Protein–RNA interactions for Protein: Q15365

PCBP1, Poly(rC)-binding protein 1, humanhuman

Known RBP eCLIP

Length 356 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PCBP1Q15365 FHL3-203ENST00000477194 1091 ntTSL 237.16■■■■□ 3.544e-6■■■□□ 15.5
PCBP1Q15365 CBFA2T3-204ENST00000563640 664 ntTSL 217.32■□□□□ 0.363e-6■■■□□ 15.5
PCBP1Q15365 PELP1-209ENST00000573242 574 ntTSL 214.54□□□□□ -0.082e-11■■■□□ 15.5
PCBP1Q15365 CDT1-203ENST00000569140 571 ntTSL 314.13□□□□□ -0.155e-7■■■□□ 15.5
PCBP1Q15365 SF1-220ENST00000626028 704 ntTSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.581e-8■■■□□ 15.5
PCBP1Q15365 SF1-221ENST00000633899 591 ntTSL 423.13■■□□□ 1.291e-8■■■□□ 15.5
PCBP1Q15365 SF1-212ENST00000463343 983 ntTSL 219.55■□□□□ 0.721e-8■■■□□ 15.5
PCBP1Q15365 SF1-207ENST00000413951 623 ntTSL 218.65■□□□□ 0.581e-8■■■□□ 15.5
PCBP1Q15365 TADA3-201ENST00000301964 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.571e-8■■■□□ 15.5
PCBP1Q15365 SF1-215ENST00000482693 755 ntTSL 218.56■□□□□ 0.561e-8■■■□□ 15.5
PCBP1Q15365 ATXN2-218ENST00000549455 568 ntTSL 416.14■□□□□ 0.171e-8■■■□□ 15.5
PCBP1Q15365 TADA3-205ENST00000492103 1868 ntTSL 213.88□□□□□ -0.191e-8■■■□□ 15.5
PCBP1Q15365 ATXN7L3-210ENST00000591295 3017 ntTSL 512.75□□□□□ -0.371e-8■■■□□ 15.5
PCBP1Q15365 ATXN7L3-202ENST00000454077 3523 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.581e-8■■■□□ 15.5
PCBP1Q15365 ATXN7L3-201ENST00000389384 3811 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.721e-8■■■□□ 15.5
PCBP1Q15365 TNRC18-202ENST00000399434 1459 ntTSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.422e-7■■■□□ 15.5
PCBP1Q15365 AC008750.8-201ENST00000600067 551 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.172e-13■■■□□ 15.4
PCBP1Q15365 ETFB-203ENST00000593992 603 ntTSL 217.39■□□□□ 0.372e-13■■■□□ 15.4
PCBP1Q15365 ETFB-201ENST00000309244 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.352e-13■■■□□ 15.4
PCBP1Q15365 CTSD-202ENST00000367196 907 ntTSL 516.57■□□□□ 0.249e-9■■■□□ 15.4
PCBP1Q15365 ETFB-205ENST00000596253 575 ntTSL 316.52■□□□□ 0.242e-13■■■□□ 15.4
PCBP1Q15365 TXNDC5-204ENST00000473453 1301 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.164e-8■■■□□ 15.4
PCBP1Q15365 WDR26-201ENST00000414423 6872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.431e-14■■■□□ 15.4
PCBP1Q15365 ETFB-202ENST00000354232 3551 ntTSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.742e-13■■■□□ 15.4
PCBP1Q15365 SLC17A9-205ENST00000483113 1624 ntTSL 315.44■□□□□ 0.063e-6■■■□□ 15.4
PCBP1Q15365 PTK7-202ENST00000230419 4272 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.281e-6■■■□□ 15.4
PCBP1Q15365 PTK7-216ENST00000489707 1935 ntTSL 1 (best)16.39■□□□□ 0.211e-6■■■□□ 15.4
PCBP1Q15365 PTK7-208ENST00000470019 4016 ntTSL 515.16■□□□□ 0.021e-6■■■□□ 15.4
PCBP1Q15365 PTK7-215ENST00000487673 5282 ntTSL 214.94□□□□□ -0.021e-6■■■□□ 15.4
PCBP1Q15365 PTK7-201ENST00000230418 3958 ntTSL 1 (best)14.75□□□□□ -0.051e-6■■■□□ 15.4
PCBP1Q15365 PTK7-203ENST00000345201 4071 ntTSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.111e-6■■■□□ 15.4
PCBP1Q15365 PTK7-205ENST00000352931 4023 ntTSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.121e-6■■■□□ 15.4
PCBP1Q15365 PTK7-204ENST00000349241 3801 ntTSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.31e-6■■■□□ 15.4
PCBP1Q15365 LAGE3-201ENST00000357360 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.067e-15■■■□□ 15.4
PCBP1Q15365 MED24-225ENST00000580885 1963 ntTSL 517.72■□□□□ 0.437e-15■■■□□ 15.4
PCBP1Q15365 MED24-213ENST00000535071 2441 ntTSL 515.24■□□□□ 0.037e-15■■■□□ 15.4
PCBP1Q15365 MED24-212ENST00000501516 3037 ntTSL 5 BASIC12.56□□□□□ -0.47e-15■■■□□ 15.4
PCBP1Q15365 MED24-231ENST00000584782 542 ntTSL 310.45□□□□□ -0.747e-15■■■□□ 15.4
PCBP1Q15365 MED24-228ENST00000581058 524 ntTSL 49.42□□□□□ -0.97e-15■■■□□ 15.4
PCBP1Q15365 MED24-219ENST00000578901 728 ntTSL 1 (best)9.11□□□□□ -0.957e-15■■■□□ 15.4
PCBP1Q15365 SNORD124-201ENST00000459577 104 ntBASIC1.26□□□□□ -2.217e-15■■■□□ 15.4
PCBP1Q15365 CBFA2T3-201ENST00000268679 4477 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.162e-6■■■□□ 15.4
PCBP1Q15365 WBP11-201ENST00000261167 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.483e-6■■■□□ 15.4
PCBP1Q15365 SLC6A8-204ENST00000430077 1892 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.446e-12■■■□□ 15.4
PCBP1Q15365 NOTUM-201ENST00000409678 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.25e-9■■■□□ 15.4
PCBP1Q15365 ERGIC3-216ENST00000488384 766 ntTSL 217.71■□□□□ 0.432e-13■■■□□ 15.4
PCBP1Q15365 ERGIC3-203ENST00000357394 1357 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.112e-13■■■□□ 15.4
PCBP1Q15365 ERGIC3-202ENST00000348547 1359 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.182e-13■■■□□ 15.4
PCBP1Q15365 ERGIC3-220ENST00000640748 832 ntTSL 5 BASIC12.82□□□□□ -0.362e-13■■■□□ 15.4
PCBP1Q15365 ERGIC3-206ENST00000416206 1235 ntTSL 512.56□□□□□ -0.42e-13■■■□□ 15.4
PCBP1Q15365 ERGIC3-210ENST00000451605 520 ntTSL 210.74□□□□□ -0.692e-13■■■□□ 15.4
PCBP1Q15365 CIZ1-218ENST00000476727 1205 ntTSL 519.68■□□□□ 0.742e-7■■■□□ 15.4
PCBP1Q15365 PTK7-207ENST00000461389 1035 ntTSL 216.14■□□□□ 0.173e-6■■■□□ 15.4
PCBP1Q15365 MKNK2-205ENST00000586828 1503 ntTSL 221.85■■□□□ 1.098e-8■■■□□ 15.4
PCBP1Q15365 ABL1-202ENST00000372348 3824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.471e-7■■■□□ 15.4
PCBP1Q15365 RPS5-207ENST00000599232 1747 nt18.49■□□□□ 0.557e-7■■■□□ 15.3
PCBP1Q15365 PPP2R5E-206ENST00000556484 1465 ntTSL 29.47□□□□□ -0.895e-6■■■□□ 15.3
PCBP1Q15365 PPP2R5E-202ENST00000422769 3478 ntTSL 2 BASIC6.45□□□□□ -1.385e-6■■■□□ 15.3
PCBP1Q15365 PPP2R5E-205ENST00000556150 744 ntTSL 35.98□□□□□ -1.455e-6■■■□□ 15.3
PCBP1Q15365 FCGRT-211ENST00000598076 676 ntTSL 315.15■□□□□ 0.026e-7■■■□□ 15.3
PCBP1Q15365 EP400NL-203ENST00000392352 2172 ntTSL 225.2■■□□□ 1.622e-7■■■□□ 15.3
PCBP1Q15365 EP400NL-205ENST00000443539 1756 ntTSL 224.62■■□□□ 1.532e-7■■■□□ 15.3
PCBP1Q15365 EP400NL-202ENST00000389560 1726 ntTSL 1 (best)23.96■■□□□ 1.432e-7■■■□□ 15.3
PCBP1Q15365 EP400NL-207ENST00000454179 781 ntTSL 221.2■□□□□ 0.982e-7■■■□□ 15.3
PCBP1Q15365 EP400NL-210ENST00000537558 861 ntTSL 420.86■□□□□ 0.932e-7■■■□□ 15.3
PCBP1Q15365 EP400NL-209ENST00000488030 1366 ntTSL 219.53■□□□□ 0.722e-7■■■□□ 15.3
PCBP1Q15365 EP400NL-212ENST00000539351 564 ntTSL 418.2■□□□□ 0.52e-7■■■□□ 15.3
PCBP1Q15365 EP400NL-206ENST00000446190 3697 ntTSL 2 BASIC13.42□□□□□ -0.262e-7■■■□□ 15.3
PCBP1Q15365 RNA5SP389-201ENST00000362610 115 ntBASIC8.55□□□□□ -1.041e-41■■■□□ 15.3
PCBP1Q15365 LAMB2-202ENST00000418109 5674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.073e-6■■■□□ 15.3
PCBP1Q15365 LAMB2-201ENST00000305544 5643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.223e-6■■■□□ 15.3
PCBP1Q15365 FBL-210ENST00000599159 1400 ntTSL 1 (best)24.68■■□□□ 1.547e-10■■■□□ 15.3
PCBP1Q15365 FBL-203ENST00000594309 603 ntTSL 224.23■■□□□ 1.477e-10■■■□□ 15.3
PCBP1Q15365 FBL-211ENST00000601274 877 ntTSL 524.23■■□□□ 1.477e-10■■■□□ 15.3
PCBP1Q15365 FBL-209ENST00000599134 500 ntTSL 522.98■■□□□ 1.277e-10■■■□□ 15.3
PCBP1Q15365 FBL-201ENST00000221801 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.137e-10■■■□□ 15.3
PCBP1Q15365 FBL-208ENST00000598417 581 ntTSL 520.87■□□□□ 0.937e-10■■■□□ 15.3
PCBP1Q15365 FBL-207ENST00000597634 726 ntTSL 516.94■□□□□ 0.37e-10■■■□□ 15.3
PCBP1Q15365 FBL-204ENST00000594443 805 ntTSL 314.11□□□□□ -0.157e-10■■■□□ 15.3
PCBP1Q15365 FBL-205ENST00000595545 896 ntTSL 29.42□□□□□ -0.97e-10■■■□□ 15.3
PCBP1Q15365 FBL-206ENST00000597224 732 ntTSL 39.41□□□□□ -0.97e-10■■■□□ 15.3
PCBP1Q15365 BAG6-245ENST00000437771 2407 ntTSL 515.85■□□□□ 0.134e-7■■■□□ 15.3
PCBP1Q15365 HPRT1-201ENST00000298556 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.571e-12■■■□□ 15.3
PCBP1Q15365 MDC1-207ENST00000492462 819 ntTSL 313.04□□□□□ -0.323e-8■■■□□ 15.3
PCBP1Q15365 TMC6-206ENST00000586271 970 ntTSL 220.88■□□□□ 0.938e-11■■■□□ 15.3
PCBP1Q15365 ATXN2L-209ENST00000562686 489 ntTSL 313.68□□□□□ -0.227e-16■■■□□ 15.3
PCBP1Q15365 ILK-212ENST00000532063 1617 ntTSL 2 BASIC32.39■■■□□ 2.782e-6■■■□□ 15.3
PCBP1Q15365 ILK-203ENST00000420936 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.962e-6■■■□□ 15.3
PCBP1Q15365 ILK-207ENST00000526711 1594 ntTSL 217.55■□□□□ 0.42e-6■■■□□ 15.3
PCBP1Q15365 ILK-201ENST00000299421 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.072e-6■■■□□ 15.3
PCBP1Q15365 ILK-215ENST00000537806 1801 ntTSL 5 BASIC12.58□□□□□ -0.42e-6■■■□□ 15.3
PCBP1Q15365 ILK-210ENST00000528995 1559 ntTSL 2 BASIC11.83□□□□□ -0.522e-6■■■□□ 15.3
PCBP1Q15365 ILK-206ENST00000526318 596 ntTSL 311.32□□□□□ -0.62e-6■■■□□ 15.3
PCBP1Q15365 ILK-202ENST00000396751 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.62e-6■■■□□ 15.3
PCBP1Q15365 FAM83A-202ENST00000518448 5393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.216e-8■■■□□ 15.3
PCBP1Q15365 FAM178B-204ENST00000490605 2710 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.51e-6■■■□□ 15.3
PCBP1Q15365 FAM178B-201ENST00000393526 1004 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.121e-6■■■□□ 15.3
PCBP1Q15365 TMC6-209ENST00000588087 2384 ntTSL 222.01■■□□□ 1.118e-11■■■□□ 15.2
PCBP1Q15365 TMC6-212ENST00000589553 2389 ntTSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.048e-11■■■□□ 15.2
PCBP1Q15365 TACC3-213ENST00000617535 1693 ntTSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.15e-6■■■□□ 15.2
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