Protein–RNA interactions for Protein: Q13620

CUL4B, Cullin-4B, humanhuman

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Length 913 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CUL4BQ13620 GTF2A2-203ENST00000396061 758 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
CUL4BQ13620 TUBB8P6-201ENST00000436895 1288 ntBASIC21.62■■□□□ 1.05
CUL4BQ13620 NREP-209ENST00000455559 698 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.62■■□□□ 1.05
CUL4BQ13620 PRELID2-204ENST00000505416 738 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC21.62■■□□□ 1.05
CUL4BQ13620 F2R-202ENST00000505600 442 ntTSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
CUL4BQ13620 EXOSC4-202ENST00000525936 606 ntTSL 3 BASIC21.62■■□□□ 1.05
CUL4BQ13620 AP003097.1-201ENST00000530657 1135 ntBASIC21.62■■□□□ 1.05
CUL4BQ13620 AC069185.1-201ENST00000531395 811 ntTSL 3 BASIC21.62■■□□□ 1.05
CUL4BQ13620 AC073912.1-201ENST00000546264 587 ntTSL 3 BASIC21.62■■□□□ 1.05
CUL4BQ13620 CLN6-207ENST00000566347 981 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
CUL4BQ13620 FXYD1-204ENST00000588081 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
CUL4BQ13620 IL15RA-221ENST00000620865 1037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
CUL4BQ13620 HCK-206ENST00000518730 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
CUL4BQ13620 SYNDIG1L-201ENST00000331628 2607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
CUL4BQ13620 ATP6V0B-213ENST00000532642 1685 ntTSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
CUL4BQ13620 AC126773.2-201ENST00000562172 1682 ntTSL 3 BASIC21.62■■□□□ 1.05
CUL4BQ13620 AC141586.3-201ENST00000562166 1838 ntBASIC21.62■■□□□ 1.05
CUL4BQ13620 MMP28-204ENST00000615136 2033 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
CUL4BQ13620 VEGFB-201ENST00000309422 1380 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
CUL4BQ13620 FEZF1-202ENST00000427185 1368 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
CUL4BQ13620 SNX19-209ENST00000530356 1562 ntTSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
CUL4BQ13620 TMEM214-203ENST00000404032 2830 ntTSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
CUL4BQ13620 AC013268.5-201ENST00000454928 1959 ntTSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
CUL4BQ13620 OTOP3-201ENST00000328801 2363 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
CUL4BQ13620 ARRB2-216ENST00000574954 1348 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
CUL4BQ13620 UPP1-201ENST00000331803 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
CUL4BQ13620 GTF3C5-201ENST00000342018 1905 ntTSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
CUL4BQ13620 OTOP2-201ENST00000331427 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
CUL4BQ13620 LIN54-209ENST00000510557 2257 ntTSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
CUL4BQ13620 PTPMT1-202ENST00000326674 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
CUL4BQ13620 MAP1LC3A-203ENST00000397709 698 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.61■■□□□ 1.05
CUL4BQ13620 AC026427.1-201ENST00000508993 555 ntTSL 3 BASIC21.61■■□□□ 1.05
CUL4BQ13620 FBXL17-205ENST00000542267 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
CUL4BQ13620 TCERG1L-201ENST00000368642 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
CUL4BQ13620 C2orf81-201ENST00000290390 2227 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
CUL4BQ13620 FAM83A-205ENST00000522648 1604 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
CUL4BQ13620 GIPR-202ENST00000304207 1432 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
CUL4BQ13620 UBL4A-202ENST00000369660 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
CUL4BQ13620 AC008691.1-203ENST00000515337 1580 ntTSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
CUL4BQ13620 CWH43-201ENST00000226432 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
CUL4BQ13620 SKOR2-202ENST00000425639 3899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
CUL4BQ13620 CIRBP-215ENST00000588030 1509 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
CUL4BQ13620 DIP2A-203ENST00000435722 2760 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
CUL4BQ13620 PLEKHG2-202ENST00000409797 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
CUL4BQ13620 HGFAC-204ENST00000511533 2016 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
CUL4BQ13620 GGT2-201ENST00000401924 2366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
CUL4BQ13620 TNFRSF8-202ENST00000413146 2363 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
CUL4BQ13620 PPP1R12C-202ENST00000435544 2363 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
CUL4BQ13620 KLHDC2-201ENST00000298307 5514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
CUL4BQ13620 CEP78-201ENST00000277082 2542 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
CUL4BQ13620 MRM3-201ENST00000304478 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
CUL4BQ13620 KLHDC4-203ENST00000347925 1821 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
CUL4BQ13620 CPNE7-201ENST00000268720 2657 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
CUL4BQ13620 ANKRD65-201ENST00000427211 1976 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
CUL4BQ13620 ABHD14A-201ENST00000273596 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
CUL4BQ13620 TREX2-203ENST00000338525 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
CUL4BQ13620 AC068831.2-201ENST00000448987 367 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
CUL4BQ13620 CENPS-CORT-202ENST00000465026 494 ntTSL 3 BASIC21.6■■□□□ 1.05
CUL4BQ13620 CENPS-CORT-203ENST00000470413 626 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
CUL4BQ13620 KRT18P6-201ENST00000555540 1265 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
CUL4BQ13620 TRAPPC5-203ENST00000595985 411 ntTSL 3 BASIC21.6■■□□□ 1.05
CUL4BQ13620 ZNF843-203ENST00000618063 1765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
CUL4BQ13620 ARHGAP28-203ENST00000383472 2295 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
CUL4BQ13620 GRM5-202ENST00000305447 4571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
CUL4BQ13620 LMNB1-202ENST00000395354 1572 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
CUL4BQ13620 ISOC2-203ENST00000438389 1566 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
CUL4BQ13620 ACBD4-207ENST00000586346 1579 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
CUL4BQ13620 FGF17-201ENST00000359441 1714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
CUL4BQ13620 YPEL5-205ENST00000402708 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
CUL4BQ13620 PCDHB14-202ENST00000624896 2367 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
CUL4BQ13620 FAM160A2-201ENST00000265978 3481 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
CUL4BQ13620 TULP1-201ENST00000229771 2162 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
CUL4BQ13620 SAAL1-204ENST00000529318 1503 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
CUL4BQ13620 ESPN-202ENST00000416731 1338 ntTSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
CUL4BQ13620 ILKAP-201ENST00000254654 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
CUL4BQ13620 LETM2-208ENST00000524874 1459 ntTSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
CUL4BQ13620 TRIP6-201ENST00000200457 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
CUL4BQ13620 FAM87B-201ENST00000326734 1947 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
CUL4BQ13620 DACT2-204ENST00000610183 2088 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
CUL4BQ13620 CD55-201ENST00000314754 2220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
CUL4BQ13620 PGAP3-206ENST00000579146 2220 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
CUL4BQ13620 HTRA3-201ENST00000307358 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
CUL4BQ13620 AC069544.2-201ENST00000640019 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
CUL4BQ13620 LAMP1-201ENST00000332556 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
CUL4BQ13620 WDR74-202ENST00000311713 1153 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
CUL4BQ13620 ADGRL1-202ENST00000361434 5610 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
CUL4BQ13620 CD99-203ENST00000381184 918 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
CUL4BQ13620 LINC01881-205ENST00000456398 1235 ntTSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
CUL4BQ13620 ZNF529-AS1-202ENST00000475219 1033 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
CUL4BQ13620 AC026366.1-201ENST00000488803 879 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
CUL4BQ13620 SPI1-204ENST00000533968 1290 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
CUL4BQ13620 MMP25-204ENST00000612971 1017 ntTSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
CUL4BQ13620 CPZ-202ENST00000360986 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
CUL4BQ13620 LEMD2-201ENST00000293760 2958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
CUL4BQ13620 SYN2-206ENST00000621198 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
CUL4BQ13620 LARGE2-202ENST00000401752 2516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
CUL4BQ13620 RHOT1-202ENST00000354266 2919 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
CUL4BQ13620 NFIX-202ENST00000360105 5459 ntTSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
CUL4BQ13620 ADGRA2-201ENST00000315215 6270 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
CUL4BQ13620 DUSP1-201ENST00000239223 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
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