Protein–RNA interactions for Protein: P84550

SKOR1, SKI family transcriptional corepressor 1, humanhuman

Predictions only

Length 965 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SKOR1P84550 KCNQ5-207ENST00000403813 6539 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
SKOR1P84550 EWSR1-207ENST00000406548 2207 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
SKOR1P84550 URI1-202ENST00000392271 3444 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
SKOR1P84550 CHRND-201ENST00000258385 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
SKOR1P84550 LMO4-202ENST00000370544 5405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
SKOR1P84550 AUNIP-203ENST00000538789 1392 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
SKOR1P84550 ANKRD10-202ENST00000310847 1193 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
SKOR1P84550 RNF5-203ENST00000375094 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
SKOR1P84550 AC080023.1-201ENST00000526906 803 ntTSL 2 BASIC20.26■□□□□ 0.83
SKOR1P84550 OVCH1-AS1-203ENST00000551108 963 ntTSL 2 BASIC20.26■□□□□ 0.83
SKOR1P84550 ASGR1-204ENST00000572879 797 ntTSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
SKOR1P84550 GLS-201ENST00000320717 4834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
SKOR1P84550 RELL2-202ENST00000444782 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
SKOR1P84550 AC011416.4-201ENST00000639283 2195 ntTSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
SKOR1P84550 LTB4R2-202ENST00000528054 3092 ntBASIC20.26■□□□□ 0.83
SKOR1P84550 FAM214B-203ENST00000378561 5771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
SKOR1P84550 WT1-211ENST00000639907 1545 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.26■□□□□ 0.83
SKOR1P84550 AP1AR-202ENST00000309703 2337 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
SKOR1P84550 SCAMP3-201ENST00000302631 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
SKOR1P84550 FAM170B-201ENST00000311787 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
SKOR1P84550 COQ10B-201ENST00000263960 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
SKOR1P84550 ALDOA-212ENST00000564546 2104 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
SKOR1P84550 CRB2-202ENST00000373631 5550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
SKOR1P84550 TOM1L2-210ENST00000542206 1320 ntTSL 2 BASIC20.26■□□□□ 0.83
SKOR1P84550 PALM3-201ENST00000340790 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
SKOR1P84550 RHBDL1-202ENST00000352681 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
SKOR1P84550 SOCS2-210ENST00000551556 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
SKOR1P84550 ARHGAP22-210ENST00000477708 1951 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
SKOR1P84550 AL356020.1-201ENST00000554235 1076 ntTSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
SKOR1P84550 LINC00304-202ENST00000562248 1095 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
SKOR1P84550 HAGHL-213ENST00000564545 663 ntTSL 3 BASIC20.25■□□□□ 0.83
SKOR1P84550 AC003102.1-201ENST00000588279 569 ntTSL 4 BASIC20.25■□□□□ 0.83
SKOR1P84550 AL160396.2-202ENST00000636692 566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
SKOR1P84550 WISP2-202ENST00000372865 1518 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
SKOR1P84550 EIF2B1-204ENST00000537073 1768 ntTSL 2 BASIC20.25■□□□□ 0.83
SKOR1P84550 TRIP4-201ENST00000261884 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
SKOR1P84550 MAFK-201ENST00000343242 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
SKOR1P84550 P2RX5-202ENST00000345901 2031 ntTSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
SKOR1P84550 RBM26-207ENST00000622611 5230 ntTSL 2 BASIC20.25■□□□□ 0.83
SKOR1P84550 AC009113.1-201ENST00000570267 2443 ntBASIC20.25■□□□□ 0.83
SKOR1P84550 ASPHD1-201ENST00000308748 1584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
SKOR1P84550 B4GALT4-202ENST00000393765 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
SKOR1P84550 CD55-201ENST00000314754 2220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
SKOR1P84550 AC135050.7-201ENST00000624508 2218 ntBASIC20.25■□□□□ 0.83
SKOR1P84550 KDELR3-201ENST00000216014 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
SKOR1P84550 PITX3-201ENST00000370002 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
SKOR1P84550 SERPINB6-204ENST00000380529 1370 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
SKOR1P84550 PPFIA1-202ENST00000389547 4133 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
SKOR1P84550 NADK-201ENST00000341426 3235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
SKOR1P84550 ASPRV1-201ENST00000320256 2177 ntAPPRIS P1 BASIC20.24■□□□□ 0.83
SKOR1P84550 PIP5K1C-201ENST00000335312 5080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
SKOR1P84550 AC068446.2-201ENST00000500487 2165 ntTSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
SKOR1P84550 EIF4ENIF1-202ENST00000344710 3115 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
SKOR1P84550 CD37-204ENST00000535669 1674 ntTSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
SKOR1P84550 HCFC1R1-202ENST00000354679 765 ntTSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
SKOR1P84550 HLA-G-202ENST00000376815 851 ntBASIC20.24■□□□□ 0.83
SKOR1P84550 HLA-G-203ENST00000376818 1127 ntBASIC20.24■□□□□ 0.83
SKOR1P84550 RNA5SP413-201ENST00000516373 109 ntBASIC20.24■□□□□ 0.83
SKOR1P84550 LIMD2-206ENST00000578993 602 ntTSL 3 BASIC20.24■□□□□ 0.83
SKOR1P84550 TXNL4A-203ENST00000585474 1185 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
SKOR1P84550 PCDHB18P-201ENST00000524813 2368 ntBASIC20.24■□□□□ 0.83
SKOR1P84550 CDKN1C-203ENST00000430149 1570 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
SKOR1P84550 RTEL1-204ENST00000370003 2273 ntTSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
SKOR1P84550 RAD23A-203ENST00000586534 1746 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
SKOR1P84550 AC083805.3-201ENST00000619560 1315 ntTSL 3 BASIC20.24■□□□□ 0.83
SKOR1P84550 MTDH-203ENST00000519934 2184 ntTSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
SKOR1P84550 DCLK2-207ENST00000635524 2153 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
SKOR1P84550 EPN2-212ENST00000575595 1491 ntTSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
SKOR1P84550 NAA35-201ENST00000361671 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
SKOR1P84550 NFIX-202ENST00000360105 5459 ntTSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
SKOR1P84550 KLHL23-201ENST00000272797 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
SKOR1P84550 PROB1-201ENST00000434752 5122 ntAPPRIS P1 BASIC20.23■□□□□ 0.83
SKOR1P84550 PYURF-201ENST00000273968 1361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
SKOR1P84550 HSD11B1L-204ENST00000411793 1362 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
SKOR1P84550 TSR1-201ENST00000301364 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
SKOR1P84550 FAM110A-204ENST00000381941 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
SKOR1P84550 GTF3C5-203ENST00000372099 1999 ntTSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
SKOR1P84550 TRIM7-205ENST00000422067 1954 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
SKOR1P84550 OPA3-202ENST00000323060 2250 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
SKOR1P84550 CDC42EP5-201ENST00000301200 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
SKOR1P84550 DNTTIP1-201ENST00000372622 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
SKOR1P84550 UPK3B-203ENST00000394849 1041 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
SKOR1P84550 DCST1-204ENST00000423025 2199 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
SKOR1P84550 CKLF-CMTM1-204ENST00000532838 587 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC20.23■□□□□ 0.83
SKOR1P84550 AC011611.3-201ENST00000552367 569 ntTSL 4 BASIC20.23■□□□□ 0.83
SKOR1P84550 NDRG2-215ENST00000553503 2162 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
SKOR1P84550 HLA-B-256ENST00000639848 1089 ntBASIC20.23■□□□□ 0.83
SKOR1P84550 SSH1-209ENST00000551165 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
SKOR1P84550 MAPK9-201ENST00000343111 4369 ntTSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
SKOR1P84550 DND1-201ENST00000542735 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
SKOR1P84550 DBNDD2-206ENST00000372720 1481 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
SKOR1P84550 IRF3-221ENST00000598808 1468 ntTSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
SKOR1P84550 RELB-201ENST00000221452 2294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
SKOR1P84550 SERPINF2-202ENST00000382061 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
SKOR1P84550 BCKDK-203ENST00000394950 1997 ntTSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
SKOR1P84550 AC013268.5-201ENST00000454928 1959 ntTSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
SKOR1P84550 KMT5B-201ENST00000304363 5837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
SKOR1P84550 DMAP1-202ENST00000361745 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
SKOR1P84550 UBP1-202ENST00000283629 4148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
SKOR1P84550 HSF2-201ENST00000368455 2549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.2 ms