Protein–RNA interactions for Protein: Q15256

PTPRR, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase R, humanhuman

Predictions only

Length 657 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRRQ15256 TMEM230-206ENST00000379283 1660 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.42■□□□□ 0.7
PTPRRQ15256 ABHD14A-ACY1-202ENST00000463937 1705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.42■□□□□ 0.7
PTPRRQ15256 AC087482.1-204ENST00000636067 2431 ntTSL 5 BASIC19.42■□□□□ 0.7
PTPRRQ15256 KRT16P1-201ENST00000399124 1418 ntBASIC19.42■□□□□ 0.7
PTPRRQ15256 CORO1B-202ENST00000393893 1931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.41■□□□□ 0.7
PTPRRQ15256 PLD4-204ENST00000540372 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.41■□□□□ 0.7
PTPRRQ15256 AC012414.5-201ENST00000564214 1602 ntTSL 5 BASIC19.41■□□□□ 0.7
PTPRRQ15256 OLFM1-205ENST00000371796 2492 ntTSL 2 BASIC19.41■□□□□ 0.7
PTPRRQ15256 TUBA4A-202ENST00000392088 2499 ntTSL 2 BASIC19.41■□□□□ 0.7
PTPRRQ15256 GAMT-201ENST00000252288 1121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
PTPRRQ15256 C7orf50-201ENST00000357429 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
PTPRRQ15256 RXFP4-201ENST00000368318 1240 ntAPPRIS P1 BASIC19.41■□□□□ 0.7
PTPRRQ15256 CTNNBIP1-204ENST00000400904 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
PTPRRQ15256 MESTP1-201ENST00000404287 994 ntBASIC19.41■□□□□ 0.7
PTPRRQ15256 PPP1R14BP5-201ENST00000440334 435 ntBASIC19.41■□□□□ 0.7
PTPRRQ15256 BABAM1-202ENST00000447614 930 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.41■□□□□ 0.7
PTPRRQ15256 AC011506.1-201ENST00000474329 610 ntBASIC19.41■□□□□ 0.7
PTPRRQ15256 ALKAL1-202ENST00000523939 536 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
PTPRRQ15256 AC022509.3-202ENST00000545819 566 ntTSL 3 BASIC19.41■□□□□ 0.7
PTPRRQ15256 AC016737.2-201ENST00000609273 358 ntTSL 3 BASIC19.41■□□□□ 0.7
PTPRRQ15256 ADAP1-216ENST00000539900 2178 ntTSL 2 BASIC19.41■□□□□ 0.7
PTPRRQ15256 P3H4-202ENST00000393928 2601 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
PTPRRQ15256 YTHDF3-214ENST00000621890 2296 ntTSL 5 BASIC19.41■□□□□ 0.7
PTPRRQ15256 PTGER2-201ENST00000245457 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
PTPRRQ15256 ITGB7-209ENST00000550743 2138 ntTSL 5 BASIC19.4■□□□□ 0.7
PTPRRQ15256 ALDOA-212ENST00000564546 2104 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
PTPRRQ15256 TRIM58-201ENST00000366481 3225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
PTPRRQ15256 GPR139-202ENST00000570682 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
PTPRRQ15256 GAL3ST4-204ENST00000423751 1695 ntTSL 3 BASIC19.4■□□□□ 0.7
PTPRRQ15256 ING1-201ENST00000333219 5119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
PTPRRQ15256 TMSB4X-203ENST00000380636 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
PTPRRQ15256 FN3KRP-201ENST00000269373 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
PTPRRQ15256 HSD17B1-202ENST00000585807 4982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
PTPRRQ15256 NTAN1-201ENST00000287706 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
PTPRRQ15256 RAP1B-203ENST00000378985 1017 ntTSL 2 BASIC19.4■□□□□ 0.7
PTPRRQ15256 BCL7B-206ENST00000455335 985 ntTSL 3 BASIC19.4■□□□□ 0.7
PTPRRQ15256 Z85996.1-201ENST00000494644 937 ntBASIC19.4■□□□□ 0.7
PTPRRQ15256 SLC39A13-212ENST00000531974 856 ntTSL 2 BASIC19.4■□□□□ 0.7
PTPRRQ15256 RAP1B-221ENST00000540209 1264 ntTSL 2 BASIC19.4■□□□□ 0.7
PTPRRQ15256 CDIPT-204ENST00000563415 1047 ntTSL 3 BASIC19.4■□□□□ 0.7
PTPRRQ15256 AL031600.3-201ENST00000566287 1124 ntTSL 5 BASIC19.4■□□□□ 0.7
PTPRRQ15256 AC026471.5-201ENST00000615068 467 ntBASIC19.4■□□□□ 0.7
PTPRRQ15256 UBTF-203ENST00000393606 2683 ntTSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
PTPRRQ15256 C6orf89-203ENST00000373685 1400 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.4■□□□□ 0.7
PTPRRQ15256 AMDHD2-201ENST00000293971 1459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
PTPRRQ15256 EPN3-216ENST00000537145 2223 ntTSL 5 BASIC19.4■□□□□ 0.7
PTPRRQ15256 MAPK8IP1-201ENST00000241014 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
PTPRRQ15256 C21orf91-203ENST00000400559 1593 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.4■□□□□ 0.7
PTPRRQ15256 EIF2B1-201ENST00000424014 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
PTPRRQ15256 PNKP-207ENST00000596014 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
PTPRRQ15256 DOK1-201ENST00000233668 2555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.7
PTPRRQ15256 SPON2-203ENST00000431380 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.39■□□□□ 0.7
PTPRRQ15256 DUSP1-201ENST00000239223 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
PTPRRQ15256 TREX2-203ENST00000338525 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
PTPRRQ15256 METTL27-201ENST00000297873 941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
PTPRRQ15256 AC137630.1-201ENST00000452042 782 ntTSL 4 BASIC19.39■□□□□ 0.69
PTPRRQ15256 AL355075.4-201ENST00000554988 638 ntBASIC19.39■□□□□ 0.69
PTPRRQ15256 AP003071.4-201ENST00000562276 1284 ntBASIC19.39■□□□□ 0.69
PTPRRQ15256 REXO1L10P-201ENST00000615707 1290 ntBASIC19.39■□□□□ 0.69
PTPRRQ15256 REXO1L12P-201ENST00000622156 912 ntBASIC19.39■□□□□ 0.69
PTPRRQ15256 ITPKB-202ENST00000366784 3146 ntTSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
PTPRRQ15256 PEX16-210ENST00000532681 1639 ntTSL 3 BASIC19.39■□□□□ 0.69
PTPRRQ15256 KRT18-207ENST00000550600 1696 ntTSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
PTPRRQ15256 PRELID3A-201ENST00000336990 1715 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.39■□□□□ 0.69
PTPRRQ15256 PRELID3A-202ENST00000440960 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
PTPRRQ15256 ISM2-207ENST00000493585 1739 ntTSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
PTPRRQ15256 GABRD-205ENST00000638771 1707 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.39■□□□□ 0.69
PTPRRQ15256 SYTL1-201ENST00000318074 1900 ntTSL 2 BASIC19.39■□□□□ 0.69
PTPRRQ15256 CTBP2-202ENST00000334808 2130 ntTSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
PTPRRQ15256 ZNF331-214ENST00000511154 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
PTPRRQ15256 SHROOM1-202ENST00000378676 2352 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.39■□□□□ 0.69
PTPRRQ15256 CRMP1-201ENST00000324989 3146 ntTSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
PTPRRQ15256 BACE2-201ENST00000328735 2824 ntTSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
PTPRRQ15256 WIPF1-202ENST00000359761 2003 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
PTPRRQ15256 TSPAN14-205ENST00000372158 1095 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.38■□□□□ 0.69
PTPRRQ15256 CEP78-202ENST00000376597 2618 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
PTPRRQ15256 ZNF316-201ENST00000382252 5392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.38■□□□□ 0.69
PTPRRQ15256 FOXD4-201ENST00000382500 1974 ntAPPRIS P1 BASIC19.38■□□□□ 0.69
PTPRRQ15256 SP9-201ENST00000394967 2554 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.38■□□□□ 0.69
PTPRRQ15256 SPAG16-204ENST00000413312 2258 ntTSL 5 BASIC19.38■□□□□ 0.69
PTPRRQ15256 PHYHD1-207ENST00000421063 1182 ntTSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
PTPRRQ15256 ECE1-205ENST00000436918 2328 ntTSL 2 BASIC19.38■□□□□ 0.69
PTPRRQ15256 ISLR2-204ENST00000453268 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
PTPRRQ15256 FBXL18-203ENST00000453700 1932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
PTPRRQ15256 KCNMA1-220ENST00000481070 896 ntTSL 2 BASIC19.38■□□□□ 0.69
PTPRRQ15256 GPBAR1-202ENST00000519574 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
PTPRRQ15256 SLC3A2-206ENST00000535296 2084 ntTSL 5 BASIC19.38■□□□□ 0.69
PTPRRQ15256 AC117500.4-201ENST00000542797 617 ntTSL 3 BASIC19.38■□□□□ 0.69
PTPRRQ15256 AC126773.2-201ENST00000562172 1682 ntTSL 3 BASIC19.38■□□□□ 0.69
PTPRRQ15256 AL160286.2-201ENST00000567150 934 ntBASIC19.38■□□□□ 0.69
PTPRRQ15256 MIEF2-207ENST00000578621 540 ntTSL 4 BASIC19.38■□□□□ 0.69
PTPRRQ15256 LGALS9C-209ENST00000581545 1378 ntTSL 5 BASIC19.38■□□□□ 0.69
PTPRRQ15256 SMAGP-204ENST00000603838 816 ntTSL 2 BASIC19.38■□□□□ 0.69
PTPRRQ15256 MTURN-201ENST00000324453 5937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
PTPRRQ15256 SPTBN4-201ENST00000338932 8686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.38■□□□□ 0.69
PTPRRQ15256 LAD1-202ENST00000391967 2906 ntTSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
PTPRRQ15256 SOCS2-201ENST00000340600 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
PTPRRQ15256 JAKMIP1-201ENST00000282924 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
PTPRRQ15256 BRAF-201ENST00000288602 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
PTPRRQ15256 UBL4A-202ENST00000369660 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.3 ms