Protein–RNA interactions for Protein: Q0D2K0

NIPAL4, Magnesium transporter NIPA4, humanhuman

Predictions only

Length 466 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NIPAL4Q0D2K0 AC100835.1-201ENST00000565737 498 ntTSL 5 BASIC19.71■□□□□ 0.75
NIPAL4Q0D2K0 MTFP1-206ENST00000629597 482 ntTSL 5 BASIC19.71■□□□□ 0.75
NIPAL4Q0D2K0 HIBADH-201ENST00000265395 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
NIPAL4Q0D2K0 RTN4-201ENST00000317610 2333 ntTSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
NIPAL4Q0D2K0 MEN1-209ENST00000394376 3034 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.71■□□□□ 0.75
NIPAL4Q0D2K0 C19orf66-209ENST00000591813 1481 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
NIPAL4Q0D2K0 MID2-201ENST00000262843 2876 ntTSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
NIPAL4Q0D2K0 KSR1-205ENST00000509603 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.71■□□□□ 0.75
NIPAL4Q0D2K0 ST3GAL4-205ENST00000449406 1669 ntTSL 5 BASIC19.71■□□□□ 0.75
NIPAL4Q0D2K0 PLPBP-201ENST00000328195 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
NIPAL4Q0D2K0 DLGAP4-206ENST00000475894 3110 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.71■□□□□ 0.75
NIPAL4Q0D2K0 SNAPC2-201ENST00000221573 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
NIPAL4Q0D2K0 NECAB3-202ENST00000375238 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
NIPAL4Q0D2K0 KXD1-203ENST00000540691 1592 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.7■□□□□ 0.74
NIPAL4Q0D2K0 CDHR5-201ENST00000349570 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
NIPAL4Q0D2K0 CACNA1B-201ENST00000277549 7158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
NIPAL4Q0D2K0 CACNA1B-202ENST00000277551 7158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.7■□□□□ 0.74
NIPAL4Q0D2K0 ZNF664-207ENST00000539644 5108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
NIPAL4Q0D2K0 PPP4R2-201ENST00000356692 4984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
NIPAL4Q0D2K0 LAG3-201ENST00000203629 1974 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
NIPAL4Q0D2K0 MAEA-208ENST00000505839 1444 ntTSL 2 BASIC19.7■□□□□ 0.74
NIPAL4Q0D2K0 LRCH4-201ENST00000310300 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
NIPAL4Q0D2K0 ETV4-204ENST00000545089 1628 ntTSL 2 BASIC19.7■□□□□ 0.74
NIPAL4Q0D2K0 PODNL1-203ENST00000538371 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.7■□□□□ 0.74
NIPAL4Q0D2K0 TSPY8-201ENST00000287721 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
NIPAL4Q0D2K0 MCAT-202ENST00000327555 1134 ntTSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
NIPAL4Q0D2K0 SIVA1-201ENST00000329967 802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
NIPAL4Q0D2K0 TSPY10-201ENST00000428845 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
NIPAL4Q0D2K0 TSPY3-203ENST00000457222 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
NIPAL4Q0D2K0 HGNC:18790-208ENST00000506380 798 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.7■□□□□ 0.74
NIPAL4Q0D2K0 CDH18-AS1-201ENST00000513573 424 ntTSL 2 BASIC19.7■□□□□ 0.74
NIPAL4Q0D2K0 RNASEK-202ENST00000548577 810 ntTSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
NIPAL4Q0D2K0 AC142381.4-202ENST00000563973 229 ntBASIC19.7■□□□□ 0.74
NIPAL4Q0D2K0 C1QL1P1-201ENST00000568105 661 ntBASIC19.7■□□□□ 0.74
NIPAL4Q0D2K0 GRM6-201ENST00000231188 6143 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.7■□□□□ 0.74
NIPAL4Q0D2K0 TMEM53-202ENST00000372237 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
NIPAL4Q0D2K0 ALDOA-212ENST00000564546 2104 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
NIPAL4Q0D2K0 SLC35B2-205ENST00000538577 1909 ntTSL 2 BASIC19.7■□□□□ 0.74
NIPAL4Q0D2K0 RNASEH2C-203ENST00000528220 1337 ntTSL 2 BASIC19.7■□□□□ 0.74
NIPAL4Q0D2K0 RPS6KA2-201ENST00000265678 5824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
NIPAL4Q0D2K0 SLC5A10-205ENST00000417251 1984 ntTSL 2 BASIC19.7■□□□□ 0.74
NIPAL4Q0D2K0 MIXL1-201ENST00000366810 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
NIPAL4Q0D2K0 TMEM235-201ENST00000374946 2409 ntTSL 5 BASIC19.69■□□□□ 0.74
NIPAL4Q0D2K0 PEX7-202ENST00000367756 680 ntTSL 3 BASIC19.69■□□□□ 0.74
NIPAL4Q0D2K0 BOLA1-203ENST00000369153 1096 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.69■□□□□ 0.74
NIPAL4Q0D2K0 AC091564.5-201ENST00000526456 820 ntTSL 4 BASIC19.69■□□□□ 0.74
NIPAL4Q0D2K0 JOSD2-202ENST00000595669 733 ntTSL 2 BASIC19.69■□□□□ 0.74
NIPAL4Q0D2K0 HOXD11-201ENST00000249504 1533 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.69■□□□□ 0.74
NIPAL4Q0D2K0 YBX3-201ENST00000228251 1796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
NIPAL4Q0D2K0 ZNF394-203ENST00000426306 2017 ntTSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
NIPAL4Q0D2K0 AC004408.2-201ENST00000623613 2777 ntBASIC19.69■□□□□ 0.74
NIPAL4Q0D2K0 NAA60-235ENST00000576916 1567 ntTSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
NIPAL4Q0D2K0 LIPG-203ENST00000577628 2323 ntTSL 2 BASIC19.69■□□□□ 0.74
NIPAL4Q0D2K0 SDCBP-204ENST00000447182 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
NIPAL4Q0D2K0 PRKCSH-209ENST00000589838 1898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
NIPAL4Q0D2K0 ADORA2A-215ENST00000618076 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
NIPAL4Q0D2K0 ZBED3-201ENST00000255198 6172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
NIPAL4Q0D2K0 ENTPD6-201ENST00000354989 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
NIPAL4Q0D2K0 LAPTM4B-204ENST00000619747 2758 ntTSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
NIPAL4Q0D2K0 ZNF815P-204ENST00000434898 1737 ntBASIC19.68■□□□□ 0.74
NIPAL4Q0D2K0 NDOR1-203ENST00000427047 2315 ntTSL 2 BASIC19.68■□□□□ 0.74
NIPAL4Q0D2K0 KCNC3-203ENST00000477616 3176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
NIPAL4Q0D2K0 C1QTNF1-201ENST00000311661 2624 ntTSL 2 BASIC19.68■□□□□ 0.74
NIPAL4Q0D2K0 STX18-201ENST00000306200 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
NIPAL4Q0D2K0 MRGPRG-201ENST00000332314 870 ntAPPRIS P1 BASIC19.68■□□□□ 0.74
NIPAL4Q0D2K0 MTHFD1L-201ENST00000367307 1049 ntTSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
NIPAL4Q0D2K0 AL360181.5-201ENST00000368554 1044 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.68■□□□□ 0.74
NIPAL4Q0D2K0 HP1BP3-202ENST00000375000 928 ntTSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
NIPAL4Q0D2K0 HES2-203ENST00000377837 1222 ntTSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
NIPAL4Q0D2K0 METTL5-206ENST00000409965 880 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
NIPAL4Q0D2K0 STK24-AS1-201ENST00000434547 1278 ntTSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
NIPAL4Q0D2K0 AL158047.1-201ENST00000445918 881 ntBASIC19.68■□□□□ 0.74
NIPAL4Q0D2K0 AC007493.2-201ENST00000568427 478 ntTSL 3 BASIC19.68■□□□□ 0.74
NIPAL4Q0D2K0 ARMC4P1-202ENST00000576034 643 ntTSL 2 BASIC19.68■□□□□ 0.74
NIPAL4Q0D2K0 CYB561-214ENST00000582034 1193 ntTSL 2 BASIC19.68■□□□□ 0.74
NIPAL4Q0D2K0 AL024498.1-202ENST00000606652 480 ntTSL 2 BASIC19.68■□□□□ 0.74
NIPAL4Q0D2K0 TMEM191A-211ENST00000637163 1067 ntBASIC19.68■□□□□ 0.74
NIPAL4Q0D2K0 STRBP-201ENST00000348403 3337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
NIPAL4Q0D2K0 TMEM191C-214ENST00000621561 1337 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.68■□□□□ 0.74
NIPAL4Q0D2K0 MVB12A-201ENST00000317040 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
NIPAL4Q0D2K0 ROPN1-209ENST00000495093 1376 ntTSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
NIPAL4Q0D2K0 P2RX5-202ENST00000345901 2031 ntTSL 5 BASIC19.68■□□□□ 0.74
NIPAL4Q0D2K0 FDFT1-226ENST00000623368 2368 ntTSL 2 BASIC19.68■□□□□ 0.74
NIPAL4Q0D2K0 FARSA-207ENST00000588025 2057 ntTSL 5 BASIC19.67■□□□□ 0.74
NIPAL4Q0D2K0 IKBKG-214ENST00000618670 2069 ntTSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
NIPAL4Q0D2K0 SLC1A6-202ENST00000430939 1794 ntTSL 2 BASIC19.67■□□□□ 0.74
NIPAL4Q0D2K0 B4GALT1-202ENST00000535206 1535 ntTSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
NIPAL4Q0D2K0 PAOX-201ENST00000278060 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
NIPAL4Q0D2K0 ANKRD18DP-204ENST00000455355 1975 ntBASIC19.67■□□□□ 0.74
NIPAL4Q0D2K0 RTL8A-201ENST00000370775 1244 ntAPPRIS P1 BASIC19.67■□□□□ 0.74
NIPAL4Q0D2K0 DYNLT3-203ENST00000432389 719 ntTSL 5 BASIC19.67■□□□□ 0.74
NIPAL4Q0D2K0 AC073050.1-201ENST00000442316 462 ntTSL 3 BASIC19.67■□□□□ 0.74
NIPAL4Q0D2K0 LINC00636-201ENST00000494231 1264 ntTSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
NIPAL4Q0D2K0 PTTG1-205ENST00000520452 895 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.67■□□□□ 0.74
NIPAL4Q0D2K0 RPL23AP53-202ENST00000606507 370 ntTSL 3 BASIC19.67■□□□□ 0.74
NIPAL4Q0D2K0 FAM197Y4-202ENST00000622692 608 ntBASIC19.67■□□□□ 0.74
NIPAL4Q0D2K0 HLA-A-209ENST00000638375 975 ntBASIC19.67■□□□□ 0.74
NIPAL4Q0D2K0 ANKRD53-202ENST00000360589 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.67■□□□□ 0.74
NIPAL4Q0D2K0 RASD1-201ENST00000225688 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
NIPAL4Q0D2K0 NFIB-208ENST00000397581 3318 ntTSL 5 BASIC19.67■□□□□ 0.74
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.2 ms