Protein–RNA interactions for Protein: P55157

MTTP, Microsomal triglyceride transfer protein large subunit, humanhuman

Predictions only

Length 894 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MTTPP55157 KCNQ5-207ENST00000403813 6539 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
MTTPP55157 SORCS2-203ENST00000507866 6152 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
MTTPP55157 RENBP-201ENST00000369997 1322 ntTSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
MTTPP55157 STMN3-202ENST00000540534 2351 ntTSL 2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
MTTPP55157 ADAMTS9-202ENST00000459780 2871 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
MTTPP55157 DMAP1-202ENST00000361745 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
MTTPP55157 ANKRD2-201ENST00000298808 1350 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
MTTPP55157 ADORA1-202ENST00000337894 2919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
MTTPP55157 EIF2B1-201ENST00000424014 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
MTTPP55157 TAF6-211ENST00000453269 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
MTTPP55157 FIP1L1-202ENST00000337488 2198 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
MTTPP55157 FIP1L1-203ENST00000358575 2180 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
MTTPP55157 LRCH3-207ENST00000441090 2034 ntTSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
MTTPP55157 PKP3-201ENST00000331563 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
MTTPP55157 RAPGEF5-203ENST00000405243 2800 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
MTTPP55157 DBNDD2-203ENST00000372710 1417 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
MTTPP55157 KRT86-202ENST00000423955 2217 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
MTTPP55157 ARL2-201ENST00000246747 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
MTTPP55157 REXO2-201ENST00000265881 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
MTTPP55157 SDHC-201ENST00000342751 1127 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
MTTPP55157 PPP1R14A-202ENST00000347262 637 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
MTTPP55157 LCE2A-201ENST00000368779 592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
MTTPP55157 METTL21A-207ENST00000442521 1003 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
MTTPP55157 TPD52L1-207ENST00000527711 999 ntTSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
MTTPP55157 PNMA6B-201ENST00000538162 1200 ntBASIC18.95■□□□□ 0.62
MTTPP55157 REXO2-208ENST00000539754 791 ntTSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
MTTPP55157 LIMD2-206ENST00000578993 602 ntTSL 3 BASIC18.95■□□□□ 0.62
MTTPP55157 TXNL4A-203ENST00000585474 1185 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
MTTPP55157 PTCRA-204ENST00000616441 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
MTTPP55157 KLHL23-201ENST00000272797 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
MTTPP55157 RBM24-202ENST00000379052 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
MTTPP55157 ACYP2-203ENST00000406041 1913 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
MTTPP55157 GPR139-202ENST00000570682 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
MTTPP55157 CAMKMT-201ENST00000378494 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
MTTPP55157 BZW1-209ENST00000452790 1473 ntTSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
MTTPP55157 EPN2-212ENST00000575595 1491 ntTSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
MTTPP55157 CA11-201ENST00000084798 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
MTTPP55157 CD247-202ENST00000392122 1678 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
MTTPP55157 B3GALNT2-201ENST00000313984 1874 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
MTTPP55157 HSD11B1L-204ENST00000411793 1362 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
MTTPP55157 RAD23A-203ENST00000586534 1746 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
MTTPP55157 TM9SF1-203ENST00000524835 1938 ntTSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
MTTPP55157 FAM217A-208ENST00000639338 1929 ntTSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
MTTPP55157 AC120498.9-201ENST00000339021 3867 ntBASIC18.94■□□□□ 0.62
MTTPP55157 RHOBTB2-201ENST00000251822 5451 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
MTTPP55157 TCAP-201ENST00000309889 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
MTTPP55157 CLEC10A-201ENST00000254868 1797 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
MTTPP55157 ZNF205-206ENST00000620094 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
MTTPP55157 ARNT-212ENST00000515192 2892 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
MTTPP55157 LRPPRC-202ENST00000409659 1610 ntTSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
MTTPP55157 SLC6A9-201ENST00000357730 2168 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
MTTPP55157 CFC1-201ENST00000259216 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
MTTPP55157 CFC1B-201ENST00000281882 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
MTTPP55157 UHRF2-202ENST00000381373 802 ntTSL 3 BASIC18.94■□□□□ 0.62
MTTPP55157 AC114730.2-201ENST00000417267 668 ntTSL 3 BASIC18.94■□□□□ 0.62
MTTPP55157 CAMLG-202ENST00000514518 895 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
MTTPP55157 PDXDC2P-202ENST00000527016 543 ntTSL 3 BASIC18.94■□□□□ 0.62
MTTPP55157 ZNF688-205ENST00000563707 244 ntTSL 3 BASIC18.94■□□□□ 0.62
MTTPP55157 INO80E-214ENST00000620599 515 ntTSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
MTTPP55157 MUTYH-203ENST00000372098 1839 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
MTTPP55157 MUTYH-204ENST00000372104 1823 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
MTTPP55157 MUTYH-205ENST00000372110 1809 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
MTTPP55157 PDLIM2-204ENST00000397760 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
MTTPP55157 PRKCI-201ENST00000295797 4950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
MTTPP55157 DBNDD2-206ENST00000372720 1481 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
MTTPP55157 AC079598.2-202ENST00000546624 1451 ntBASIC18.94■□□□□ 0.62
MTTPP55157 CACTIN-201ENST00000221899 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
MTTPP55157 RAB4A-205ENST00000618010 2799 ntTSL 3 BASIC18.94■□□□□ 0.62
MTTPP55157 CLASRP-201ENST00000221455 2234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
MTTPP55157 BAIAP2-204ENST00000428708 2095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
MTTPP55157 SLC7A10-201ENST00000253188 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
MTTPP55157 ZBTB7B-201ENST00000292176 2129 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
MTTPP55157 PPM1G-201ENST00000344034 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
MTTPP55157 ACBD4-207ENST00000586346 1579 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
MTTPP55157 PFKFB3-217ENST00000626882 1965 ntTSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
MTTPP55157 TRABD-203ENST00000395827 2172 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
MTTPP55157 HBEGF-201ENST00000230990 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
MTTPP55157 SNAP47-201ENST00000315781 2367 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
MTTPP55157 DSCAM-201ENST00000400454 8552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
MTTPP55157 TAL1-202ENST00000371884 4642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
MTTPP55157 RUVBL2-211ENST00000601968 1641 ntTSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
MTTPP55157 RELB-201ENST00000221452 2294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
MTTPP55157 SLC37A2-203ENST00000403796 2910 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
MTTPP55157 SMYD2-201ENST00000366957 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
MTTPP55157 FAM160B1-201ENST00000369246 666 ntTSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
MTTPP55157 RER1-204ENST00000378518 522 ntTSL 3 BASIC18.93■□□□□ 0.62
MTTPP55157 NCBP2-207ENST00000452404 1133 ntTSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
MTTPP55157 AC068987.5-201ENST00000642069 987 ntAPPRIS P1 BASIC18.93■□□□□ 0.62
MTTPP55157 GTF2IRD2B-210ENST00000629105 1910 ntTSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
MTTPP55157 FBXL17-205ENST00000542267 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
MTTPP55157 SOCS2-210ENST00000551556 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
MTTPP55157 PRAF2-202ENST00000553851 1334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
MTTPP55157 FAM57A-201ENST00000301324 2013 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
MTTPP55157 CDKN1C-203ENST00000430149 1570 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
MTTPP55157 POLR3E-209ENST00000564209 2464 ntTSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
MTTPP55157 SLC16A3-222ENST00000619321 2015 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
MTTPP55157 SDK1-202ENST00000404826 10397 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
MTTPP55157 EPB41L3-207ENST00000545076 3190 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
MTTPP55157 AC005332.8-201ENST00000622750 2735 ntBASIC18.93■□□□□ 0.62
MTTPP55157 RAPH1-201ENST00000308091 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.2 ms