Protein–RNA interactions for Protein: Q15270

NKX1-1, NK1 transcription factor-related protein 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 411 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NKX1-1Q15270 MOB3C-202ENST00000319928 2822 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.02■■□□□ 1.6
NKX1-1Q15270 MORF4L1-215ENST00000559345 1468 ntTSL 2 BASIC25.02■■□□□ 1.6
NKX1-1Q15270 MAG-201ENST00000361922 2426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
NKX1-1Q15270 FAM110A-204ENST00000381941 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
NKX1-1Q15270 IGLL1-201ENST00000249053 716 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
NKX1-1Q15270 SWI5-201ENST00000320188 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
NKX1-1Q15270 IFT27-201ENST00000340630 1113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
NKX1-1Q15270 HSD11B1L-205ENST00000422535 730 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
NKX1-1Q15270 HCG4P8-203ENST00000443049 980 ntBASIC25.01■■□□□ 1.59
NKX1-1Q15270 CHCHD3-203ENST00000448878 1038 ntTSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
NKX1-1Q15270 LBX1-AS1-203ENST00000454527 740 ntTSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
NKX1-1Q15270 AC021739.3-201ENST00000557908 855 ntTSL 2 BASIC25.01■■□□□ 1.59
NKX1-1Q15270 CLEC4GP1-201ENST00000596555 870 ntBASIC25.01■■□□□ 1.59
NKX1-1Q15270 AP005212.1-201ENST00000581547 1997 ntBASIC25.01■■□□□ 1.59
NKX1-1Q15270 CIRBP-201ENST00000320936 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
NKX1-1Q15270 CIRBP-207ENST00000586472 1303 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC25.01■■□□□ 1.59
NKX1-1Q15270 KCNH1-214ENST00000640566 1365 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
NKX1-1Q15270 METTL1-202ENST00000324871 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
NKX1-1Q15270 ACSF3-202ENST00000378345 1541 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
NKX1-1Q15270 AC148477.3-202ENST00000376617 1766 ntTSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
NKX1-1Q15270 AC116565.2-201ENST00000637674 1854 ntTSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
NKX1-1Q15270 GTF3C5-201ENST00000342018 1905 ntTSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
NKX1-1Q15270 TSPAN14-202ENST00000341863 1037 ntTSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
NKX1-1Q15270 BUB3-202ENST00000368859 667 ntTSL 3 BASIC25■■□□□ 1.59
NKX1-1Q15270 ATP5G2P1-201ENST00000433580 426 ntBASIC25■■□□□ 1.59
NKX1-1Q15270 MIR1302-2HG-202ENST00000473358 712 ntTSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
NKX1-1Q15270 MTHFS-202ENST00000559722 948 ntTSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
NKX1-1Q15270 AC140725.1-202ENST00000561145 712 ntTSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
NKX1-1Q15270 AC064834.1-201ENST00000606986 503 ntTSL 3 BASIC25■■□□□ 1.59
NKX1-1Q15270 SLF2-205ENST00000609386 891 ntAPPRIS ALT2 BASIC25■■□□□ 1.59
NKX1-1Q15270 C6orf89-203ENST00000373685 1400 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
NKX1-1Q15270 NAT6-204ENST00000443094 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
NKX1-1Q15270 ACAA1-201ENST00000301810 1540 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
NKX1-1Q15270 PLAUR-203ENST00000340093 1548 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
NKX1-1Q15270 RBM14-RBM4-201ENST00000412278 1566 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
NKX1-1Q15270 MRPL3-201ENST00000264995 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
NKX1-1Q15270 SLC35A3-224ENST00000640732 1777 ntTSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
NKX1-1Q15270 SSR1-204ENST00000474597 1808 ntTSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
NKX1-1Q15270 RABAC1-201ENST00000222008 821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
NKX1-1Q15270 CYB561D2-201ENST00000232508 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
NKX1-1Q15270 TUBA8-201ENST00000316027 1518 ntTSL 2 BASIC24.99■■□□□ 1.59
NKX1-1Q15270 CD151-201ENST00000322008 1548 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
NKX1-1Q15270 C7orf25-201ENST00000350427 2451 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.99■■□□□ 1.59
NKX1-1Q15270 MRPL24-202ENST00000368211 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
NKX1-1Q15270 GRB10-206ENST00000402497 2289 ntTSL 5 BASIC24.99■■□□□ 1.59
NKX1-1Q15270 CYP2D7-203ENST00000433992 1740 ntTSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
NKX1-1Q15270 APTR-204ENST00000440088 2029 ntTSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
NKX1-1Q15270 AC022424.1-201ENST00000512155 889 ntTSL 3 BASIC24.99■■□□□ 1.59
NKX1-1Q15270 CNTD2-203ENST00000513948 787 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.99■■□□□ 1.59
NKX1-1Q15270 AP002433.1-201ENST00000525548 964 ntTSL 3 BASIC24.99■■□□□ 1.59
NKX1-1Q15270 AC104417.2-201ENST00000562989 1793 ntBASIC24.99■■□□□ 1.59
NKX1-1Q15270 LINC01311-201ENST00000565162 1445 ntBASIC24.99■■□□□ 1.59
NKX1-1Q15270 NDUFV2-AS1-203ENST00000608008 779 ntBASIC24.99■■□□□ 1.59
NKX1-1Q15270 CYP2D7-207ENST00000612115 1734 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.99■■□□□ 1.59
NKX1-1Q15270 CR769767.2-201ENST00000622735 460 ntBASIC24.99■■□□□ 1.59
NKX1-1Q15270 CPLX3-201ENST00000395018 2082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
NKX1-1Q15270 ZNF513-202ENST00000407879 2077 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
NKX1-1Q15270 PIGQ-206ENST00000422307 2052 ntTSL 3 BASIC24.98■■□□□ 1.59
NKX1-1Q15270 CASKIN2-205ENST00000581870 1612 ntTSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
NKX1-1Q15270 RFC2-213ENST00000621097 1635 ntTSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
NKX1-1Q15270 SLC22A18-202ENST00000347936 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
NKX1-1Q15270 WRNIP1-204ENST00000380773 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
NKX1-1Q15270 HSD17B10-201ENST00000168216 960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
NKX1-1Q15270 DECR2-202ENST00000424398 1012 ntTSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
NKX1-1Q15270 SPPL2B-212ENST00000618220 2459 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
NKX1-1Q15270 KIF12-202ENST00000468460 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
NKX1-1Q15270 PRMT2-206ENST00000397638 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
NKX1-1Q15270 PCDHB12-202ENST00000622978 2093 ntTSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
NKX1-1Q15270 UBXN6-201ENST00000301281 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
NKX1-1Q15270 GLT8D1-206ENST00000478968 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
NKX1-1Q15270 RTN1-202ENST00000342503 1703 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
NKX1-1Q15270 TANGO2-217ENST00000456048 2439 ntTSL 2 BASIC24.97■■□□□ 1.59
NKX1-1Q15270 AL390860.1-201ENST00000449298 1541 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
NKX1-1Q15270 HHIPL1-202ENST00000357223 2241 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
NKX1-1Q15270 C1orf210-202ENST00000523677 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
NKX1-1Q15270 SCFD2-204ENST00000611795 1320 ntTSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
NKX1-1Q15270 NTMT1-211ENST00000617943 1346 ntTSL 3 BASIC24.97■■□□□ 1.59
NKX1-1Q15270 LINC01063-201ENST00000441644 348 ntTSL 3 BASIC24.97■■□□□ 1.59
NKX1-1Q15270 DGUOK-AS1-203ENST00000453103 601 ntTSL 3 BASIC24.97■■□□□ 1.59
NKX1-1Q15270 TYROBP-209ENST00000589517 415 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
NKX1-1Q15270 LINC01785-201ENST00000598042 1112 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
NKX1-1Q15270 GPX4-210ENST00000611653 793 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
NKX1-1Q15270 HOXB8-201ENST00000239144 1823 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.97■■□□□ 1.59
NKX1-1Q15270 LPAR2-203ENST00000586703 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
NKX1-1Q15270 SLC22A17-202ENST00000354772 2238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
NKX1-1Q15270 TMEM176A-210ENST00000484928 1530 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
NKX1-1Q15270 RNF32-208ENST00000432459 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
NKX1-1Q15270 FFAR1-201ENST00000246553 2311 ntAPPRIS P1 BASIC24.96■■□□□ 1.59
NKX1-1Q15270 ZNF707-222ENST00000532158 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
NKX1-1Q15270 RNF216P1-205ENST00000406089 807 ntTSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
NKX1-1Q15270 SNHG7-203ENST00000436596 509 ntTSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
NKX1-1Q15270 HOXB-AS3-203ENST00000465846 434 ntTSL 3 BASIC24.96■■□□□ 1.59
NKX1-1Q15270 KANSL1-AS1-203ENST00000572973 424 ntTSL 3 BASIC24.96■■□□□ 1.59
NKX1-1Q15270 CCM2L-201ENST00000262659 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
NKX1-1Q15270 TNFRSF19-202ENST00000382258 1625 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
NKX1-1Q15270 HECA-201ENST00000367658 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
NKX1-1Q15270 SRSF11-203ENST00000370951 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
NKX1-1Q15270 PDS5A-202ENST00000503396 2685 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
NKX1-1Q15270 PNKP-224ENST00000631020 1545 ntTSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
NKX1-1Q15270 TRPM4-213ENST00000599628 1829 ntTSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
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