Protein–RNA interactions for Protein: Q29983

MICA, MHC class I polypeptide-related sequence A, humanhuman

Predictions only

Length 383 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MICAQ29983 FRMD8-208ENST00000531296 366 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
MICAQ29983 PTGER2-202ENST00000557436 643 ntTSL 3 BASIC17.77■□□□□ 0.44
MICAQ29983 AC092143.4-201ENST00000570217 559 ntTSL 4 BASIC17.77■□□□□ 0.44
MICAQ29983 ANAPC11-208ENST00000572851 686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
MICAQ29983 AC011767.1-201ENST00000617410 1153 ntBASIC17.77■□□□□ 0.44
MICAQ29983 AC000035.1-201ENST00000634116 343 ntTSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
MICAQ29983 GPR142-201ENST00000335666 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
MICAQ29983 AL390961.4-201ENST00000623958 2535 ntBASIC17.77■□□□□ 0.44
MICAQ29983 CCNJ-202ENST00000403870 2830 ntTSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
MICAQ29983 LGI2-201ENST00000382114 6428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
MICAQ29983 SLC6A9-201ENST00000357730 2168 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
MICAQ29983 ZNF280B-203ENST00000626650 5721 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.43
MICAQ29983 AC020763.4-201ENST00000623414 4170 ntBASIC17.77■□□□□ 0.43
MICAQ29983 TMEM91-203ENST00000392002 1389 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.43
MICAQ29983 ADCY5-202ENST00000462833 7311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
MICAQ29983 FER1L4-211ENST00000616283 1818 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
MICAQ29983 CABIN1-202ENST00000337989 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
MICAQ29983 CGRRF1-201ENST00000216420 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
MICAQ29983 NUP50-AS1-201ENST00000426282 2076 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
MICAQ29983 SHANK3-203ENST00000445220 5175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
MICAQ29983 SEMA3D-202ENST00000444867 1605 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
MICAQ29983 AC138430.1-201ENST00000586064 5409 ntTSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
MICAQ29983 PLIN5-201ENST00000381848 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
MICAQ29983 PARP15-202ENST00000464300 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
MICAQ29983 AP001351.1-201ENST00000501397 1865 ntTSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
MICAQ29983 GPRC5C-205ENST00000481232 1592 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
MICAQ29983 NUDT4-202ENST00000415493 4839 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
MICAQ29983 P2RX2-202ENST00000348800 1222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
MICAQ29983 SPOCK2-203ENST00000412663 1284 ntTSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
MICAQ29983 APTR-203ENST00000430801 583 ntTSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
MICAQ29983 P2RX2-207ENST00000449132 1113 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
MICAQ29983 SERP1-205ENST00000487153 657 ntTSL 4 BASIC17.76■□□□□ 0.43
MICAQ29983 NDUFS3-207ENST00000529276 558 ntTSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
MICAQ29983 SEPHS1-206ENST00000545675 2988 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
MICAQ29983 ANAPC11-212ENST00000577425 603 ntTSL 3 BASIC17.76■□□□□ 0.43
MICAQ29983 ATRAID-208ENST00000611786 1256 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
MICAQ29983 BID-214ENST00000617586 542 ntTSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
MICAQ29983 PARP1-210ENST00000629232 477 ntTSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
MICAQ29983 AL133516.1-201ENST00000633012 540 ntTSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
MICAQ29983 ANKS3-201ENST00000304283 2662 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
MICAQ29983 UBL4A-202ENST00000369660 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
MICAQ29983 STMN3-202ENST00000540534 2351 ntTSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
MICAQ29983 GOSR2-226ENST00000639287 2367 ntTSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
MICAQ29983 CD177-203ENST00000618265 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
MICAQ29983 UBE2E1-201ENST00000306627 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
MICAQ29983 AC087457.1-201ENST00000503496 2727 ntTSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
MICAQ29983 PDLIM4-201ENST00000253754 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
MICAQ29983 TMEM176B-203ENST00000434545 1303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
MICAQ29983 AC073107.1-201ENST00000633579 1962 ntTSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
MICAQ29983 CFP-203ENST00000396992 1592 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
MICAQ29983 C21orf91-203ENST00000400559 1593 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
MICAQ29983 SEC14L2-215ENST00000617837 2632 ntTSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
MICAQ29983 ZNF205-206ENST00000620094 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
MICAQ29983 PODXL2-201ENST00000342480 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
MICAQ29983 OIP5-201ENST00000220514 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
MICAQ29983 UTF1-201ENST00000304477 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
MICAQ29983 ATP5C1-202ENST00000356708 1163 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
MICAQ29983 IL15RA-201ENST00000379971 588 ntTSL 3 BASIC17.75■□□□□ 0.43
MICAQ29983 MCRIP1-203ENST00000538396 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
MICAQ29983 DHRS4-207ENST00000559632 1003 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
MICAQ29983 LINC01976-201ENST00000565120 434 ntTSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
MICAQ29983 ARFRP1-202ENST00000607873 1061 ntTSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
MICAQ29983 ACBD4-216ENST00000619916 1276 ntTSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
MICAQ29983 AC231657.2-201ENST00000624556 255 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
MICAQ29983 TOR2A-203ENST00000373284 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
MICAQ29983 NEUROD2-201ENST00000302584 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
MICAQ29983 CLK1-205ENST00000434813 2026 ntTSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
MICAQ29983 DCBLD2-201ENST00000326840 6122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
MICAQ29983 OTOP2-201ENST00000331427 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
MICAQ29983 MEN1-205ENST00000377316 2868 ntTSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
MICAQ29983 PPFIA1-202ENST00000389547 4133 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
MICAQ29983 KRT8-216ENST00000552551 2126 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
MICAQ29983 CASC2-205ENST00000454781 2216 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
MICAQ29983 FP475955.4-201ENST00000623131 1990 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
MICAQ29983 WNT6-201ENST00000233948 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
MICAQ29983 ABHD14A-ACY1-202ENST00000463937 1705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
MICAQ29983 CCDC17-209ENST00000528266 2181 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
MICAQ29983 AC011416.4-201ENST00000639283 2195 ntTSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
MICAQ29983 RNF139-201ENST00000303545 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
MICAQ29983 TCTN1-223ENST00000550703 2149 ntTSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
MICAQ29983 LLGL2-203ENST00000392550 3509 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
MICAQ29983 PACSIN2-203ENST00000402229 1883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
MICAQ29983 PHLDA1-202ENST00000602540 5741 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
MICAQ29983 DKK3-202ENST00000396505 2650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
MICAQ29983 AL512625.2-201ENST00000417533 625 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
MICAQ29983 DIMT1-202ENST00000506390 1208 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
MICAQ29983 AC009093.4-201ENST00000567984 561 ntTSL 4 BASIC17.74■□□□□ 0.43
MICAQ29983 NUTM2F-202ENST00000341207 2516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
MICAQ29983 NUTM2G-202ENST00000372322 2516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
MICAQ29983 LINC01586-201ENST00000506090 1840 ntTSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
MICAQ29983 RASSF1-210ENST00000616212 1842 ntTSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
MICAQ29983 PKN1-201ENST00000242783 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
MICAQ29983 ARNT-202ENST00000358595 4887 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
MICAQ29983 AC011944.1-201ENST00000316148 1900 ntTSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
MICAQ29983 FOXI3-201ENST00000428390 2804 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.74■□□□□ 0.43
MICAQ29983 ZNF302-206ENST00000505242 2849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
MICAQ29983 SGCE-207ENST00000447873 1597 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
MICAQ29983 WNT8B-201ENST00000343737 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
MICAQ29983 C19orf25-207ENST00000588871 2128 ntTSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
MICAQ29983 RAB11B-201ENST00000328024 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.1 ms