Protein–RNA interactions for Protein: P42766

RPL35, 60S ribosomal protein L35, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 123 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RPL35P42766 AURKAIP1-204ENST00000378853 875 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
RPL35P42766 TMEM238-201ENST00000444469 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
RPL35P42766 INPP4A-205ENST00000409851 3365 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
RPL35P42766 SCARF1-205ENST00000571272 2871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
RPL35P42766 SRGAP2B-207ENST00000641863 2367 ntAPPRIS P5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
RPL35P42766 AL160276.1-201ENST00000636672 1312 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
RPL35P42766 LLGL2-203ENST00000392550 3509 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
RPL35P42766 MGEA5-202ENST00000361464 5155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
RPL35P42766 TSKS-202ENST00000358830 1367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
RPL35P42766 ECHDC1-203ENST00000368291 1354 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
RPL35P42766 SLC4A3-204ENST00000373760 4134 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
RPL35P42766 STARD3NL-202ENST00000396013 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
RPL35P42766 CA9-204ENST00000617161 1374 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
RPL35P42766 SH2D3C-213ENST00000629203 2478 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
RPL35P42766 GALNT10-203ENST00000425427 4344 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
RPL35P42766 CDC73-201ENST00000367435 4969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
RPL35P42766 CEP85L-205ENST00000419517 2079 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
RPL35P42766 PODNL1-204ENST00000538517 2744 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
RPL35P42766 IDUA-210ENST00000514224 2130 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
RPL35P42766 ASB7-203ENST00000558747 2133 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
RPL35P42766 SNAP91-211ENST00000520213 2168 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
RPL35P42766 TYMP-202ENST00000395678 1614 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
RPL35P42766 COQ10A-201ENST00000308197 1652 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
RPL35P42766 IFNGR2-203ENST00000405436 1684 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
RPL35P42766 PTPN6-204ENST00000456013 2389 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
RPL35P42766 TK2-201ENST00000299697 5114 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
RPL35P42766 IGF2-204ENST00000381406 5179 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
RPL35P42766 KCNH6-203ENST00000580652 1703 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
RPL35P42766 INTS11-202ENST00000411962 1832 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
RPL35P42766 VDAC1-203ENST00000395047 1873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
RPL35P42766 MAPK7-201ENST00000299612 2715 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
RPL35P42766 MIB1-201ENST00000261537 9576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
RPL35P42766 AC007114.1-201ENST00000576871 713 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
RPL35P42766 GPX4-213ENST00000622390 1002 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
RPL35P42766 FIP1L1-202ENST00000337488 2198 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
RPL35P42766 ST3GAL5-202ENST00000377332 2165 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
RPL35P42766 SH3BP5-206ENST00000426925 2190 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
RPL35P42766 CTCF-201ENST00000264010 3939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
RPL35P42766 ALDH5A1-201ENST00000348925 2266 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
RPL35P42766 TMUB1-201ENST00000297533 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
RPL35P42766 GMPPB-201ENST00000308375 3217 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
RPL35P42766 DUSP8-202ENST00000397374 4480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
RPL35P42766 KLHL22-201ENST00000328879 2616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
RPL35P42766 P2RX5-TAX1BP3-201ENST00000550383 5905 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
RPL35P42766 HASPIN-201ENST00000325418 2797 ntAPPRIS P1 BASIC15.57■□□□□ 0.08
RPL35P42766 GLUD1-201ENST00000277865 3039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
RPL35P42766 TMCO6-203ENST00000394671 1887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
RPL35P42766 ADAM15-207ENST00000368413 1901 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
RPL35P42766 PPP4R3A-208ENST00000555462 3236 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
RPL35P42766 ZNF804A-201ENST00000302277 4690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
RPL35P42766 PRCC-201ENST00000271526 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
RPL35P42766 BAIAP2L2-202ENST00000381669 2146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
RPL35P42766 RBPJL-201ENST00000343694 2489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
RPL35P42766 NR2C2-206ENST00000425241 2494 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
RPL35P42766 LINC01502-201ENST00000445997 2471 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
RPL35P42766 GSDMD-206ENST00000526406 2496 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
RPL35P42766 DCAF12L2-201ENST00000360028 2599 ntAPPRIS P1 BASIC15.56■□□□□ 0.08
RPL35P42766 RNF139-201ENST00000303545 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
RPL35P42766 SCAMP4-201ENST00000316097 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
RPL35P42766 GATA3-201ENST00000346208 2654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
RPL35P42766 SUPT20H-202ENST00000356185 2681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
RPL35P42766 PAK4-202ENST00000358301 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
RPL35P42766 DIXDC1-208ENST00000615255 4825 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
RPL35P42766 MYLK2-202ENST00000375994 2956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
RPL35P42766 TEX261-201ENST00000272438 3441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
RPL35P42766 CTDP1-201ENST00000075430 3538 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
RPL35P42766 AC005540.1-201ENST00000413911 919 ntTSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
RPL35P42766 AP005435.1-201ENST00000529293 1178 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
RPL35P42766 PICSAR-201ENST00000615826 733 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
RPL35P42766 PRMT5-228ENST00000627278 129 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
RPL35P42766 SLC35A3-216ENST00000639221 1032 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
RPL35P42766 HSD11B1L-201ENST00000301382 1457 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
RPL35P42766 TRIM14-202ENST00000342043 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
RPL35P42766 TUSC3-203ENST00000503731 1498 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
RPL35P42766 MYCBPAP-202ENST00000419930 1640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
RPL35P42766 SPATA22-210ENST00000573128 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
RPL35P42766 ANAPC1P1-202ENST00000616781 1771 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
RPL35P42766 PRKRA-201ENST00000325748 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
RPL35P42766 LINC00482-201ENST00000332012 2023 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
RPL35P42766 PRR5-ARHGAP8-201ENST00000352766 2043 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
RPL35P42766 TSC2-201ENST00000219476 6156 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
RPL35P42766 TOR1A-201ENST00000351698 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
RPL35P42766 FPGS-201ENST00000373225 2278 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
RPL35P42766 GGT5-201ENST00000263112 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
RPL35P42766 TADA3-201ENST00000301964 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
RPL35P42766 PPP2R2B-206ENST00000453001 2569 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
RPL35P42766 GPAT3-202ENST00000395226 2631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
RPL35P42766 ADAMTSL5-201ENST00000330475 2857 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
RPL35P42766 COQ8A-201ENST00000366777 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
RPL35P42766 PCGF3-201ENST00000362003 5685 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
RPL35P42766 RUNX1-201ENST00000300305 6222 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
RPL35P42766 MGEA5-203ENST00000370094 3314 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
RPL35P42766 ADAM11-203ENST00000535346 2529 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
RPL35P42766 RGS14-201ENST00000408923 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
RPL35P42766 PIGW-204ENST00000614443 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
RPL35P42766 AC009133.6-201ENST00000609618 2252 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
RPL35P42766 UBE2F-205ENST00000414443 2100 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
RPL35P42766 KLHL23-201ENST00000272797 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
RPL35P42766 PCBP3-203ENST00000400308 1911 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
RPL35P42766 BAG4-202ENST00000432471 1943 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 56 ms