Protein–RNA interactions for Protein: Q14004

CDK13, Cyclin-dependent kinase 13, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,512 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDK13Q14004 PEX16-202ENST00000378750 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.01■■■□□ 2.39
CDK13Q14004 CYB561-204ENST00000448884 1496 ntTSL 2 BASIC30.01■■■□□ 2.39
CDK13Q14004 C17orf62-204ENST00000437807 2242 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.01■■■□□ 2.39
CDK13Q14004 PDIA5-201ENST00000316218 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30■■■□□ 2.39
CDK13Q14004 CD151-201ENST00000322008 1548 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30■■■□□ 2.39
CDK13Q14004 AC124066.1-201ENST00000581122 1660 ntTSL 5 BASIC30■■■□□ 2.39
CDK13Q14004 FAM187B-201ENST00000324675 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30■■■□□ 2.39
CDK13Q14004 MADCAM1-203ENST00000382683 603 ntTSL 1 (best) BASIC30■■■□□ 2.39
CDK13Q14004 AC005056.1-201ENST00000435932 532 ntTSL 4 BASIC30■■■□□ 2.39
CDK13Q14004 SNHG7-203ENST00000436596 509 ntTSL 2 BASIC30■■■□□ 2.39
CDK13Q14004 AP000347.1-209ENST00000437294 557 ntTSL 4 BASIC30■■■□□ 2.39
CDK13Q14004 EHMT1-211ENST00000482340 691 ntTSL 5 BASIC30■■■□□ 2.39
CDK13Q14004 TMEM218-206ENST00000527766 812 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC30■■■□□ 2.39
CDK13Q14004 AL162377.1-201ENST00000618844 1793 ntBASIC30■■■□□ 2.39
CDK13Q14004 CRYBB2P1-202ENST00000382734 1364 ntTSL 1 (best) BASIC29.99■■■□□ 2.39
CDK13Q14004 KCNH1-214ENST00000640566 1365 ntTSL 1 (best) BASIC29.99■■■□□ 2.39
CDK13Q14004 ACSF3-202ENST00000378345 1541 ntTSL 1 (best) BASIC29.99■■■□□ 2.39
CDK13Q14004 TTC39C-202ENST00000317571 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.99■■■□□ 2.39
CDK13Q14004 TMC6-212ENST00000589553 2389 ntTSL 2 BASIC29.99■■■□□ 2.39
CDK13Q14004 FSTL3-201ENST00000166139 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.99■■■□□ 2.39
CDK13Q14004 KCNAB3-201ENST00000303790 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.99■■■□□ 2.39
CDK13Q14004 LY6E-213ENST00000522528 606 ntTSL 3 BASIC29.99■■■□□ 2.39
CDK13Q14004 GFOD2-207ENST00000602855 819 ntTSL 3 BASIC29.99■■■□□ 2.39
CDK13Q14004 NPAP1P7-201ENST00000613027 823 ntBASIC29.99■■■□□ 2.39
CDK13Q14004 CR769767.2-201ENST00000622735 460 ntBASIC29.99■■■□□ 2.39
CDK13Q14004 ZNF513-202ENST00000407879 2077 ntTSL 1 (best) BASIC29.99■■■□□ 2.39
CDK13Q14004 GMPPA-213ENST00000622191 1473 ntTSL 5 BASIC29.98■■■□□ 2.39
CDK13Q14004 ACHE-203ENST00000411582 2179 ntTSL 1 (best) BASIC29.98■■■□□ 2.39
CDK13Q14004 SCFD2-204ENST00000611795 1320 ntTSL 5 BASIC29.98■■■□□ 2.39
CDK13Q14004 FAM19A3-201ENST00000361886 1056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.98■■■□□ 2.39
CDK13Q14004 DECR2-202ENST00000424398 1012 ntTSL 5 BASIC29.98■■■□□ 2.39
CDK13Q14004 KIF12-202ENST00000468460 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.98■■■□□ 2.39
CDK13Q14004 LINC01140-202ENST00000467438 2375 ntTSL 2 BASIC29.98■■■□□ 2.39
CDK13Q14004 ZNF852-201ENST00000436261 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.98■■■□□ 2.39
CDK13Q14004 GJA8-201ENST00000369235 1302 ntAPPRIS P1 BASIC29.98■■■□□ 2.39
CDK13Q14004 FAM110A-204ENST00000381941 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.98■■■□□ 2.39
CDK13Q14004 SPON2-203ENST00000431380 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.98■■■□□ 2.39
CDK13Q14004 OTUB1-210ENST00000541478 1803 ntTSL 5 BASIC29.98■■■□□ 2.39
CDK13Q14004 NUDT15-201ENST00000258662 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.98■■■□□ 2.39
CDK13Q14004 PRSS33-204ENST00000576886 1755 ntTSL 1 (best) BASIC29.97■■■□□ 2.39
CDK13Q14004 IFT27-201ENST00000340630 1113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.97■■■□□ 2.39
CDK13Q14004 TSPY21P-201ENST00000433481 731 ntBASIC29.97■■■□□ 2.39
CDK13Q14004 TSPY23P-201ENST00000440136 739 ntBASIC29.97■■■□□ 2.39
CDK13Q14004 AP006621.4-201ENST00000527021 532 ntTSL 5 BASIC29.97■■■□□ 2.39
CDK13Q14004 NEK7-207ENST00000538004 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.97■■■□□ 2.39
CDK13Q14004 CLN6-214ENST00000636314 442 ntTSL 3 BASIC29.97■■■□□ 2.39
CDK13Q14004 PFKFB3-217ENST00000626882 1965 ntTSL 5 BASIC29.97■■■□□ 2.39
CDK13Q14004 PIGQ-206ENST00000422307 2052 ntTSL 3 BASIC29.97■■■□□ 2.39
CDK13Q14004 SSR1-204ENST00000474597 1808 ntTSL 5 BASIC29.97■■■□□ 2.39
CDK13Q14004 BCKDK-202ENST00000287507 1907 ntTSL 1 (best) BASIC29.97■■■□□ 2.39
CDK13Q14004 CCDC130-201ENST00000221554 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.97■■■□□ 2.39
CDK13Q14004 PDE9A-213ENST00000398236 1776 ntTSL 1 (best) BASIC29.97■■■□□ 2.39
CDK13Q14004 FKBP8-206ENST00000596558 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC29.97■■■□□ 2.39
CDK13Q14004 LINC01311-201ENST00000565162 1445 ntBASIC29.97■■■□□ 2.39
CDK13Q14004 ZGPAT-203ENST00000357119 1896 ntTSL 1 (best) BASIC29.97■■■□□ 2.39
CDK13Q14004 TEAD2-201ENST00000311227 2164 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.97■■■□□ 2.39
CDK13Q14004 TLCD1-201ENST00000292090 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.96■■■□□ 2.39
CDK13Q14004 HDAC11-204ENST00000404040 967 ntTSL 3 BASIC29.96■■■□□ 2.39
CDK13Q14004 AC140113.3-201ENST00000605663 199 ntBASIC29.96■■■□□ 2.39
CDK13Q14004 IRF7-202ENST00000348655 1801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.96■■■□□ 2.39
CDK13Q14004 FAM50A-202ENST00000393600 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.96■■■□□ 2.39
CDK13Q14004 FFAR1-201ENST00000246553 2311 ntAPPRIS P1 BASIC29.96■■■□□ 2.39
CDK13Q14004 KCNK4-202ENST00000422670 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.96■■■□□ 2.39
CDK13Q14004 NAPRT-202ENST00000426292 1654 ntTSL 1 (best) BASIC29.96■■■□□ 2.39
CDK13Q14004 ACTG1-201ENST00000331925 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.96■■■□□ 2.39
CDK13Q14004 AL391422.3-201ENST00000603791 2761 ntBASIC29.96■■■□□ 2.39
CDK13Q14004 AC007375.3-201ENST00000600936 2314 ntBASIC29.96■■■□□ 2.39
CDK13Q14004 PDE5A-201ENST00000264805 3020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.96■■■□□ 2.39
CDK13Q14004 BECN2-201ENST00000419583 1296 ntAPPRIS P1 BASIC29.96■■■□□ 2.39
CDK13Q14004 AC064834.1-201ENST00000606986 503 ntTSL 3 BASIC29.96■■■□□ 2.39
CDK13Q14004 SPSB3-208ENST00000566339 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.96■■■□□ 2.39
CDK13Q14004 ANKRD18DP-204ENST00000455355 1975 ntBASIC29.96■■■□□ 2.39
CDK13Q14004 PALM-208ENST00000592155 2272 ntTSL 4 BASIC29.96■■■□□ 2.39
CDK13Q14004 OAF-201ENST00000328965 2525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.95■■■□□ 2.39
CDK13Q14004 TNFRSF1A-201ENST00000162749 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.95■■■□□ 2.39
CDK13Q14004 LPAR2-203ENST00000586703 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.95■■■□□ 2.39
CDK13Q14004 TRPM4-213ENST00000599628 1829 ntTSL 2 BASIC29.95■■■□□ 2.39
CDK13Q14004 ICA1-208ENST00000407906 1615 ntTSL 1 (best) BASIC29.95■■■□□ 2.39
CDK13Q14004 CYP1B1-207ENST00000614273 2174 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.95■■■□□ 2.39
CDK13Q14004 RBM14-RBM4-201ENST00000412278 1566 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.95■■■□□ 2.38
CDK13Q14004 AC022424.1-201ENST00000512155 889 ntTSL 3 BASIC29.95■■■□□ 2.38
CDK13Q14004 AP000662.2-202ENST00000530595 2790 ntTSL 2 BASIC29.94■■■□□ 2.38
CDK13Q14004 MRPL3-201ENST00000264995 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.94■■■□□ 2.38
CDK13Q14004 HBZP1-201ENST00000354915 429 ntBASIC29.94■■■□□ 2.38
CDK13Q14004 BUB3-202ENST00000368859 667 ntTSL 3 BASIC29.94■■■□□ 2.38
CDK13Q14004 SDCBP2-203ENST00000381808 1261 ntTSL 1 (best) BASIC29.94■■■□□ 2.38
CDK13Q14004 ATP5G2P1-201ENST00000433580 426 ntBASIC29.94■■■□□ 2.38
CDK13Q14004 AC004448.5-201ENST00000579897 567 ntTSL 5 BASIC29.94■■■□□ 2.38
CDK13Q14004 RNF32-208ENST00000432459 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.94■■■□□ 2.38
CDK13Q14004 AC104417.2-201ENST00000562989 1793 ntBASIC29.94■■■□□ 2.38
CDK13Q14004 WIPF1-202ENST00000359761 2003 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.94■■■□□ 2.38
CDK13Q14004 APTR-204ENST00000440088 2029 ntTSL 1 (best) BASIC29.94■■■□□ 2.38
CDK13Q14004 HOXB8-201ENST00000239144 1823 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC29.94■■■□□ 2.38
CDK13Q14004 STARD4-203ENST00000502322 1467 ntTSL 1 (best) BASIC29.93■■■□□ 2.38
CDK13Q14004 ELL3-201ENST00000319359 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.93■■■□□ 2.38
CDK13Q14004 CHRNA3-202ENST00000348639 2030 ntTSL 1 (best) BASIC29.93■■■□□ 2.38
CDK13Q14004 PHB2-203ENST00000535923 1515 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC29.93■■■□□ 2.38
CDK13Q14004 BCL2L10-201ENST00000260442 1249 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.93■■■□□ 2.38
CDK13Q14004 TPM4P1-201ENST00000436100 807 ntBASIC29.93■■■□□ 2.38
CDK13Q14004 MTHFS-202ENST00000559722 948 ntTSL 2 BASIC29.93■■■□□ 2.38
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