Protein–RNA interactions for Protein: Q15642

TRIP10, Cdc42-interacting protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 601 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRIP10Q15642 GLIS1-202ENST00000628545 2807 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
TRIP10Q15642 TXNRD3-203ENST00000524230 2950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
TRIP10Q15642 UXS1-203ENST00000409501 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
TRIP10Q15642 ORC5-201ENST00000297431 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
TRIP10Q15642 RAB24-201ENST00000303251 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
TRIP10Q15642 MIF4GD-202ENST00000325102 1306 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
TRIP10Q15642 AKR7A3-201ENST00000361640 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
TRIP10Q15642 MRPS7-204ENST00000579761 1717 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
TRIP10Q15642 PDZD3-202ENST00000355547 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.54
TRIP10Q15642 SPRYD7-204ENST00000613924 2285 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.54
TRIP10Q15642 NOXA1-202ENST00000392815 1464 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.54
TRIP10Q15642 ZNF746-202ENST00000458143 3797 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
TRIP10Q15642 ATF5-202ENST00000595125 1637 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
TRIP10Q15642 SCARB1-203ENST00000415380 2731 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
TRIP10Q15642 PARD3-205ENST00000374773 3420 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
TRIP10Q15642 RAB24-202ENST00000303270 1385 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
TRIP10Q15642 SLC9A6-208ENST00000636206 4711 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
TRIP10Q15642 FAM3A-201ENST00000322269 1815 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
TRIP10Q15642 SLC47A1-202ENST00000395585 1998 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
TRIP10Q15642 GADD45A-201ENST00000370985 803 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
TRIP10Q15642 KRT18P5-201ENST00000436075 1291 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
TRIP10Q15642 PRKCQ-AS1-204ENST00000455810 920 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
TRIP10Q15642 RPLP2-207ENST00000530797 637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
TRIP10Q15642 POLR2E-214ENST00000619917 932 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
TRIP10Q15642 AC105233.4-201ENST00000642045 216 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
TRIP10Q15642 ZNF446-207ENST00000610298 1869 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
TRIP10Q15642 QPRT-202ENST00000395384 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
TRIP10Q15642 TPST2-201ENST00000338754 5697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
TRIP10Q15642 TES-201ENST00000358204 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
TRIP10Q15642 TDP2-202ENST00000378198 2071 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
TRIP10Q15642 LHX8-201ENST00000294638 2373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
TRIP10Q15642 PCSK5-202ENST00000376767 2845 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
TRIP10Q15642 CD55-206ENST00000391921 2433 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
TRIP10Q15642 SLC5A10-204ENST00000395647 2140 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
TRIP10Q15642 RREB1-201ENST00000334984 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
TRIP10Q15642 MELTF-202ENST00000296351 1650 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
TRIP10Q15642 RASL12-202ENST00000421977 1523 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
TRIP10Q15642 KIAA1324L-207ENST00000444627 3527 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
TRIP10Q15642 PCDHA13-201ENST00000289272 5260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
TRIP10Q15642 UBE2L6-202ENST00000340573 1573 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
TRIP10Q15642 ANKS3-230ENST00000614075 2387 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
TRIP10Q15642 SPI1-201ENST00000227163 1168 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
TRIP10Q15642 GUK1-207ENST00000366726 873 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC18.44■□□□□ 0.54
TRIP10Q15642 TSPAN2-201ENST00000369515 793 ntTSL 3 BASIC18.44■□□□□ 0.54
TRIP10Q15642 LHPP-203ENST00000392757 840 ntTSL 3 BASIC18.44■□□□□ 0.54
TRIP10Q15642 TMEM70-203ENST00000517439 617 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
TRIP10Q15642 AC008750.8-201ENST00000600067 551 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
TRIP10Q15642 IKBKGP1-201ENST00000612193 1073 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
TRIP10Q15642 EDA-203ENST00000374552 5278 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
TRIP10Q15642 TSGA10IP-203ENST00000532620 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
TRIP10Q15642 KDF1-201ENST00000320567 1793 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
TRIP10Q15642 LIN28B-AS1-203ENST00000636682 1797 ntTSL 3 BASIC18.44■□□□□ 0.54
TRIP10Q15642 NDUFAF1-201ENST00000260361 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
TRIP10Q15642 CYB561-204ENST00000448884 1496 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
TRIP10Q15642 DPYSL5-202ENST00000401478 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
TRIP10Q15642 GPR78-201ENST00000382487 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
TRIP10Q15642 WDR90-215ENST00000549091 5589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
TRIP10Q15642 NAPRT-203ENST00000435154 1877 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
TRIP10Q15642 SYTL1-210ENST00000616558 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
TRIP10Q15642 ABCC6-209ENST00000640696 1893 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
TRIP10Q15642 FARSA-207ENST00000588025 2057 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
TRIP10Q15642 PVRIG-201ENST00000317271 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
TRIP10Q15642 TRIM63-201ENST00000374272 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
TRIP10Q15642 CNTNAP3-204ENST00000377656 4986 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
TRIP10Q15642 MEF2B-203ENST00000410050 1429 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
TRIP10Q15642 SNAP23-201ENST00000249647 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
TRIP10Q15642 ZNF131-206ENST00000505606 3209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
TRIP10Q15642 MTX1-202ENST00000368376 1632 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
TRIP10Q15642 FOXP1-214ENST00000493089 2703 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
TRIP10Q15642 AC123595.1-201ENST00000440769 1046 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
TRIP10Q15642 ZFAS1-206ENST00000450535 1075 ntTSL 3 BASIC18.43■□□□□ 0.54
TRIP10Q15642 ATOX1-207ENST00000524142 749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
TRIP10Q15642 TSPAN11-202ENST00000535215 988 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
TRIP10Q15642 EGFL6-202ENST00000380602 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
TRIP10Q15642 TBX18-202ENST00000369663 6245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
TRIP10Q15642 PRELID3A-209ENST00000592149 2001 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
TRIP10Q15642 KCNQ2-205ENST00000360480 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
TRIP10Q15642 RBM42-201ENST00000262633 1680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
TRIP10Q15642 AC114490.1-202ENST00000311990 1887 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
TRIP10Q15642 PCID2-202ENST00000337344 1898 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
TRIP10Q15642 FBLN1-201ENST00000262722 2251 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
TRIP10Q15642 ADCY6-202ENST00000357869 5748 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
TRIP10Q15642 VHL-202ENST00000345392 2696 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
TRIP10Q15642 ZNFX1-203ENST00000371754 5235 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
TRIP10Q15642 AC067852.2-201ENST00000590513 2313 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
TRIP10Q15642 MAPKAPK3-201ENST00000357955 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
TRIP10Q15642 MTX2-201ENST00000249442 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
TRIP10Q15642 UCK2-201ENST00000367879 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
TRIP10Q15642 AP001271.2-201ENST00000624018 1556 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
TRIP10Q15642 Z98044.1-201ENST00000632503 1764 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
TRIP10Q15642 DHRS12-201ENST00000218981 1970 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
TRIP10Q15642 RARRES1-201ENST00000237696 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
TRIP10Q15642 CNRIP1-201ENST00000263655 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
TRIP10Q15642 ADCY8-201ENST00000286355 5938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
TRIP10Q15642 HYOU1-212ENST00000532519 2162 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
TRIP10Q15642 ANKMY1-209ENST00000405523 1827 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
TRIP10Q15642 CDCP1-202ENST00000425231 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
TRIP10Q15642 FAM212B-203ENST00000444059 1423 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
TRIP10Q15642 CCM2-207ENST00000475551 2471 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
TRIP10Q15642 DMRTA1-201ENST00000325870 5569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.4 ms