Protein–RNA interactions for Protein: Q13618

CUL3, Cullin-3, humanhuman

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Length 768 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CUL3Q13618 ELOVL2-AS1-201ENST00000456190 737 ntTSL 3 BASIC19.15■□□□□ 0.66
CUL3Q13618 PPP1R14BP3-201ENST00000509033 445 ntBASIC19.15■□□□□ 0.66
CUL3Q13618 CIRBP-214ENST00000587896 1081 ntTSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
CUL3Q13618 ATRAID-208ENST00000611786 1256 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
CUL3Q13618 ALDH3A2-224ENST00000626500 995 ntTSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
CUL3Q13618 KRT15-203ENST00000393976 2394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
CUL3Q13618 TSPAN3-207ENST00000559494 1326 ntTSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
CUL3Q13618 PRODH-215ENST00000610940 2405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
CUL3Q13618 CLDN5-204ENST00000618236 1374 ntAPPRIS P1 BASIC19.15■□□□□ 0.66
CUL3Q13618 CTBP2-202ENST00000334808 2130 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
CUL3Q13618 FXYD6-211ENST00000539526 2132 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
CUL3Q13618 NDRG2-215ENST00000553503 2162 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
CUL3Q13618 WAC-205ENST00000375664 5924 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
CUL3Q13618 PSMD8-201ENST00000215071 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
CUL3Q13618 ADK-206ENST00000541550 2222 ntTSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
CUL3Q13618 LZTS2-202ENST00000370223 2883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
CUL3Q13618 UAP1-204ENST00000367926 2294 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.66
CUL3Q13618 WNK2-202ENST00000395477 6834 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.66
CUL3Q13618 CPSF3-201ENST00000238112 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.66
CUL3Q13618 PPM1G-201ENST00000344034 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.66
CUL3Q13618 CAMKV-205ENST00000467248 1688 ntTSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.66
CUL3Q13618 ETV7-206ENST00000615781 1776 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.66
CUL3Q13618 ULK3-220ENST00000569437 2611 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
CUL3Q13618 ANKRD6-202ENST00000369408 5258 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
CUL3Q13618 GAR1-201ENST00000226796 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
CUL3Q13618 ZDHHC2-201ENST00000262096 6377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
CUL3Q13618 XBP1-202ENST00000344347 1131 ntTSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
CUL3Q13618 C20orf196-202ENST00000378979 585 ntTSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
CUL3Q13618 NCF1B-203ENST00000435988 1254 ntBASIC19.14■□□□□ 0.65
CUL3Q13618 AL031963.3-201ENST00000606441 850 ntBASIC19.14■□□□□ 0.65
CUL3Q13618 TBC1D19-201ENST00000264866 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
CUL3Q13618 KRT8P20-201ENST00000423953 1409 ntBASIC19.14■□□□□ 0.65
CUL3Q13618 ETS1-208ENST00000535549 4594 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
CUL3Q13618 SNRPA-201ENST00000243563 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
CUL3Q13618 TSEN15-203ENST00000423085 1743 ntTSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
CUL3Q13618 HPGD-213ENST00000541923 2920 ntTSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
CUL3Q13618 RAB28-201ENST00000288723 1810 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
CUL3Q13618 GCOM1-202ENST00000380569 1846 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
CUL3Q13618 FGFR3-202ENST00000340107 4293 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
CUL3Q13618 KAZN-203ENST00000376030 6030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
CUL3Q13618 EEF1A2-201ENST00000217182 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
CUL3Q13618 PDCD10-201ENST00000392750 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
CUL3Q13618 TLNRD1-201ENST00000267984 4845 ntAPPRIS P1 BASIC19.13■□□□□ 0.65
CUL3Q13618 PGRMC2-208ENST00000613358 3783 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
CUL3Q13618 PPP1CA-202ENST00000358239 1054 ntTSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
CUL3Q13618 FAM229A-204ENST00000432622 699 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
CUL3Q13618 H1FX-AS1-204ENST00000511998 917 ntTSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
CUL3Q13618 AC023632.3-201ENST00000521633 145 ntBASIC19.13■□□□□ 0.65
CUL3Q13618 ZNF324-202ENST00000535298 1006 ntTSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
CUL3Q13618 CAMTA1-216ENST00000557126 486 ntTSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
CUL3Q13618 ATP6V0E2-211ENST00000606024 893 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
CUL3Q13618 WDR37-203ENST00000381329 1307 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
CUL3Q13618 FN3K-201ENST00000300784 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
CUL3Q13618 UNC119-202ENST00000335765 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
CUL3Q13618 ESX1-201ENST00000372588 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
CUL3Q13618 AC009237.14-201ENST00000609975 1594 ntBASIC19.13■□□□□ 0.65
CUL3Q13618 ADRA1A-203ENST00000380572 1697 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
CUL3Q13618 AL138781.2-201ENST00000617896 1843 ntBASIC19.13■□□□□ 0.65
CUL3Q13618 ARHGAP22-210ENST00000477708 1951 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
CUL3Q13618 ASMTL-201ENST00000381317 2027 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
CUL3Q13618 ASMTL-202ENST00000381333 2035 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
CUL3Q13618 ADAP1-205ENST00000449296 2093 ntTSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
CUL3Q13618 DBNL-217ENST00000468694 2068 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
CUL3Q13618 CCDC17-202ENST00000421127 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
CUL3Q13618 LRRC25-201ENST00000339007 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
CUL3Q13618 AKT1S1-207ENST00000391835 3075 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
CUL3Q13618 GABBR1-204ENST00000377016 4299 ntTSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
CUL3Q13618 FNBP1-202ENST00000420781 5410 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
CUL3Q13618 MAPK9-207ENST00000452135 4815 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
CUL3Q13618 FGFR3-205ENST00000440486 4287 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
CUL3Q13618 ZYG11A-203ENST00000612017 3682 ntTSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
CUL3Q13618 ELAC2-202ENST00000395962 2924 ntTSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
CUL3Q13618 RSPO4-201ENST00000217260 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
CUL3Q13618 CHPF-203ENST00000535926 2634 ntTSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
CUL3Q13618 AC008764.1-201ENST00000409035 2567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
CUL3Q13618 HSF2-201ENST00000368455 2549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
CUL3Q13618 TACSTD2-201ENST00000371225 2351 ntAPPRIS P1 BASIC19.12■□□□□ 0.65
CUL3Q13618 MMD2-201ENST00000401401 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
CUL3Q13618 ZNF205-206ENST00000620094 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
CUL3Q13618 TNFRSF1A-201ENST00000162749 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
CUL3Q13618 SLC34A3-202ENST00000538474 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
CUL3Q13618 LAG3-201ENST00000203629 1974 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
CUL3Q13618 TIMM13-201ENST00000215570 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
CUL3Q13618 TBC1D10A-204ENST00000403477 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
CUL3Q13618 MPP5-201ENST00000261681 5552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
CUL3Q13618 MFSD10-211ENST00000514800 1776 ntTSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
CUL3Q13618 TMSB4X-203ENST00000380636 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
CUL3Q13618 RNH1-206ENST00000438658 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
CUL3Q13618 CHMP6-201ENST00000325167 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
CUL3Q13618 RBM14-RBM4-201ENST00000412278 1566 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
CUL3Q13618 NOMO3-202ENST00000399336 4356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
CUL3Q13618 SPESP1-201ENST00000310673 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
CUL3Q13618 TNFRSF25-203ENST00000351959 1441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
CUL3Q13618 SYNM-204ENST00000594047 6407 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
CUL3Q13618 TAF9-201ENST00000217893 1283 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
CUL3Q13618 LRR1-202ENST00000318317 957 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
CUL3Q13618 HLA-G-202ENST00000376815 851 ntBASIC19.12■□□□□ 0.65
CUL3Q13618 HLA-G-203ENST00000376818 1127 ntBASIC19.12■□□□□ 0.65
CUL3Q13618 MIPEPP3-201ENST00000412105 444 ntBASIC19.12■□□□□ 0.65
CUL3Q13618 GATA3-AS1-204ENST00000438755 675 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
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