Protein–RNA interactions for Protein: P61574

HERVK_113, Endogenous retrovirus group K member 113 Rec protein, humanhuman

Predictions only

Length 105 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HERVK_113P61574 FAM212B-203ENST00000444059 1423 ntTSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
HERVK_113P61574 CASK-203ENST00000378163 4411 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.61□□□□□ -0.23
HERVK_113P61574 ANKRD65-201ENST00000427211 1976 ntTSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
HERVK_113P61574 PFKFB3-217ENST00000626882 1965 ntTSL 5 BASIC13.61□□□□□ -0.23
HERVK_113P61574 MCF2L2-201ENST00000328913 4980 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.61□□□□□ -0.23
HERVK_113P61574 LEFTY2-201ENST00000366820 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
HERVK_113P61574 SYT7-208ENST00000542670 1887 ntTSL 5 BASIC13.61□□□□□ -0.23
HERVK_113P61574 UBE2D2-202ENST00000398733 2702 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
HERVK_113P61574 SEC22C-207ENST00000423701 1458 ntTSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
HERVK_113P61574 GDF11-201ENST00000257868 8657 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
HERVK_113P61574 PLK3-201ENST00000372201 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
HERVK_113P61574 KDM4B-203ENST00000536461 5027 ntTSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
HERVK_113P61574 SMIM4-203ENST00000477703 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
HERVK_113P61574 SFRP1-201ENST00000220772 4492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
HERVK_113P61574 KANK3-201ENST00000330915 2787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
HERVK_113P61574 GNE-202ENST00000396594 5298 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
HERVK_113P61574 B3GALNT1-212ENST00000488170 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
HERVK_113P61574 COL17A1-202ENST00000369733 5488 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
HERVK_113P61574 CPEB2-201ENST00000259997 5612 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
HERVK_113P61574 BSG-201ENST00000333511 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
HERVK_113P61574 GPATCH3-201ENST00000361720 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
HERVK_113P61574 ZIC5-201ENST00000267294 4639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
HERVK_113P61574 NPTX2-201ENST00000265634 2700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
HERVK_113P61574 RNH1-201ENST00000354420 1894 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
HERVK_113P61574 CARD19-201ENST00000375464 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
HERVK_113P61574 TRAF3-203ENST00000392745 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
HERVK_113P61574 APTR-204ENST00000440088 2029 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
HERVK_113P61574 FAM107A-203ENST00000447756 1432 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
HERVK_113P61574 AC004540.2-202ENST00000451264 508 ntTSL 2 BASIC13.6□□□□□ -0.23
HERVK_113P61574 WDR86-AS1-204ENST00000489632 751 ntTSL 3 BASIC13.6□□□□□ -0.23
HERVK_113P61574 DNM1P51-202ENST00000558801 8752 ntTSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
HERVK_113P61574 CCDC120-204ENST00000597275 2752 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.6□□□□□ -0.23
HERVK_113P61574 TRAF3IP1-202ENST00000391993 4003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
HERVK_113P61574 RB1CC1-202ENST00000435644 6614 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
HERVK_113P61574 PJA1-202ENST00000374571 2672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
HERVK_113P61574 NFATC4-220ENST00000555393 2235 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
HERVK_113P61574 SMPD3-203ENST00000563226 2093 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
HERVK_113P61574 KRT78-201ENST00000304620 1778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
HERVK_113P61574 RAB11B-201ENST00000328024 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
HERVK_113P61574 LHX8-202ENST00000356261 1764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
HERVK_113P61574 ZNRF2-201ENST00000323037 3460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
HERVK_113P61574 NOC4L-201ENST00000330579 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
HERVK_113P61574 WTAP-201ENST00000337387 1622 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
HERVK_113P61574 FAM167A-207ENST00000534308 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
HERVK_113P61574 ATRIP-201ENST00000320211 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
HERVK_113P61574 USP49-202ENST00000373010 2446 ntTSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
HERVK_113P61574 LTBP4-205ENST00000396819 4764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
HERVK_113P61574 CALM3-201ENST00000291295 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
HERVK_113P61574 WIZP1-201ENST00000531444 2299 ntBASIC13.6□□□□□ -0.23
HERVK_113P61574 SLC5A10-204ENST00000395647 2140 ntTSL 2 BASIC13.6□□□□□ -0.23
HERVK_113P61574 AC126755.1-201ENST00000525846 6405 ntBASIC13.6□□□□□ -0.23
HERVK_113P61574 KCNH1-210ENST00000640044 1818 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
HERVK_113P61574 TEX45-201ENST00000361664 1679 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
HERVK_113P61574 SLIT1-204ENST00000371070 4564 ntTSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
HERVK_113P61574 CPEB2-202ENST00000345451 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
HERVK_113P61574 ST6GALNAC6-215ENST00000542456 2018 ntTSL 2 BASIC13.59□□□□□ -0.23
HERVK_113P61574 GCDH-216ENST00000591470 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
HERVK_113P61574 USP42-201ENST00000306177 5155 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
HERVK_113P61574 PML-204ENST00000359928 1726 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
HERVK_113P61574 DUX4-204ENST00000569241 1574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
HERVK_113P61574 DOK7-201ENST00000340083 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
HERVK_113P61574 DOK7-203ENST00000507039 2551 ntTSL 2 BASIC13.59□□□□□ -0.23
HERVK_113P61574 BAG4-202ENST00000432471 1943 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
HERVK_113P61574 TSGA10IP-203ENST00000532620 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
HERVK_113P61574 EIF4EBP1-201ENST00000338825 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
HERVK_113P61574 CARD9-201ENST00000371732 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
HERVK_113P61574 ACYP2-202ENST00000394666 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
HERVK_113P61574 HES6-206ENST00000409574 738 ntTSL 2 BASIC13.59□□□□□ -0.23
HERVK_113P61574 SRD5A1P1-201ENST00000442297 786 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
HERVK_113P61574 LINC02136-201ENST00000567469 530 ntTSL 4 BASIC13.59□□□□□ -0.23
HERVK_113P61574 AC012313.1-203ENST00000597980 570 ntTSL 4 BASIC13.59□□□□□ -0.23
HERVK_113P61574 CBSL-210ENST00000624934 1992 ntTSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
HERVK_113P61574 XKR8-201ENST00000373884 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
HERVK_113P61574 ATP6V1D-201ENST00000216442 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
HERVK_113P61574 NKD2-202ENST00000296849 2155 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
HERVK_113P61574 NR4A2-204ENST00000409572 2878 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
HERVK_113P61574 BNC1-201ENST00000345382 4610 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
HERVK_113P61574 FAM219B-204ENST00000563119 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
HERVK_113P61574 TMEM70-201ENST00000312184 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
HERVK_113P61574 UBE3A-207ENST00000614096 8741 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
HERVK_113P61574 RBM42-201ENST00000262633 1680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
HERVK_113P61574 P2RY6-210ENST00000542092 1674 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.59□□□□□ -0.23
HERVK_113P61574 AC005224.4-201ENST00000583262 1652 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
HERVK_113P61574 RAB1A-202ENST00000409751 1333 ntTSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
HERVK_113P61574 NOS1AP-205ENST00000493151 5559 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
HERVK_113P61574 MAPKAPK3-208ENST00000621469 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
HERVK_113P61574 SLC25A20-201ENST00000319017 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
HERVK_113P61574 AL354751.1-201ENST00000412768 1863 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
HERVK_113P61574 RGMA-208ENST00000556658 1889 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
HERVK_113P61574 VIPR1-201ENST00000325123 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
HERVK_113P61574 PTTG1IP-201ENST00000330938 2760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
HERVK_113P61574 ACP1-201ENST00000272065 1549 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
HERVK_113P61574 THAP12-201ENST00000260045 3300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
HERVK_113P61574 TEPSIN-201ENST00000300714 2287 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
HERVK_113P61574 INTS10-201ENST00000397977 2804 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.59□□□□□ -0.23
HERVK_113P61574 NFKB2-201ENST00000189444 3011 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
HERVK_113P61574 HNRNPD-201ENST00000313899 3033 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
HERVK_113P61574 EEF1A1-203ENST00000331523 1923 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.23
HERVK_113P61574 ODC1-202ENST00000405333 1943 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.58□□□□□ -0.23
HERVK_113P61574 ZBTB7B-201ENST00000292176 2129 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 47.1 ms