Protein–RNA interactions for Protein: P55087

AQP4, Aquaporin-4, humanhuman

Predictions only

Length 323 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AQP4P55087 RFT1-202ENST00000394738 1800 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
AQP4P55087 MRGPRG-AS1-201ENST00000420873 1818 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
AQP4P55087 NLE1-201ENST00000360831 1726 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
AQP4P55087 FGF16-201ENST00000439435 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
AQP4P55087 SYNE3-202ENST00000553340 2615 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
AQP4P55087 KLC2-203ENST00000394066 2591 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
AQP4P55087 SREBF2-201ENST00000361204 5240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
AQP4P55087 GPRC5C-204ENST00000392629 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
AQP4P55087 HGFAC-201ENST00000382774 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
AQP4P55087 DLK1-202ENST00000341267 4722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
AQP4P55087 IGFBP3-202ENST00000381083 1050 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
AQP4P55087 C4orf48-201ENST00000409248 433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
AQP4P55087 C4orf48-202ENST00000409860 477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
AQP4P55087 AC009299.2-201ENST00000482477 511 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
AQP4P55087 YJEFN3-203ENST00000514277 995 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
AQP4P55087 CHTF8-210ENST00000523421 766 ntTSL 3 BASIC18.09■□□□□ 0.49
AQP4P55087 AC011448.1-201ENST00000555938 1100 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
AQP4P55087 AC018755.3-201ENST00000598755 664 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
AQP4P55087 LINC00896-202ENST00000609602 2128 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
AQP4P55087 BCL7A-203ENST00000538010 6247 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
AQP4P55087 KANSL2-212ENST00000550347 2714 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
AQP4P55087 HOXC10-201ENST00000303460 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
AQP4P55087 INTS11-209ENST00000450926 1839 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
AQP4P55087 PRKAR2A-206ENST00000454963 1849 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
AQP4P55087 TMEM91-209ENST00000539627 1843 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
AQP4P55087 TBXA2R-204ENST00000589966 1814 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
AQP4P55087 GCSH-208ENST00000639169 2537 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
AQP4P55087 ANKRD13D-201ENST00000308440 2219 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.49
AQP4P55087 LRRC56-201ENST00000270115 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
AQP4P55087 CCDC106-201ENST00000308964 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
AQP4P55087 AL096870.2-201ENST00000565988 2108 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
AQP4P55087 MYBL2-202ENST00000396863 2704 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.49
AQP4P55087 CACNA1B-206ENST00000371372 9790 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.49
AQP4P55087 ZNF688-203ENST00000563276 1492 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.49
AQP4P55087 ALG1-202ENST00000544428 1419 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.49
AQP4P55087 ESR1-210ENST00000456483 1368 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
AQP4P55087 FARP1-242ENST00000627049 5103 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.49
AQP4P55087 CDK11A-203ENST00000357760 2446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
AQP4P55087 CDK11A-204ENST00000358779 2419 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
AQP4P55087 CDK11A-206ENST00000378638 2429 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.49
AQP4P55087 CDK11A-208ENST00000404249 2449 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
AQP4P55087 DBN1-210ENST00000512501 1878 ntTSL 3 BASIC18.08■□□□□ 0.49
AQP4P55087 TEFM-205ENST00000581216 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
AQP4P55087 CENPS-CORT-204ENST00000602296 1326 ntTSL 3 BASIC18.08■□□□□ 0.49
AQP4P55087 LGALS7B-201ENST00000314980 483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
AQP4P55087 SRM-201ENST00000376957 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
AQP4P55087 FAM219A-202ENST00000379078 770 ntTSL 3 BASIC18.08■□□□□ 0.48
AQP4P55087 UMAD1-202ENST00000463725 559 ntTSL 4 BASIC18.08■□□□□ 0.48
AQP4P55087 NRIP3-203ENST00000531090 980 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
AQP4P55087 AC138907.5-202ENST00000569484 235 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
AQP4P55087 AL356652.1-201ENST00000615962 565 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
AQP4P55087 ST6GALNAC6-201ENST00000291839 2280 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
AQP4P55087 NR2E1-202ENST00000368986 3212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
AQP4P55087 NRM-203ENST00000376421 1734 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
AQP4P55087 BFSP1-205ENST00000536626 2075 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
AQP4P55087 DPAGT1-203ENST00000409993 3274 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
AQP4P55087 NAPSA-201ENST00000253719 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
AQP4P55087 TMEM106C-202ENST00000429772 1515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
AQP4P55087 PPP1R7-201ENST00000234038 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
AQP4P55087 KCNQ2-218ENST00000629676 2399 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
AQP4P55087 GMPPA-213ENST00000622191 1473 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
AQP4P55087 PTPA-203ENST00000348141 2737 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
AQP4P55087 PTPA-207ENST00000393370 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
AQP4P55087 PPP1R16A-202ENST00000435887 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
AQP4P55087 MCUR1-201ENST00000379170 5471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
AQP4P55087 ABCB9-207ENST00000442833 2587 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
AQP4P55087 DMRT3-201ENST00000190165 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
AQP4P55087 CHTOP-203ENST00000368690 2165 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
AQP4P55087 DDX17-211ENST00000640332 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
AQP4P55087 DDX17-212ENST00000640668 2196 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
AQP4P55087 EIF2B4-201ENST00000347454 1792 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
AQP4P55087 SNAI3-201ENST00000332281 1732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
AQP4P55087 ACY1-207ENST00000476854 1319 ntTSL 3 BASIC18.07■□□□□ 0.48
AQP4P55087 ZSWIM5-201ENST00000359600 5819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
AQP4P55087 PTTG1IP-203ENST00000397887 2413 ntTSL 4 BASIC18.07■□□□□ 0.48
AQP4P55087 TNPO2-203ENST00000450764 4993 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
AQP4P55087 GSR-201ENST00000221130 3119 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
AQP4P55087 ATRN-201ENST00000262919 8633 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
AQP4P55087 CTAG1B-202ENST00000359887 998 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
AQP4P55087 VGLL4-208ENST00000424529 1025 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
AQP4P55087 ALG5-202ENST00000443765 1119 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
AQP4P55087 FAM71E1-204ENST00000600100 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
AQP4P55087 AMIGO2-202ENST00000429635 3058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
AQP4P55087 ANKS1A-201ENST00000360359 6347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
AQP4P55087 SIX5-203ENST00000560168 1975 ntTSL 4 BASIC18.07■□□□□ 0.48
AQP4P55087 RNF187-201ENST00000305943 3017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
AQP4P55087 FOXN3-209ENST00000555353 1595 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
AQP4P55087 RIC8A-208ENST00000527696 2565 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
AQP4P55087 BCAR1-201ENST00000162330 3221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
AQP4P55087 DMAP1-202ENST00000361745 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
AQP4P55087 TXNL4A-201ENST00000269601 3504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
AQP4P55087 TBL2-201ENST00000305632 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
AQP4P55087 SHANK1-202ENST00000359082 6459 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
AQP4P55087 CREB3L3-202ENST00000595923 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
AQP4P55087 RNH1-202ENST00000356187 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
AQP4P55087 AC148477.3-202ENST00000376617 1766 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
AQP4P55087 ANKRD2-202ENST00000307518 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
AQP4P55087 AC124067.4-201ENST00000519691 2379 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
AQP4P55087 ADGRA3-202ENST00000334304 4566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
AQP4P55087 ISY1-201ENST00000273541 1704 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22 ms