Protein–RNA interactions for Protein: Q15906

VPS72, Vacuolar protein sorting-associated protein 72 homolog, humanhuman

Predictions only

Length 364 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VPS72Q15906 RNF39-201ENST00000244360 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
VPS72Q15906 CPEB1-AS1-201ENST00000560650 2138 ntTSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
VPS72Q15906 MAP3K3-210ENST00000584573 2480 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
VPS72Q15906 RSRC1-211ENST00000480820 1410 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.47■■□□□ 1.67
VPS72Q15906 HLX-201ENST00000366903 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
VPS72Q15906 PPP4C-202ENST00000561610 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
VPS72Q15906 SPCS1-201ENST00000233025 1082 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
VPS72Q15906 SYS1-202ENST00000372727 813 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.47■■□□□ 1.67
VPS72Q15906 EEF1E1-202ENST00000429723 562 ntTSL 3 BASIC25.47■■□□□ 1.67
VPS72Q15906 TOB2P1-201ENST00000469761 992 ntBASIC25.47■■□□□ 1.67
VPS72Q15906 CLDN7-204ENST00000571881 735 ntTSL 3 BASIC25.47■■□□□ 1.67
VPS72Q15906 AF228730.7-201ENST00000641842 219 ntBASIC25.47■■□□□ 1.67
VPS72Q15906 TSR2-201ENST00000375151 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
VPS72Q15906 AC140125.2-201ENST00000502515 1517 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
VPS72Q15906 AC116565.2-201ENST00000637674 1854 ntTSL 2 BASIC25.47■■□□□ 1.67
VPS72Q15906 IRX4-202ENST00000505790 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
VPS72Q15906 FBXW9-203ENST00000587955 1437 ntTSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
VPS72Q15906 LAYN-204ENST00000525126 1763 ntTSL 5 BASIC25.46■■□□□ 1.67
VPS72Q15906 DPY19L1-209ENST00000638088 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.46■■□□□ 1.67
VPS72Q15906 AC124066.1-201ENST00000581122 1660 ntTSL 5 BASIC25.46■■□□□ 1.67
VPS72Q15906 LHX2-201ENST00000373615 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
VPS72Q15906 VAMP5-201ENST00000306384 689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
VPS72Q15906 CELA2A-201ENST00000359621 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
VPS72Q15906 AC005056.1-201ENST00000435932 532 ntTSL 4 BASIC25.46■■□□□ 1.67
VPS72Q15906 AL356056.2-201ENST00000506914 669 ntTSL 4 BASIC25.46■■□□□ 1.67
VPS72Q15906 NAA38-203ENST00000575071 553 ntTSL 2 BASIC25.46■■□□□ 1.67
VPS72Q15906 SRSF1-209ENST00000585096 568 ntTSL 4 BASIC25.46■■□□□ 1.67
VPS72Q15906 AC036176.1-201ENST00000589905 785 ntTSL 2 BASIC25.46■■□□□ 1.67
VPS72Q15906 ATP5D-207ENST00000591660 637 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.46■■□□□ 1.67
VPS72Q15906 AC024243.1-201ENST00000609234 778 ntBASIC25.46■■□□□ 1.67
VPS72Q15906 RXFP3-201ENST00000330120 1852 ntAPPRIS P1 BASIC25.46■■□□□ 1.67
VPS72Q15906 ASPG-201ENST00000546892 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
VPS72Q15906 FAM57B-204ENST00000564806 1710 ntTSL 2 BASIC25.46■■□□□ 1.67
VPS72Q15906 CRTC3-208ENST00000560098 1421 ntTSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
VPS72Q15906 SETD3-201ENST00000329331 1330 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
VPS72Q15906 MRPL43-208ENST00000370242 884 ntTSL 2 BASIC25.45■■□□□ 1.66
VPS72Q15906 MIR662-201ENST00000384847 95 ntBASIC25.45■■□□□ 1.66
VPS72Q15906 SLC2A1-204ENST00000460369 541 ntTSL 2 BASIC25.45■■□□□ 1.66
VPS72Q15906 RPL29-202ENST00000466397 742 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.45■■□□□ 1.66
VPS72Q15906 AC243773.2-203ENST00000612281 640 ntTSL 3 BASIC25.45■■□□□ 1.66
VPS72Q15906 AGAP2-AS1-201ENST00000542466 1500 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
VPS72Q15906 GAMT-202ENST00000447102 1769 ntTSL 2 BASIC25.45■■□□□ 1.66
VPS72Q15906 APBB3-204ENST00000358580 2020 ntTSL 5 BASIC25.45■■□□□ 1.66
VPS72Q15906 TMEM150C-201ENST00000449862 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
VPS72Q15906 SMYD2-201ENST00000366957 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
VPS72Q15906 TSPAN15-201ENST00000373290 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
VPS72Q15906 ST3GAL3-239ENST00000545417 1667 ntTSL 5 BASIC25.45■■□□□ 1.66
VPS72Q15906 RCN3-201ENST00000270645 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
VPS72Q15906 NCK2-201ENST00000233154 2683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
VPS72Q15906 SSBP2-218ENST00000514493 1790 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
VPS72Q15906 FAM19A5-202ENST00000358295 2638 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.44■■□□□ 1.66
VPS72Q15906 TBL1Y-202ENST00000355162 2376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
VPS72Q15906 ATP5J-201ENST00000284971 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
VPS72Q15906 CKLF-202ENST00000345436 571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
VPS72Q15906 DPYS-201ENST00000351513 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
VPS72Q15906 CST3-202ENST00000398409 832 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.44■■□□□ 1.66
VPS72Q15906 SEC61G-203ENST00000415949 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
VPS72Q15906 C1QB-203ENST00000509305 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
VPS72Q15906 UBXN1-210ENST00000529640 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
VPS72Q15906 AL353801.3-201ENST00000609898 542 ntBASIC25.44■■□□□ 1.66
VPS72Q15906 CIC-201ENST00000160740 6111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
VPS72Q15906 BCS1L-201ENST00000359273 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
VPS72Q15906 C6orf203-202ENST00000405204 1420 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.44■■□□□ 1.66
VPS72Q15906 CPNE9-202ENST00000383831 1751 ntTSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
VPS72Q15906 CRYBB2P1-202ENST00000382734 1364 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
VPS72Q15906 B3GNT6-202ENST00000622824 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
VPS72Q15906 L3HYPDH-201ENST00000247194 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
VPS72Q15906 LINC01558-202ENST00000495520 1652 ntTSL 2 BASIC25.43■■□□□ 1.66
VPS72Q15906 CLN6-201ENST00000249806 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
VPS72Q15906 P2RX4-202ENST00000337233 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
VPS72Q15906 TPM1-203ENST00000317516 738 ntTSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
VPS72Q15906 AC064807.1-202ENST00000423716 936 ntTSL 2 BASIC25.43■■□□□ 1.66
VPS72Q15906 PRSS21-202ENST00000450020 1106 ntTSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
VPS72Q15906 TPM1-218ENST00000559281 851 ntTSL 5 BASIC25.43■■□□□ 1.66
VPS72Q15906 AC009084.1-201ENST00000566869 317 ntTSL 5 BASIC25.43■■□□□ 1.66
VPS72Q15906 IRF3-202ENST00000377135 1442 ntTSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
VPS72Q15906 ETV7-202ENST00000340181 1719 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
VPS72Q15906 SLC2A8-203ENST00000373371 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
VPS72Q15906 EMC8-202ENST00000435200 1935 ntTSL 2 BASIC25.42■■□□□ 1.66
VPS72Q15906 TMEM14A-201ENST00000211314 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
VPS72Q15906 CCDC134-201ENST00000255784 1270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
VPS72Q15906 MSRB1-202ENST00000399753 847 ntTSL 3 BASIC25.42■■□□□ 1.66
VPS72Q15906 CRELD2-202ENST00000403427 1242 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
VPS72Q15906 AP003555.3-201ENST00000534086 432 ntTSL 4 BASIC25.42■■□□□ 1.66
VPS72Q15906 STX10-207ENST00000589083 1241 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
VPS72Q15906 RASGEF1C-201ENST00000361132 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
VPS72Q15906 CABP4-202ENST00000438189 1426 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
VPS72Q15906 MRPL3-201ENST00000264995 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
VPS72Q15906 CXorf40A-208ENST00000434353 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
VPS72Q15906 MKRN1-208ENST00000474576 1661 ntTSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
VPS72Q15906 NAGK-229ENST00000613852 1801 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
VPS72Q15906 ITGB1BP1-203ENST00000359712 2126 ntTSL 2 BASIC25.42■■□□□ 1.66
VPS72Q15906 PLEKHA8-201ENST00000258679 2293 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
VPS72Q15906 TERF2-201ENST00000254942 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
VPS72Q15906 TMEM204-202ENST00000566264 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
VPS72Q15906 NDUFAF6-203ENST00000396124 1798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.41■■□□□ 1.66
VPS72Q15906 TNFRSF19-202ENST00000382258 1625 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
VPS72Q15906 UNC93B1-201ENST00000227471 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
VPS72Q15906 ISLR2-202ENST00000419208 2306 ntTSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
VPS72Q15906 KCNK17-202ENST00000453413 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
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