Protein–RNA interactions for Protein: P46527

CDKN1B, Cyclin-dependent kinase inhibitor 1B, humanhuman

Predictions only

Length 198 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDKN1BP46527 AC046158.3-201ENST00000624947 2558 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
CDKN1BP46527 TRMU-201ENST00000290846 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
CDKN1BP46527 CLIP2-201ENST00000223398 5563 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
CDKN1BP46527 P2RY6-208ENST00000540124 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
CDKN1BP46527 OSTM1-201ENST00000193322 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
CDKN1BP46527 TMC6-203ENST00000392467 2833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
CDKN1BP46527 FBL-201ENST00000221801 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
CDKN1BP46527 LINC00471-201ENST00000313064 1282 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
CDKN1BP46527 NAA20-202ENST00000334982 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
CDKN1BP46527 CD47-202ENST00000361309 1285 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
CDKN1BP46527 ULK4P1-204ENST00000565949 721 ntTSL 4 BASIC14.65□□□□□ -0.06
CDKN1BP46527 AC005410.1-201ENST00000579522 462 ntTSL 3 BASIC14.65□□□□□ -0.06
CDKN1BP46527 AL121832.2-201ENST00000610979 668 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
CDKN1BP46527 AL050303.2-201ENST00000619798 666 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
CDKN1BP46527 AL772284.2-201ENST00000620151 1147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
CDKN1BP46527 STK25-204ENST00000405585 1643 ntTSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
CDKN1BP46527 GRM2-204ENST00000442933 2064 ntTSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
CDKN1BP46527 RNF135-205ENST00000535306 2098 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
CDKN1BP46527 KIF16B-206ENST00000636835 5109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
CDKN1BP46527 IMPAD1-201ENST00000262644 7199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
CDKN1BP46527 TAF5L-201ENST00000258281 3112 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
CDKN1BP46527 LYNX1-204ENST00000614491 4708 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
CDKN1BP46527 CPEB1-214ENST00000617522 2220 ntTSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
CDKN1BP46527 CACNA1A-247ENST00000637769 8648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
CDKN1BP46527 FOXD4L1-201ENST00000306507 2491 ntAPPRIS P1 BASIC14.65□□□□□ -0.06
CDKN1BP46527 FLCN-203ENST00000389169 1692 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
CDKN1BP46527 GIT1-201ENST00000225394 3768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
CDKN1BP46527 GLB1-201ENST00000307363 2616 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
CDKN1BP46527 SLC35E1-208ENST00000595753 5099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
CDKN1BP46527 ZMYND11-208ENST00000397962 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
CDKN1BP46527 AC125437.2-201ENST00000625180 2167 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
CDKN1BP46527 RAB28-201ENST00000288723 1810 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
CDKN1BP46527 SAXO1-202ENST00000380534 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
CDKN1BP46527 ZDHHC16-202ENST00000352634 1718 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
CDKN1BP46527 WDTC1-201ENST00000319394 4819 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
CDKN1BP46527 CHST11-205ENST00000549260 5696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
CDKN1BP46527 CLDN5-204ENST00000618236 1374 ntAPPRIS P1 BASIC14.64□□□□□ -0.07
CDKN1BP46527 PHGDH-210ENST00000641115 1638 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
CDKN1BP46527 AC131160.1-201ENST00000639401 3058 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
CDKN1BP46527 HSPD1-202ENST00000388968 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
CDKN1BP46527 WNK2-202ENST00000395477 6834 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
CDKN1BP46527 CLN3-205ENST00000359984 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
CDKN1BP46527 SPHK1-207ENST00000590959 1851 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
CDKN1BP46527 ZNF446-207ENST00000610298 1869 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
CDKN1BP46527 AC139713.2-201ENST00000641328 2723 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
CDKN1BP46527 PPP1CA-202ENST00000358239 1054 ntTSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
CDKN1BP46527 PPA1-202ENST00000373232 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
CDKN1BP46527 ELOVL2-AS1-201ENST00000456190 737 ntTSL 3 BASIC14.64□□□□□ -0.07
CDKN1BP46527 SNAP23-210ENST00000564153 775 ntTSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
CDKN1BP46527 AC018521.5-202ENST00000577279 374 ntTSL 3 BASIC14.64□□□□□ -0.07
CDKN1BP46527 AC018521.5-201ENST00000582787 496 ntTSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
CDKN1BP46527 PLK5-204ENST00000588430 900 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
CDKN1BP46527 RAP2CP1-201ENST00000605103 478 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
CDKN1BP46527 RBL2-201ENST00000262133 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
CDKN1BP46527 NADK-201ENST00000341426 3235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
CDKN1BP46527 AL162311.3-201ENST00000555918 2867 ntTSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
CDKN1BP46527 WFIKKN1-201ENST00000319070 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
CDKN1BP46527 RAB8A-201ENST00000300935 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
CDKN1BP46527 NFIL3-201ENST00000297689 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
CDKN1BP46527 CHRNA4-207ENST00000615287 5643 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
CDKN1BP46527 NPTX2-201ENST00000265634 2700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
CDKN1BP46527 HSPA1A-201ENST00000375651 2483 ntAPPRIS P1 BASIC14.64□□□□□ -0.07
CDKN1BP46527 DGKZ-203ENST00000421244 2862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
CDKN1BP46527 FAM57B-204ENST00000564806 1710 ntTSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
CDKN1BP46527 ZNF865-201ENST00000568956 4005 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
CDKN1BP46527 CCNI2-201ENST00000378731 2355 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
CDKN1BP46527 TNPO2-203ENST00000450764 4993 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
CDKN1BP46527 DEDD2-204ENST00000595337 1894 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC14.63□□□□□ -0.07
CDKN1BP46527 ADORA1-202ENST00000337894 2919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
CDKN1BP46527 PDZD3-202ENST00000355547 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
CDKN1BP46527 DVL3-203ENST00000431765 2294 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
CDKN1BP46527 ACOT2-205ENST00000622407 1604 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
CDKN1BP46527 TSPAN14-203ENST00000372156 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
CDKN1BP46527 ANKRD17-211ENST00000639793 3486 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
CDKN1BP46527 PCDHAC2-201ENST00000289269 5963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
CDKN1BP46527 PITPNC1-201ENST00000299954 6359 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
CDKN1BP46527 CLDN14-202ENST00000399135 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
CDKN1BP46527 RGS3-232ENST00000620489 1503 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
CDKN1BP46527 LINC01505-207ENST00000637185 1540 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
CDKN1BP46527 PIGW-204ENST00000614443 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
CDKN1BP46527 CLIP3-206ENST00000593074 2080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
CDKN1BP46527 LRR1-202ENST00000318317 957 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
CDKN1BP46527 KRTAP5-8-201ENST00000398534 1183 ntAPPRIS P1 BASIC14.63□□□□□ -0.07
CDKN1BP46527 AL021707.1-201ENST00000416406 500 ntTSL 3 BASIC14.63□□□□□ -0.07
CDKN1BP46527 CROCCP5-201ENST00000436658 830 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
CDKN1BP46527 AC080013.1-202ENST00000465477 674 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
CDKN1BP46527 DIMT1-202ENST00000506390 1208 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
CDKN1BP46527 RRAS2-203ENST00000526063 970 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
CDKN1BP46527 RRAS2-208ENST00000532814 982 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
CDKN1BP46527 OGFR-204ENST00000621591 1194 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
CDKN1BP46527 PRR16-201ENST00000379551 1826 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
CDKN1BP46527 TINCR-201ENST00000448587 3733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
CDKN1BP46527 FGFBP3-201ENST00000311575 2545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
CDKN1BP46527 FAM216A-201ENST00000377673 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
CDKN1BP46527 GATA6-201ENST00000269216 3770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
CDKN1BP46527 AIRE-201ENST00000291582 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
CDKN1BP46527 MEF2A-204ENST00000557785 2854 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
CDKN1BP46527 CYTH1-209ENST00000589296 2159 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
CDKN1BP46527 RUVBL2-211ENST00000601968 1641 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
CDKN1BP46527 TRAF3-203ENST00000392745 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.1 ms