Protein–RNA interactions for Protein: Q5W186

CST9, Cystatin-9, humanhuman

Predictions only

Length 159 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CST9Q5W186 RRAS-201ENST00000246792 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
CST9Q5W186 SYS1-202ENST00000372727 813 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.6■■□□□ 1.21
CST9Q5W186 LINC01770-202ENST00000430109 510 ntTSL 3 BASIC22.6■■□□□ 1.21
CST9Q5W186 PMS2P1-201ENST00000431037 1228 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
CST9Q5W186 AL611929.1-201ENST00000457340 449 ntTSL 3 BASIC22.6■■□□□ 1.21
CST9Q5W186 PENK-208ENST00000523051 772 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
CST9Q5W186 CIB2-208ENST00000560618 804 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
CST9Q5W186 AC036176.1-201ENST00000589905 785 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
CST9Q5W186 GNAS-AS1-203ENST00000598163 548 ntTSL 4 BASIC22.6■■□□□ 1.21
CST9Q5W186 AC243773.1-201ENST00000614759 544 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
CST9Q5W186 GAMT-202ENST00000447102 1769 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
CST9Q5W186 FIP1L1-201ENST00000306932 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
CST9Q5W186 GLT8D1-213ENST00000491606 1577 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
CST9Q5W186 TMEM237-213ENST00000621467 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
CST9Q5W186 MED26-207ENST00000611692 1444 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
CST9Q5W186 SKOR2-203ENST00000620245 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
CST9Q5W186 ASPG-201ENST00000546892 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
CST9Q5W186 HINT1-201ENST00000304043 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
CST9Q5W186 HDDC3-201ENST00000330334 1047 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
CST9Q5W186 DUSP15-203ENST00000375966 1077 ntTSL 3 BASIC22.59■■□□□ 1.21
CST9Q5W186 TSPY22P-201ENST00000427496 604 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
CST9Q5W186 EEF1E1-202ENST00000429723 562 ntTSL 3 BASIC22.59■■□□□ 1.21
CST9Q5W186 AL356056.2-201ENST00000506914 669 ntTSL 4 BASIC22.59■■□□□ 1.21
CST9Q5W186 AC012615.1-201ENST00000565797 1299 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
CST9Q5W186 RXFP3-201ENST00000330120 1852 ntAPPRIS P1 BASIC22.59■■□□□ 1.21
CST9Q5W186 NEK6-214ENST00000545174 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
CST9Q5W186 RBM4B-203ENST00000525754 2339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
CST9Q5W186 TNFAIP3-207ENST00000614035 1430 ntTSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
CST9Q5W186 DTNB-210ENST00000407186 2275 ntTSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
CST9Q5W186 AC064807.1-202ENST00000423716 936 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
CST9Q5W186 LMCD1-AS1-204ENST00000446281 932 ntTSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
CST9Q5W186 AC024243.1-201ENST00000609234 778 ntBASIC22.58■■□□□ 1.21
CST9Q5W186 DNAJB6-218ENST00000634080 1005 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
CST9Q5W186 PTPN18-202ENST00000347849 2472 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
CST9Q5W186 PHKG2-202ENST00000424889 1566 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.2
CST9Q5W186 TSPAN15-201ENST00000373290 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
CST9Q5W186 RCN3-201ENST00000270645 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
CST9Q5W186 FBXW9-203ENST00000587955 1437 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
CST9Q5W186 GAL3ST1-206ENST00000406955 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
CST9Q5W186 DPY19L1-209ENST00000638088 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
CST9Q5W186 DAPK3-201ENST00000301264 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
CST9Q5W186 GJC2-201ENST00000366714 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
CST9Q5W186 CMTM1-204ENST00000336328 606 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
CST9Q5W186 RAB24-204ENST00000393611 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
CST9Q5W186 SMN1-203ENST00000503079 1219 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
CST9Q5W186 CMTM1-213ENST00000529506 581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
CST9Q5W186 STX10-207ENST00000589083 1241 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
CST9Q5W186 NR1H2-202ENST00000411902 1466 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
CST9Q5W186 NKX2-3-201ENST00000344586 2097 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
CST9Q5W186 CIC-201ENST00000160740 6111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
CST9Q5W186 P4HTM-202ENST00000383729 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
CST9Q5W186 APBB3-204ENST00000358580 2020 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
CST9Q5W186 AL117328.2-201ENST00000624617 1940 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
CST9Q5W186 AC140125.2-201ENST00000502515 1517 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
CST9Q5W186 CBLC-202ENST00000341505 1441 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
CST9Q5W186 IRF3-202ENST00000377135 1442 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
CST9Q5W186 CABP4-202ENST00000438189 1426 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
CST9Q5W186 RSRC1-211ENST00000480820 1410 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
CST9Q5W186 CRTC3-208ENST00000560098 1421 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
CST9Q5W186 PPP4C-202ENST00000561610 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
CST9Q5W186 AC116565.2-201ENST00000637674 1854 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
CST9Q5W186 CCDC71-201ENST00000321895 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
CST9Q5W186 ST3GAL3-239ENST00000545417 1667 ntTSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
CST9Q5W186 VAMP5-201ENST00000306384 689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
CST9Q5W186 TSPY2-201ENST00000320701 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
CST9Q5W186 HLA-F-217ENST00000334668 1283 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
CST9Q5W186 ITM2C-204ENST00000409704 1106 ntTSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
CST9Q5W186 TSPY2-203ENST00000429039 779 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
CST9Q5W186 HLA-F-220ENST00000434407 884 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
CST9Q5W186 PRSS21-202ENST00000450020 1106 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
CST9Q5W186 SLC2A1-204ENST00000460369 541 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
CST9Q5W186 TOB2P1-201ENST00000469761 992 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
CST9Q5W186 C12orf43-206ENST00000537817 1270 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
CST9Q5W186 AC079031.1-201ENST00000542627 1035 ntTSL 3 BASIC22.56■■□□□ 1.2
CST9Q5W186 CLDN7-204ENST00000571881 735 ntTSL 3 BASIC22.56■■□□□ 1.2
CST9Q5W186 AC004448.5-201ENST00000579897 567 ntTSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
CST9Q5W186 ZNF444-201ENST00000337080 2042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
CST9Q5W186 EMC8-202ENST00000435200 1935 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
CST9Q5W186 TMEM204-202ENST00000566264 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
CST9Q5W186 RITA1-201ENST00000548278 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
CST9Q5W186 SLC1A6-203ENST00000544886 2420 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
CST9Q5W186 SETD3-201ENST00000329331 1330 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
CST9Q5W186 CPNE9-202ENST00000383831 1751 ntTSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
CST9Q5W186 MKRN1-208ENST00000474576 1661 ntTSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
CST9Q5W186 AC124066.1-201ENST00000581122 1660 ntTSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
CST9Q5W186 ITGB1BP1-203ENST00000359712 2126 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
CST9Q5W186 NAP1L4-212ENST00000526115 1941 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
CST9Q5W186 ETV7-202ENST00000340181 1719 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
CST9Q5W186 DFFB-203ENST00000341385 572 ntTSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
CST9Q5W186 CELA2A-201ENST00000359621 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
CST9Q5W186 MSRB1-202ENST00000399753 847 ntTSL 3 BASIC22.55■■□□□ 1.2
CST9Q5W186 AL137026.1-202ENST00000452578 1089 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
CST9Q5W186 UBXN1-210ENST00000529640 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
CST9Q5W186 ATP5G2-204ENST00000549164 745 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.55■■□□□ 1.2
CST9Q5W186 EFCAB11-211ENST00000556609 568 ntTSL 3 BASIC22.55■■□□□ 1.2
CST9Q5W186 NAA38-203ENST00000575071 553 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
CST9Q5W186 SRSF1-209ENST00000585096 568 ntTSL 4 BASIC22.55■■□□□ 1.2
CST9Q5W186 ATP5D-207ENST00000591660 637 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.55■■□□□ 1.2
CST9Q5W186 ATP5G2-209ENST00000602871 668 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
CST9Q5W186 CD151-201ENST00000322008 1548 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.9 ms