■■□□□ 1.37
CASC1Q6TDU7 AC120498.8-201ENST00000614275 531 ntBASIC23.58■■□□□ 1.37
CASC1Q6TDU7 SLC9A6-201ENST00000370695 4725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
CASC1Q6TDU7 DLGAP4-206ENST00000475894 3110 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
CASC1Q6TDU7 PDCD10-201ENST00000392750 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
CASC1Q6TDU7 BCL2-203ENST00000589955 5011 ntBASIC23.58■■□□□ 1.36
CASC1Q6TDU7 HAUS4-204ENST00000490506 1447 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
CASC1Q6TDU7 TRIM7-205ENST00000422067 1954 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
CASC1Q6TDU7 ANKRD18DP-204ENST00000455355 1975 ntBASIC23.58■■□□□ 1.36
CASC1Q6TDU7 GTF3C5-202ENST00000372097 2406 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
CASC1Q6TDU7 HCN2-201ENST00000251287 3408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
CASC1Q6TDU7 LYSMD4-202ENST00000344791 2885 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
CASC1Q6TDU7 DPYSL3-202ENST00000398514 5309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
CASC1Q6TDU7 MARC2-202ENST00000366913 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
CASC1Q6TDU7 C21orf91-203ENST00000400559 1593 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
CASC1Q6TDU7 EARS2-210ENST00000564501 2027 ntTSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
CASC1Q6TDU7 PLEKHH3-204ENST00000591022 2983 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
CASC1Q6TDU7 FBXL12-205ENST00000586651 1736 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
CASC1Q6TDU7 MRPS26-201ENST00000380325 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
CASC1Q6TDU7 MDK-204ENST00000395569 686 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
CASC1Q6TDU7 ZPBP-203ENST00000419417 1095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
CASC1Q6TDU7 PLEKHB1-216ENST00000543085 632 ntTSL 3 BASIC23.57■■□□□ 1.36
CASC1Q6TDU7 KLF13-207ENST00000560473 489 ntTSL 3 BASIC23.57■■□□□ 1.36
CASC1Q6TDU7 ZIC1-201ENST00000282928 5241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
CASC1Q6TDU7 TUBA3FP-202ENST00000422086 1974 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
CASC1Q6TDU7 AC013268.5-201ENST00000454928 1959 ntTSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
CASC1Q6TDU7 NTMT1-210ENST00000613644 1501 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.57■■□□□ 1.36
CASC1Q6TDU7 OGFOD2-201ENST00000228922 1780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.6 ms