Protein–RNA interactions for Protein: P62873

GNB1, Guanine nucleotide-binding protein G(I)/G(S)/G(T) subunit beta-1, humanhuman

Predictions only

Length 340 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GNB1P62873 LARGE2-201ENST00000325468 2522 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
GNB1P62873 COL9A3-201ENST00000343916 2485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
GNB1P62873 FAM111A-204ENST00000528737 6189 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
GNB1P62873 EPS8L1-203ENST00000540810 2360 ntTSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
GNB1P62873 SEMA7A-203ENST00000543145 2304 ntTSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
GNB1P62873 PSMG4-209ENST00000473000 4603 ntTSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
GNB1P62873 PGS1-201ENST00000262764 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
GNB1P62873 AKAP8L-201ENST00000397410 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
GNB1P62873 SAXO1-202ENST00000380534 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
GNB1P62873 CTBP2-205ENST00000411419 2036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
GNB1P62873 C5orf17-202ENST00000512559 1984 ntTSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
GNB1P62873 MALT1-202ENST00000348428 9368 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
GNB1P62873 SLC1A6-210ENST00000600144 1735 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
GNB1P62873 TMPRSS6-207ENST00000442782 1695 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
GNB1P62873 PHGDH-210ENST00000641115 1638 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
GNB1P62873 MORF4L1-201ENST00000331268 2359 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
GNB1P62873 C14orf79-202ENST00000547315 2370 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
GNB1P62873 PRKAG2-203ENST00000418337 2318 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
GNB1P62873 ITGB4-201ENST00000200181 5919 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
GNB1P62873 RHBDL1-202ENST00000352681 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
GNB1P62873 BABAM1-208ENST00000598188 1470 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
GNB1P62873 AC006001.3-204ENST00000638711 2103 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
GNB1P62873 SNTB2-201ENST00000336278 9789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
GNB1P62873 ADAD1-202ENST00000388724 1912 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
GNB1P62873 N4BP2L1-203ENST00000380133 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
GNB1P62873 GGT1-206ENST00000404223 952 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
GNB1P62873 ZNF295-AS1-201ENST00000412906 952 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
GNB1P62873 AKAIN1-201ENST00000434239 575 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
GNB1P62873 GGTLC2-204ENST00000613850 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
GNB1P62873 GGTLC2-205ENST00000618722 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
GNB1P62873 AC006557.6-201ENST00000623071 864 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
GNB1P62873 AL160396.2-202ENST00000636692 566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
GNB1P62873 PGR-201ENST00000263463 2496 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
GNB1P62873 ORAI2-204ENST00000473939 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
GNB1P62873 STX17-212ENST00000534052 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
GNB1P62873 ACADVL-203ENST00000356839 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
GNB1P62873 THAP7-AS1-203ENST00000452284 2298 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
GNB1P62873 FKRP-202ENST00000391909 2801 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
GNB1P62873 KSR1-205ENST00000509603 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
GNB1P62873 CASP16P-202ENST00000575497 2161 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
GNB1P62873 KCNE5-201ENST00000372101 1473 ntAPPRIS P1 BASIC15.78■□□□□ 0.12
GNB1P62873 ESPN-216ENST00000636330 4731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
GNB1P62873 FBXL20-202ENST00000394294 2309 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
GNB1P62873 COBL-202ENST00000395540 2332 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
GNB1P62873 LINC00315-201ENST00000441947 2323 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
GNB1P62873 LPCAT3-201ENST00000261407 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
GNB1P62873 SGO1-209ENST00000442720 2266 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
GNB1P62873 CRACR2B-207ENST00000528542 1792 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
GNB1P62873 ITGA9-201ENST00000264741 7889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
GNB1P62873 KDELR3-201ENST00000216014 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
GNB1P62873 MAN2A1-201ENST00000261483 4667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
GNB1P62873 SYDE2-202ENST00000341460 5512 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
GNB1P62873 LCE2A-201ENST00000368779 592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
GNB1P62873 RNF5-203ENST00000375094 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
GNB1P62873 AP000282.1-201ENST00000454622 682 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
GNB1P62873 RNA5SP413-201ENST00000516373 109 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
GNB1P62873 C17orf107-202ENST00000521575 1275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
GNB1P62873 NDUFB10-204ENST00000569148 628 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
GNB1P62873 HEG1-201ENST00000311127 9156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
GNB1P62873 AGTR1-201ENST00000349243 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
GNB1P62873 AC092368.3-202ENST00000574180 1591 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
GNB1P62873 WWP1-202ENST00000517970 4686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
GNB1P62873 RAB5C-202ENST00000393860 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
GNB1P62873 KAT5-203ENST00000377046 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
GNB1P62873 DBNDD2-206ENST00000372720 1481 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
GNB1P62873 OGG1-204ENST00000339511 1815 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
GNB1P62873 AC129492.1-201ENST00000399413 1804 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
GNB1P62873 LETM1P2-201ENST00000597330 2178 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
GNB1P62873 PHKA1-201ENST00000339490 6121 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
GNB1P62873 ETV4-201ENST00000319349 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
GNB1P62873 PIGQ-206ENST00000422307 2052 ntTSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.12
GNB1P62873 SLC3A2-206ENST00000535296 2084 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
GNB1P62873 EPOR-208ENST00000592375 2086 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
GNB1P62873 C2CD2L-201ENST00000336702 4771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
GNB1P62873 PGP-201ENST00000333503 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
GNB1P62873 KBTBD2-201ENST00000304056 3745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
GNB1P62873 CD247-202ENST00000392122 1678 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
GNB1P62873 EEF1D-225ENST00000529272 1311 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
GNB1P62873 NEFHP1-201ENST00000412845 2629 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
GNB1P62873 POM121C-208ENST00000615331 5835 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
GNB1P62873 CDC42EP5-201ENST00000301200 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
GNB1P62873 MZB1-201ENST00000302125 825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
GNB1P62873 GATS-209ENST00000454084 1030 ntTSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.12
GNB1P62873 C5orf38-206ENST00000505778 509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
GNB1P62873 UNC93B6-201ENST00000525262 1143 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
GNB1P62873 LIMD2-206ENST00000578993 602 ntTSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.12
GNB1P62873 PSME3-210ENST00000590720 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
GNB1P62873 AP001271.2-201ENST00000624018 1556 ntBASIC15.77■□□□□ 0.11
GNB1P62873 DEDD2-204ENST00000595337 1894 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.11
GNB1P62873 SMPD1-201ENST00000342245 2452 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
GNB1P62873 ECHDC1-214ENST00000474289 2443 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
GNB1P62873 HR-201ENST00000312841 5351 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
GNB1P62873 ZSCAN1-201ENST00000282326 2054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.11
GNB1P62873 ACTR8-202ENST00000482349 2091 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.11
GNB1P62873 NFIX-205ENST00000585575 1485 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
GNB1P62873 PCDHA5-202ENST00000529859 5218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
GNB1P62873 ZNF84-201ENST00000327668 7162 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
GNB1P62873 MED26-207ENST00000611692 1444 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
GNB1P62873 STARD3-219ENST00000580611 1989 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
GNB1P62873 XKR6-203ENST00000416569 3382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.8 ms