Protein–RNA interactions for Protein: Q13224

GRIN2B, Glutamate receptor ionotropic, NMDA 2B, humanhuman

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Length 1,484 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GRIN2BQ13224 SUMO3-201ENST00000332859 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.75■■■□□ 2.67
GRIN2BQ13224 ACTG1-201ENST00000331925 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.75■■■□□ 2.67
GRIN2BQ13224 BRWD1-202ENST00000341322 2495 ntTSL 1 (best) BASIC31.75■■■□□ 2.67
GRIN2BQ13224 AP003396.1-201ENST00000501918 507 ntTSL 5 BASIC31.75■■■□□ 2.67
GRIN2BQ13224 RPUSD2-202ENST00000559271 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC31.75■■■□□ 2.67
GRIN2BQ13224 RPS6KB2-201ENST00000312629 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.75■■■□□ 2.67
GRIN2BQ13224 KTI12-201ENST00000371614 1714 ntAPPRIS P1 BASIC31.75■■■□□ 2.67
GRIN2BQ13224 AL117328.2-201ENST00000624617 1940 ntBASIC31.75■■■□□ 2.67
GRIN2BQ13224 TTLL7-214ENST00000610996 2028 ntTSL 5 BASIC31.75■■■□□ 2.67
GRIN2BQ13224 DYRK1B-204ENST00000593685 2724 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC31.75■■■□□ 2.67
GRIN2BQ13224 CNPY2-201ENST00000273308 1214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.74■■■□□ 2.67
GRIN2BQ13224 RNPEP-201ENST00000295640 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.74■■■□□ 2.67
GRIN2BQ13224 SPSB1-203ENST00000377399 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.74■■■□□ 2.67
GRIN2BQ13224 DYNLT3-201ENST00000378578 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.74■■■□□ 2.67
GRIN2BQ13224 CIB2-208ENST00000560618 804 ntTSL 2 BASIC31.74■■■□□ 2.67
GRIN2BQ13224 SEPT9-236ENST00000591088 1691 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC31.74■■■□□ 2.67
GRIN2BQ13224 AC092902.2-222ENST00000626312 568 ntTSL 5 BASIC31.74■■■□□ 2.67
GRIN2BQ13224 TRAM2-AS1-204ENST00000606714 2453 ntTSL 2 BASIC31.74■■■□□ 2.67
GRIN2BQ13224 FOXA2-201ENST00000377115 2401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.74■■■□□ 2.67
GRIN2BQ13224 AC124066.1-201ENST00000581122 1660 ntTSL 5 BASIC31.73■■■□□ 2.67
GRIN2BQ13224 NR1H2-202ENST00000411902 1466 ntTSL 1 (best) BASIC31.73■■■□□ 2.67
GRIN2BQ13224 OGFOD2-205ENST00000454694 1488 ntTSL 1 (best) BASIC31.73■■■□□ 2.67
GRIN2BQ13224 ELANE-201ENST00000263621 920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.73■■■□□ 2.67
GRIN2BQ13224 DRAXINP1-201ENST00000437611 948 ntBASIC31.73■■■□□ 2.67
GRIN2BQ13224 MAP2K3-215ENST00000627447 351 ntTSL 5 BASIC31.73■■■□□ 2.67
GRIN2BQ13224 MRPL3-201ENST00000264995 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.73■■■□□ 2.67
GRIN2BQ13224 SHMT1-202ENST00000352886 2437 ntTSL 2 BASIC31.73■■■□□ 2.67
GRIN2BQ13224 C6orf203-202ENST00000405204 1420 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.73■■■□□ 2.67
GRIN2BQ13224 KLHDC4-227ENST00000622456 1422 ntTSL 5 BASIC31.73■■■□□ 2.67
GRIN2BQ13224 CRYBB2P1-202ENST00000382734 1364 ntTSL 1 (best) BASIC31.73■■■□□ 2.67
GRIN2BQ13224 KIAA1456-201ENST00000400069 1982 ntTSL 2 BASIC31.72■■■□□ 2.67
GRIN2BQ13224 UFSP1-201ENST00000388761 996 ntAPPRIS P1 BASIC31.72■■■□□ 2.67
GRIN2BQ13224 ITM2C-204ENST00000409704 1106 ntTSL 5 BASIC31.72■■■□□ 2.67
GRIN2BQ13224 RABL2B-209ENST00000435118 1126 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.72■■■□□ 2.67
GRIN2BQ13224 DMKN-215ENST00000451297 1111 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.72■■■□□ 2.67
GRIN2BQ13224 KLK12-205ENST00000529888 735 ntTSL 1 (best) BASIC31.72■■■□□ 2.67
GRIN2BQ13224 TMIGD2-202ENST00000595645 1212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.72■■■□□ 2.67
GRIN2BQ13224 ABHD14A-ACY1-202ENST00000463937 1705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC31.72■■■□□ 2.67
GRIN2BQ13224 GPR137-204ENST00000438980 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.72■■■□□ 2.67
GRIN2BQ13224 FCMR-202ENST00000442471 1441 ntTSL 2 BASIC31.72■■■□□ 2.67
GRIN2BQ13224 APBB1-207ENST00000529519 1442 ntTSL 5 BASIC31.72■■■□□ 2.67
GRIN2BQ13224 DUSP15-203ENST00000375966 1077 ntTSL 3 BASIC31.72■■■□□ 2.67
GRIN2BQ13224 CGB7-201ENST00000377280 918 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC31.72■■■□□ 2.67
GRIN2BQ13224 CAPG-203ENST00000409670 1183 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.72■■■□□ 2.67
GRIN2BQ13224 TSPY12P-201ENST00000421279 868 ntBASIC31.72■■■□□ 2.67
GRIN2BQ13224 AC069368.1-202ENST00000437723 750 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.72■■■□□ 2.67
GRIN2BQ13224 ATP5D-207ENST00000591660 637 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC31.72■■■□□ 2.67
GRIN2BQ13224 AC099811.2-203ENST00000592574 958 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.72■■■□□ 2.67
GRIN2BQ13224 CHMP4A-211ENST00000609024 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.72■■■□□ 2.67
GRIN2BQ13224 CPEB1-218ENST00000620182 2422 ntTSL 2 BASIC31.71■■■□□ 2.67
GRIN2BQ13224 PHKG2-202ENST00000424889 1566 ntTSL 2 BASIC31.71■■■□□ 2.67
GRIN2BQ13224 PACSIN3-211ENST00000539589 2009 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.71■■■□□ 2.67
GRIN2BQ13224 GRK3-203ENST00000619906 2873 ntTSL 5 BASIC31.71■■■□□ 2.67
GRIN2BQ13224 HLA-F-217ENST00000334668 1283 ntAPPRIS ALT2 BASIC31.71■■■□□ 2.67
GRIN2BQ13224 GGT1-208ENST00000404920 657 ntTSL 1 (best) BASIC31.71■■■□□ 2.67
GRIN2BQ13224 AC003075.1-204ENST00000433005 540 ntTSL 2 BASIC31.71■■■□□ 2.67
GRIN2BQ13224 HLA-F-220ENST00000434407 884 ntBASIC31.71■■■□□ 2.67
GRIN2BQ13224 AC093459.1-201ENST00000444567 481 ntTSL 3 BASIC31.71■■■□□ 2.67
GRIN2BQ13224 GGTLC2-203ENST00000480559 657 ntTSL 1 (best) BASIC31.71■■■□□ 2.67
GRIN2BQ13224 PLPP5-214ENST00000531823 875 ntTSL 3 BASIC31.71■■■□□ 2.67
GRIN2BQ13224 BMF-207ENST00000559701 630 ntTSL 3 BASIC31.71■■■□□ 2.67
GRIN2BQ13224 C1orf43-210ENST00000640799 1287 ntTSL 5 BASIC31.71■■■□□ 2.67
GRIN2BQ13224 BEST2-204ENST00000553030 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.7■■■□□ 2.67
GRIN2BQ13224 FGF16-201ENST00000439435 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.7■■■□□ 2.67
GRIN2BQ13224 FBXW4P1-201ENST00000426721 2239 ntBASIC31.7■■■□□ 2.67
GRIN2BQ13224 CA9-201ENST00000378357 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.7■■■□□ 2.67
GRIN2BQ13224 AC011773.3-202ENST00000549291 790 ntTSL 3 BASIC31.7■■■□□ 2.66
GRIN2BQ13224 LINC01582-202ENST00000561215 452 ntTSL 4 BASIC31.7■■■□□ 2.66
GRIN2BQ13224 GNAS-AS1-203ENST00000598163 548 ntTSL 4 BASIC31.7■■■□□ 2.66
GRIN2BQ13224 PLAUR-214ENST00000601723 1205 ntTSL 1 (best) BASIC31.7■■■□□ 2.66
GRIN2BQ13224 AL513523.2-201ENST00000633218 660 ntTSL 3 BASIC31.7■■■□□ 2.66
GRIN2BQ13224 CXorf40A-208ENST00000434353 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC31.7■■■□□ 2.66
GRIN2BQ13224 AC140125.2-201ENST00000502515 1517 ntTSL 1 (best) BASIC31.7■■■□□ 2.66
GRIN2BQ13224 AGAP2-AS1-201ENST00000542466 1500 ntTSL 1 (best) BASIC31.7■■■□□ 2.66
GRIN2BQ13224 ADAMTS2-202ENST00000274609 2044 ntTSL 1 (best) BASIC31.7■■■□□ 2.66
GRIN2BQ13224 CCDC189-206ENST00000543610 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.7■■■□□ 2.66
GRIN2BQ13224 MICU2-201ENST00000382374 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.7■■■□□ 2.66
GRIN2BQ13224 DNAAF3-201ENST00000391720 2169 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC31.69■■■□□ 2.66
GRIN2BQ13224 C7orf34-201ENST00000409607 766 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.69■■■□□ 2.66
GRIN2BQ13224 AC079602.3-201ENST00000623931 403 ntBASIC31.69■■■□□ 2.66
GRIN2BQ13224 MAP2K5-202ENST00000340972 1491 ntTSL 2 BASIC31.69■■■□□ 2.66
GRIN2BQ13224 TNFRSF19-202ENST00000382258 1625 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC31.69■■■□□ 2.66
GRIN2BQ13224 C1QTNF1-209ENST00000581774 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.68■■■□□ 2.66
GRIN2BQ13224 NPAS3-206ENST00000548645 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.68■■■□□ 2.66
GRIN2BQ13224 OSR1-201ENST00000272223 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.68■■■□□ 2.66
GRIN2BQ13224 MYOG-201ENST00000241651 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.68■■■□□ 2.66
GRIN2BQ13224 CYCS-202ENST00000409409 974 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC31.68■■■□□ 2.66
GRIN2BQ13224 AC004975.2-201ENST00000442017 565 ntTSL 5 BASIC31.68■■■□□ 2.66
GRIN2BQ13224 AC012615.1-201ENST00000565797 1299 ntBASIC31.68■■■□□ 2.66
GRIN2BQ13224 FBXW9-203ENST00000587955 1437 ntTSL 1 (best) BASIC31.68■■■□□ 2.66
GRIN2BQ13224 SLC7A10-201ENST00000253188 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.68■■■□□ 2.66
GRIN2BQ13224 NAGPA-202ENST00000381955 2100 ntTSL 5 BASIC31.67■■■□□ 2.66
GRIN2BQ13224 PTPMT1-201ENST00000326656 928 ntTSL 1 (best) BASIC31.67■■■□□ 2.66
GRIN2BQ13224 C7orf50-203ENST00000397100 1264 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC31.67■■■□□ 2.66
GRIN2BQ13224 GGT1-204ENST00000401885 968 ntTSL 1 (best) BASIC31.67■■■□□ 2.66
GRIN2BQ13224 NECTIN3-AS1-204ENST00000476301 568 ntTSL 4 BASIC31.67■■■□□ 2.66
GRIN2BQ13224 IL11-204ENST00000590625 1028 ntTSL 2 BASIC31.67■■■□□ 2.66
GRIN2BQ13224 MUC1-224ENST00000611577 1023 ntTSL 1 (best) BASIC31.67■■■□□ 2.66
GRIN2BQ13224 CYP2D7-203ENST00000433992 1740 ntTSL 1 (best) BASIC31.67■■■□□ 2.66
GRIN2BQ13224 CYP2D7-207ENST00000612115 1734 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.67■■■□□ 2.66
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