Protein–RNA interactions for Protein: P23396

RPS3, 40S ribosomal protein S3, humanhuman

Known RBP eCLIP

Length 243 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RPS3P23396 TSPAN14-203ENST00000372156 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.78■□□□□ 0.761e-8■■■■□ 21.3
RPS3P23396 TSPAN14-210ENST00000616406 2436 ntTSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.071e-8■■■■□ 21.3
RPS3P23396 PKM-208ENST00000563275 699 ntTSL 1 (best)12.15□□□□□ -0.461e-22■■■■□ 21.3
RPS3P23396 SLC1A5-203ENST00000542575 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.833e-11■■■■□ 21.3
RPS3P23396 HDAC2-201ENST00000368632 2084 ntTSL 2 BASIC19.77■□□□□ 0.769e-9■■■■□ 21.3
RPS3P23396 HDAC2-207ENST00000520170 690 ntTSL 219.04■□□□□ 0.649e-9■■■■□ 21.3
RPS3P23396 HDAC2-209ENST00000520895 551 ntTSL 415.1■□□□□ 0.019e-9■■■■□ 21.3
RPS3P23396 HDAC2-217ENST00000524334 570 ntTSL 412.48□□□□□ -0.419e-9■■■■□ 21.3
RPS3P23396 HDAC2-211ENST00000521233 733 ntTSL 212.29□□□□□ -0.449e-9■■■■□ 21.3
RPS3P23396 HDAC2-205ENST00000519065 9874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.579e-9■■■■□ 21.3
RPS3P23396 HDAC2-210ENST00000521163 557 ntTSL 59.73□□□□□ -0.859e-9■■■■□ 21.3
RPS3P23396 HDAC2-213ENST00000522371 502 ntTSL 41.06□□□□□ -2.249e-9■■■■□ 21.3
RPS3P23396 CAPG-201ENST00000263867 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.991e-12■■■■□ 21.3
RPS3P23396 TACC3-213ENST00000617535 1693 ntTSL 5 BASIC20■□□□□ 0.791e-12■■■■□ 21.3
RPS3P23396 TACC3-201ENST00000313288 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.21e-12■■■■□ 21.3
RPS3P23396 CAPG-203ENST00000409670 1183 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.171e-12■■■■□ 21.3
RPS3P23396 CAPG-205ENST00000409921 1195 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.151e-12■■■■□ 21.3
RPS3P23396 TACC3-205ENST00000467746 966 ntTSL 315.89■□□□□ 0.131e-12■■■■□ 21.3
RPS3P23396 TACC3-212ENST00000612220 1756 ntTSL 5 BASIC14.1□□□□□ -0.151e-12■■■■□ 21.3
RPS3P23396 CAPG-210ENST00000453973 452 ntTSL 313.98□□□□□ -0.171e-12■■■■□ 21.3
RPS3P23396 ARL2-203ENST00000529254 601 nt13.95□□□□□ -0.181e-12■■■■□ 21.3
RPS3P23396 TACC3-209ENST00000484651 2715 ntTSL 213.36□□□□□ -0.271e-12■■■■□ 21.3
RPS3P23396 TACC3-210ENST00000485989 726 ntTSL 312.41□□□□□ -0.421e-12■■■■□ 21.3
RPS3P23396 CAPG-204ENST00000409724 1151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.631e-12■■■■□ 21.3
RPS3P23396 HNRNPM-205ENST00000596295 910 ntTSL 317.53■□□□□ 0.43e-11■■■■□ 21.3
RPS3P23396 ACY1-222ENST00000637209 687 ntTSL 517.97■□□□□ 0.478e-7■■■■□ 21.3
RPS3P23396 ACY1-225ENST00000637460 884 ntTSL 317.34■□□□□ 0.378e-7■■■■□ 21.3
RPS3P23396 ACY1-216ENST00000636556 1059 ntTSL 516.85■□□□□ 0.298e-7■■■■□ 21.3
RPS3P23396 ACY1-223ENST00000637251 1739 ntTSL 515.65■□□□□ 0.18e-7■■■■□ 21.3
RPS3P23396 ACY1-205ENST00000469863 755 ntTSL 310.7□□□□□ -0.78e-7■■■■□ 21.3
RPS3P23396 ABHD14A-ACY1-223ENST00000637461 566 ntTSL 510.18□□□□□ -0.788e-7■■■■□ 21.3
RPS3P23396 MPDU1-206ENST00000571391 677 ntTSL 210.43□□□□□ -0.742e-6■■■■□ 21.3
RPS3P23396 MPDU1-219ENST00000580708 563 ntTSL 57.62□□□□□ -1.192e-6■■■■□ 21.3
RPS3P23396 MPDU1-213ENST00000575256 392 ntTSL 35.06□□□□□ -1.62e-6■■■■□ 21.3
RPS3P23396 PGD-201ENST00000270776 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.241e-7■■■■□ 21.3
RPS3P23396 TF-210ENST00000482271 659 ntTSL 418.46■□□□□ 0.556e-27■■■■□ 21.3
RPS3P23396 ABHD14A-ACY1-215ENST00000636646 2151 ntTSL 522.57■■□□□ 1.29e-7■■■■□ 21.2
RPS3P23396 ABHD14A-ACY1-212ENST00000636089 2230 ntTSL 522.23■■□□□ 1.159e-7■■■■□ 21.2
RPS3P23396 ABHD14A-ACY1-201ENST00000463721 1836 ntTSL 221.74■■□□□ 1.079e-7■■■■□ 21.2
RPS3P23396 ABHD14A-ACY1-219ENST00000636942 1696 ntTSL 520.86■□□□□ 0.939e-7■■■■□ 21.2
RPS3P23396 ABHD14A-ACY1-226ENST00000637696 2373 ntTSL 520.54■□□□□ 0.889e-7■■■■□ 21.2
RPS3P23396 ACY1-207ENST00000476854 1319 ntTSL 3 BASIC20.23■□□□□ 0.837e-7■■■■□ 21.2
RPS3P23396 ABHD14A-ACY1-208ENST00000635951 2168 ntTSL 519.75■□□□□ 0.759e-7■■■■□ 21.2
RPS3P23396 ACY1-215ENST00000636358 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.747e-7■■■■□ 21.2
RPS3P23396 ABHD14A-ACY1-217ENST00000636718 2499 ntTSL 519.32■□□□□ 0.689e-7■■■■□ 21.2
RPS3P23396 ABHD14A-ACY1-202ENST00000463937 1705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.669e-7■■■■□ 21.2
RPS3P23396 ACY1-201ENST00000404366 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.627e-7■■■■□ 21.2
RPS3P23396 ABHD14A-ACY1-207ENST00000635946 2459 ntTSL 518.72■□□□□ 0.599e-7■■■■□ 21.2
RPS3P23396 ABHD14A-ACY1-225ENST00000637563 2622 ntTSL 518.09■□□□□ 0.499e-7■■■■□ 21.2
RPS3P23396 ACY1-210ENST00000494103 1298 ntTSL 3 BASIC17.7■□□□□ 0.427e-7■■■■□ 21.2
RPS3P23396 ACY1-206ENST00000476351 1409 ntTSL 3 BASIC17.59■□□□□ 0.417e-7■■■■□ 21.2
RPS3P23396 ACY1-213ENST00000635941 1691 ntTSL 517.06■□□□□ 0.327e-7■■■■□ 21.2
RPS3P23396 ABHD14A-ACY1-218ENST00000636826 2940 ntTSL 516.86■□□□□ 0.299e-7■■■■□ 21.2
RPS3P23396 ABHD14A-ACY1-220ENST00000637025 2926 ntTSL 516.73■□□□□ 0.279e-7■■■■□ 21.2
RPS3P23396 ABHD14A-ACY1-229ENST00000637978 1758 ntAPPRIS P5 TSL 516.64■□□□□ 0.259e-7■■■■□ 21.2
RPS3P23396 ACY1-212ENST00000635797 1294 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.257e-7■■■■□ 21.2
RPS3P23396 ABHD14A-ACY1-206ENST00000635937 3078 ntTSL 516.17■□□□□ 0.189e-7■■■■□ 21.2
RPS3P23396 ACY1-209ENST00000491318 1390 ntTSL 315.56■□□□□ 0.087e-7■■■■□ 21.2
RPS3P23396 ABHD14A-ACY1-221ENST00000637130 3158 ntTSL 515.52■□□□□ 0.079e-7■■■■□ 21.2
RPS3P23396 ABHD14A-ACY1-224ENST00000637512 1536 ntTSL 515□□□□□ -0.019e-7■■■■□ 21.2
RPS3P23396 ACY1-217ENST00000636880 1457 ntTSL 314.7□□□□□ -0.067e-7■■■■□ 21.2
RPS3P23396 ACY1-229ENST00000638136 1857 ntTSL 514.69□□□□□ -0.067e-7■■■■□ 21.2
RPS3P23396 ACY1-224ENST00000637349 703 ntTSL 514.41□□□□□ -0.17e-7■■■■□ 21.2
RPS3P23396 ABHD14A-ACY1-227ENST00000637730 2735 ntTSL 514.39□□□□□ -0.119e-7■■■■□ 21.2
RPS3P23396 ACY1-203ENST00000465121 1600 ntTSL 214.23□□□□□ -0.137e-7■■■■□ 21.2
RPS3P23396 ABHD14A-ACY1-214ENST00000636490 3067 ntTSL 513.84□□□□□ -0.199e-7■■■■□ 21.2
RPS3P23396 ABHD14A-ACY1-228ENST00000637778 3628 ntTSL 513.76□□□□□ -0.219e-7■■■■□ 21.2
RPS3P23396 ABHD14A-ACY1-216ENST00000636660 1126 ntTSL 512.92□□□□□ -0.347e-7■■■■□ 21.2
RPS3P23396 ABHD14A-ACY1-205ENST00000635785 1060 ntTSL 511.82□□□□□ -0.529e-7■■■■□ 21.2
RPS3P23396 FGG-206ENST00000443553 789 ntTSL 54.36□□□□□ -1.712e-17■■■■□ 21.2
RPS3P23396 FGG-202ENST00000393846 641 ntTSL 22.47□□□□□ -2.012e-17■■■■□ 21.2
RPS3P23396 CYBA-204ENST00000563526 1052 ntTSL 215.02■□□□□ -02e-20■■■■□ 21.2
RPS3P23396 CYBA-207ENST00000566534 1006 ntTSL 513.9□□□□□ -0.181e-18■■■■□ 21.2
RPS3P23396 SF3B3-208ENST00000567250 1084 ntTSL 311.97□□□□□ -0.492e-17■■■■□ 21.2
RPS3P23396 EIF3K-206ENST00000588299 524 ntTSL 28.96□□□□□ -0.981e-6■■■■□ 21.2
RPS3P23396 PC-204ENST00000524491 1714 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.265e-7■■■■□ 21.2
RPS3P23396 PC-214ENST00000628663 1470 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.255e-7■■■■□ 21.2
RPS3P23396 PC-207ENST00000528403 706 ntTSL 215.77■□□□□ 0.125e-7■■■■□ 21.2
RPS3P23396 PC-212ENST00000531614 690 ntTSL 512.77□□□□□ -0.375e-7■■■■□ 21.2
RPS3P23396 SSU72-201ENST00000291386 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.824e-7■■■■□ 21.2
RPS3P23396 NPLOC4-217ENST00000574897 2365 ntTSL 223.34■■□□□ 1.334e-7■■■■□ 21.2
RPS3P23396 UBR2-203ENST00000372903 2423 ntTSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.779e-11■■■■□ 21.2
RPS3P23396 PFKL-212ENST00000628044 129 ntTSL 3 BASIC19.78■□□□□ 0.764e-7■■■■□ 21.2
RPS3P23396 EXOSC4-202ENST00000525936 606 ntTSL 3 BASIC19.33■□□□□ 0.683e-6■■■■□ 21.2
RPS3P23396 ALDH7A1-215ENST00000553117 1935 ntTSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.654e-7■■■■□ 21.2
RPS3P23396 ACADS-202ENST00000411593 1398 ntTSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.594e-7■■■■□ 21.2
RPS3P23396 ACADS-201ENST00000242592 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.574e-7■■■■□ 21.2
RPS3P23396 NPLOC4-201ENST00000331134 4415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.544e-7■■■■□ 21.2
RPS3P23396 ALDH7A1-225ENST00000636808 2639 ntTSL 517.97■□□□□ 0.474e-7■■■■□ 21.2
RPS3P23396 EXOSC4-201ENST00000316052 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.263e-6■■■■□ 21.2
RPS3P23396 USP11-202ENST00000377078 1077 ntTSL 516.59■□□□□ 0.254e-7■■■■□ 21.2
RPS3P23396 NAGLU-203ENST00000590358 634 ntTSL 416.11■□□□□ 0.174e-7■■■■□ 21.2
RPS3P23396 ACADS-203ENST00000539690 1142 ntTSL 215.69■□□□□ 0.14e-7■■■■□ 21.2
RPS3P23396 ELAC2-213ENST00000578104 664 ntTSL 315.37■□□□□ 0.054e-7■■■■□ 21.2
RPS3P23396 EXOSC4-203ENST00000527954 1065 ntTSL 214.58□□□□□ -0.083e-6■■■■□ 21.2
RPS3P23396 SMYD5-202ENST00000389501 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.154e-7■■■■□ 21.2
RPS3P23396 USP11-207ENST00000478596 970 ntTSL 314.01□□□□□ -0.174e-7■■■■□ 21.2
RPS3P23396 UBR2-201ENST00000372899 7857 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.29e-11■■■■□ 21.2
RPS3P23396 UBR2-202ENST00000372901 7857 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.83□□□□□ -0.29e-11■■■■□ 21.2
RPS3P23396 ALDH7A1-201ENST00000409134 4964 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.224e-7■■■■□ 21.2
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