Protein–RNA interactions for Protein: P48201

ATP5G3, ATP synthase F(0) complex subunit C3, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 142 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATP5G3P48201 C19orf54-203ENST00000470681 2521 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
ATP5G3P48201 PGRMC2-208ENST00000613358 3783 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
ATP5G3P48201 PDLIM3-201ENST00000284767 2589 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
ATP5G3P48201 KCNH2-203ENST00000430723 2648 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
ATP5G3P48201 TRAF4-201ENST00000262395 2923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
ATP5G3P48201 SF1-203ENST00000377387 2947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
ATP5G3P48201 LRRC32-202ENST00000404995 2656 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
ATP5G3P48201 TEX21P-204ENST00000641479 1693 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
ATP5G3P48201 KRT8P17-201ENST00000453110 1448 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
ATP5G3P48201 ARNTL-201ENST00000389707 2776 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
ATP5G3P48201 PROSER2-201ENST00000277570 3333 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
ATP5G3P48201 SLC43A1-201ENST00000278426 2598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
ATP5G3P48201 SAMD11-212ENST00000617307 2314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
ATP5G3P48201 NDUFB2-207ENST00000465506 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
ATP5G3P48201 TRAK1-209ENST00000487159 5536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
ATP5G3P48201 AC110285.4-201ENST00000572590 424 ntTSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
ATP5G3P48201 AL512625.3-202ENST00000591993 1091 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
ATP5G3P48201 T-201ENST00000296946 2436 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
ATP5G3P48201 CD55-206ENST00000391921 2433 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
ATP5G3P48201 MRPL2-202ENST00000388752 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
ATP5G3P48201 BANP-202ENST00000355022 2164 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
ATP5G3P48201 PANX1-201ENST00000227638 2769 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
ATP5G3P48201 FAM53A-207ENST00000489363 2776 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
ATP5G3P48201 ARHGAP26-201ENST00000274498 6862 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
ATP5G3P48201 ANKRD65-204ENST00000520296 1632 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
ATP5G3P48201 SLC36A1-209ENST00000521925 1621 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
ATP5G3P48201 SOWAHC-201ENST00000356454 4657 ntAPPRIS P1 BASIC15.09■□□□□ 0.01
ATP5G3P48201 SIRT1-201ENST00000212015 4094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
ATP5G3P48201 C5orf17-202ENST00000512559 1984 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
ATP5G3P48201 SPATA22-214ENST00000575375 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
ATP5G3P48201 ADCY3-201ENST00000260600 5050 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
ATP5G3P48201 B4GALT2-202ENST00000356836 2629 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
ATP5G3P48201 YPEL5-205ENST00000402708 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
ATP5G3P48201 EIF2B5-201ENST00000273783 2655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
ATP5G3P48201 PRKCB-202ENST00000321728 2689 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
ATP5G3P48201 APP-202ENST00000348990 3355 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
ATP5G3P48201 EFTUD1P1-204ENST00000560401 1798 ntBASIC15.08■□□□□ 0.01
ATP5G3P48201 MMD2-202ENST00000404774 2415 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
ATP5G3P48201 SUSD2-201ENST00000358321 3404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
ATP5G3P48201 PRKRIP1-208ENST00000496391 3430 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0.01
ATP5G3P48201 WDR25-201ENST00000335290 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
ATP5G3P48201 ADAMTS7-201ENST00000388820 5490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
ATP5G3P48201 COBLL1-201ENST00000342193 4898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
ATP5G3P48201 CLN3-205ENST00000359984 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
ATP5G3P48201 SIL1-202ENST00000394817 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
ATP5G3P48201 FOXN3-209ENST00000555353 1595 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
ATP5G3P48201 GSEC-201ENST00000626810 2289 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
ATP5G3P48201 FAM213B-202ENST00000378425 2665 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
ATP5G3P48201 ZBTB33-201ENST00000326624 5211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
ATP5G3P48201 STX6-201ENST00000258301 4851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
ATP5G3P48201 SPI1-201ENST00000227163 1168 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
ATP5G3P48201 UCHL1-201ENST00000284440 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
ATP5G3P48201 COX20-201ENST00000366528 568 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
ATP5G3P48201 SLC35A2-205ENST00000376529 865 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
ATP5G3P48201 PGM5P4-201ENST00000421970 445 ntBASIC15.08■□□□□ 0
ATP5G3P48201 AP002748.1-201ENST00000504911 580 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
ATP5G3P48201 UCHL1-210ENST00000512788 785 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
ATP5G3P48201 SFTPC-205ENST00000521315 1046 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
ATP5G3P48201 RPLP2-207ENST00000530797 637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
ATP5G3P48201 DUX4L2-201ENST00000561772 1275 ntBASIC15.08■□□□□ 0
ATP5G3P48201 DUX4-206ENST00000616166 1275 ntAPPRIS P2 BASIC15.08■□□□□ 0
ATP5G3P48201 ANKRD20A6P-201ENST00000618763 204 ntBASIC15.08■□□□□ 0
ATP5G3P48201 DUX4L6-201ENST00000626483 1275 ntBASIC15.08■□□□□ 0
ATP5G3P48201 DUX4L1-201ENST00000627662 1275 ntBASIC15.08■□□□□ 0
ATP5G3P48201 DUX4L8-201ENST00000629013 1275 ntBASIC15.08■□□□□ 0
ATP5G3P48201 DUX4L3-201ENST00000630187 1275 ntBASIC15.08■□□□□ 0
ATP5G3P48201 DUX4L7-201ENST00000630678 1275 ntBASIC15.08■□□□□ 0
ATP5G3P48201 DUX4L5-201ENST00000630834 1275 ntBASIC15.08■□□□□ 0
ATP5G3P48201 RAB11FIP2-201ENST00000355624 6061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
ATP5G3P48201 STK16-201ENST00000396738 1673 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
ATP5G3P48201 ZMYND11-210ENST00000403354 1664 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
ATP5G3P48201 RAB28-208ENST00000630951 1679 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
ATP5G3P48201 NOMO3-201ENST00000263012 3911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
ATP5G3P48201 CBS-203ENST00000398158 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
ATP5G3P48201 CBSL-206ENST00000624406 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
ATP5G3P48201 NCOA6-207ENST00000616167 3271 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
ATP5G3P48201 LIN28B-AS1-203ENST00000636682 1797 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
ATP5G3P48201 PODXL2-201ENST00000342480 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
ATP5G3P48201 CASC2-205ENST00000454781 2216 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
ATP5G3P48201 GDPD1-201ENST00000284116 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
ATP5G3P48201 PPP2R2C-209ENST00000515571 1832 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
ATP5G3P48201 AC141586.3-201ENST00000562166 1838 ntBASIC15.08■□□□□ 0
ATP5G3P48201 COL18A1-202ENST00000355480 5924 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
ATP5G3P48201 KMT5B-203ENST00000401547 2666 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
ATP5G3P48201 IFRD2-204ENST00000436390 2275 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
ATP5G3P48201 SAR1B-208ENST00000507419 2287 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
ATP5G3P48201 MRPL23-AS1-201ENST00000419080 1876 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
ATP5G3P48201 ESPN-205ENST00000461727 1869 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
ATP5G3P48201 CREB3L3-202ENST00000595923 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
ATP5G3P48201 KCNQ2-205ENST00000360480 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
ATP5G3P48201 FAM234A-203ENST00000399932 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
ATP5G3P48201 MAFF-201ENST00000338483 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
ATP5G3P48201 LMNB1-202ENST00000395354 1572 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
ATP5G3P48201 ZBTB16-201ENST00000335953 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
ATP5G3P48201 HNRNPLL-206ENST00000410076 1687 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
ATP5G3P48201 FARP1-242ENST00000627049 5103 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
ATP5G3P48201 FAM187A-202ENST00000412523 1748 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
ATP5G3P48201 RBCK1-203ENST00000382181 2208 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
ATP5G3P48201 RNH1-202ENST00000356187 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
ATP5G3P48201 TRIM63-201ENST00000374272 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.4 ms