Protein–RNA interactions for Protein: Q07343

PDE4B, cAMP-specific 3',5'-cyclic phosphodiesterase 4B, humanhuman

Predictions only

Length 736 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDE4BQ07343 DGCR10-201ENST00000609839 495 ntBASIC22.89■■□□□ 1.25
PDE4BQ07343 PHOSPHO2-206ENST00000616481 1252 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.89■■□□□ 1.25
PDE4BQ07343 PHOSPHO2-208ENST00000617738 1053 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
PDE4BQ07343 AC130371.2-201ENST00000619443 611 ntBASIC22.89■■□□□ 1.25
PDE4BQ07343 GMPPA-213ENST00000622191 1473 ntTSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
PDE4BQ07343 CDCA4-201ENST00000336219 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
PDE4BQ07343 SLC35E2-201ENST00000246421 1430 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
PDE4BQ07343 PTGER3-209ENST00000460330 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
PDE4BQ07343 ACTR5-201ENST00000243903 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
PDE4BQ07343 SKP2-208ENST00000546211 1589 ntTSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
PDE4BQ07343 ZNF282-204ENST00000610704 3722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
PDE4BQ07343 AFDN-202ENST00000351017 5823 ntTSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
PDE4BQ07343 USP21-203ENST00000368002 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
PDE4BQ07343 TSNAXIP1-202ENST00000415766 2338 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
PDE4BQ07343 KCTD1-202ENST00000408011 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
PDE4BQ07343 LSR-214ENST00000621372 2274 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
PDE4BQ07343 WDR37-206ENST00000620998 1303 ntTSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
PDE4BQ07343 ATP11C-203ENST00000370557 6924 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
PDE4BQ07343 LRRC4B-201ENST00000389201 2958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
PDE4BQ07343 DNAJC11-201ENST00000294401 2210 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
PDE4BQ07343 ADM-207ENST00000530439 1839 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
PDE4BQ07343 UBB-203ENST00000395839 1012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
PDE4BQ07343 DBNL-214ENST00000456905 1241 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
PDE4BQ07343 ASPHD1-203ENST00000483405 1115 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.88■■□□□ 1.25
PDE4BQ07343 NEURL1B-202ENST00000520919 1089 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
PDE4BQ07343 RPS20-210ENST00000523936 899 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
PDE4BQ07343 GCHFR-205ENST00000559932 695 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
PDE4BQ07343 AP000525.1-201ENST00000608286 694 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
PDE4BQ07343 ANKRD54-211ENST00000609454 825 ntTSL 3 BASIC22.88■■□□□ 1.25
PDE4BQ07343 AC011298.2-201ENST00000617989 482 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
PDE4BQ07343 NARS2-201ENST00000281038 2519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
PDE4BQ07343 TRAK2-202ENST00000430254 1436 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
PDE4BQ07343 ZBTB7B-201ENST00000292176 2129 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
PDE4BQ07343 KANK4-202ENST00000354381 2103 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
PDE4BQ07343 MSANTD1-203ENST00000507492 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
PDE4BQ07343 NRXN2-201ENST00000265459 6621 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
PDE4BQ07343 MMP23A-201ENST00000234610 1017 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
PDE4BQ07343 HCRT-201ENST00000293330 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
PDE4BQ07343 RABL2A-202ENST00000393165 1118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
PDE4BQ07343 HOXD12-201ENST00000404162 841 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
PDE4BQ07343 SMIM1-201ENST00000444870 546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
PDE4BQ07343 KRT8P12-201ENST00000468527 998 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
PDE4BQ07343 GLRB-205ENST00000512619 728 ntTSL 3 BASIC22.87■■□□□ 1.25
PDE4BQ07343 FAU-207ENST00000529639 847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
PDE4BQ07343 SIVA1-207ENST00000556195 674 ntTSL 3 BASIC22.87■■□□□ 1.25
PDE4BQ07343 AC087498.1-201ENST00000572493 945 ntAPPRIS P1 BASIC22.87■■□□□ 1.25
PDE4BQ07343 GRAMD4P8-201ENST00000605465 1115 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
PDE4BQ07343 FXYD3-214ENST00000605677 633 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
PDE4BQ07343 RTN4RL2-201ENST00000335099 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
PDE4BQ07343 AC004982.2-201ENST00000609497 1578 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
PDE4BQ07343 PAIP1-203ENST00000436644 1734 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
PDE4BQ07343 DHRS3-204ENST00000616661 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
PDE4BQ07343 SYT7-206ENST00000540677 2013 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
PDE4BQ07343 HPS6-201ENST00000299238 2649 ntAPPRIS P1 BASIC22.87■■□□□ 1.25
PDE4BQ07343 WNT7B-202ENST00000409496 2285 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
PDE4BQ07343 AC148477.3-202ENST00000376617 1766 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
PDE4BQ07343 BPIFB3-201ENST00000375494 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
PDE4BQ07343 RTN4-207ENST00000402434 1456 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
PDE4BQ07343 ST3GAL5-222ENST00000638572 4431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
PDE4BQ07343 NAA60-235ENST00000576916 1567 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
PDE4BQ07343 VCY1B-201ENST00000250823 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
PDE4BQ07343 VCY-201ENST00000250825 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
PDE4BQ07343 SYNE4-202ENST00000340477 1004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
PDE4BQ07343 DUSP23-203ENST00000368109 729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
PDE4BQ07343 AL445645.1-201ENST00000451318 1019 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
PDE4BQ07343 CHCHD10-202ENST00000484558 1171 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
PDE4BQ07343 ZNF561-AS1-202ENST00000586614 568 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
PDE4BQ07343 CIRBP-217ENST00000588230 1013 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
PDE4BQ07343 ATG4B-226ENST00000625810 370 ntTSL 4 BASIC22.86■■□□□ 1.25
PDE4BQ07343 ACTR3B-203ENST00000397282 1692 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
PDE4BQ07343 CHTOP-204ENST00000368694 2096 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
PDE4BQ07343 ENGASE-205ENST00000579016 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
PDE4BQ07343 GALNT8-202ENST00000433855 5977 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
PDE4BQ07343 CXXC4-201ENST00000394767 5565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
PDE4BQ07343 PRELID3A-201ENST00000336990 1715 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
PDE4BQ07343 PRELID3A-202ENST00000440960 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
PDE4BQ07343 WEE1-202ENST00000450114 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
PDE4BQ07343 ILF3-217ENST00000589998 2622 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
PDE4BQ07343 FGF2-202ENST00000608478 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
PDE4BQ07343 TMC6-201ENST00000306591 1681 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
PDE4BQ07343 KRT18-207ENST00000550600 1696 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
PDE4BQ07343 SYTL1-201ENST00000318074 1900 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
PDE4BQ07343 GTF3C5-201ENST00000342018 1905 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
PDE4BQ07343 KCNC2-204ENST00000540018 2168 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
PDE4BQ07343 AC073343.2-203ENST00000366167 564 ntTSL 4 BASIC22.85■■□□□ 1.25
PDE4BQ07343 ID1-202ENST00000376112 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
PDE4BQ07343 ACP1-205ENST00000407983 703 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
PDE4BQ07343 MIR1238-201ENST00000408483 83 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
PDE4BQ07343 AC087499.1-201ENST00000418141 1075 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
PDE4BQ07343 TARBP2-220ENST00000552857 916 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
PDE4BQ07343 CDKN2A-213ENST00000579122 666 ntTSL 3 BASIC22.85■■□□□ 1.25
PDE4BQ07343 AC103746.1-201ENST00000617440 1133 ntTSL 3 BASIC22.85■■□□□ 1.25
PDE4BQ07343 IMMP2L-202ENST00000405709 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
PDE4BQ07343 MAP4K4-210ENST00000425019 4403 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
PDE4BQ07343 NEU4-201ENST00000325935 2288 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
PDE4BQ07343 PEX16-210ENST00000532681 1639 ntTSL 3 BASIC22.85■■□□□ 1.25
PDE4BQ07343 ZNF815P-204ENST00000434898 1737 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
PDE4BQ07343 TMEM25-203ENST00000354284 1456 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
PDE4BQ07343 NUDT15-201ENST00000258662 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
PDE4BQ07343 FBXO27-207ENST00000600828 1557 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24 ms