Protein–RNA interactions for Protein: Q53RE8

ANKRD39, Ankyrin repeat domain-containing protein 39, humanhuman

Predictions only

Length 183 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ANKRD39Q53RE8 HDAC10-201ENST00000216271 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
ANKRD39Q53RE8 C16orf71-204ENST00000590191 2564 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
ANKRD39Q53RE8 ATP6V1H-201ENST00000355221 2365 ntTSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
ANKRD39Q53RE8 RTN4-204ENST00000357732 2390 ntTSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
ANKRD39Q53RE8 PCDHA13-201ENST00000289272 5260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
ANKRD39Q53RE8 EIF5-201ENST00000216554 5945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
ANKRD39Q53RE8 RREB1-203ENST00000379933 5826 ntTSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
ANKRD39Q53RE8 TRIM63-201ENST00000374272 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
ANKRD39Q53RE8 LRP1-204ENST00000553277 1693 ntTSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
ANKRD39Q53RE8 B3GALT5-206ENST00000615480 2617 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.89□□□□□ -0.19
ANKRD39Q53RE8 RALGAPA1-219ENST00000637992 8512 ntTSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
ANKRD39Q53RE8 LMTK2-201ENST00000297293 8946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
ANKRD39Q53RE8 SENP5-202ENST00000419026 973 ntTSL 3 BASIC13.89□□□□□ -0.19
ANKRD39Q53RE8 CTSO-201ENST00000433477 2954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
ANKRD39Q53RE8 ATP6V0E2-204ENST00000464662 513 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.89□□□□□ -0.19
ANKRD39Q53RE8 BRSK1-206ENST00000590333 2977 ntTSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
ANKRD39Q53RE8 TAPT1-201ENST00000405303 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
ANKRD39Q53RE8 TACC3-201ENST00000313288 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
ANKRD39Q53RE8 SIL1-202ENST00000394817 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
ANKRD39Q53RE8 LRCH1-202ENST00000389797 3314 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
ANKRD39Q53RE8 RPH3AL-222ENST00000618002 2578 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
ANKRD39Q53RE8 STRN4-201ENST00000263280 3210 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
ANKRD39Q53RE8 NR2C2-206ENST00000425241 2494 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.89□□□□□ -0.19
ANKRD39Q53RE8 HTR7P1-202ENST00000624664 4411 ntBASIC13.89□□□□□ -0.19
ANKRD39Q53RE8 PPCDC-201ENST00000342932 2250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
ANKRD39Q53RE8 AL355987.4-201ENST00000415992 4244 ntTSL 2 BASIC13.89□□□□□ -0.19
ANKRD39Q53RE8 MOB3C-202ENST00000319928 2822 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.89□□□□□ -0.19
ANKRD39Q53RE8 RAB3A-201ENST00000222256 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
ANKRD39Q53RE8 UBAP1-203ENST00000379186 2524 ntTSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
ANKRD39Q53RE8 CD68-201ENST00000250092 1878 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
ANKRD39Q53RE8 ABHD17B-202ENST00000377041 1312 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
ANKRD39Q53RE8 SNAP91-201ENST00000195649 4434 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
ANKRD39Q53RE8 SNAP91-204ENST00000369694 4449 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
ANKRD39Q53RE8 COBLL1-201ENST00000342193 4898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
ANKRD39Q53RE8 SLC31A2-201ENST00000259392 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
ANKRD39Q53RE8 AL121749.1-201ENST00000635993 1768 ntTSL 5 BASIC13.88□□□□□ -0.19
ANKRD39Q53RE8 LIN28B-AS1-203ENST00000636682 1797 ntTSL 3 BASIC13.88□□□□□ -0.19
ANKRD39Q53RE8 C19orf54-201ENST00000378313 2753 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.88□□□□□ -0.19
ANKRD39Q53RE8 RND2-202ENST00000587250 4147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
ANKRD39Q53RE8 ZNF454-202ENST00000519564 2142 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.88□□□□□ -0.19
ANKRD39Q53RE8 CACNA1A-247ENST00000637769 8648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
ANKRD39Q53RE8 DDX59-206ENST00000447706 2900 ntTSL 2 BASIC13.88□□□□□ -0.19
ANKRD39Q53RE8 TCF25-225ENST00000614813 2047 ntTSL 5 BASIC13.88□□□□□ -0.19
ANKRD39Q53RE8 PDPK2P-201ENST00000382326 2387 ntTSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
ANKRD39Q53RE8 AL121758.1-201ENST00000488788 2714 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.88□□□□□ -0.19
ANKRD39Q53RE8 SBF2-AS1-201ENST00000498905 2709 ntTSL 5 BASIC13.88□□□□□ -0.19
ANKRD39Q53RE8 ZNF746-202ENST00000458143 3797 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.88□□□□□ -0.19
ANKRD39Q53RE8 AC055733.4-201ENST00000638462 1354 ntBASIC13.88□□□□□ -0.19
ANKRD39Q53RE8 PRPS1-204ENST00000372435 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
ANKRD39Q53RE8 ABTB1-206ENST00000468137 2065 ntTSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
ANKRD39Q53RE8 CDCA5-202ENST00000404147 1012 ntTSL 2 BASIC13.88□□□□□ -0.19
ANKRD39Q53RE8 PTPMT1-203ENST00000426530 1014 ntTSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
ANKRD39Q53RE8 AC073111.5-204ENST00000498682 1167 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.88□□□□□ -0.19
ANKRD39Q53RE8 TYMP-202ENST00000395678 1614 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
ANKRD39Q53RE8 TBC1D10A-204ENST00000403477 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.88□□□□□ -0.19
ANKRD39Q53RE8 AC114490.1-202ENST00000311990 1887 ntTSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
ANKRD39Q53RE8 AKIRIN1-202ENST00000432648 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
ANKRD39Q53RE8 EGFL6-201ENST00000361306 2398 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
ANKRD39Q53RE8 KLHL33-202ENST00000636854 2394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.88□□□□□ -0.19
ANKRD39Q53RE8 ST6GALNAC6-215ENST00000542456 2018 ntTSL 2 BASIC13.88□□□□□ -0.19
ANKRD39Q53RE8 VRK2-207ENST00000440705 1676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
ANKRD39Q53RE8 ADAM15-207ENST00000368413 1901 ntTSL 5 BASIC13.88□□□□□ -0.19
ANKRD39Q53RE8 PIGQ-204ENST00000409527 1915 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.88□□□□□ -0.19
ANKRD39Q53RE8 PANX1-202ENST00000436171 2750 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
ANKRD39Q53RE8 KCNK3-201ENST00000302909 6162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
ANKRD39Q53RE8 FAM102B-202ENST00000405454 1585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.88□□□□□ -0.19
ANKRD39Q53RE8 CXXC4-201ENST00000394767 5565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.88□□□□□ -0.19
ANKRD39Q53RE8 TMEM209-202ENST00000462753 2322 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.87□□□□□ -0.19
ANKRD39Q53RE8 LEMD3-201ENST00000308330 4764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
ANKRD39Q53RE8 GRK6-211ENST00000528793 2571 ntTSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
ANKRD39Q53RE8 ST3GAL4-213ENST00000530591 1459 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
ANKRD39Q53RE8 PNLIPRP2-204ENST00000591655 1456 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.87□□□□□ -0.19
ANKRD39Q53RE8 ACBD4-203ENST00000398322 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
ANKRD39Q53RE8 PLBD2-201ENST00000280800 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
ANKRD39Q53RE8 CD276-201ENST00000318424 2738 ntTSL 5 BASIC13.87□□□□□ -0.19
ANKRD39Q53RE8 CLIP2-201ENST00000223398 5563 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.87□□□□□ -0.19
ANKRD39Q53RE8 SLC4A3-204ENST00000373760 4134 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.87□□□□□ -0.19
ANKRD39Q53RE8 LRPPRC-202ENST00000409659 1610 ntTSL 5 BASIC13.87□□□□□ -0.19
ANKRD39Q53RE8 RUSC1-AS1-203ENST00000450199 1636 ntTSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
ANKRD39Q53RE8 MAPK8IP3-201ENST00000250894 5661 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
ANKRD39Q53RE8 TMEM70-201ENST00000312184 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
ANKRD39Q53RE8 GTSE1-AS1-202ENST00000623117 1518 ntBASIC13.87□□□□□ -0.19
ANKRD39Q53RE8 TSPAN10-204ENST00000611590 1068 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
ANKRD39Q53RE8 SLC9A6-208ENST00000636206 4711 ntTSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
ANKRD39Q53RE8 MEGF9-201ENST00000373930 6298 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.87□□□□□ -0.19
ANKRD39Q53RE8 CBWD3-202ENST00000377342 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
ANKRD39Q53RE8 DPP3P2-201ENST00000416030 1696 ntBASIC13.87□□□□□ -0.19
ANKRD39Q53RE8 TACC3-213ENST00000617535 1693 ntTSL 5 BASIC13.87□□□□□ -0.19
ANKRD39Q53RE8 HNF1A-215ENST00000615446 2344 ntTSL 5 BASIC13.87□□□□□ -0.19
ANKRD39Q53RE8 TXNRD3-203ENST00000524230 2950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
ANKRD39Q53RE8 C1orf56-201ENST00000368926 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
ANKRD39Q53RE8 MTFR1L-202ENST00000374301 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
ANKRD39Q53RE8 NMRK1-203ENST00000376811 2050 ntTSL 2 BASIC13.87□□□□□ -0.19
ANKRD39Q53RE8 CRKL-201ENST00000354336 5325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
ANKRD39Q53RE8 MUTYH-203ENST00000372098 1839 ntTSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
ANKRD39Q53RE8 MUTYH-204ENST00000372104 1823 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
ANKRD39Q53RE8 MUTYH-205ENST00000372110 1809 ntTSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
ANKRD39Q53RE8 GPRC5B-201ENST00000300571 5213 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
ANKRD39Q53RE8 TMEM183A-201ENST00000367242 3019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
ANKRD39Q53RE8 HRASLS5-206ENST00000540857 3032 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 54.3 ms