Protein–RNA interactions for Protein: P41238

APOBEC1, C->U-editing enzyme APOBEC-1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 236 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
APOBEC1P41238 TFEB-211ENST00000420312 1996 ntTSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
APOBEC1P41238 MELTF-202ENST00000296351 1650 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
APOBEC1P41238 GNB1-201ENST00000378609 3132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
APOBEC1P41238 NKX1-2-201ENST00000451024 3364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
APOBEC1P41238 GJB3-202ENST00000373366 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
APOBEC1P41238 GTF3C5-201ENST00000342018 1905 ntTSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
APOBEC1P41238 BCAP29-202ENST00000379117 1946 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
APOBEC1P41238 NKX2-1-202ENST00000498187 2338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
APOBEC1P41238 CLINT1-207ENST00000523908 2346 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
APOBEC1P41238 MYH14-206ENST00000596571 5988 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
APOBEC1P41238 BST1-201ENST00000265016 1480 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
APOBEC1P41238 ANXA8L1-201ENST00000584982 2174 ntTSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
APOBEC1P41238 SREBF2-209ENST00000612482 5365 ntTSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
APOBEC1P41238 C20orf27-201ENST00000217195 1302 ntTSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
APOBEC1P41238 HTR7P1-201ENST00000538670 1336 ntBASIC17.5■□□□□ 0.39
APOBEC1P41238 B3GALNT2-201ENST00000313984 1874 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
APOBEC1P41238 SERPINF2-201ENST00000324015 2284 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
APOBEC1P41238 DOK7-206ENST00000515886 2263 ntTSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
APOBEC1P41238 PHLDA3-202ENST00000367311 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
APOBEC1P41238 SIVA1-201ENST00000329967 802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
APOBEC1P41238 PHYHD1-207ENST00000421063 1182 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
APOBEC1P41238 UBE2SP1-201ENST00000450587 669 ntBASIC17.5■□□□□ 0.39
APOBEC1P41238 AP002982.1-201ENST00000492365 877 ntBASIC17.5■□□□□ 0.39
APOBEC1P41238 NDUFS3-212ENST00000534208 583 ntTSL 4 BASIC17.5■□□□□ 0.39
APOBEC1P41238 C17orf62-238ENST00000585064 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
APOBEC1P41238 SPIB-206ENST00000596074 847 ntTSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
APOBEC1P41238 AL353708.3-201ENST00000610272 989 ntBASIC17.5■□□□□ 0.39
APOBEC1P41238 FCMR-210ENST00000628511 1055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
APOBEC1P41238 TMEM191A-211ENST00000637163 1067 ntBASIC17.5■□□□□ 0.39
APOBEC1P41238 CHMP6-201ENST00000325167 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
APOBEC1P41238 AC126773.2-201ENST00000562172 1682 ntTSL 3 BASIC17.5■□□□□ 0.39
APOBEC1P41238 SORCS3-201ENST00000369699 5530 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
APOBEC1P41238 CYP21A2-222ENST00000435122 1914 ntTSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
APOBEC1P41238 MTSS1L-201ENST00000338779 4992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
APOBEC1P41238 TMEM175-220ENST00000515740 1514 ntTSL 3 BASIC17.5■□□□□ 0.39
APOBEC1P41238 EPOR-201ENST00000222139 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
APOBEC1P41238 UBE2N-201ENST00000318066 5186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
APOBEC1P41238 ROPN1-209ENST00000495093 1376 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
APOBEC1P41238 ZNF12-201ENST00000342651 2921 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
APOBEC1P41238 SNX11-203ENST00000452859 1601 ntTSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
APOBEC1P41238 ZIM2-208ENST00000629319 2253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
APOBEC1P41238 RORA-204ENST00000449337 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
APOBEC1P41238 MCIDAS-201ENST00000513312 1736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
APOBEC1P41238 RPL7-202ENST00000396465 1308 ntTSL 3 BASIC17.49■□□□□ 0.39
APOBEC1P41238 P2RX3-204ENST00000616487 1346 ntTSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
APOBEC1P41238 UBTD2-201ENST00000393792 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
APOBEC1P41238 AC087482.1-204ENST00000636067 2431 ntTSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
APOBEC1P41238 CDC42EP1-201ENST00000249014 2181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
APOBEC1P41238 BIRC2-206ENST00000530675 1927 ntTSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
APOBEC1P41238 SMPD3-201ENST00000219334 5453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
APOBEC1P41238 ATP5D-201ENST00000215375 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
APOBEC1P41238 MRPL15-201ENST00000260102 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
APOBEC1P41238 PDCD2-202ENST00000392090 936 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
APOBEC1P41238 GCSHP5-201ENST00000443090 522 ntBASIC17.49■□□□□ 0.39
APOBEC1P41238 AC098590.1-201ENST00000468126 897 ntBASIC17.49■□□□□ 0.39
APOBEC1P41238 GRAMD1B-209ENST00000533341 707 ntTSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
APOBEC1P41238 TESC-AS1-201ENST00000547006 1053 ntTSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
APOBEC1P41238 AC100835.1-201ENST00000565737 498 ntTSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
APOBEC1P41238 AL160286.2-201ENST00000567150 934 ntBASIC17.49■□□□□ 0.39
APOBEC1P41238 AC004771.5-201ENST00000575985 542 ntTSL 4 BASIC17.49■□□□□ 0.39
APOBEC1P41238 ZFP92-201ENST00000338647 6105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
APOBEC1P41238 LTBP4-201ENST00000204005 5032 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
APOBEC1P41238 PEX16-210ENST00000532681 1639 ntTSL 3 BASIC17.49■□□□□ 0.39
APOBEC1P41238 AC007952.6-201ENST00000573168 2673 ntBASIC17.49■□□□□ 0.39
APOBEC1P41238 AC003957.1-201ENST00000625108 2673 ntBASIC17.49■□□□□ 0.39
APOBEC1P41238 KLRG2-201ENST00000340940 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
APOBEC1P41238 AL032819.2-201ENST00000624543 2162 ntBASIC17.49■□□□□ 0.39
APOBEC1P41238 CRLF3-201ENST00000324238 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
APOBEC1P41238 BTD-202ENST00000383778 2261 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
APOBEC1P41238 AKT1-211ENST00000554848 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
APOBEC1P41238 MACROD2-201ENST00000217246 4994 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
APOBEC1P41238 C6orf89-203ENST00000373685 1400 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
APOBEC1P41238 AL135905.2-201ENST00000584934 1404 ntBASIC17.48■□□□□ 0.39
APOBEC1P41238 SLC22A18-202ENST00000347936 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
APOBEC1P41238 STXBP6-203ENST00000419632 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
APOBEC1P41238 ETV4-204ENST00000545089 1628 ntTSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
APOBEC1P41238 AC009133.6-201ENST00000609618 2252 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
APOBEC1P41238 CMTM8-201ENST00000307526 1174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
APOBEC1P41238 HP1BP3-202ENST00000375000 928 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
APOBEC1P41238 SEC61A2-206ENST00000379051 707 ntTSL 3 BASIC17.48■□□□□ 0.39
APOBEC1P41238 TSPAN4-209ENST00000409543 1031 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
APOBEC1P41238 NIFKP9-201ENST00000419265 221 ntBASIC17.48■□□□□ 0.39
APOBEC1P41238 AL158047.1-201ENST00000445918 881 ntBASIC17.48■□□□□ 0.39
APOBEC1P41238 RBCK1-213ENST00000475269 1200 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
APOBEC1P41238 CDH18-AS1-201ENST00000513573 424 ntTSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
APOBEC1P41238 TK2-204ENST00000525974 1178 ntTSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
APOBEC1P41238 MRPL4-204ENST00000588502 827 ntTSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
APOBEC1P41238 TM9SF1-203ENST00000524835 1938 ntTSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
APOBEC1P41238 ASMTL-202ENST00000381333 2035 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
APOBEC1P41238 PLD4-204ENST00000540372 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
APOBEC1P41238 ISOC2-203ENST00000438389 1566 ntTSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
APOBEC1P41238 FBXO27-207ENST00000600828 1557 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
APOBEC1P41238 FXR2-201ENST00000250113 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
APOBEC1P41238 TMEM230-206ENST00000379283 1660 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.48■□□□□ 0.39
APOBEC1P41238 POU3F2-201ENST00000328345 4879 ntAPPRIS P1 BASIC17.48■□□□□ 0.39
APOBEC1P41238 TDRP-203ENST00000523656 2622 ntTSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
APOBEC1P41238 PCSK6-214ENST00000611716 4409 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
APOBEC1P41238 LDHD-201ENST00000300051 2067 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
APOBEC1P41238 C14orf79-202ENST00000547315 2370 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
APOBEC1P41238 TUBA8-201ENST00000316027 1518 ntTSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44.8 ms