Protein–RNA interactions for Protein: Q09161

NCBP1, Nuclear cap-binding protein subunit 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 790 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NCBP1Q09161 HAUS4-204ENST00000490506 1447 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
NCBP1Q09161 SOX4-201ENST00000244745 5852 ntAPPRIS P1 BASIC21.88■■□□□ 1.09
NCBP1Q09161 PACSIN2-203ENST00000402229 1883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
NCBP1Q09161 LUC7L2-210ENST00000619796 2783 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
NCBP1Q09161 ACD-201ENST00000219251 2052 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
NCBP1Q09161 SYT7-209ENST00000542836 1362 ntTSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
NCBP1Q09161 CMIP-209ENST00000566513 2288 ntTSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
NCBP1Q09161 NAAA-206ENST00000507956 1300 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
NCBP1Q09161 TMEM191C-214ENST00000621561 1337 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
NCBP1Q09161 CIRBP-215ENST00000588030 1509 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
NCBP1Q09161 SOCS2-210ENST00000551556 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
NCBP1Q09161 IFI6-203ENST00000362020 828 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
NCBP1Q09161 CALML5-201ENST00000380332 859 ntAPPRIS P1 BASIC21.87■■□□□ 1.09
NCBP1Q09161 A3GALT2-201ENST00000442999 1023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
NCBP1Q09161 AL049780.2-201ENST00000556236 367 ntTSL 3 BASIC21.87■■□□□ 1.09
NCBP1Q09161 TMEM191B-203ENST00000613597 366 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
NCBP1Q09161 TMEM206-201ENST00000261455 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
NCBP1Q09161 MAFF-206ENST00000538320 2458 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.87■■□□□ 1.09
NCBP1Q09161 ADK-206ENST00000541550 2222 ntTSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
NCBP1Q09161 TM9SF1-206ENST00000528669 2425 ntTSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
NCBP1Q09161 NFE2L1-204ENST00000536222 2172 ntTSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
NCBP1Q09161 CDH5-204ENST00000563425 1932 ntTSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
NCBP1Q09161 HNRNPUL1-203ENST00000378215 2864 ntTSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
NCBP1Q09161 AL049812.1-201ENST00000432563 2267 ntBASIC21.86■■□□□ 1.09
NCBP1Q09161 VAV1-210ENST00000602142 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
NCBP1Q09161 GLS-201ENST00000320717 4834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
NCBP1Q09161 TBX2-201ENST00000240328 3339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
NCBP1Q09161 DNAH17-AS1-202ENST00000591373 1453 ntTSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
NCBP1Q09161 GTPBP2-202ENST00000307126 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
NCBP1Q09161 SYNGR1-201ENST00000216155 497 ntTSL 3 BASIC21.86■■□□□ 1.09
NCBP1Q09161 FKBP2-202ENST00000394540 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
NCBP1Q09161 NPY-202ENST00000405982 565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
NCBP1Q09161 METTL23-208ENST00000588822 1049 ntTSL 3 BASIC21.86■■□□□ 1.09
NCBP1Q09161 AL024498.1-202ENST00000606652 480 ntTSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
NCBP1Q09161 REEP2-202ENST00000378339 2170 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
NCBP1Q09161 FBXO27-201ENST00000292853 2330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
NCBP1Q09161 MAP2K5-203ENST00000354498 1783 ntTSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
NCBP1Q09161 WAC-202ENST00000347934 2839 ntTSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
NCBP1Q09161 AR-207ENST00000612010 3896 ntTSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
NCBP1Q09161 CABIN1-202ENST00000337989 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
NCBP1Q09161 C17orf58-204ENST00000580729 2065 ntTSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
NCBP1Q09161 NADK-201ENST00000341426 3235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
NCBP1Q09161 BANP-223ENST00000538234 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
NCBP1Q09161 MTA1-201ENST00000331320 2876 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
NCBP1Q09161 AC069544.2-201ENST00000640019 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
NCBP1Q09161 C20orf27-201ENST00000217195 1302 ntTSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
NCBP1Q09161 SEC14L2-215ENST00000617837 2632 ntTSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
NCBP1Q09161 HAPLN4-201ENST00000291481 3449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
NCBP1Q09161 H19-201ENST00000411754 1788 ntTSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
NCBP1Q09161 NCLN-205ENST00000590671 2070 ntTSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
NCBP1Q09161 MRPS24-201ENST00000317534 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
NCBP1Q09161 SERF2-207ENST00000409614 582 ntTSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
NCBP1Q09161 ANKRD54-204ENST00000411961 946 ntTSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
NCBP1Q09161 HAGLROS-201ENST00000426615 1121 ntTSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
NCBP1Q09161 LINC00894-209ENST00000458274 547 ntTSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
NCBP1Q09161 AC035140.1-201ENST00000507957 493 ntTSL 3 BASIC21.85■■□□□ 1.09
NCBP1Q09161 ARMC4P1-202ENST00000576034 643 ntTSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
NCBP1Q09161 CABP2-204ENST00000636477 941 ntTSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
NCBP1Q09161 CRB2-202ENST00000373631 5550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
NCBP1Q09161 MTSS1L-204ENST00000616026 2241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
NCBP1Q09161 CPEB1-214ENST00000617522 2220 ntTSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
NCBP1Q09161 GPRC5C-204ENST00000392629 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
NCBP1Q09161 RSAD1-201ENST00000258955 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
NCBP1Q09161 KIF1BP-201ENST00000361983 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
NCBP1Q09161 POLI-202ENST00000406285 2030 ntTSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
NCBP1Q09161 LDLRAD4-211ENST00000587757 2171 ntTSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
NCBP1Q09161 PTOV1-AS1-201ENST00000596521 2155 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
NCBP1Q09161 TMPRSS6-207ENST00000442782 1695 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
NCBP1Q09161 AC008764.1-201ENST00000409035 2567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
NCBP1Q09161 NECTIN1-201ENST00000264025 5840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
NCBP1Q09161 GALNT13-201ENST00000392825 5536 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
NCBP1Q09161 LBX2-AS1-202ENST00000603175 2083 ntBASIC21.84■■□□□ 1.09
NCBP1Q09161 P2RY11-201ENST00000321826 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
NCBP1Q09161 KMT5A-201ENST00000330479 3069 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
NCBP1Q09161 BLOC1S3-201ENST00000433642 2601 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
NCBP1Q09161 FBXL12-205ENST00000586651 1736 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
NCBP1Q09161 CXXC4-201ENST00000394767 5565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
NCBP1Q09161 KRT16P6-202ENST00000425692 1426 ntBASIC21.84■■□□□ 1.09
NCBP1Q09161 AL135905.2-201ENST00000584934 1404 ntBASIC21.84■■□□□ 1.09
NCBP1Q09161 FBXO24-201ENST00000241071 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
NCBP1Q09161 C5orf56-203ENST00000378953 942 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
NCBP1Q09161 AC069185.1-201ENST00000531395 811 ntTSL 3 BASIC21.84■■□□□ 1.09
NCBP1Q09161 AC090877.2-202ENST00000560363 574 ntTSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
NCBP1Q09161 ELAC1-203ENST00000588577 694 ntTSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
NCBP1Q09161 C19orf25-207ENST00000588871 2128 ntTSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
NCBP1Q09161 CORO1B-210ENST00000627576 960 ntTSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
NCBP1Q09161 GLT8D1-206ENST00000478968 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
NCBP1Q09161 GYG1-202ENST00000345003 2052 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
NCBP1Q09161 FBLN7-202ENST00000331203 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
NCBP1Q09161 CYGB-201ENST00000293230 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
NCBP1Q09161 GNB1-201ENST00000378609 3132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
NCBP1Q09161 OBSL1-204ENST00000404537 5841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
NCBP1Q09161 GOLGA4-208ENST00000444882 1451 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
NCBP1Q09161 UPF1-201ENST00000262803 5348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
NCBP1Q09161 GPR146-201ENST00000397095 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
NCBP1Q09161 RFC2-202ENST00000352131 1576 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
NCBP1Q09161 CXCL3-201ENST00000296026 1075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
NCBP1Q09161 AL590666.2-201ENST00000448869 758 ntTSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
NCBP1Q09161 GLYCTK-205ENST00000473032 935 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
NCBP1Q09161 EXOSC4-202ENST00000525936 606 ntTSL 3 BASIC21.83■■□□□ 1.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.3 ms