Protein–RNA interactions for Protein: Q15399

TLR1, Toll-like receptor 1, humanhuman

Predictions only

Length 786 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TLR1Q15399 DHRSX-201ENST00000334651 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.62
TLR1Q15399 PPFIA1-201ENST00000253925 5234 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.62
TLR1Q15399 SLC22A17-211ENST00000637426 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.62
TLR1Q15399 PML-204ENST00000359928 1726 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
TLR1Q15399 ARHGAP8-204ENST00000389774 1725 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.89■□□□□ 0.61
TLR1Q15399 ARNT-212ENST00000515192 2892 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
TLR1Q15399 ZNF346-201ENST00000358149 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
TLR1Q15399 ARMC6-220ENST00000546344 1814 ntTSL 2 BASIC18.89■□□□□ 0.61
TLR1Q15399 RPS6KA1-203ENST00000374166 3131 ntTSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.61
TLR1Q15399 IFI27L2-201ENST00000238609 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
TLR1Q15399 PMAIP1-201ENST00000269518 1262 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
TLR1Q15399 ETHE1-201ENST00000292147 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
TLR1Q15399 WDR74-202ENST00000311713 1153 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
TLR1Q15399 NMRK1-201ENST00000361092 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
TLR1Q15399 GPX1-202ENST00000419783 1146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
TLR1Q15399 GCC2-AS1-202ENST00000440975 574 ntTSL 4 BASIC18.89■□□□□ 0.61
TLR1Q15399 AC226101.2-201ENST00000458252 747 ntTSL 2 BASIC18.89■□□□□ 0.61
TLR1Q15399 PDCD10-202ENST00000461494 934 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.89■□□□□ 0.61
TLR1Q15399 RPS2P4-201ENST00000476944 856 ntBASIC18.89■□□□□ 0.61
TLR1Q15399 UNC93B4-201ENST00000505679 747 ntBASIC18.89■□□□□ 0.61
TLR1Q15399 KRT81-201ENST00000327741 1929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
TLR1Q15399 TBC1D10A-204ENST00000403477 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.89■□□□□ 0.61
TLR1Q15399 ILDR2-203ENST00000469934 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.61
TLR1Q15399 NXN-202ENST00000537628 1340 ntTSL 3 BASIC18.89■□□□□ 0.61
TLR1Q15399 APTR-204ENST00000440088 2029 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
TLR1Q15399 DTD1-201ENST00000377452 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
TLR1Q15399 ZNF302-206ENST00000505242 2849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
TLR1Q15399 CDK18-217ENST00000506784 2143 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
TLR1Q15399 ANKRD13D-216ENST00000514166 2138 ntTSL 2 BASIC18.89■□□□□ 0.61
TLR1Q15399 AIPL1-209ENST00000575265 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
TLR1Q15399 ANXA8L1-201ENST00000584982 2174 ntTSL 2 BASIC18.89■□□□□ 0.61
TLR1Q15399 TBC1D19-201ENST00000264866 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
TLR1Q15399 DMAP1-202ENST00000361745 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
TLR1Q15399 RIMBP3-201ENST00000619918 6105 ntAPPRIS P1 BASIC18.89■□□□□ 0.61
TLR1Q15399 FAM90A1-201ENST00000307435 2342 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.89■□□□□ 0.61
TLR1Q15399 PPM1G-201ENST00000344034 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
TLR1Q15399 DPF1-209ENST00000456296 1562 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.61
TLR1Q15399 BLACE-201ENST00000378120 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
TLR1Q15399 OGG1-204ENST00000339511 1815 ntTSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
TLR1Q15399 CA11-201ENST00000084798 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
TLR1Q15399 KCNC4-204ENST00000438661 2953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
TLR1Q15399 RAI14-201ENST00000265109 5092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
TLR1Q15399 AKT1S1-207ENST00000391835 3075 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
TLR1Q15399 TSR1-201ENST00000301364 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
TLR1Q15399 AL032819.2-201ENST00000624543 2162 ntBASIC18.88■□□□□ 0.61
TLR1Q15399 BRAF-201ENST00000288602 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
TLR1Q15399 TMEM35B-201ENST00000373337 922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
TLR1Q15399 SLC35A2-202ENST00000376512 903 ntTSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
TLR1Q15399 TNIK-208ENST00000465393 750 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
TLR1Q15399 PNMA6B-201ENST00000538162 1200 ntBASIC18.88■□□□□ 0.61
TLR1Q15399 AC022167.3-201ENST00000564485 427 ntTSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
TLR1Q15399 ABCG4-206ENST00000622721 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
TLR1Q15399 ZNF623-203ENST00000526926 2612 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
TLR1Q15399 CDHR1-201ENST00000332904 2694 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
TLR1Q15399 KRT19-201ENST00000361566 1390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
TLR1Q15399 MED26-207ENST00000611692 1444 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
TLR1Q15399 TMEM214-201ENST00000238788 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
TLR1Q15399 GOLGA4-212ENST00000617480 1545 ntTSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
TLR1Q15399 AC092368.3-202ENST00000574180 1591 ntBASIC18.88■□□□□ 0.61
TLR1Q15399 CD55-203ENST00000367063 1691 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
TLR1Q15399 NEURL3-202ENST00000435380 1675 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
TLR1Q15399 P2RY6-210ENST00000542092 1674 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
TLR1Q15399 BIRC2-206ENST00000530675 1927 ntTSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
TLR1Q15399 IGFBP4-201ENST00000269593 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
TLR1Q15399 LRRC25-201ENST00000339007 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
TLR1Q15399 RFTN1-201ENST00000334133 2982 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
TLR1Q15399 SNRPA-201ENST00000243563 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
TLR1Q15399 HSPB8-201ENST00000281938 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
TLR1Q15399 ZBTB7B-201ENST00000292176 2129 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
TLR1Q15399 SSNA1-201ENST00000322310 896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
TLR1Q15399 PTPMT1-202ENST00000326674 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
TLR1Q15399 DUT-201ENST00000331200 2147 ntTSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
TLR1Q15399 BOLA1-203ENST00000369153 1096 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.87■□□□□ 0.61
TLR1Q15399 FBXO6-201ENST00000376753 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
TLR1Q15399 CSPG5-202ENST00000383738 4161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
TLR1Q15399 IRF7-203ENST00000397566 2051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
TLR1Q15399 ASB18-201ENST00000409749 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
TLR1Q15399 LEF1-203ENST00000438313 1488 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
TLR1Q15399 FAM131A-208ENST00000453072 1038 ntTSL 2 BASIC18.87■□□□□ 0.61
TLR1Q15399 DBNL-217ENST00000468694 2068 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.87■□□□□ 0.61
TLR1Q15399 ENTPD8-204ENST00000472938 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
TLR1Q15399 AC113189.1-201ENST00000570444 327 ntTSL 3 BASIC18.87■□□□□ 0.61
TLR1Q15399 AC008403.3-201ENST00000598924 454 ntBASIC18.87■□□□□ 0.61
TLR1Q15399 ATRAID-208ENST00000611786 1256 ntTSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
TLR1Q15399 DLGAP4-201ENST00000339266 5016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
TLR1Q15399 GTF2IP1-210ENST00000622829 3605 ntTSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
TLR1Q15399 TLK2-203ENST00000346027 3449 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
TLR1Q15399 RALGPS1-208ENST00000424082 2362 ntTSL 2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
TLR1Q15399 MCCC1-215ENST00000629669 2316 ntTSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
TLR1Q15399 EGLN2-201ENST00000303961 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
TLR1Q15399 CARD9-201ENST00000371732 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
TLR1Q15399 PEX5L-206ENST00000465751 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
TLR1Q15399 C5orf17-202ENST00000512559 1984 ntTSL 2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
TLR1Q15399 CLN3-205ENST00000359984 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
TLR1Q15399 KRT18-207ENST00000550600 1696 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
TLR1Q15399 CDC123-201ENST00000281141 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
TLR1Q15399 ACBD4-202ENST00000376955 1453 ntTSL 2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
TLR1Q15399 MTA1-201ENST00000331320 2876 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
TLR1Q15399 KRT16P6-202ENST00000425692 1426 ntBASIC18.86■□□□□ 0.61
TLR1Q15399 EIF3J-201ENST00000261868 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.2 ms