Protein–RNA interactions for Protein: P36544

CHRNA7, Neuronal acetylcholine receptor subunit alpha-7, humanhuman

Predictions only

Length 502 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHRNA7P36544 NTSR2-201ENST00000306928 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
CHRNA7P36544 TRAPPC12-201ENST00000324266 2508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
CHRNA7P36544 SPEG-203ENST00000396688 1457 ntTSL 3 BASIC15.78■□□□□ 0.12
CHRNA7P36544 IRF3-221ENST00000598808 1468 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
CHRNA7P36544 GPRC5B-201ENST00000300571 5213 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
CHRNA7P36544 TNFRSF25-203ENST00000351959 1441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
CHRNA7P36544 SNAP47-202ENST00000366759 2362 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
CHRNA7P36544 DAG1-220ENST00000539901 5665 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
CHRNA7P36544 SLC35B1-201ENST00000240333 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
CHRNA7P36544 PRKAG2-203ENST00000418337 2318 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
CHRNA7P36544 ZNF419-205ENST00000424930 2323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
CHRNA7P36544 SPATA20-226ENST00000619622 2769 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
CHRNA7P36544 PITX3-201ENST00000370002 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
CHRNA7P36544 AK3-202ENST00000381809 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
CHRNA7P36544 SKOR1-203ENST00000554054 3620 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
CHRNA7P36544 SPSB1-201ENST00000328089 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
CHRNA7P36544 ZNFX1-203ENST00000371754 5235 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
CHRNA7P36544 LDHAL6A-202ENST00000396213 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
CHRNA7P36544 HAPLN4-201ENST00000291481 3449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
CHRNA7P36544 DUT-201ENST00000331200 2147 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
CHRNA7P36544 DGCR6L-202ENST00000405465 962 ntTSL 3 BASIC15.78■□□□□ 0.12
CHRNA7P36544 CT47A12-201ENST00000419982 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
CHRNA7P36544 OTUB1-203ENST00000428192 1296 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
CHRNA7P36544 GATS-209ENST00000454084 1030 ntTSL 3 BASIC15.78■□□□□ 0.12
CHRNA7P36544 C17orf107-202ENST00000521575 1275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
CHRNA7P36544 AC005410.1-201ENST00000579522 462 ntTSL 3 BASIC15.78■□□□□ 0.12
CHRNA7P36544 SLC35A3-218ENST00000639994 1114 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
CHRNA7P36544 AC068987.5-201ENST00000642069 987 ntAPPRIS P1 BASIC15.78■□□□□ 0.12
CHRNA7P36544 AC013269.1-201ENST00000409259 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
CHRNA7P36544 CAMKV-205ENST00000467248 1688 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
CHRNA7P36544 P2RY6-210ENST00000542092 1674 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
CHRNA7P36544 TISP43-206ENST00000623376 1653 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
CHRNA7P36544 CGRRF1-201ENST00000216420 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
CHRNA7P36544 STK25-204ENST00000405585 1643 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
CHRNA7P36544 NOMO2-212ENST00000622306 4252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
CHRNA7P36544 KLHL21-206ENST00000610898 1945 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
CHRNA7P36544 KLHL31-201ENST00000370905 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
CHRNA7P36544 RGS3-232ENST00000620489 1503 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
CHRNA7P36544 AMDHD1-201ENST00000266736 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
CHRNA7P36544 KIAA1522-202ENST00000373480 5294 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
CHRNA7P36544 KIAA1522-203ENST00000373481 5293 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
CHRNA7P36544 BCR-201ENST00000305877 7082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
CHRNA7P36544 MIF-AS1-201ENST00000406213 1476 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
CHRNA7P36544 NFIX-205ENST00000585575 1485 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
CHRNA7P36544 TSSK6-201ENST00000585580 1467 ntAPPRIS P1 BASIC15.78■□□□□ 0.12
CHRNA7P36544 TESMIN-201ENST00000255087 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
CHRNA7P36544 NDRG2-215ENST00000553503 2162 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
CHRNA7P36544 HDAC1-201ENST00000373548 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
CHRNA7P36544 PRSS36-202ENST00000418068 2446 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
CHRNA7P36544 KSR1-205ENST00000509603 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
CHRNA7P36544 RNF146-203ENST00000368314 2369 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
CHRNA7P36544 FGF16-201ENST00000439435 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
CHRNA7P36544 KRT18-207ENST00000550600 1696 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
CHRNA7P36544 NLRP6-201ENST00000312165 2679 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
CHRNA7P36544 CBR1-205ENST00000530908 1924 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
CHRNA7P36544 CDH5-204ENST00000563425 1932 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
CHRNA7P36544 FBL-201ENST00000221801 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
CHRNA7P36544 HCFC1R1-202ENST00000354679 765 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
CHRNA7P36544 ANKRD39-201ENST00000393537 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
CHRNA7P36544 ZNF295-AS1-201ENST00000412906 952 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
CHRNA7P36544 AL359182.2-201ENST00000457720 606 ntTSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.12
CHRNA7P36544 AC023632.3-201ENST00000521633 145 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
CHRNA7P36544 AC011611.3-201ENST00000552367 569 ntTSL 4 BASIC15.77■□□□□ 0.12
CHRNA7P36544 FAM219B-212ENST00000565772 1249 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
CHRNA7P36544 AC003102.1-201ENST00000588279 569 ntTSL 4 BASIC15.77■□□□□ 0.12
CHRNA7P36544 CD99-210ENST00000611428 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
CHRNA7P36544 AC092368.3-202ENST00000574180 1591 ntBASIC15.77■□□□□ 0.11
CHRNA7P36544 ZNF211-204ENST00000347302 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
CHRNA7P36544 RAB4A-205ENST00000618010 2799 ntTSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.11
CHRNA7P36544 EGFL7-203ENST00000371699 2125 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.11
CHRNA7P36544 ACD-201ENST00000219251 2052 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.11
CHRNA7P36544 PIGQ-206ENST00000422307 2052 ntTSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.11
CHRNA7P36544 SLC9A6-201ENST00000370695 4725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
CHRNA7P36544 B4GALT2-201ENST00000309519 2004 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.11
CHRNA7P36544 CDK5R1-201ENST00000313401 4325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
CHRNA7P36544 SMPD4-202ENST00000409031 4896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
CHRNA7P36544 BICRA-201ENST00000396720 5739 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
CHRNA7P36544 CNIH3-201ENST00000272133 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
CHRNA7P36544 POFUT2-201ENST00000331343 4825 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
CHRNA7P36544 PFKFB3-217ENST00000626882 1965 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
CHRNA7P36544 DCHS2-201ENST00000339452 5064 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CHRNA7P36544 ORAI2-204ENST00000473939 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CHRNA7P36544 JAG1-201ENST00000254958 6048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CHRNA7P36544 SLC6A9-201ENST00000357730 2168 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CHRNA7P36544 SNRPA-201ENST00000243563 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CHRNA7P36544 CLN3-205ENST00000359984 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CHRNA7P36544 INTS11-250ENST00000620829 1862 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
CHRNA7P36544 RBM42-204ENST00000589559 1328 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
CHRNA7P36544 CBLC-201ENST00000270279 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CHRNA7P36544 C11orf86-201ENST00000308963 1187 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
CHRNA7P36544 LIPT2-201ENST00000310109 1018 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
CHRNA7P36544 TRAPPC5-201ENST00000317378 790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CHRNA7P36544 AL390719.1-204ENST00000412397 1219 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
CHRNA7P36544 ZNF467-202ENST00000484747 913 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
CHRNA7P36544 SERP1-205ENST00000487153 657 ntTSL 4 BASIC15.76■□□□□ 0.11
CHRNA7P36544 RNA5SP413-201ENST00000516373 109 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
CHRNA7P36544 AL356020.1-201ENST00000554235 1076 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
CHRNA7P36544 AF274858.3-202ENST00000569906 755 ntTSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
CHRNA7P36544 LRRC42-203ENST00000371370 2037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
CHRNA7P36544 APTR-204ENST00000440088 2029 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20 ms