Protein–RNA interactions for Protein: P40818

USP8, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 8, humanhuman

Predictions only

Length 1,118 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP8P40818 SLC38A8-201ENST00000299709 1308 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
USP8P40818 KATNAL2-208ENST00000592005 1348 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
USP8P40818 MTA1-201ENST00000331320 2876 ntTSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
USP8P40818 MLX-201ENST00000246912 2586 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
USP8P40818 AC009133.6-201ENST00000609618 2252 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.03■□□□□ 0.96
USP8P40818 TMEM131-201ENST00000186436 6640 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.03■□□□□ 0.96
USP8P40818 ACD-201ENST00000219251 2052 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.03■□□□□ 0.96
USP8P40818 CD8A-202ENST00000352580 1977 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.03■□□□□ 0.96
USP8P40818 RNF144A-201ENST00000320892 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
USP8P40818 CKLF-201ENST00000264001 669 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
USP8P40818 BACE2-202ENST00000330333 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
USP8P40818 SYNE2-201ENST00000341472 1132 ntTSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
USP8P40818 FAM160B1-201ENST00000369246 666 ntTSL 2 BASIC21.03■□□□□ 0.96
USP8P40818 PNN-205ENST00000556530 601 ntTSL 2 BASIC21.03■□□□□ 0.96
USP8P40818 EMC9-206ENST00000560403 872 ntTSL 2 BASIC21.03■□□□□ 0.96
USP8P40818 ENTPD6-202ENST00000360031 2766 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
USP8P40818 SAMD14-203ENST00000503131 1938 ntTSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
USP8P40818 PHF2-202ENST00000375376 3045 ntTSL 5 BASIC21.03■□□□□ 0.96
USP8P40818 DDX59-201ENST00000331314 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
USP8P40818 HTRA4-201ENST00000302495 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
USP8P40818 DCHS2-201ENST00000339452 5064 ntTSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
USP8P40818 CENPH-206ENST00000515001 1305 ntTSL 2 BASIC21.03■□□□□ 0.96
USP8P40818 PRKAG2-203ENST00000418337 2318 ntTSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
USP8P40818 MLXIP-201ENST00000319080 8427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
USP8P40818 TLK2-202ENST00000343388 3227 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
USP8P40818 UNKL-204ENST00000389221 5116 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.96
USP8P40818 KLHL2-201ENST00000226725 3134 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
USP8P40818 AKNA-205ENST00000374079 2138 ntTSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
USP8P40818 COL5A3-201ENST00000264828 6174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
USP8P40818 DNLZ-202ENST00000371739 2934 ntTSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.96
USP8P40818 SLC16A5-206ENST00000580123 2019 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.02■□□□□ 0.96
USP8P40818 PIGQ-204ENST00000409527 1915 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.02■□□□□ 0.96
USP8P40818 OSR2-202ENST00000435298 1736 ntTSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
USP8P40818 HTR1E-201ENST00000305344 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
USP8P40818 DBNL-217ENST00000468694 2068 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.02■□□□□ 0.96
USP8P40818 DYNLRB1-203ENST00000374846 1044 ntTSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.96
USP8P40818 DDR1-228ENST00000376575 732 ntTSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
USP8P40818 AC114730.1-201ENST00000400768 472 ntTSL 4 BASIC21.02■□□□□ 0.96
USP8P40818 PDXDC2P-202ENST00000527016 543 ntTSL 3 BASIC21.02■□□□□ 0.96
USP8P40818 AL121906.2-201ENST00000621597 723 ntBASIC21.02■□□□□ 0.96
USP8P40818 SLC35A3-218ENST00000639994 1114 ntTSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.96
USP8P40818 GPR139-202ENST00000570682 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
USP8P40818 TFEB-211ENST00000420312 1996 ntTSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.96
USP8P40818 LTBP4-203ENST00000308370 4948 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
USP8P40818 KCNC3-203ENST00000477616 3176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
USP8P40818 ARHGEF28-204ENST00000437974 5792 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
USP8P40818 CHST11-201ENST00000303694 5709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
USP8P40818 TP53BP2-201ENST00000343537 4651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.95
USP8P40818 DCAF4-201ENST00000353777 1940 ntTSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.95
USP8P40818 CDK13-201ENST00000181839 7298 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.95
USP8P40818 RHOU-201ENST00000366691 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
USP8P40818 TMEM151A-201ENST00000327259 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
USP8P40818 ANKRD6-202ENST00000369408 5258 ntTSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
USP8P40818 TOM1L1-202ENST00000445275 2228 ntTSL 2 BASIC21.01■□□□□ 0.95
USP8P40818 STARD3-201ENST00000336308 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
USP8P40818 INTS11-250ENST00000620829 1862 ntTSL 2 BASIC21.01■□□□□ 0.95
USP8P40818 EGFL7-202ENST00000371698 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
USP8P40818 STPG4-207ENST00000445927 891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.01■□□□□ 0.95
USP8P40818 AC007161.3-201ENST00000469183 637 ntTSL 5 BASIC21.01■□□□□ 0.95
USP8P40818 AC008443.1-203ENST00000505151 886 ntTSL 2 BASIC21.01■□□□□ 0.95
USP8P40818 UNC93B4-201ENST00000505679 747 ntBASIC21.01■□□□□ 0.95
USP8P40818 GNB5-211ENST00000560116 918 ntTSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
USP8P40818 PSME3-210ENST00000590720 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
USP8P40818 ANHX-202ENST00000545940 3452 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.01■□□□□ 0.95
USP8P40818 TIMP4-201ENST00000287814 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
USP8P40818 STARD10-213ENST00000538536 1678 ntTSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
USP8P40818 MAGED2-203ENST00000375053 2066 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
USP8P40818 HERPUD2-201ENST00000311350 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
USP8P40818 TRAPPC12-202ENST00000382110 2483 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.01■□□□□ 0.95
USP8P40818 ADCY6-206ENST00000550422 5877 ntTSL 2 BASIC21.01■□□□□ 0.95
USP8P40818 GSEC-202ENST00000629441 1572 ntTSL 2 BASIC21.01■□□□□ 0.95
USP8P40818 ZNF302-215ENST00000627982 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.01■□□□□ 0.95
USP8P40818 KBTBD2-201ENST00000304056 3745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
USP8P40818 DBN1-210ENST00000512501 1878 ntTSL 3 BASIC21.01■□□□□ 0.95
USP8P40818 PTGER3-203ENST00000354608 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.01■□□□□ 0.95
USP8P40818 TNPO2-203ENST00000450764 4993 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
USP8P40818 EEF1A2-201ENST00000217182 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
USP8P40818 MFSD10-201ENST00000329687 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
USP8P40818 FBXO41-204ENST00000520530 3293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21■□□□□ 0.95
USP8P40818 TRMU-202ENST00000381019 1381 ntTSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
USP8P40818 PRKAR2A-201ENST00000265563 6471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
USP8P40818 LRP8-204ENST00000371454 3322 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
USP8P40818 KRT18-207ENST00000550600 1696 ntTSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
USP8P40818 PUF60-202ENST00000349157 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
USP8P40818 THAP7-201ENST00000215742 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
USP8P40818 MEA1-201ENST00000244711 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
USP8P40818 TP73-202ENST00000354437 2140 ntTSL 5 BASIC21■□□□□ 0.95
USP8P40818 ZDHHC20-204ENST00000415724 1296 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21■□□□□ 0.95
USP8P40818 AC226101.2-201ENST00000458252 747 ntTSL 2 BASIC21■□□□□ 0.95
USP8P40818 NCBP2-AS2-201ENST00000602845 918 ntAPPRIS P1 BASIC21■□□□□ 0.95
USP8P40818 BTD-202ENST00000383778 2261 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21■□□□□ 0.95
USP8P40818 MTX1-201ENST00000316721 1441 ntTSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
USP8P40818 RAX2-201ENST00000555633 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
USP8P40818 SLC25A15-201ENST00000338625 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
USP8P40818 TSPAN3-210ENST00000561277 1592 ntTSL 5 BASIC21■□□□□ 0.95
USP8P40818 BLACE-201ENST00000378120 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
USP8P40818 SARDH-201ENST00000298628 1484 ntTSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
USP8P40818 SLC52A2-209ENST00000530047 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21■□□□□ 0.95
USP8P40818 SLC3A2-206ENST00000535296 2084 ntTSL 5 BASIC21■□□□□ 0.95
USP8P40818 FAM129C-208ENST00000599164 2073 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21■□□□□ 0.95
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 53.7 ms