Protein–RNA interactions for Protein: Q13310

PABPC4, Polyadenylate-binding protein 4, humanhuman

Known RBP eCLIP

Length 644 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PABPC4Q13310 AHCYL1-203ENST00000393614 4313 ntTSL 2 BASIC21.06■□□□□ 0.969e-10■■■■□ 20.1
PABPC4Q13310 AHCYL1-202ENST00000369799 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.99e-10■■■■□ 20.1
PABPC4Q13310 TACO1-201ENST00000258975 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.429e-8■■■■□ 20.1
PABPC4Q13310 TACO1-202ENST00000581120 2304 ntTSL 218.03■□□□□ 0.489e-8■■■■□ 20.1
PABPC4Q13310 NDUFA13-201ENST00000428459 576 ntTSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.39e-10■■■■□ 20.1
PABPC4Q13310 MYCBP-201ENST00000397572 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.082e-7■■■■□ 20.1
PABPC4Q13310 CTSD-203ENST00000429746 690 ntTSL 320.69■□□□□ 0.97e-15■■■■□ 20.1
PABPC4Q13310 CDKN1B-202ENST00000396340 897 ntTSL 3 BASIC23.31■■□□□ 1.323e-6■■■■□ 20.1
PABPC4Q13310 CDKN1B-203ENST00000442489 577 ntTSL 519.94■□□□□ 0.783e-6■■■■□ 20.1
PABPC4Q13310 FAM50A-203ENST00000464419 1470 ntTSL 526.8■■□□□ 1.883e-7■■■■□ 20.1
PABPC4Q13310 FAM50A-202ENST00000393600 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.083e-7■■■■□ 20.1
PABPC4Q13310 DHPS-218ENST00000600510 1085 ntTSL 217.21■□□□□ 0.359e-9■■■■□ 20.1
PABPC4Q13310 DHPS-219ENST00000600639 285 ntTSL 316.41■□□□□ 0.229e-9■■■■□ 20.1
PABPC4Q13310 DHPS-214ENST00000598246 553 ntTSL 315.12■□□□□ 0.019e-9■■■■□ 20.1
PABPC4Q13310 DHPS-220ENST00000600864 464 ntTSL 512.81□□□□□ -0.369e-9■■■■□ 20.1
PABPC4Q13310 GNAL-201ENST00000269162 1722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.77■■□□□ 1.882e-7■■■■□ 20.1
PABPC4Q13310 KCNN4-201ENST00000262888 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.32e-7■■■■□ 20.1
PABPC4Q13310 KCNN4-207ENST00000600909 1190 ntTSL 322.81■■□□□ 1.242e-7■■■■□ 20.1
PABPC4Q13310 KCNN4-203ENST00000598836 1003 ntTSL 521.74■■□□□ 1.072e-7■■■■□ 20.1
PABPC4Q13310 AKAP17A-203ENST00000474361 3232 ntTSL 1 (best)20.46■□□□□ 0.872e-7■■■■□ 20.1
PABPC4Q13310 KCNN4-209ENST00000615047 2029 ntTSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.872e-7■■■■□ 20.1
PABPC4Q13310 AKAP17A-201ENST00000313871 3204 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.852e-7■■■■□ 20.1
PABPC4Q13310 LETMD1-202ENST00000380135 1566 ntTSL 319.22■□□□□ 0.674e-6■■■■□ 20.1
PABPC4Q13310 LETMD1-210ENST00000547555 1658 ntTSL 518.65■□□□□ 0.584e-6■■■■□ 20.1
PABPC4Q13310 GNAL-204ENST00000535121 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.512e-7■■■■□ 20.1
PABPC4Q13310 ASXL1-212ENST00000620121 5374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.512e-7■■■■□ 20.1
PABPC4Q13310 GNAL-202ENST00000334049 6535 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.482e-7■■■■□ 20.1
PABPC4Q13310 LETMD1-206ENST00000547008 1665 ntTSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.374e-6■■■■□ 20.1
PABPC4Q13310 LETMD1-212ENST00000547877 2020 ntTSL 517.14■□□□□ 0.334e-6■■■■□ 20.1
PABPC4Q13310 FBXO5-202ENST00000367241 2221 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.316e-6■■■■□ 20.1
PABPC4Q13310 LETMD1-235ENST00000552739 1713 ntTSL 2 BASIC16.65■□□□□ 0.264e-6■■■■□ 20.1
PABPC4Q13310 LETMD1-201ENST00000262055 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.254e-6■■■■□ 20.1
PABPC4Q13310 LETMD1-203ENST00000418425 2123 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.254e-6■■■■□ 20.1
PABPC4Q13310 C1orf109-211ENST00000494120 2570 ntTSL 1 (best)16.57■□□□□ 0.242e-7■■■■□ 20.1
PABPC4Q13310 ZC3HAV1-204ENST00000471652 3182 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.22e-7■■■■□ 20.1
PABPC4Q13310 RTN3-207ENST00000536011 992 ntTSL 216.03■□□□□ 0.162e-7■■■■□ 20.1
PABPC4Q13310 LETMD1-209ENST00000547318 2001 ntTSL 1 (best)15.97■□□□□ 0.154e-6■■■■□ 20.1
PABPC4Q13310 ZC3HAV1-203ENST00000464606 4776 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.092e-7■■■■□ 20.1
PABPC4Q13310 RTN3-210ENST00000540798 3124 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.032e-7■■■■□ 20.1
PABPC4Q13310 FBXO5-201ENST00000229758 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.056e-6■■■■□ 20.1
PABPC4Q13310 GNAL-203ENST00000423027 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.062e-7■■■■□ 20.1
PABPC4Q13310 C1orf109-201ENST00000358011 2355 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.53□□□□□ -0.082e-7■■■■□ 20.1
PABPC4Q13310 LETMD1-221ENST00000550100 1480 ntTSL 214.14□□□□□ -0.154e-6■■■■□ 20.1
PABPC4Q13310 AAMP-206ENST00000461911 567 ntTSL 213.42□□□□□ -0.262e-7■■■■□ 20.1
PABPC4Q13310 CHMP1B-201ENST00000526991 3054 ntAPPRIS P1 BASIC13.2□□□□□ -0.32e-7■■■■□ 20.1
PABPC4Q13310 LETMD1-234ENST00000552645 1623 ntTSL 1 (best)11.69□□□□□ -0.544e-6■■■■□ 20.1
PABPC4Q13310 GNAL-206ENST00000585642 623 ntTSL 411.24□□□□□ -0.612e-7■■■■□ 20.1
PABPC4Q13310 ZC3HAV1-202ENST00000460845 1487 ntTSL 1 (best)10.39□□□□□ -0.752e-7■■■■□ 20.1
PABPC4Q13310 C1orf109-213ENST00000609516 2622 nt9.36□□□□□ -0.912e-7■■■■□ 20.1
PABPC4Q13310 LETMD1-238ENST00000623495 2948 nt8.2□□□□□ -1.14e-6■■■■□ 20.1
PABPC4Q13310 FBXO5-203ENST00000477822 2610 ntTSL 27.61□□□□□ -1.196e-6■■■■□ 20.1
PABPC4Q13310 GNAL-208ENST00000590228 585 ntTSL 44.72□□□□□ -1.652e-7■■■■□ 20.1
PABPC4Q13310 MRPS2-202ENST00000371785 1640 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.51■■□□□ 1.672e-7■■■■□ 20.1
PABPC4Q13310 MRPS2-201ENST00000241600 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.312e-7■■■■□ 20.1
PABPC4Q13310 TPGS2-221ENST00000614939 1268 ntTSL 4 BASIC22.65■■□□□ 1.222e-7■■■■□ 20
PABPC4Q13310 TPGS2-219ENST00000593035 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.842e-7■■■■□ 20
PABPC4Q13310 TPGS2-220ENST00000610723 1426 ntTSL 3 BASIC19.81■□□□□ 0.762e-7■■■■□ 20
PABPC4Q13310 TPGS2-215ENST00000590842 1239 ntTSL 2 BASIC19.28■□□□□ 0.682e-7■■■■□ 20
PABPC4Q13310 TPGS2-202ENST00000383056 1726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.372e-7■■■■□ 20
PABPC4Q13310 TPGS2-201ENST00000334295 4030 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.272e-7■■■■□ 20
PABPC4Q13310 TPGS2-210ENST00000590258 2679 ntTSL 211.21□□□□□ -0.612e-7■■■■□ 20
PABPC4Q13310 TPGS2-204ENST00000587129 841 ntTSL 4 BASIC9.52□□□□□ -0.892e-7■■■■□ 20
PABPC4Q13310 TPGS2-206ENST00000587382 2079 ntTSL 38.95□□□□□ -0.982e-7■■■■□ 20
PABPC4Q13310 TPGS2-218ENST00000591906 936 ntTSL 38.77□□□□□ -1.012e-7■■■■□ 20
PABPC4Q13310 TPGS2-213ENST00000590652 515 ntTSL 55.66□□□□□ -1.52e-7■■■■□ 20
PABPC4Q13310 ASNS-216ENST00000487714 689 ntTSL 26.5□□□□□ -1.377e-8■■■■□ 20
PABPC4Q13310 RPS6KB2-211ENST00000531765 723 ntTSL 323.13■■□□□ 1.292e-6■■■■□ 20
PABPC4Q13310 MAPK3-206ENST00000461737 612 ntTSL 220.09■□□□□ 0.812e-6■■■■□ 20
PABPC4Q13310 CHCHD3-204ENST00000457942 559 ntTSL 419.15■□□□□ 0.663e-7■■■■□ 20
PABPC4Q13310 ABHD14A-ACY1-224ENST00000637512 1536 ntTSL 518.14■□□□□ 0.492e-7■■■■□ 20
PABPC4Q13310 ABHD14A-ACY1-227ENST00000637730 2735 ntTSL 516.22■□□□□ 0.192e-7■■■■□ 20
PABPC4Q13310 ABHD14A-ACY1-228ENST00000637778 3628 ntTSL 515.73■□□□□ 0.112e-7■■■■□ 20
PABPC4Q13310 GRK2-204ENST00000526285 1458 ntTSL 5 BASIC32.61■■■□□ 2.812e-7■■■■□ 20
PABPC4Q13310 GRK2-201ENST00000308595 3466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.062e-7■■■■□ 20
PABPC4Q13310 GRK2-202ENST00000416281 4493 ntTSL 215.64■□□□□ 0.092e-7■■■■□ 20
PABPC4Q13310 KLHDC3-201ENST00000244670 1903 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.791e-6■■■■□ 20
PABPC4Q13310 KLHDC3-202ENST00000326974 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.61e-6■■■■□ 20
PABPC4Q13310 KLHDC3-203ENST00000332245 1494 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.471e-6■■■■□ 20
PABPC4Q13310 NDUFAF4-201ENST00000316149 2399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.7□□□□□ -1.669e-8■■■■□ 20
PABPC4Q13310 NDUFAF4-202ENST00000478382 555 ntTSL 23.59□□□□□ -1.839e-8■■■■□ 20
PABPC4Q13310 TRIM28-202ENST00000341753 2709 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.489e-9■■■■□ 20
PABPC4Q13310 TRIM28-201ENST00000253024 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.379e-9■■■■□ 20
PABPC4Q13310 TRIM28-207ENST00000597136 1552 ntTSL 217.61■□□□□ 0.419e-9■■■■□ 20
PABPC4Q13310 SAT1-207ENST00000474223 1033 ntTSL 27.31□□□□□ -1.248e-20■■■■□ 20
PABPC4Q13310 ARL2-SNX15-201ENST00000301886 2392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.465e-7■■■■□ 20
PABPC4Q13310 RPS4X-202ENST00000373626 594 ntTSL 39.83□□□□□ -0.841e-70■■■■□ 20
PABPC4Q13310 TPX2-201ENST00000300403 3497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.251e-7■■■■□ 20
PABPC4Q13310 TPX2-202ENST00000340513 3605 ntTSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.291e-7■■■■□ 20
PABPC4Q13310 GOT2-202ENST00000434819 1615 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.219e-12■■■■□ 20
PABPC4Q13310 ASXL1-202ENST00000375687 7031 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.611e-7■■■■□ 20
PABPC4Q13310 ASXL1-210ENST00000613218 7038 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.421e-7■■■■□ 20
PABPC4Q13310 ASXL1-201ENST00000306058 6591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.181e-7■■■■□ 20
PABPC4Q13310 PSMC5-203ENST00000578570 1680 ntTSL 224.21■■□□□ 1.475e-7■■■■□ 20
PABPC4Q13310 PSMC5-202ENST00000375812 1494 ntTSL 2 BASIC19.82■□□□□ 0.765e-7■■■■□ 20
PABPC4Q13310 PSMC5-209ENST00000580864 1552 ntTSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.565e-7■■■■□ 20
PABPC4Q13310 PSMC5-212ENST00000581882 1474 ntTSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.15e-7■■■■□ 20
PABPC4Q13310 PSMC5-201ENST00000310144 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.095e-7■■■■□ 20
PABPC4Q13310 PSMC5-205ENST00000579147 2586 ntTSL 214.12□□□□□ -0.155e-7■■■■□ 20
PABPC4Q13310 PSMC5-221ENST00000585242 1178 ntTSL 510.83□□□□□ -0.685e-7■■■■□ 20
PABPC4Q13310 MBD3-209ENST00000592012 2379 ntTSL 521.85■■□□□ 1.093e-7■■■■□ 20
Retrieved 100 of 23,669 protein–RNA pairs in 90.3 ms