Protein–RNA interactions for Protein: P31269

HOXA9, Homeobox protein Hox-A9, humanhuman

Predictions only

Length 272 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXA9P31269 MATN4-204ENST00000372756 2077 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
HOXA9P31269 ZNF513-202ENST00000407879 2077 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
HOXA9P31269 CR769775.1-204ENST00000439760 747 ntTSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
HOXA9P31269 AC009947.2-201ENST00000444014 672 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
HOXA9P31269 NT5C2-211ENST00000470299 249 ntTSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
HOXA9P31269 AF250324.1-201ENST00000506276 703 ntTSL 3 BASIC20.16■□□□□ 0.82
HOXA9P31269 CMTM3-210ENST00000565666 769 ntTSL 3 BASIC20.16■□□□□ 0.82
HOXA9P31269 KANSL1-AS1-203ENST00000572973 424 ntTSL 3 BASIC20.16■□□□□ 0.82
HOXA9P31269 NEK4P2-201ENST00000580004 1012 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
HOXA9P31269 ELAVL1-202ENST00000593807 856 ntTSL 3 BASIC20.16■□□□□ 0.82
HOXA9P31269 ZNF575-205ENST00000601282 1086 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
HOXA9P31269 C10orf142-201ENST00000619243 1110 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
HOXA9P31269 AL023973.1-201ENST00000624619 620 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
HOXA9P31269 C22orf39-205ENST00000542103 1523 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
HOXA9P31269 SELENOF-207ENST00000611507 1785 ntTSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
HOXA9P31269 DBN1-210ENST00000512501 1878 ntTSL 3 BASIC20.16■□□□□ 0.82
HOXA9P31269 BCKDK-202ENST00000287507 1907 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
HOXA9P31269 PCMT1-203ENST00000367384 1938 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
HOXA9P31269 AL691432.2-201ENST00000607222 2038 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
HOXA9P31269 SOCS2-207ENST00000549206 2072 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.15■□□□□ 0.82
HOXA9P31269 DYRK3-202ENST00000367108 2218 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
HOXA9P31269 SOCS2-206ENST00000549122 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
HOXA9P31269 DUSP5-201ENST00000369583 2557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
HOXA9P31269 CIZ1-206ENST00000372954 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
HOXA9P31269 INAFM2-202ENST00000638170 3052 ntAPPRIS P1 BASIC20.15■□□□□ 0.82
HOXA9P31269 NEURL4-201ENST00000315614 5182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
HOXA9P31269 BUD23-201ENST00000265758 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
HOXA9P31269 ISCA1-202ENST00000326094 1264 ntTSL 3 BASIC20.15■□□□□ 0.82
HOXA9P31269 UFD1-202ENST00000399523 1007 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
HOXA9P31269 TMA7-201ENST00000438607 561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
HOXA9P31269 HIGD1A-204ENST00000452906 585 ntTSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
HOXA9P31269 AL671277.2-201ENST00000458060 996 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
HOXA9P31269 KCNMA1-220ENST00000481070 896 ntTSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
HOXA9P31269 NMU-205ENST00000511469 756 ntTSL 3 BASIC20.15■□□□□ 0.82
HOXA9P31269 MVB12A-204ENST00000528515 686 ntTSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
HOXA9P31269 EEF1D-243ENST00000532400 419 ntTSL 3 BASIC20.15■□□□□ 0.82
HOXA9P31269 KRTCAP3-207ENST00000543753 956 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
HOXA9P31269 MRPL46-202ENST00000558531 1002 ntTSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
HOXA9P31269 UBA52-210ENST00000598780 668 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.15■□□□□ 0.82
HOXA9P31269 RNASET2-213ENST00000611959 1124 ntTSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
HOXA9P31269 RNF187-203ENST00000639044 708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
HOXA9P31269 ZMYM5-202ENST00000382905 1382 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
HOXA9P31269 KRT8P45-201ENST00000414328 1447 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
HOXA9P31269 GALE-201ENST00000374497 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
HOXA9P31269 CYB561-204ENST00000448884 1496 ntTSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
HOXA9P31269 GMPPA-213ENST00000622191 1473 ntTSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
HOXA9P31269 JPT1-203ENST00000409753 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
HOXA9P31269 SSR1-204ENST00000474597 1808 ntTSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
HOXA9P31269 SUMF2-202ENST00000342190 1876 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
HOXA9P31269 IRF7-205ENST00000397574 1968 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
HOXA9P31269 KIRREL2-202ENST00000347900 2015 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
HOXA9P31269 ZNF668-209ENST00000539836 2469 ntTSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
HOXA9P31269 IRX3-201ENST00000329734 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
HOXA9P31269 PALM-202ENST00000338448 2725 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
HOXA9P31269 KLC2-207ENST00000421552 2721 ntTSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.82
HOXA9P31269 CPNE7-202ENST00000319518 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
HOXA9P31269 ITGBL1-206ENST00000618057 2368 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
HOXA9P31269 CCDC88B-203ENST00000359902 2326 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
HOXA9P31269 SDHAF3-202ENST00000432641 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
HOXA9P31269 NCLN-205ENST00000590671 2070 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
HOXA9P31269 GTF2IRD2B-210ENST00000629105 1910 ntTSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
HOXA9P31269 QPCTL-202ENST00000366382 1814 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
HOXA9P31269 LPAR2-203ENST00000586703 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
HOXA9P31269 AL162377.1-201ENST00000618844 1793 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
HOXA9P31269 CXorf49-202ENST00000535490 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
HOXA9P31269 CXorf49B-202ENST00000542739 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
HOXA9P31269 TMEM151B-202ENST00000451188 4895 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
HOXA9P31269 CNOT9-209ENST00000627282 1621 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
HOXA9P31269 EDEM1-204ENST00000445686 1363 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
HOXA9P31269 AVL9-209ENST00000640103 1367 ntTSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
HOXA9P31269 NPM3-201ENST00000370110 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
HOXA9P31269 PCED1CP-201ENST00000419887 785 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
HOXA9P31269 MALL-203ENST00000427178 1070 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
HOXA9P31269 DAP-202ENST00000432074 1048 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
HOXA9P31269 CD320-202ENST00000537716 1119 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
HOXA9P31269 ETFA-216ENST00000560726 942 ntTSL 3 BASIC20.14■□□□□ 0.81
HOXA9P31269 AC027682.5-201ENST00000567122 530 ntTSL 3 BASIC20.14■□□□□ 0.81
HOXA9P31269 FAM104A-205ENST00000581110 512 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
HOXA9P31269 USF2-205ENST00000594064 1179 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
HOXA9P31269 SAV1-201ENST00000324679 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
HOXA9P31269 AC073314.1-201ENST00000568729 2216 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
HOXA9P31269 SLC16A3-201ENST00000392339 2074 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
HOXA9P31269 SLC16A3-202ENST00000392341 2086 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
HOXA9P31269 AP005212.1-201ENST00000581547 1997 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
HOXA9P31269 DOK2-201ENST00000276420 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
HOXA9P31269 WDSUB1-202ENST00000359774 1912 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
HOXA9P31269 WAS-201ENST00000376701 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
HOXA9P31269 WDSUB1-203ENST00000392796 1812 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
HOXA9P31269 GLT8D1-206ENST00000478968 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
HOXA9P31269 PDIA5-201ENST00000316218 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
HOXA9P31269 RBM14-RBM4-201ENST00000412278 1566 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
HOXA9P31269 MORF4L1-215ENST00000559345 1468 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
HOXA9P31269 GMDS-208ENST00000530927 1440 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
HOXA9P31269 EPN1-201ENST00000085079 2355 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
HOXA9P31269 VLDLR-AS1-205ENST00000599229 1346 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
HOXA9P31269 GPX4-201ENST00000354171 919 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
HOXA9P31269 GGT1-205ENST00000403838 1033 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
HOXA9P31269 UBE2C-206ENST00000405520 641 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
HOXA9P31269 AL359075.1-203ENST00000462729 1002 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
HOXA9P31269 AC019068.1-202ENST00000483218 768 ntTSL 3 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.7 ms