Protein–RNA interactions for Protein: P28329

CHAT, Choline O-acetyltransferase, humanhuman

Predictions only

Length 748 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHATP28329 CLDN5-204ENST00000618236 1374 ntAPPRIS P1 BASIC16.48■□□□□ 0.23
CHATP28329 EFR3A-201ENST00000254624 5438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
CHATP28329 EFCAB11-202ENST00000538485 1870 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
CHATP28329 SPHK1-207ENST00000590959 1851 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
CHATP28329 GGT6-202ENST00000381550 2145 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
CHATP28329 RPP25-201ENST00000322177 3049 ntAPPRIS P1 BASIC16.48■□□□□ 0.23
CHATP28329 ABCB9-202ENST00000344275 2394 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
CHATP28329 ACD-202ENST00000393919 1974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
CHATP28329 LRWD1-201ENST00000292616 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
CHATP28329 CD55-201ENST00000314754 2220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
CHATP28329 AC120498.9-201ENST00000339021 3867 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
CHATP28329 CYB561D2-205ENST00000425346 1319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
CHATP28329 CD58-203ENST00000457047 1328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
CHATP28329 CGRRF1-201ENST00000216420 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
CHATP28329 IL4I1-201ENST00000341114 2349 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
CHATP28329 DHRSX-201ENST00000334651 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
CHATP28329 TPCN2-201ENST00000294309 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
CHATP28329 MFSD10-201ENST00000329687 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
CHATP28329 AC069544.2-201ENST00000640019 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
CHATP28329 MIB2-203ENST00000378712 2890 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
CHATP28329 GGT2-201ENST00000401924 2366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
CHATP28329 RNF5-203ENST00000375094 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
CHATP28329 AC133552.2-202ENST00000575694 574 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
CHATP28329 PCID2-202ENST00000337344 1898 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
CHATP28329 SLC38A11-203ENST00000409149 1621 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
CHATP28329 ESPN-216ENST00000636330 4731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
CHATP28329 ARHGAP27-201ENST00000290470 1376 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
CHATP28329 CEP85L-205ENST00000419517 2079 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
CHATP28329 BCS1L-201ENST00000359273 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
CHATP28329 PDLIM2-205ENST00000397761 1491 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
CHATP28329 CELF6-205ENST00000567083 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
CHATP28329 TMEM179-201ENST00000341595 2513 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
CHATP28329 HMGXB3-206ENST00000613459 5567 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
CHATP28329 CBFA2T2-201ENST00000342704 2864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
CHATP28329 BCR-201ENST00000305877 7082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
CHATP28329 ISOC1-201ENST00000173527 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
CHATP28329 EEF1A1-203ENST00000331523 1923 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
CHATP28329 PIGQ-204ENST00000409527 1915 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
CHATP28329 TFP1-202ENST00000475455 1573 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
CHATP28329 SNX19-209ENST00000530356 1562 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
CHATP28329 ST3GAL3-206ENST00000351035 2377 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
CHATP28329 SLC23A3-201ENST00000295738 2037 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
CHATP28329 AC013269.1-201ENST00000409259 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
CHATP28329 TISP43-206ENST00000623376 1653 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
CHATP28329 MARC2-202ENST00000366913 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
CHATP28329 SOGA3-203ENST00000525778 4077 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
CHATP28329 AC148477.3-202ENST00000376617 1766 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
CHATP28329 PLPPR2-208ENST00000591608 2552 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
CHATP28329 CORO1B-201ENST00000341356 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
CHATP28329 MRPL23-AS1-201ENST00000419080 1876 ntTSL 3 BASIC16.46■□□□□ 0.23
CHATP28329 ATP2A3-201ENST00000309890 4826 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
CHATP28329 PPM1H-201ENST00000228705 6353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
CHATP28329 ETV4-201ENST00000319349 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
CHATP28329 SMPD3-203ENST00000563226 2093 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
CHATP28329 CDCA7L-203ENST00000406877 3066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
CHATP28329 SCARF1-202ENST00000348987 2619 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
CHATP28329 AGPAT3-201ENST00000291572 5546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
CHATP28329 GOLPH3-201ENST00000265070 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
CHATP28329 PGPEP1L-201ENST00000378919 995 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
CHATP28329 C20orf196-202ENST00000378979 585 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
CHATP28329 AC004911.1-201ENST00000416316 871 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
CHATP28329 EIF5A-205ENST00000419711 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
CHATP28329 AL032819.3-201ENST00000640283 925 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
CHATP28329 VSTM2B-201ENST00000335523 1488 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
CHATP28329 MTMR1-208ENST00000445323 4516 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
CHATP28329 TCTA-201ENST00000273590 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
CHATP28329 PGAP3-206ENST00000579146 2220 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
CHATP28329 PHF12-201ENST00000268756 2957 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
CHATP28329 FBXL20-202ENST00000394294 2309 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
CHATP28329 FGFR1-206ENST00000397091 5702 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
CHATP28329 PGP-201ENST00000333503 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
CHATP28329 TLX1-201ENST00000370196 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
CHATP28329 CENPH-206ENST00000515001 1305 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
CHATP28329 ADGRD2-201ENST00000334810 3244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
CHATP28329 WRNIP1-202ENST00000380769 3239 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
CHATP28329 EDN3-204ENST00000371028 2397 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
CHATP28329 CORO1A-216ENST00000570045 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
CHATP28329 TNPO2-201ENST00000356861 4962 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
CHATP28329 MCIDAS-201ENST00000513312 1736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
CHATP28329 PRKAR2A-206ENST00000454963 1849 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
CHATP28329 MAP3K11-210ENST00000532507 1812 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
CHATP28329 WNK1-206ENST00000535572 9886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
CHATP28329 GAR1-201ENST00000226796 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
CHATP28329 SPATA25-201ENST00000372519 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
CHATP28329 GRPEL2-202ENST00000416916 1006 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
CHATP28329 VSX1-206ENST00000444511 1197 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
CHATP28329 AC073896.1-201ENST00000549318 937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
CHATP28329 MFSD14C-203ENST00000602917 786 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
CHATP28329 ATP6V0E2-211ENST00000606024 893 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
CHATP28329 CENPN-201ENST00000299572 1398 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
CHATP28329 RAB34-203ENST00000395243 1597 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
CHATP28329 KCNK17-201ENST00000373231 1658 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
CHATP28329 SPAST-202ENST00000345662 5116 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
CHATP28329 HCCS-201ENST00000321143 2277 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
CHATP28329 SPRYD7-204ENST00000613924 2285 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
CHATP28329 TBX18-202ENST00000369663 6245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
CHATP28329 SEPT8-216ENST00000620483 4335 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
CHATP28329 P3H4-202ENST00000393928 2601 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
CHATP28329 ITGB7-209ENST00000550743 2138 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
CHATP28329 CFAP77-203ENST00000393216 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.8 ms