Protein–RNA interactions for Protein: Q6ISB3

GRHL2, Grainyhead-like protein 2 homolog, humanhuman

Predictions only

Length 625 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GRHL2Q6ISB3 C1orf50-201ENST00000372525 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
GRHL2Q6ISB3 TMEM35B-201ENST00000373337 922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
GRHL2Q6ISB3 TRA2B-203ENST00000382191 976 ntTSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
GRHL2Q6ISB3 AC239809.2-201ENST00000415381 517 ntBASIC18.6■□□□□ 0.57
GRHL2Q6ISB3 CD99P1-205ENST00000527459 561 ntBASIC18.6■□□□□ 0.57
GRHL2Q6ISB3 BCL2L10-202ENST00000561198 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
GRHL2Q6ISB3 AL023875.1-201ENST00000640777 796 ntBASIC18.6■□□□□ 0.57
GRHL2Q6ISB3 TINCR-201ENST00000448587 3733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
GRHL2Q6ISB3 FGFR2-204ENST00000356226 3547 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
GRHL2Q6ISB3 LINC01465-201ENST00000408887 1940 ntBASIC18.6■□□□□ 0.57
GRHL2Q6ISB3 PRKCSH-209ENST00000589838 1898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
GRHL2Q6ISB3 CRB2-202ENST00000373631 5550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
GRHL2Q6ISB3 EVC-201ENST00000264956 6431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
GRHL2Q6ISB3 PCDHA4-201ENST00000378125 2328 ntTSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
GRHL2Q6ISB3 AC012414.5-201ENST00000564214 1602 ntTSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
GRHL2Q6ISB3 GCSH-201ENST00000315467 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
GRHL2Q6ISB3 SLC22A18-202ENST00000347936 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
GRHL2Q6ISB3 CXXC4-201ENST00000394767 5565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
GRHL2Q6ISB3 CAMKK1-202ENST00000348335 3563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
GRHL2Q6ISB3 ZMAT3-203ENST00000432729 2944 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
GRHL2Q6ISB3 AC098818.2-201ENST00000564925 2320 ntBASIC18.59■□□□□ 0.57
GRHL2Q6ISB3 AC009041.2-204ENST00000568394 3343 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
GRHL2Q6ISB3 NUDT8-202ENST00000376693 728 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
GRHL2Q6ISB3 C5orf56-203ENST00000378953 942 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
GRHL2Q6ISB3 KRASP1-201ENST00000407852 552 ntBASIC18.59■□□□□ 0.57
GRHL2Q6ISB3 C1orf52-203ENST00000471115 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
GRHL2Q6ISB3 OPA3-203ENST00000544371 1146 ntTSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
GRHL2Q6ISB3 RASD1-201ENST00000225688 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
GRHL2Q6ISB3 YPEL5-205ENST00000402708 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
GRHL2Q6ISB3 ZDHHC3-205ENST00000424952 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
GRHL2Q6ISB3 FOXN3-214ENST00000557258 2692 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
GRHL2Q6ISB3 DUSP15-209ENST00000486996 1651 ntTSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
GRHL2Q6ISB3 MEN1-209ENST00000394376 3034 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
GRHL2Q6ISB3 PEX16-210ENST00000532681 1639 ntTSL 3 BASIC18.59■□□□□ 0.57
GRHL2Q6ISB3 TRMT2A-203ENST00000404751 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
GRHL2Q6ISB3 ZNF385C-201ENST00000436535 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
GRHL2Q6ISB3 DBNL-219ENST00000490734 2004 ntTSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
GRHL2Q6ISB3 AKT1-211ENST00000554848 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
GRHL2Q6ISB3 ADAMTS19-205ENST00000638972 5089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
GRHL2Q6ISB3 UMOD-203ENST00000396138 2399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
GRHL2Q6ISB3 ZNF346-201ENST00000358149 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
GRHL2Q6ISB3 PGM1-205ENST00000540265 2345 ntTSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.57
GRHL2Q6ISB3 NAT6-204ENST00000443094 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
GRHL2Q6ISB3 C6orf89-203ENST00000373685 1400 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.57
GRHL2Q6ISB3 PTOV1-AS1-201ENST00000596521 2155 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
GRHL2Q6ISB3 TMEM132A-202ENST00000453848 3346 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
GRHL2Q6ISB3 C5orf47-201ENST00000340147 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
GRHL2Q6ISB3 PAFAH1B2-202ENST00000419197 2517 ntTSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.57
GRHL2Q6ISB3 PLK5-201ENST00000334770 2106 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.57
GRHL2Q6ISB3 AC087289.5-201ENST00000586076 3175 ntBASIC18.58■□□□□ 0.57
GRHL2Q6ISB3 PMAIP1-201ENST00000269518 1262 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
GRHL2Q6ISB3 PRSS57-201ENST00000329267 1025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
GRHL2Q6ISB3 NMRK1-201ENST00000361092 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
GRHL2Q6ISB3 SERF2-207ENST00000409614 582 ntTSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
GRHL2Q6ISB3 METTL21A-204ENST00000425132 869 ntTSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
GRHL2Q6ISB3 AL162258.1-201ENST00000497086 753 ntTSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
GRHL2Q6ISB3 LY6E-205ENST00000519611 635 ntTSL 3 BASIC18.58■□□□□ 0.56
GRHL2Q6ISB3 LY6E-212ENST00000522024 868 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
GRHL2Q6ISB3 NDUFV2-AS1-201ENST00000582375 770 ntTSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
GRHL2Q6ISB3 PRSS57-202ENST00000613411 1090 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
GRHL2Q6ISB3 TMEM191B-203ENST00000613597 366 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
GRHL2Q6ISB3 HOOK1-201ENST00000371208 5857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
GRHL2Q6ISB3 UPP1-201ENST00000331803 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
GRHL2Q6ISB3 DMRT2-204ENST00000382251 2292 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
GRHL2Q6ISB3 P3H4-202ENST00000393928 2601 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
GRHL2Q6ISB3 LSM4-203ENST00000593829 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
GRHL2Q6ISB3 FBXO27-207ENST00000600828 1557 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
GRHL2Q6ISB3 ACTL6B-201ENST00000160382 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
GRHL2Q6ISB3 TUBA8-201ENST00000316027 1518 ntTSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
GRHL2Q6ISB3 P4HB-203ENST00000439918 1502 ntTSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
GRHL2Q6ISB3 RHOT2-201ENST00000315082 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
GRHL2Q6ISB3 PDLIM2-204ENST00000397760 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
GRHL2Q6ISB3 PODNL1-203ENST00000538371 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
GRHL2Q6ISB3 YBX3-201ENST00000228251 1796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
GRHL2Q6ISB3 CXXC5-201ENST00000302517 2658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
GRHL2Q6ISB3 WBP2-213ENST00000590221 1745 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC18.57■□□□□ 0.56
GRHL2Q6ISB3 SCARB1-201ENST00000261693 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
GRHL2Q6ISB3 PIK3R1-201ENST00000320694 2625 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
GRHL2Q6ISB3 THOC6-209ENST00000575576 1360 ntTSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
GRHL2Q6ISB3 MEF2B-201ENST00000409224 1683 ntTSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
GRHL2Q6ISB3 ATP6V0A2-201ENST00000330342 6542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
GRHL2Q6ISB3 GRK2-201ENST00000308595 3466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
GRHL2Q6ISB3 EWSR1-208ENST00000414183 2189 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
GRHL2Q6ISB3 ASGR1-208ENST00000574388 1552 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
GRHL2Q6ISB3 ZNF561-AS1-201ENST00000585797 1593 ntTSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
GRHL2Q6ISB3 ACBD4-207ENST00000586346 1579 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
GRHL2Q6ISB3 PRSS36-202ENST00000418068 2446 ntTSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
GRHL2Q6ISB3 IZUMO2-201ENST00000293405 728 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
GRHL2Q6ISB3 GUK1-201ENST00000312726 1084 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
GRHL2Q6ISB3 AC096537.1-201ENST00000437416 684 ntTSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
GRHL2Q6ISB3 ARF3-208ENST00000541959 807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
GRHL2Q6ISB3 RNASEK-202ENST00000548577 810 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
GRHL2Q6ISB3 CYB561-214ENST00000582034 1193 ntTSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
GRHL2Q6ISB3 AC006058.3-201ENST00000606217 1069 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
GRHL2Q6ISB3 AC073648.6-201ENST00000641589 218 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
GRHL2Q6ISB3 ARMC6-202ENST00000392335 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
GRHL2Q6ISB3 RAB11FIP5-201ENST00000258098 4342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
GRHL2Q6ISB3 ZNF326-202ENST00000361911 1538 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
GRHL2Q6ISB3 AL390860.1-201ENST00000449298 1541 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
GRHL2Q6ISB3 MTFR1L-202ENST00000374301 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.4 ms