Protein–RNA interactions for Protein: Q53GQ0

HSD17B12, Very-long-chain 3-oxoacyl-CoA reductase, humanhuman

Predictions only

Length 312 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HSD17B12Q53GQ0 PRDM11-201ENST00000424263 1858 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
HSD17B12Q53GQ0 ARHGDIA-202ENST00000400721 1568 ntTSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
HSD17B12Q53GQ0 SEPT7-206ENST00000435235 1584 ntTSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
HSD17B12Q53GQ0 AC009113.1-201ENST00000570267 2443 ntBASIC17.04■□□□□ 0.32
HSD17B12Q53GQ0 GDF15-201ENST00000252809 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
HSD17B12Q53GQ0 JTB-203ENST00000368589 1216 ntTSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
HSD17B12Q53GQ0 CD58-201ENST00000369487 892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
HSD17B12Q53GQ0 CD58-202ENST00000369489 1098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
HSD17B12Q53GQ0 RAB43-208ENST00000615093 783 ntTSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
HSD17B12Q53GQ0 AC100791.3-201ENST00000617619 330 ntBASIC17.04■□□□□ 0.32
HSD17B12Q53GQ0 CDCA4-202ENST00000392590 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
HSD17B12Q53GQ0 SIGLEC14-201ENST00000360844 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
HSD17B12Q53GQ0 GORASP1-206ENST00000422110 2523 ntTSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
HSD17B12Q53GQ0 ST3GAL4-203ENST00000392669 1724 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
HSD17B12Q53GQ0 YPEL5-205ENST00000402708 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
HSD17B12Q53GQ0 CACTIN-201ENST00000221899 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
HSD17B12Q53GQ0 SCD5-201ENST00000273908 1995 ntTSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
HSD17B12Q53GQ0 ACSF2-201ENST00000300441 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
HSD17B12Q53GQ0 CASKIN2-201ENST00000321617 5015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
HSD17B12Q53GQ0 TFEB-203ENST00000358871 2188 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
HSD17B12Q53GQ0 AC068446.2-201ENST00000500487 2165 ntTSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
HSD17B12Q53GQ0 MCU-202ENST00000373053 2949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
HSD17B12Q53GQ0 SAMD3-202ENST00000368134 2377 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
HSD17B12Q53GQ0 PKN1-201ENST00000242783 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
HSD17B12Q53GQ0 GRM2-204ENST00000442933 2064 ntTSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
HSD17B12Q53GQ0 ASPHD1-201ENST00000308748 1584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
HSD17B12Q53GQ0 SETD7-202ENST00000404104 1590 ntTSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
HSD17B12Q53GQ0 MARC2-201ENST00000359316 1335 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
HSD17B12Q53GQ0 NADK-201ENST00000341426 3235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
HSD17B12Q53GQ0 WDR34-201ENST00000372715 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
HSD17B12Q53GQ0 DEF8-211ENST00000563795 1767 ntTSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
HSD17B12Q53GQ0 AC135050.7-201ENST00000624508 2218 ntBASIC17.03■□□□□ 0.32
HSD17B12Q53GQ0 EXD3-208ENST00000479452 962 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
HSD17B12Q53GQ0 RPS15-210ENST00000592623 873 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
HSD17B12Q53GQ0 HAS1-203ENST00000594621 760 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
HSD17B12Q53GQ0 UBE2Q2P2-204ENST00000618775 648 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
HSD17B12Q53GQ0 TMEM182-210ENST00000639249 1025 ntTSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
HSD17B12Q53GQ0 TMEM109-201ENST00000227525 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
HSD17B12Q53GQ0 MCIDAS-201ENST00000513312 1736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
HSD17B12Q53GQ0 TBXA2R-202ENST00000411851 1494 ntTSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
HSD17B12Q53GQ0 GMPPA-213ENST00000622191 1473 ntTSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
HSD17B12Q53GQ0 MICU2-201ENST00000382374 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
HSD17B12Q53GQ0 C15orf56-202ENST00000623360 2129 ntTSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
HSD17B12Q53GQ0 TEX21P-204ENST00000641479 1693 ntBASIC17.03■□□□□ 0.32
HSD17B12Q53GQ0 WBP2-219ENST00000626827 1867 ntTSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
HSD17B12Q53GQ0 RPS6KA1-204ENST00000374168 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
HSD17B12Q53GQ0 SLC5A10-203ENST00000395645 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
HSD17B12Q53GQ0 ADCY3-201ENST00000260600 5050 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
HSD17B12Q53GQ0 SPRED3-202ENST00000586301 1366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
HSD17B12Q53GQ0 DDX51-202ENST00000397333 4718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
HSD17B12Q53GQ0 ISOC2-203ENST00000438389 1566 ntTSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
HSD17B12Q53GQ0 GLIS1-201ENST00000312233 2812 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
HSD17B12Q53GQ0 GLIS1-202ENST00000628545 2807 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
HSD17B12Q53GQ0 ACVR1B-205ENST00000541224 1791 ntTSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
HSD17B12Q53GQ0 TNFAIP2-201ENST00000333007 4175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
HSD17B12Q53GQ0 GCOM1-201ENST00000380568 1516 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
HSD17B12Q53GQ0 PPM1D-204ENST00000629650 1525 ntTSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
HSD17B12Q53GQ0 GBGT1-208ENST00000540636 1934 ntTSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
HSD17B12Q53GQ0 NIPAL2-202ENST00000430223 4496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
HSD17B12Q53GQ0 NAPRT-203ENST00000435154 1877 ntTSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
HSD17B12Q53GQ0 GCDH-216ENST00000591470 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
HSD17B12Q53GQ0 SPEG-203ENST00000396688 1457 ntTSL 3 BASIC17.02■□□□□ 0.32
HSD17B12Q53GQ0 MORF4L1-215ENST00000559345 1468 ntTSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
HSD17B12Q53GQ0 BABAM1-208ENST00000598188 1470 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
HSD17B12Q53GQ0 IRF3-221ENST00000598808 1468 ntTSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
HSD17B12Q53GQ0 CACNA1A-227ENST00000636549 6792 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
HSD17B12Q53GQ0 TM4SF5-201ENST00000270560 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
HSD17B12Q53GQ0 UCN-201ENST00000296099 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
HSD17B12Q53GQ0 AC007322.4-201ENST00000509611 723 ntBASIC17.02■□□□□ 0.32
HSD17B12Q53GQ0 BRI3-207ENST00000539286 699 ntTSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
HSD17B12Q53GQ0 SRRM2-231ENST00000630499 1207 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
HSD17B12Q53GQ0 AC093762.2-201ENST00000641700 291 ntAPPRIS P1 BASIC17.02■□□□□ 0.32
HSD17B12Q53GQ0 GTF2IP4-202ENST00000544802 3609 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
HSD17B12Q53GQ0 DAG1-220ENST00000539901 5665 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.31
HSD17B12Q53GQ0 TMEM91-209ENST00000539627 1843 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
HSD17B12Q53GQ0 ADGRG2-208ENST00000379873 4698 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
HSD17B12Q53GQ0 MAFF-207ENST00000538999 2365 ntTSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.31
HSD17B12Q53GQ0 NOMO2-212ENST00000622306 4252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
HSD17B12Q53GQ0 SLC47A1-202ENST00000395585 1998 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
HSD17B12Q53GQ0 CCNL2-201ENST00000400809 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
HSD17B12Q53GQ0 MCCC1-215ENST00000629669 2316 ntTSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.31
HSD17B12Q53GQ0 CHRND-201ENST00000258385 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
HSD17B12Q53GQ0 COPS7A-215ENST00000543155 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
HSD17B12Q53GQ0 POLR3E-209ENST00000564209 2464 ntTSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.31
HSD17B12Q53GQ0 CDK11B-208ENST00000629289 2490 ntTSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.31
HSD17B12Q53GQ0 CDK11B-209ENST00000629312 2496 ntTSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.31
HSD17B12Q53GQ0 FOXI3-201ENST00000428390 2804 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.02■□□□□ 0.31
HSD17B12Q53GQ0 ANKS3-202ENST00000446014 2265 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
HSD17B12Q53GQ0 GABBR1-202ENST00000376977 1739 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
HSD17B12Q53GQ0 CAMKK2-206ENST00000402834 2051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
HSD17B12Q53GQ0 GPT-202ENST00000394955 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
HSD17B12Q53GQ0 LAD1-202ENST00000391967 2906 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
HSD17B12Q53GQ0 ADCY8-201ENST00000286355 5938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
HSD17B12Q53GQ0 MAP3K11-210ENST00000532507 1812 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
HSD17B12Q53GQ0 HTR7P1-202ENST00000624664 4411 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
HSD17B12Q53GQ0 CEACAM4-201ENST00000221954 1205 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
HSD17B12Q53GQ0 FOXB2-201ENST00000376708 1299 ntAPPRIS P1 BASIC17.01■□□□□ 0.31
HSD17B12Q53GQ0 CEACAM4-203ENST00000600925 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
HSD17B12Q53GQ0 SP2-202ENST00000613139 908 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
HSD17B12Q53GQ0 AC013268.1-206ENST00000638368 961 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.9 ms