Protein–RNA interactions for Protein: P43268

ETV4, ETS translocation variant 4, humanhuman

Predictions only

Length 484 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ETV4P43268 NDUFS3-207ENST00000529276 558 ntTSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
ETV4P43268 DHRS4-207ENST00000559632 1003 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
ETV4P43268 BEAN1-AS1-201ENST00000564618 533 ntTSL 4 BASIC19.09■□□□□ 0.65
ETV4P43268 ZNF263-205ENST00000574253 1139 ntTSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
ETV4P43268 FAM222B-213ENST00000583522 556 ntTSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
ETV4P43268 AC007773.1-201ENST00000592680 972 ntTSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
ETV4P43268 ACBD4-216ENST00000619916 1276 ntTSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
ETV4P43268 DGKI-202ENST00000424189 4163 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
ETV4P43268 PRDM14-201ENST00000276594 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
ETV4P43268 MMP9-201ENST00000372330 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
ETV4P43268 AP2M1-203ENST00000411763 1577 ntTSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
ETV4P43268 EPB41L2-211ENST00000525271 2568 ntTSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
ETV4P43268 PSTPIP1-203ENST00000558012 1896 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
ETV4P43268 KRT5-201ENST00000252242 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
ETV4P43268 MTMR12-203ENST00000382142 5187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
ETV4P43268 WWOX-214ENST00000566780 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
ETV4P43268 PTGIR-201ENST00000291294 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
ETV4P43268 CCNA1-202ENST00000440264 1758 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
ETV4P43268 CCS-208ENST00000533244 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
ETV4P43268 SH3BP2-202ENST00000435136 2318 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.65
ETV4P43268 PPTC7-201ENST00000354300 4996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
ETV4P43268 PLK3-201ENST00000372201 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
ETV4P43268 RSPO4-201ENST00000217260 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
ETV4P43268 DYNLRB1-203ENST00000374846 1044 ntTSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
ETV4P43268 AL512625.2-201ENST00000417533 625 ntBASIC19.08■□□□□ 0.64
ETV4P43268 ATE1-AS1-201ENST00000437593 951 ntTSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.64
ETV4P43268 AC093787.1-201ENST00000450396 207 ntBASIC19.08■□□□□ 0.64
ETV4P43268 PYCARD-AS1-201ENST00000561916 1095 ntTSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.64
ETV4P43268 PTGIR-205ENST00000597185 775 ntTSL 3 BASIC19.08■□□□□ 0.64
ETV4P43268 NF2-203ENST00000353887 1845 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
ETV4P43268 ARSA-203ENST00000395619 1824 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
ETV4P43268 P2RY6-208ENST00000540124 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
ETV4P43268 EPB41L4B-201ENST00000374557 4006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
ETV4P43268 PRELID3A-209ENST00000592149 2001 ntTSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.64
ETV4P43268 KANK3-201ENST00000330915 2787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
ETV4P43268 RAVER1-207ENST00000615032 1952 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
ETV4P43268 HUNK-201ENST00000270112 7385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
ETV4P43268 KCNK17-201ENST00000373231 1658 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
ETV4P43268 GRTP1-203ENST00000375431 1384 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
ETV4P43268 MBIP-203ENST00000416007 1648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
ETV4P43268 CCNJL-203ENST00000393977 3320 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
ETV4P43268 HNF1A-202ENST00000400024 2337 ntTSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
ETV4P43268 AHCYL1-202ENST00000369799 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
ETV4P43268 UBQLN4P1-201ENST00000461599 1801 ntBASIC19.07■□□□□ 0.64
ETV4P43268 NOV-201ENST00000259526 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
ETV4P43268 NFATC4-228ENST00000556759 2025 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
ETV4P43268 SERPINA4-201ENST00000298841 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
ETV4P43268 THOC3-208ENST00000513482 1796 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
ETV4P43268 UTF1-201ENST00000304477 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
ETV4P43268 P2RX2-202ENST00000348800 1222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
ETV4P43268 SULT1A1-202ENST00000350842 1282 ntTSL 3 BASIC19.07■□□□□ 0.64
ETV4P43268 AC006015.1-201ENST00000429970 570 ntBASIC19.07■□□□□ 0.64
ETV4P43268 P2RX2-207ENST00000449132 1113 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
ETV4P43268 HES2-206ENST00000489730 730 ntTSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
ETV4P43268 FBXL17-205ENST00000542267 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
ETV4P43268 NAA35-201ENST00000361671 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
ETV4P43268 R3HCC1-210ENST00000625275 1489 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
ETV4P43268 PCDHB18P-201ENST00000524813 2368 ntBASIC19.07■□□□□ 0.64
ETV4P43268 GPATCH3-201ENST00000361720 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
ETV4P43268 AC013269.1-201ENST00000409259 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
ETV4P43268 TISP43-206ENST00000623376 1653 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
ETV4P43268 AC114490.1-202ENST00000311990 1887 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
ETV4P43268 SMARCC2-203ENST00000394023 4271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
ETV4P43268 CCAR2-214ENST00000613179 1421 ntTSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
ETV4P43268 CBS-203ENST00000398158 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
ETV4P43268 CBSL-206ENST00000624406 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
ETV4P43268 AKT1S1-207ENST00000391835 3075 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
ETV4P43268 NPEPL1-203ENST00000525817 1780 ntTSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
ETV4P43268 GUCY1A2-201ENST00000282249 3047 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
ETV4P43268 ANKRD40-201ENST00000285243 4184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
ETV4P43268 CHRAC1-201ENST00000220913 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
ETV4P43268 GOSR2-210ENST00000576910 1891 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
ETV4P43268 SAMD11-216ENST00000620200 1874 ntTSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
ETV4P43268 PRSS33-201ENST00000293851 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
ETV4P43268 MAF1-201ENST00000322428 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
ETV4P43268 DLGAP4-201ENST00000339266 5016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
ETV4P43268 RRAS-201ENST00000246792 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
ETV4P43268 KHDC3L-201ENST00000370367 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
ETV4P43268 IL15RA-201ENST00000379971 588 ntTSL 3 BASIC19.06■□□□□ 0.64
ETV4P43268 AC073210.2-201ENST00000430369 194 ntBASIC19.06■□□□□ 0.64
ETV4P43268 CXXC5-AS1-201ENST00000514287 577 ntTSL 4 BASIC19.06■□□□□ 0.64
ETV4P43268 PCSK5-202ENST00000376767 2845 ntTSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
ETV4P43268 TMC6-203ENST00000392467 2833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
ETV4P43268 TSG101-201ENST00000251968 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
ETV4P43268 PPP2R2C-209ENST00000515571 1832 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
ETV4P43268 PSMD6-201ENST00000295901 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
ETV4P43268 PCOLCE-AS1-201ENST00000442166 2537 ntTSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
ETV4P43268 GAS7-205ENST00000542249 1799 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
ETV4P43268 CLN8-211ENST00000636934 1790 ntTSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
ETV4P43268 SRSF2-202ENST00000359995 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
ETV4P43268 NFE2-204ENST00000553070 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
ETV4P43268 UTP18-201ENST00000225298 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
ETV4P43268 SEMA3B-209ENST00000456560 2221 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
ETV4P43268 RBM42-201ENST00000262633 1680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
ETV4P43268 PDZD7-201ENST00000370215 2032 ntTSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
ETV4P43268 MADD-208ENST00000405573 1823 ntTSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
ETV4P43268 DBNDD2-206ENST00000372720 1481 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
ETV4P43268 SUDS3-204ENST00000543473 4897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
ETV4P43268 STARD3-201ENST00000336308 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
ETV4P43268 FAIM-202ENST00000360570 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC19.05■□□□□ 0.64
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.9 ms