Protein–RNA interactions for Protein: P36383

GJC1, Gap junction gamma-1 protein, humanhuman

Predictions only

Length 396 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GJC1P36383 ATP6V0E2-213ENST00000615196 2727 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
GJC1P36383 LAMP1-201ENST00000332556 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
GJC1P36383 SLC1A7-201ENST00000371491 1306 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
GJC1P36383 MRAP-201ENST00000303645 935 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
GJC1P36383 CABP2-202ENST00000353903 789 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.85
GJC1P36383 MRPS26-201ENST00000380325 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
GJC1P36383 RAMP1-202ENST00000403885 650 ntTSL 3 BASIC20.39■□□□□ 0.85
GJC1P36383 JDP2-202ENST00000419727 972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.85
GJC1P36383 GOSR2-208ENST00000573224 1115 ntTSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.85
GJC1P36383 DCAKD-205ENST00000588499 990 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.85
GJC1P36383 FFAR3-202ENST00000594310 1182 ntAPPRIS P1 BASIC20.39■□□□□ 0.85
GJC1P36383 INO80E-214ENST00000620599 515 ntTSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.85
GJC1P36383 AL121906.2-201ENST00000621597 723 ntBASIC20.39■□□□□ 0.85
GJC1P36383 AL160396.2-202ENST00000636692 566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.85
GJC1P36383 GTPBP3-222ENST00000600625 2493 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
GJC1P36383 GPR135-201ENST00000395116 4578 ntAPPRIS P1 BASIC20.39■□□□□ 0.85
GJC1P36383 DMRT2-204ENST00000382251 2292 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.85
GJC1P36383 PDZD3-203ENST00000525131 1882 ntTSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.85
GJC1P36383 ADAM33-202ENST00000356518 3677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
GJC1P36383 RAB11FIP2-201ENST00000355624 6061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
GJC1P36383 LARGE2-208ENST00000531526 2528 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
GJC1P36383 AOC3-204ENST00000591562 2522 ntTSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
GJC1P36383 SLC38A11-203ENST00000409149 1621 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
GJC1P36383 TIGD6-202ENST00000515406 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
GJC1P36383 MORF4L1-201ENST00000331268 2359 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
GJC1P36383 ARMC6-202ENST00000392335 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
GJC1P36383 WWOX-202ENST00000402655 1594 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
GJC1P36383 SETD7-202ENST00000404104 1590 ntTSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
GJC1P36383 MXD3-202ENST00000427908 2269 ntTSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
GJC1P36383 TWF1-201ENST00000395510 3045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
GJC1P36383 TACO1-201ENST00000258975 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
GJC1P36383 VSTM2B-201ENST00000335523 1488 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
GJC1P36383 NAT16-204ENST00000455377 1492 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
GJC1P36383 NFS1-214ENST00000541387 1436 ntTSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
GJC1P36383 DUT-202ENST00000455976 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
GJC1P36383 ABHD17AP6-201ENST00000458502 1044 ntBASIC20.38■□□□□ 0.85
GJC1P36383 COX4I1-202ENST00000561569 716 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
GJC1P36383 LIMD2-206ENST00000578993 602 ntTSL 3 BASIC20.38■□□□□ 0.85
GJC1P36383 PTPA-204ENST00000355007 2515 ntTSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
GJC1P36383 NOMO3-202ENST00000399336 4356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
GJC1P36383 N4BP3-201ENST00000274605 6080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
GJC1P36383 CDK17-203ENST00000543119 2442 ntTSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
GJC1P36383 LMF1-212ENST00000568897 1603 ntTSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
GJC1P36383 SENP6-202ENST00000370010 4644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
GJC1P36383 TEAD2-202ENST00000377214 2440 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
GJC1P36383 SLC27A3-214ENST00000624995 2413 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
GJC1P36383 SLC7A10-201ENST00000253188 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
GJC1P36383 USP48-204ENST00000400301 4309 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
GJC1P36383 MPP5-201ENST00000261681 5552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
GJC1P36383 SLC39A4-201ENST00000276833 2297 ntTSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
GJC1P36383 AC090340.1-201ENST00000620778 4980 ntBASIC20.37■□□□□ 0.85
GJC1P36383 KATNAL2-208ENST00000592005 1348 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
GJC1P36383 COL16A1-203ENST00000373672 5736 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
GJC1P36383 HOXB9-201ENST00000311177 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
GJC1P36383 DHRSX-201ENST00000334651 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
GJC1P36383 CAVIN3-201ENST00000303927 1174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
GJC1P36383 LIPT2-201ENST00000310109 1018 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
GJC1P36383 SBK2-201ENST00000344158 1056 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
GJC1P36383 SBK2-202ENST00000413299 1085 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
GJC1P36383 ITGB7-209ENST00000550743 2138 ntTSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
GJC1P36383 LAD1-202ENST00000391967 2906 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
GJC1P36383 RAB11FIP2-202ENST00000369199 6119 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
GJC1P36383 LAG3-201ENST00000203629 1974 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
GJC1P36383 GPR146-201ENST00000397095 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
GJC1P36383 STXBP6-203ENST00000419632 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
GJC1P36383 DSCC1-201ENST00000313655 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
GJC1P36383 CYP2E1-205ENST00000463117 1912 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
GJC1P36383 ARL5A-201ENST00000295087 5326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
GJC1P36383 ZNF470-201ENST00000330619 7151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
GJC1P36383 TBXA2R-201ENST00000375190 2608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
GJC1P36383 DNAJC11-201ENST00000294401 2210 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
GJC1P36383 PON1-201ENST00000222381 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
GJC1P36383 STRN4-202ENST00000391910 3628 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
GJC1P36383 ZNF12-204ENST00000405858 5051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
GJC1P36383 TRMU-202ENST00000381019 1381 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
GJC1P36383 GOLGA6L3-201ENST00000507199 1679 ntBASIC20.36■□□□□ 0.85
GJC1P36383 RENBP-201ENST00000369997 1322 ntTSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
GJC1P36383 PRAF2-202ENST00000553851 1334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
GJC1P36383 KRT9-201ENST00000246662 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
GJC1P36383 DDR1-228ENST00000376575 732 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
GJC1P36383 APTR-205ENST00000447009 902 ntTSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
GJC1P36383 MAGI2-AS3-209ENST00000448195 774 ntTSL 3 BASIC20.36■□□□□ 0.85
GJC1P36383 AL929601.1-201ENST00000551565 573 ntTSL 4 BASIC20.36■□□□□ 0.85
GJC1P36383 GNB5-211ENST00000560116 918 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
GJC1P36383 ZNF688-205ENST00000563707 244 ntTSL 3 BASIC20.36■□□□□ 0.85
GJC1P36383 AC142086.2-201ENST00000569753 217 ntBASIC20.36■□□□□ 0.85
GJC1P36383 AC010646.1-201ENST00000594059 515 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC20.36■□□□□ 0.85
GJC1P36383 TIMM50-213ENST00000599794 786 ntTSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
GJC1P36383 PVRIG-201ENST00000317271 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
GJC1P36383 SLC25A41-201ENST00000321510 1532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
GJC1P36383 AP006587.1-201ENST00000534129 1502 ntBASIC20.36■□□□□ 0.85
GJC1P36383 AC129492.1-201ENST00000399413 1804 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
GJC1P36383 ARMC6-220ENST00000546344 1814 ntTSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
GJC1P36383 AATK-203ENST00000417379 5081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
GJC1P36383 SMIM4-203ENST00000477703 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
GJC1P36383 MSL1-202ENST00000398532 4707 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
GJC1P36383 HEMK1-206ENST00000455834 1499 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
GJC1P36383 LSM12-201ENST00000293406 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
GJC1P36383 SHF-201ENST00000290894 2500 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
GJC1P36383 KIF22-203ENST00000561482 2505 ntTSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.6 ms