Protein–RNA interactions for Protein: Q16384

SSX1, Protein SSX1, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SSX1Q16384 GAS2L1P2-201ENST00000436355 1356 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
SSX1Q16384 ARRB1-201ENST00000360025 1895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
SSX1Q16384 GAREM2-201ENST00000401533 4161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
SSX1Q16384 RNPS1-202ENST00000320225 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
SSX1Q16384 ZDHHC24-203ENST00000526986 1424 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
SSX1Q16384 TMC6-202ENST00000322914 2786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
SSX1Q16384 GOLGA3-203ENST00000456883 5496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
SSX1Q16384 CAPS-201ENST00000452990 1789 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
SSX1Q16384 HES4-201ENST00000304952 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
SSX1Q16384 LINC01659-202ENST00000449711 917 ntTSL 3 BASIC17.16■□□□□ 0.34
SSX1Q16384 SMIM20-201ENST00000506197 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
SSX1Q16384 TESC-206ENST00000541210 936 ntTSL 3 BASIC17.16■□□□□ 0.34
SSX1Q16384 AC010999.2-201ENST00000621974 596 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
SSX1Q16384 NARFL-218ENST00000568545 2486 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
SSX1Q16384 BRMS1L-201ENST00000216807 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
SSX1Q16384 BCS1L-201ENST00000359273 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
SSX1Q16384 BX322557.1-202ENST00000400362 1460 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
SSX1Q16384 QPCTL-202ENST00000366382 1814 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
SSX1Q16384 IRX1P1-201ENST00000438849 1838 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
SSX1Q16384 RBFOX1-204ENST00000422070 1684 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
SSX1Q16384 KLHDC4-201ENST00000270583 1886 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
SSX1Q16384 SOCS2-210ENST00000551556 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
SSX1Q16384 AK1-203ENST00000373176 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
SSX1Q16384 ULK2-201ENST00000361658 3908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
SSX1Q16384 SPHK2-213ENST00000601712 1394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
SSX1Q16384 ZNF131-206ENST00000505606 3209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
SSX1Q16384 SNAP23-201ENST00000249647 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
SSX1Q16384 ATXN7L2-202ENST00000369870 2318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
SSX1Q16384 RFXANK-201ENST00000303088 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
SSX1Q16384 MTX1-201ENST00000316721 1441 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
SSX1Q16384 ZNF211-203ENST00000299871 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.15■□□□□ 0.34
SSX1Q16384 FAM234A-203ENST00000399932 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
SSX1Q16384 CDKN2AIPNL-201ENST00000395009 800 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
SSX1Q16384 DHRS4-202ENST00000397074 785 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
SSX1Q16384 RHOF-204ENST00000537265 699 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
SSX1Q16384 PHC1-212ENST00000543824 4292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
SSX1Q16384 C3orf70-201ENST00000335012 5901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
SSX1Q16384 PTGIR-201ENST00000291294 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
SSX1Q16384 BAIAP2L2-202ENST00000381669 2146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
SSX1Q16384 NOP9-202ENST00000396802 1942 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
SSX1Q16384 KDELR3-201ENST00000216014 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
SSX1Q16384 UBE2E1-201ENST00000306627 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
SSX1Q16384 BSCL2-207ENST00000407022 1516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
SSX1Q16384 HOXD10-201ENST00000249501 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
SSX1Q16384 TGIF1-207ENST00000407501 1585 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.15■□□□□ 0.34
SSX1Q16384 CCM2-207ENST00000475551 2471 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.34
SSX1Q16384 DND1-201ENST00000542735 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
SSX1Q16384 HPS3-202ENST00000460120 2745 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
SSX1Q16384 AFG3L1P-203ENST00000418696 2965 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
SSX1Q16384 CTSB-202ENST00000353047 3875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
SSX1Q16384 ISYNA1-206ENST00000578963 1691 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
SSX1Q16384 RHOU-201ENST00000366691 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
SSX1Q16384 FBXL15-201ENST00000224862 2362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
SSX1Q16384 CCNI2-201ENST00000378731 2355 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
SSX1Q16384 SAMD11-215ENST00000618779 2368 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
SSX1Q16384 KLHL33-202ENST00000636854 2394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
SSX1Q16384 HAUS4-202ENST00000342454 1474 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
SSX1Q16384 CDH24-201ENST00000267383 2873 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
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SSX1Q16384 EFNA2-201ENST00000215368 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
SSX1Q16384 EIF6-203ENST00000374450 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
SSX1Q16384 ASMT-202ENST00000381233 989 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
SSX1Q16384 NGEF-203ENST00000409079 1022 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
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SSX1Q16384 NLGN2-204ENST00000575301 4374 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
SSX1Q16384 CCDC107-205ENST00000421582 1324 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
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SSX1Q16384 APP-202ENST00000348990 3355 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
SSX1Q16384 PLAGL1-207ENST00000417959 1645 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
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SSX1Q16384 LINC02228-203ENST00000641970 1355 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
SSX1Q16384 RIMKLB-202ENST00000357529 5830 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
SSX1Q16384 TOR3A-203ENST00000367627 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
SSX1Q16384 GSDMD-206ENST00000526406 2496 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
SSX1Q16384 STX3-201ENST00000337979 3299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
SSX1Q16384 P2RX5-203ENST00000547178 1998 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
SSX1Q16384 TMEM230-207ENST00000379286 1735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
SSX1Q16384 PRKCI-201ENST00000295797 4950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
SSX1Q16384 SLC39A1-209ENST00000537590 2022 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
SSX1Q16384 PRRT2-212ENST00000636619 2065 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
SSX1Q16384 RRNAD1-202ENST00000368218 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.13■□□□□ 0.33
SSX1Q16384 PABPC1L-202ENST00000217074 1263 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
SSX1Q16384 RPLP0-201ENST00000228306 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
SSX1Q16384 DCLK1-203ENST00000379892 2101 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
SSX1Q16384 AC009086.2-201ENST00000449759 610 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.13■□□□□ 0.33
SSX1Q16384 AC022509.3-202ENST00000545819 566 ntTSL 3 BASIC17.13■□□□□ 0.33
SSX1Q16384 AL591742.1-201ENST00000604433 565 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
SSX1Q16384 ZXDB-201ENST00000374888 5894 ntAPPRIS P1 BASIC17.13■□□□□ 0.33
SSX1Q16384 TBX20-201ENST00000408931 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
SSX1Q16384 AC135782.1-201ENST00000537498 2154 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
SSX1Q16384 KCNC2-203ENST00000393288 2485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
SSX1Q16384 PGRMC2-208ENST00000613358 3783 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
SSX1Q16384 TRPV4-208ENST00000544971 2295 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
SSX1Q16384 PRSS33-201ENST00000293851 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
SSX1Q16384 CNIH2-201ENST00000311445 1356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
SSX1Q16384 CCNA1-202ENST00000440264 1758 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
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