Protein–RNA interactions for Protein: P98173

FAM3A, Protein FAM3A, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FAM3AP98173 VAV1-210ENST00000602142 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
FAM3AP98173 FARSA-207ENST00000588025 2057 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
FAM3AP98173 CNOT6-201ENST00000261951 6176 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
FAM3AP98173 KAT5-203ENST00000377046 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
FAM3AP98173 AP000974.1-201ENST00000623909 2387 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
FAM3AP98173 PRPF39-201ENST00000355765 2868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
FAM3AP98173 PYCR1-204ENST00000403172 1811 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
FAM3AP98173 MAP3K11-210ENST00000532507 1812 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
FAM3AP98173 BCAT2-208ENST00000598162 1329 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
FAM3AP98173 BRAF-201ENST00000288602 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
FAM3AP98173 PRKAR1B-212ENST00000544935 2494 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
FAM3AP98173 FOLH1-203ENST00000343844 2258 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
FAM3AP98173 LGALS9C-212ENST00000583322 1602 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
FAM3AP98173 RRAS-201ENST00000246792 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
FAM3AP98173 LMCD1-AS1-204ENST00000446281 932 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
FAM3AP98173 NREP-209ENST00000455559 698 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.75■□□□□ 0.27
FAM3AP98173 LINC01881-205ENST00000456398 1235 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
FAM3AP98173 SCARA5-203ENST00000518030 1074 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
FAM3AP98173 ZNF580-203ENST00000545125 1025 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.75■□□□□ 0.27
FAM3AP98173 FXYD1-204ENST00000588081 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
FAM3AP98173 DEDD2-205ENST00000596251 1183 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
FAM3AP98173 C17orf50-201ENST00000603305 569 ntTSL 3 BASIC16.75■□□□□ 0.27
FAM3AP98173 C17orf50-203ENST00000605587 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
FAM3AP98173 MMP25-204ENST00000612971 1017 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
FAM3AP98173 DTWD1-202ENST00000403028 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
FAM3AP98173 CXorf49-202ENST00000535490 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
FAM3AP98173 CXorf49B-202ENST00000542739 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
FAM3AP98173 P3H4-201ENST00000355468 2791 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
FAM3AP98173 TMTC1-203ENST00000539277 2758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
FAM3AP98173 ZSWIM5-201ENST00000359600 5819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
FAM3AP98173 EPHX1-201ENST00000272167 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
FAM3AP98173 RND1-201ENST00000309739 1681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
FAM3AP98173 MLF2-201ENST00000203630 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
FAM3AP98173 FBXO24-201ENST00000241071 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
FAM3AP98173 MEN1-209ENST00000394376 3034 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
FAM3AP98173 FOXP4-205ENST00000409208 3341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
FAM3AP98173 CACNA1B-204ENST00000371357 9642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
FAM3AP98173 REPS1-203ENST00000409812 2511 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
FAM3AP98173 CASTOR1-202ENST00000407689 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
FAM3AP98173 KXD1-202ENST00000539106 1496 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.74■□□□□ 0.27
FAM3AP98173 PAOX-201ENST00000278060 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
FAM3AP98173 ARHGAP11A-208ENST00000567348 2422 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
FAM3AP98173 MXD3-202ENST00000427908 2269 ntTSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
FAM3AP98173 POMC-201ENST00000264708 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
FAM3AP98173 PARL-201ENST00000311101 1240 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
FAM3AP98173 CD99-203ENST00000381184 918 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
FAM3AP98173 TUBB8P6-201ENST00000436895 1288 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
FAM3AP98173 ZNF529-AS1-202ENST00000475219 1033 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
FAM3AP98173 AC026366.1-201ENST00000488803 879 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
FAM3AP98173 PDXDC2P-202ENST00000527016 543 ntTSL 3 BASIC16.74■□□□□ 0.27
FAM3AP98173 PRKY-204ENST00000533551 1019 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
FAM3AP98173 AC073912.1-201ENST00000546264 587 ntTSL 3 BASIC16.74■□□□□ 0.27
FAM3AP98173 LINC00654-202ENST00000589201 579 ntTSL 3 BASIC16.74■□□□□ 0.27
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FAM3AP98173 GPR146-201ENST00000397095 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
FAM3AP98173 AC129492.1-201ENST00000399413 1804 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
FAM3AP98173 CAPN1-226ENST00000533820 3083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
FAM3AP98173 AUP1-201ENST00000377526 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
FAM3AP98173 LAPTM4B-204ENST00000619747 2758 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
FAM3AP98173 RNF146-213ENST00000610153 2070 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
FAM3AP98173 SMPD1-201ENST00000342245 2452 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
FAM3AP98173 NDOR1-203ENST00000427047 2315 ntTSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
FAM3AP98173 NFATC1-201ENST00000253506 4642 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
FAM3AP98173 TULP1-201ENST00000229771 2162 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
FAM3AP98173 EWSR1-208ENST00000414183 2189 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
FAM3AP98173 FOXN3-214ENST00000557258 2692 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
FAM3AP98173 ARHGAP9-202ENST00000393797 2912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
FAM3AP98173 MON1A-202ENST00000417270 2527 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
FAM3AP98173 SDCBP-204ENST00000447182 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
FAM3AP98173 MCIDAS-201ENST00000513312 1736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
FAM3AP98173 ANKRD18DP-204ENST00000455355 1975 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
FAM3AP98173 ADAM33-202ENST00000356518 3677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
FAM3AP98173 DNAJC11-201ENST00000294401 2210 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
FAM3AP98173 TLE3-201ENST00000317509 5207 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
FAM3AP98173 SMC5-AS1-201ENST00000594708 1818 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
FAM3AP98173 CACNA2D1-203ENST00000423588 1429 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
FAM3AP98173 GATM-201ENST00000396659 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
FAM3AP98173 CYP2E1-205ENST00000463117 1912 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
FAM3AP98173 WDR74-202ENST00000311713 1153 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
FAM3AP98173 IFI6-203ENST00000362020 828 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
FAM3AP98173 KRT17P3-201ENST00000420566 1262 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
FAM3AP98173 LCN6-203ENST00000476567 1015 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
FAM3AP98173 EXOSC4-202ENST00000525936 606 ntTSL 3 BASIC16.73■□□□□ 0.27
FAM3AP98173 SYNGR4-202ENST00000595322 533 ntTSL 3 BASIC16.73■□□□□ 0.27
FAM3AP98173 SMAGP-206ENST00000604188 433 ntTSL 3 BASIC16.73■□□□□ 0.27
FAM3AP98173 PHLDA1-202ENST00000602540 5741 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
FAM3AP98173 KCTD18-201ENST00000359878 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
FAM3AP98173 SAAL1-204ENST00000529318 1503 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
FAM3AP98173 CXXC4-201ENST00000394767 5565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
FAM3AP98173 P2RX5-202ENST00000345901 2031 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
FAM3AP98173 RBPJL-203ENST00000372743 1623 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
FAM3AP98173 FAM83A-205ENST00000522648 1604 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
FAM3AP98173 ETV4-204ENST00000545089 1628 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
FAM3AP98173 C16orf58-202ENST00000430477 2471 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
FAM3AP98173 LAG3-201ENST00000203629 1974 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
FAM3AP98173 L2HGDH-203ENST00000421284 1958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
FAM3AP98173 AC010173.1-201ENST00000549023 1453 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
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FAM3AP98173 ARMC6-220ENST00000546344 1814 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
FAM3AP98173 UBE2Q2-204ENST00000561851 1582 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
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