Protein–RNA interactions for Protein: Q5VU97

CACHD1, VWFA and cache domain-containing protein 1, humanhuman

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Length 1,274 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CACHD1Q5VU97 COL13A1-205ENST00000398978 3093 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
CACHD1Q5VU97 FAM83A-205ENST00000522648 1604 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
CACHD1Q5VU97 LYNX1-204ENST00000614491 4708 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
CACHD1Q5VU97 PUF60-202ENST00000349157 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
CACHD1Q5VU97 MAPK8IP3-202ENST00000356010 4456 ntTSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
CACHD1Q5VU97 TREX1-205ENST00000625293 1783 ntBASIC19.09■□□□□ 0.65
CACHD1Q5VU97 SHROOM1-202ENST00000378676 2352 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.65
CACHD1Q5VU97 POLI-202ENST00000406285 2030 ntTSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.65
CACHD1Q5VU97 STARD10-213ENST00000538536 1678 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
CACHD1Q5VU97 KIAA1456-201ENST00000400069 1982 ntTSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.65
CACHD1Q5VU97 AC044802.1-201ENST00000501143 2894 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
CACHD1Q5VU97 B4GALNT1-213ENST00000552350 1649 ntTSL 4 BASIC19.08■□□□□ 0.65
CACHD1Q5VU97 MAPK8IP1-201ENST00000241014 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
CACHD1Q5VU97 DPP10-203ENST00000393147 2758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
CACHD1Q5VU97 CBLC-201ENST00000270279 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
CACHD1Q5VU97 ZNF561-AS1-201ENST00000585797 1593 ntTSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.65
CACHD1Q5VU97 HAUS1-201ENST00000282058 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
CACHD1Q5VU97 AKR1A1-201ENST00000351829 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
CACHD1Q5VU97 GPSM1-203ENST00000392944 1111 ntTSL 3 BASIC19.08■□□□□ 0.64
CACHD1Q5VU97 YBEY-205ENST00000397694 534 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
CACHD1Q5VU97 NPY-202ENST00000405982 565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
CACHD1Q5VU97 MOK-228ENST00000523231 1114 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
CACHD1Q5VU97 C17orf62-238ENST00000585064 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.64
CACHD1Q5VU97 AC007786.1-201ENST00000587859 709 ntTSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.64
CACHD1Q5VU97 AC004264.1-201ENST00000608354 794 ntBASIC19.08■□□□□ 0.64
CACHD1Q5VU97 AC004706.3-201ENST00000634558 1009 ntTSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
CACHD1Q5VU97 RELB-202ENST00000505236 2219 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
CACHD1Q5VU97 NFATC1-217ENST00000591814 4819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
CACHD1Q5VU97 KRT18-202ENST00000388837 1420 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
CACHD1Q5VU97 BTBD11-201ENST00000280758 5767 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
CACHD1Q5VU97 CXXC5-201ENST00000302517 2658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
CACHD1Q5VU97 RAX-202ENST00000334889 3197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
CACHD1Q5VU97 SLC29A4-202ENST00000396872 5685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
CACHD1Q5VU97 ROPN1-209ENST00000495093 1376 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
CACHD1Q5VU97 ZSCAN1-201ENST00000282326 2054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
CACHD1Q5VU97 KRT17P2-201ENST00000300992 1314 ntBASIC19.07■□□□□ 0.64
CACHD1Q5VU97 BACE1-203ENST00000428381 1333 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
CACHD1Q5VU97 HTR7P1-201ENST00000538670 1336 ntBASIC19.07■□□□□ 0.64
CACHD1Q5VU97 DMAP1-202ENST00000361745 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
CACHD1Q5VU97 SAAL1-204ENST00000529318 1503 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
CACHD1Q5VU97 NTMT1-210ENST00000613644 1501 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.07■□□□□ 0.64
CACHD1Q5VU97 CTAG2-201ENST00000247306 993 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
CACHD1Q5VU97 CMTM8-201ENST00000307526 1174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
CACHD1Q5VU97 VMO1-201ENST00000328739 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
CACHD1Q5VU97 AL390728.5-201ENST00000428687 706 ntTSL 3 BASIC19.07■□□□□ 0.64
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CACHD1Q5VU97 CXCL2-202ENST00000508487 1218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
CACHD1Q5VU97 SMIM1-203ENST00000561886 491 ntTSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
CACHD1Q5VU97 AC113410.3-201ENST00000623366 203 ntBASIC19.07■□□□□ 0.64
CACHD1Q5VU97 CLIP2-202ENST00000361545 5445 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
CACHD1Q5VU97 AKR7A3-201ENST00000361640 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
CACHD1Q5VU97 FAM57B-204ENST00000564806 1710 ntTSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
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CACHD1Q5VU97 NDRG2-215ENST00000553503 2162 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
CACHD1Q5VU97 Z83844.2-201ENST00000456099 1945 ntTSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
CACHD1Q5VU97 NFATC1-201ENST00000253506 4642 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
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CACHD1Q5VU97 TMEM151A-201ENST00000327259 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
CACHD1Q5VU97 HOXA13-201ENST00000222753 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
CACHD1Q5VU97 SHANK1-202ENST00000359082 6459 ntTSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
CACHD1Q5VU97 MED26-207ENST00000611692 1444 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
CACHD1Q5VU97 TTC34-201ENST00000401095 8814 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
CACHD1Q5VU97 B4GALT2-201ENST00000309519 2004 ntTSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
CACHD1Q5VU97 EPN3-216ENST00000537145 2223 ntTSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
CACHD1Q5VU97 ETV7-206ENST00000615781 1776 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
CACHD1Q5VU97 TRIM58-201ENST00000366481 3225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
CACHD1Q5VU97 MFSD1-219ENST00000622669 2361 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
CACHD1Q5VU97 LRRC1-202ENST00000370888 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
CACHD1Q5VU97 NEU4-201ENST00000325935 2288 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
CACHD1Q5VU97 PCSK7-201ENST00000320934 4649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
CACHD1Q5VU97 ILKAP-201ENST00000254654 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
CACHD1Q5VU97 ATP5D-201ENST00000215375 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
CACHD1Q5VU97 C1QBP-201ENST00000225698 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
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CACHD1Q5VU97 AL390719.1-201ENST00000427998 977 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
CACHD1Q5VU97 SBF2-AS1-202ENST00000499953 854 ntTSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
CACHD1Q5VU97 GNB5-211ENST00000560116 918 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
CACHD1Q5VU97 LINC02167-201ENST00000562769 594 ntTSL 3 BASIC19.06■□□□□ 0.64
CACHD1Q5VU97 IMPA2-208ENST00000589238 923 ntTSL 3 BASIC19.06■□□□□ 0.64
CACHD1Q5VU97 CTBP2-205ENST00000411419 2036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
CACHD1Q5VU97 AL035252.2-201ENST00000454676 3168 ntTSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
CACHD1Q5VU97 MED25-201ENST00000312865 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
CACHD1Q5VU97 PRKAG2-203ENST00000418337 2318 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
CACHD1Q5VU97 PSMD8-201ENST00000215071 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
CACHD1Q5VU97 HDAC1-201ENST00000373548 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
CACHD1Q5VU97 EMC8-202ENST00000435200 1935 ntTSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
CACHD1Q5VU97 OSTM1-201ENST00000193322 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
CACHD1Q5VU97 PRSS12-201ENST00000296498 4809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
CACHD1Q5VU97 GRK2-201ENST00000308595 3466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
CACHD1Q5VU97 PLA2G15-202ENST00000413021 1346 ntTSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
CACHD1Q5VU97 COMMD7-202ENST00000446419 1343 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
CACHD1Q5VU97 FAM3A-215ENST00000447601 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
CACHD1Q5VU97 PCDH1-201ENST00000287008 4793 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
CACHD1Q5VU97 JAK2-201ENST00000381652 5285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
CACHD1Q5VU97 TRMT2A-201ENST00000252136 2964 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
CACHD1Q5VU97 PTPRCAP-201ENST00000326294 1292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
CACHD1Q5VU97 MRGPRG-201ENST00000332314 870 ntAPPRIS P1 BASIC19.05■□□□□ 0.64
CACHD1Q5VU97 USF2-203ENST00000379134 648 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
CACHD1Q5VU97 AC019257.1-201ENST00000517676 557 ntTSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
CACHD1Q5VU97 ANKRD2-202ENST00000307518 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
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